Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0R0LYL0

Protein Details
Accession A0A0R0LYL0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
269-289KYSPRTSKYSPLSPKKKDDSKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto 6, mito 3, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045867  DNA-dir_RpoC_beta_prime  
IPR000684  RNA_pol_II_repeat_euk  
IPR007081  RNA_pol_Rpb1_5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003899  F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF04998  RNA_pol_Rpb1_5  
PF05001  RNA_pol_Rpb1_R  
Amino Acid Sequences NNVNFIDQELSWQLQTCGSNLRDMMVDPLIKDCYTNDIHETYTVLGIEAARSVILTEILKVLQSDGSYVNIRHLLLLIDIMTYNGVVLGITRHGINRKIGSPLMRCTFEETVEILLDAACKGEISHMQSVSEGIMAGNIVKCGTGQPTLLLDMKLITQGEKFTFLENKGELINMNEKDDNISFIYSPSSVLGSPSIHSPSMTSPGDYSPMSPKYSPMSPKYSPMSPKYSPVSPKYSPMSPKYSPVSPKYSPMSPKYNPMSPKYTPMSPKYSPRTSKYSPLSPKKKDDSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.2
3 0.18
4 0.23
5 0.22
6 0.25
7 0.24
8 0.24
9 0.21
10 0.2
11 0.22
12 0.18
13 0.19
14 0.16
15 0.18
16 0.19
17 0.18
18 0.18
19 0.15
20 0.17
21 0.19
22 0.21
23 0.21
24 0.21
25 0.22
26 0.22
27 0.22
28 0.17
29 0.16
30 0.14
31 0.11
32 0.1
33 0.09
34 0.09
35 0.08
36 0.07
37 0.05
38 0.05
39 0.05
40 0.05
41 0.07
42 0.07
43 0.07
44 0.08
45 0.08
46 0.09
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.08
51 0.09
52 0.09
53 0.12
54 0.13
55 0.14
56 0.15
57 0.16
58 0.16
59 0.14
60 0.14
61 0.11
62 0.1
63 0.1
64 0.07
65 0.06
66 0.06
67 0.06
68 0.05
69 0.05
70 0.04
71 0.04
72 0.03
73 0.03
74 0.03
75 0.04
76 0.04
77 0.05
78 0.06
79 0.08
80 0.11
81 0.14
82 0.17
83 0.19
84 0.2
85 0.23
86 0.24
87 0.27
88 0.28
89 0.31
90 0.31
91 0.3
92 0.29
93 0.31
94 0.3
95 0.25
96 0.24
97 0.18
98 0.16
99 0.14
100 0.13
101 0.08
102 0.07
103 0.06
104 0.05
105 0.04
106 0.03
107 0.03
108 0.03
109 0.05
110 0.07
111 0.11
112 0.13
113 0.14
114 0.14
115 0.14
116 0.14
117 0.13
118 0.11
119 0.07
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.03
128 0.04
129 0.04
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.07
134 0.07
135 0.09
136 0.1
137 0.1
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.06
144 0.06
145 0.07
146 0.08
147 0.1
148 0.11
149 0.11
150 0.14
151 0.14
152 0.16
153 0.15
154 0.16
155 0.13
156 0.13
157 0.11
158 0.11
159 0.16
160 0.14
161 0.16
162 0.15
163 0.15
164 0.17
165 0.17
166 0.17
167 0.11
168 0.11
169 0.1
170 0.1
171 0.11
172 0.09
173 0.09
174 0.07
175 0.08
176 0.07
177 0.08
178 0.09
179 0.08
180 0.09
181 0.11
182 0.12
183 0.12
184 0.12
185 0.12
186 0.12
187 0.18
188 0.18
189 0.16
190 0.15
191 0.16
192 0.18
193 0.17
194 0.17
195 0.18
196 0.2
197 0.23
198 0.22
199 0.23
200 0.25
201 0.3
202 0.35
203 0.33
204 0.38
205 0.37
206 0.42
207 0.44
208 0.46
209 0.46
210 0.45
211 0.48
212 0.42
213 0.46
214 0.45
215 0.47
216 0.47
217 0.47
218 0.49
219 0.44
220 0.48
221 0.47
222 0.49
223 0.49
224 0.48
225 0.5
226 0.44
227 0.48
228 0.47
229 0.48
230 0.48
231 0.47
232 0.49
233 0.44
234 0.48
235 0.47
236 0.49
237 0.49
238 0.49
239 0.52
240 0.47
241 0.54
242 0.54
243 0.57
244 0.56
245 0.55
246 0.56
247 0.49
248 0.55
249 0.51
250 0.52
251 0.53
252 0.53
253 0.55
254 0.54
255 0.61
256 0.62
257 0.67
258 0.67
259 0.66
260 0.68
261 0.66
262 0.7
263 0.68
264 0.7
265 0.71
266 0.74
267 0.79
268 0.78
269 0.83