Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FKG8

Protein Details
Accession Q6FKG8    Localization Confidence High Confidence Score 27
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-29LSELKKTKPKTVISPPQKANKQEHydrophilic
58-82LKNPELAKKKQKQVRKTPSSSKASTHydrophilic
207-229QPNERLKKKLEMRQRVNKSRRYEHydrophilic
313-336KREEAWLKKHEQEKKKKKLKLQKRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
62-87ELAKKKQKQVRKTPSSSKASTGKKDK
99-108KRKVGSDKPA
110-118PIQVKKKPQ
211-216RLKKKL
318-336WLKKHEQEKKKKKLKLQKR
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000217  F:DNA secondary structure binding  
GO:0042393  F:histone binding  
GO:0140713  F:histone chaperone activity  
GO:0031507  P:heterochromatin formation  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0043631  P:RNA polyadenylation  
GO:0140673  P:transcription elongation-coupled chromatin remodeling  
KEGG cgr:CAGL0L11704g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MSFLSKLSELKKTKPKTVISPPQKANKQEEISLLPKNYVREEDPAVTRLKELRRQELLKNPELAKKKQKQVRKTPSSSKASTGKKDKNGDDNMLVSRFKRKVGSDKPAVPIQVKKKPQPIKKLSFEELMKQAENNQTIPVSKDTQSNGAGEKIKGSAKLNKPGFKTSRPKSLSPTTHINKTDHGKDKSTAKEKSEPVVKIGIPKFAQPNERLKKKLEMRQRVNKSRRYEDEEDDMDDFIEDDEEEYSSYRTTSKDPGYDRDEIWAMFNKGRKRSYNEYMDYEEEDDFDAMEANEMEILEEEEEAARMARLEDKREEAWLKKHEQEKKKKKLKLQKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.68
3 0.68
4 0.75
5 0.77
6 0.77
7 0.8
8 0.78
9 0.8
10 0.81
11 0.78
12 0.74
13 0.73
14 0.67
15 0.6
16 0.57
17 0.52
18 0.49
19 0.48
20 0.41
21 0.35
22 0.33
23 0.33
24 0.32
25 0.3
26 0.29
27 0.27
28 0.31
29 0.33
30 0.33
31 0.34
32 0.33
33 0.3
34 0.29
35 0.31
36 0.34
37 0.37
38 0.4
39 0.45
40 0.51
41 0.55
42 0.59
43 0.63
44 0.63
45 0.6
46 0.6
47 0.55
48 0.54
49 0.56
50 0.57
51 0.58
52 0.6
53 0.64
54 0.66
55 0.72
56 0.75
57 0.8
58 0.84
59 0.83
60 0.83
61 0.83
62 0.85
63 0.84
64 0.75
65 0.7
66 0.68
67 0.64
68 0.65
69 0.64
70 0.63
71 0.63
72 0.69
73 0.67
74 0.67
75 0.64
76 0.59
77 0.51
78 0.46
79 0.4
80 0.35
81 0.31
82 0.23
83 0.27
84 0.24
85 0.25
86 0.26
87 0.28
88 0.36
89 0.44
90 0.52
91 0.51
92 0.54
93 0.56
94 0.54
95 0.52
96 0.44
97 0.42
98 0.41
99 0.43
100 0.44
101 0.46
102 0.53
103 0.61
104 0.66
105 0.7
106 0.71
107 0.71
108 0.74
109 0.74
110 0.67
111 0.64
112 0.57
113 0.51
114 0.45
115 0.39
116 0.3
117 0.25
118 0.25
119 0.24
120 0.25
121 0.21
122 0.18
123 0.16
124 0.16
125 0.18
126 0.17
127 0.15
128 0.15
129 0.18
130 0.18
131 0.21
132 0.21
133 0.2
134 0.19
135 0.19
136 0.19
137 0.16
138 0.16
139 0.14
140 0.14
141 0.16
142 0.17
143 0.22
144 0.25
145 0.34
146 0.38
147 0.41
148 0.42
149 0.47
150 0.48
151 0.48
152 0.53
153 0.47
154 0.53
155 0.52
156 0.51
157 0.5
158 0.55
159 0.5
160 0.45
161 0.51
162 0.44
163 0.46
164 0.47
165 0.42
166 0.38
167 0.38
168 0.42
169 0.41
170 0.41
171 0.37
172 0.37
173 0.42
174 0.46
175 0.49
176 0.44
177 0.4
178 0.45
179 0.44
180 0.47
181 0.47
182 0.4
183 0.35
184 0.35
185 0.31
186 0.31
187 0.3
188 0.3
189 0.24
190 0.26
191 0.28
192 0.27
193 0.32
194 0.28
195 0.38
196 0.42
197 0.48
198 0.47
199 0.47
200 0.53
201 0.56
202 0.6
203 0.6
204 0.61
205 0.65
206 0.73
207 0.8
208 0.82
209 0.82
210 0.82
211 0.78
212 0.75
213 0.72
214 0.71
215 0.66
216 0.59
217 0.57
218 0.51
219 0.46
220 0.39
221 0.32
222 0.23
223 0.18
224 0.14
225 0.08
226 0.07
227 0.05
228 0.04
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.06
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.08
237 0.09
238 0.12
239 0.19
240 0.22
241 0.28
242 0.31
243 0.37
244 0.41
245 0.43
246 0.4
247 0.37
248 0.34
249 0.28
250 0.27
251 0.27
252 0.24
253 0.24
254 0.29
255 0.32
256 0.37
257 0.43
258 0.46
259 0.49
260 0.55
261 0.6
262 0.65
263 0.63
264 0.61
265 0.59
266 0.55
267 0.49
268 0.43
269 0.34
270 0.25
271 0.21
272 0.16
273 0.12
274 0.1
275 0.09
276 0.07
277 0.08
278 0.07
279 0.06
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.06
284 0.07
285 0.07
286 0.06
287 0.07
288 0.06
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.06
293 0.06
294 0.07
295 0.15
296 0.18
297 0.23
298 0.27
299 0.32
300 0.33
301 0.39
302 0.43
303 0.41
304 0.46
305 0.49
306 0.51
307 0.53
308 0.61
309 0.64
310 0.7
311 0.75
312 0.78
313 0.82
314 0.86
315 0.87
316 0.89