Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A0R0LSW1

Protein Details
Accession A0A0R0LSW1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-40NKRTFVKREGEHKKYNKPTEQTKTHydrophilic
70-93GHTVYKCSENKRKPKEIKEPEVVIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12, mito 5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038635  CCR4-NOT_su2/3/5_C_sf  
IPR040168  Not2/3/5  
IPR007282  NOT2/3/5_C  
Gene Ontology GO:0030015  C:CCR4-NOT core complex  
GO:0000289  P:nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF04153  NOT2_3_5  
Amino Acid Sequences MKKTANDIKKDLKPVENKRTFVKREGEHKKYNKPTEQTKTNITSENQNNSTIRSEQQKKDLKFEKAVFHGHTVYKCSENKRKPKEIKEPEVVISAADIWKNAAKLLDSKKQTVKNEQKSEITKIKPENTNISNPLDNLKEKQKYGHSVYKEALLHSILNRLTISSDLLKDSPLKGNSNQESDKNILETNNHENIESVEPQKRKVPDWFPKKPIHVFDNSLIYNNLNIDTLFFIFYFSKNEKQIFAARHLKKYSWRYHTKYNTWFQRLEEPKLITEYYEQGIFLFFDYEVTWTNRKKTDFTFEYKYLENIEI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.75
3 0.74
4 0.7
5 0.7
6 0.75
7 0.71
8 0.68
9 0.67
10 0.62
11 0.65
12 0.73
13 0.73
14 0.73
15 0.77
16 0.8
17 0.81
18 0.84
19 0.82
20 0.79
21 0.8
22 0.8
23 0.79
24 0.73
25 0.71
26 0.67
27 0.62
28 0.59
29 0.51
30 0.51
31 0.5
32 0.54
33 0.48
34 0.46
35 0.43
36 0.4
37 0.42
38 0.35
39 0.31
40 0.33
41 0.39
42 0.4
43 0.49
44 0.56
45 0.54
46 0.62
47 0.67
48 0.62
49 0.62
50 0.62
51 0.58
52 0.53
53 0.55
54 0.48
55 0.43
56 0.41
57 0.36
58 0.33
59 0.31
60 0.29
61 0.3
62 0.32
63 0.38
64 0.45
65 0.51
66 0.6
67 0.66
68 0.74
69 0.78
70 0.83
71 0.86
72 0.86
73 0.84
74 0.81
75 0.74
76 0.65
77 0.58
78 0.48
79 0.36
80 0.26
81 0.19
82 0.13
83 0.1
84 0.08
85 0.07
86 0.09
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.15
92 0.21
93 0.28
94 0.29
95 0.33
96 0.39
97 0.45
98 0.48
99 0.52
100 0.57
101 0.59
102 0.63
103 0.62
104 0.62
105 0.58
106 0.61
107 0.57
108 0.48
109 0.43
110 0.41
111 0.44
112 0.43
113 0.42
114 0.42
115 0.38
116 0.41
117 0.38
118 0.36
119 0.31
120 0.27
121 0.27
122 0.22
123 0.2
124 0.19
125 0.23
126 0.24
127 0.23
128 0.27
129 0.28
130 0.32
131 0.37
132 0.4
133 0.35
134 0.35
135 0.35
136 0.36
137 0.33
138 0.27
139 0.22
140 0.16
141 0.15
142 0.12
143 0.16
144 0.11
145 0.11
146 0.11
147 0.1
148 0.09
149 0.09
150 0.1
151 0.07
152 0.08
153 0.08
154 0.09
155 0.1
156 0.1
157 0.12
158 0.15
159 0.16
160 0.18
161 0.19
162 0.27
163 0.28
164 0.32
165 0.32
166 0.28
167 0.29
168 0.29
169 0.27
170 0.2
171 0.19
172 0.15
173 0.14
174 0.17
175 0.19
176 0.22
177 0.22
178 0.21
179 0.2
180 0.22
181 0.23
182 0.22
183 0.19
184 0.21
185 0.21
186 0.23
187 0.28
188 0.28
189 0.28
190 0.34
191 0.41
192 0.45
193 0.54
194 0.61
195 0.62
196 0.66
197 0.69
198 0.66
199 0.61
200 0.56
201 0.5
202 0.45
203 0.41
204 0.42
205 0.36
206 0.32
207 0.28
208 0.23
209 0.2
210 0.17
211 0.15
212 0.09
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.09
218 0.08
219 0.1
220 0.1
221 0.11
222 0.15
223 0.18
224 0.22
225 0.25
226 0.27
227 0.26
228 0.29
229 0.34
230 0.32
231 0.37
232 0.42
233 0.43
234 0.49
235 0.5
236 0.5
237 0.53
238 0.59
239 0.6
240 0.6
241 0.65
242 0.64
243 0.72
244 0.78
245 0.78
246 0.78
247 0.78
248 0.78
249 0.74
250 0.7
251 0.62
252 0.63
253 0.6
254 0.57
255 0.54
256 0.46
257 0.43
258 0.44
259 0.41
260 0.32
261 0.29
262 0.25
263 0.21
264 0.19
265 0.17
266 0.14
267 0.15
268 0.14
269 0.12
270 0.1
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.1
275 0.12
276 0.17
277 0.23
278 0.25
279 0.32
280 0.37
281 0.4
282 0.43
283 0.46
284 0.52
285 0.51
286 0.55
287 0.57
288 0.54
289 0.55
290 0.52
291 0.48