Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0R0M193

Protein Details
Accession A0A0R0M193    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
86-110ISKVSALKSRPPPKNKRELQKLLGFHydrophilic
126-148ATLSEKLKKCPKKINWTENDEKIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 6, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043502  DNA/RNA_pol_sf  
IPR001584  Integrase_cat-core  
IPR043128  Rev_trsase/Diguanyl_cyclase  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR000477  RT_dom  
IPR041577  RT_RNaseH_2  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0015074  P:DNA integration  
Pfam View protein in Pfam  
PF17919  RT_RNaseH_2  
PF00665  rve  
PF00078  RVT_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50994  INTEGRASE  
PS50878  RT_POL  
CDD cd09274  RNase_HI_RT_Ty3  
cd01647  RT_LTR  
Amino Acid Sequences GLKNAPKSFQRIMEEILSDLECVTIFVDDVLISSETEADHYYDVKKVLTRLMDAGAKINYEKSSFKKREIKFLGCIVNENGIRADISKVSALKSRPPPKNKRELQKLLGFCNWFRKFVPRISDITATLSEKLKKCPKKINWTENDEKIRQKIFEKIEENLTLAHPDYKKPFELHTDASNIGIGGILVQENKLIGIYSKKLNKSESNYTTVEKELYAIIKSLENFREIIWGQEITIYTDSKNITHISNSLDSRTKRWKTLLAEYDYKMLHVAGEKNEGPDQLSRNYRAILKRENENTDIEKFIMEKHYELIHAGIERLFQTIRYSKENITREFIKKIIKKCIECQKFKNDSRKFGKIEGSIHSIYPMTDLCCDIYGPLPYEVTQTDKKLYILTMIDRCTRICRLAVMNSIESSKVAKYIEENWIVEFGEPHSILTDRGTQFTSDIFEKFCIERNIKHLKTSPYNPTCNGIAER
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.36
3 0.33
4 0.26
5 0.2
6 0.17
7 0.13
8 0.09
9 0.09
10 0.08
11 0.06
12 0.06
13 0.05
14 0.06
15 0.05
16 0.06
17 0.08
18 0.08
19 0.08
20 0.08
21 0.09
22 0.08
23 0.1
24 0.11
25 0.1
26 0.1
27 0.12
28 0.14
29 0.16
30 0.17
31 0.18
32 0.2
33 0.21
34 0.25
35 0.26
36 0.26
37 0.25
38 0.28
39 0.29
40 0.26
41 0.28
42 0.24
43 0.23
44 0.21
45 0.22
46 0.2
47 0.19
48 0.23
49 0.26
50 0.36
51 0.39
52 0.48
53 0.55
54 0.55
55 0.64
56 0.67
57 0.67
58 0.6
59 0.63
60 0.61
61 0.51
62 0.52
63 0.42
64 0.41
65 0.35
66 0.31
67 0.25
68 0.18
69 0.18
70 0.16
71 0.16
72 0.1
73 0.12
74 0.14
75 0.14
76 0.16
77 0.21
78 0.21
79 0.28
80 0.38
81 0.46
82 0.53
83 0.63
84 0.71
85 0.76
86 0.85
87 0.85
88 0.85
89 0.86
90 0.85
91 0.81
92 0.79
93 0.73
94 0.67
95 0.63
96 0.55
97 0.45
98 0.48
99 0.42
100 0.36
101 0.34
102 0.37
103 0.36
104 0.39
105 0.45
106 0.38
107 0.39
108 0.41
109 0.43
110 0.36
111 0.35
112 0.31
113 0.26
114 0.24
115 0.25
116 0.27
117 0.26
118 0.34
119 0.4
120 0.46
121 0.51
122 0.6
123 0.65
124 0.7
125 0.79
126 0.81
127 0.8
128 0.81
129 0.81
130 0.78
131 0.76
132 0.68
133 0.61
134 0.54
135 0.49
136 0.42
137 0.37
138 0.37
139 0.35
140 0.39
141 0.38
142 0.36
143 0.37
144 0.36
145 0.34
146 0.27
147 0.23
148 0.16
149 0.14
150 0.18
151 0.14
152 0.16
153 0.2
154 0.22
155 0.24
156 0.24
157 0.25
158 0.26
159 0.29
160 0.29
161 0.27
162 0.27
163 0.25
164 0.24
165 0.22
166 0.16
167 0.12
168 0.09
169 0.06
170 0.03
171 0.03
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.07
182 0.09
183 0.15
184 0.2
185 0.23
186 0.26
187 0.3
188 0.34
189 0.37
190 0.44
191 0.43
192 0.42
193 0.41
194 0.4
195 0.37
196 0.32
197 0.27
198 0.17
199 0.14
200 0.1
201 0.1
202 0.09
203 0.08
204 0.08
205 0.09
206 0.09
207 0.12
208 0.12
209 0.12
210 0.12
211 0.12
212 0.15
213 0.14
214 0.14
215 0.12
216 0.11
217 0.1
218 0.11
219 0.11
220 0.09
221 0.1
222 0.1
223 0.09
224 0.11
225 0.12
226 0.1
227 0.12
228 0.11
229 0.11
230 0.11
231 0.12
232 0.12
233 0.16
234 0.16
235 0.17
236 0.21
237 0.21
238 0.25
239 0.34
240 0.34
241 0.32
242 0.34
243 0.38
244 0.37
245 0.45
246 0.48
247 0.43
248 0.44
249 0.42
250 0.43
251 0.37
252 0.32
253 0.24
254 0.16
255 0.12
256 0.1
257 0.12
258 0.1
259 0.14
260 0.15
261 0.16
262 0.17
263 0.17
264 0.16
265 0.16
266 0.17
267 0.18
268 0.21
269 0.22
270 0.22
271 0.24
272 0.27
273 0.29
274 0.32
275 0.34
276 0.34
277 0.39
278 0.43
279 0.45
280 0.42
281 0.41
282 0.39
283 0.33
284 0.31
285 0.24
286 0.19
287 0.15
288 0.15
289 0.16
290 0.14
291 0.13
292 0.14
293 0.14
294 0.14
295 0.14
296 0.13
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.09
304 0.09
305 0.08
306 0.12
307 0.16
308 0.19
309 0.23
310 0.25
311 0.28
312 0.36
313 0.41
314 0.4
315 0.4
316 0.44
317 0.42
318 0.42
319 0.42
320 0.42
321 0.43
322 0.46
323 0.51
324 0.52
325 0.52
326 0.58
327 0.66
328 0.66
329 0.67
330 0.67
331 0.68
332 0.7
333 0.74
334 0.77
335 0.72
336 0.73
337 0.74
338 0.76
339 0.68
340 0.62
341 0.61
342 0.54
343 0.51
344 0.45
345 0.44
346 0.36
347 0.33
348 0.3
349 0.24
350 0.2
351 0.18
352 0.15
353 0.1
354 0.11
355 0.11
356 0.11
357 0.11
358 0.11
359 0.11
360 0.12
361 0.13
362 0.14
363 0.14
364 0.14
365 0.14
366 0.16
367 0.16
368 0.19
369 0.21
370 0.21
371 0.23
372 0.24
373 0.25
374 0.24
375 0.23
376 0.22
377 0.2
378 0.24
379 0.25
380 0.27
381 0.3
382 0.3
383 0.31
384 0.31
385 0.32
386 0.29
387 0.25
388 0.26
389 0.27
390 0.31
391 0.36
392 0.36
393 0.35
394 0.33
395 0.33
396 0.29
397 0.25
398 0.22
399 0.16
400 0.15
401 0.13
402 0.13
403 0.15
404 0.21
405 0.28
406 0.31
407 0.31
408 0.28
409 0.3
410 0.29
411 0.26
412 0.22
413 0.15
414 0.17
415 0.16
416 0.16
417 0.16
418 0.16
419 0.16
420 0.18
421 0.25
422 0.2
423 0.23
424 0.24
425 0.22
426 0.23
427 0.23
428 0.25
429 0.18
430 0.19
431 0.18
432 0.18
433 0.21
434 0.21
435 0.27
436 0.31
437 0.33
438 0.36
439 0.42
440 0.52
441 0.5
442 0.56
443 0.56
444 0.57
445 0.62
446 0.66
447 0.69
448 0.66
449 0.71
450 0.66
451 0.64
452 0.56