Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FVC6

Protein Details
Accession Q6FVC6    Localization Confidence Low Confidence Score 6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
65-90QEFTRNIKTEIKRRAKQKHTEEQPLEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 21, nucl 3, cyto 3, cyto_nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000002  P:mitochondrial genome maintenance  
GO:0000963  P:mitochondrial RNA processing  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:2000234  P:positive regulation of rRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
GO:0016072  P:rRNA metabolic process  
KEGG cgr:CAGL0E02959g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01535  PPR  
PF13041  PPR_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MRTVLPVHRFVRTVYLPARRLVKANVGAQKIAPAASSAILPKDLDIDIRGIEDPKVLEMKVKQLQEFTRNIKTEIKRRAKQKHTEEQPLELSNNEDISAVFNAVVNTPKKADSIGKGITEKLMENTVDQIIDNVVPKAIQERIADKSLMVRALVRTSVHTPIESNMLVKKLAESEMRLKGLPQEDIRTFLKKSIKNLNFTNILELDKMLLEYVGNDISKFSDNMYKCLFSNLSKLNAQSTQHSKDDLVIKMFNKLLKRYDTNLNTTNANVWNEKMTNVILSYCINYSIKLKDFEITDKFVSKFKNDYKLLPDKQNYTSIIHFYSKLGLSDKAWDTFDTMKFLSRSHAPDTKAYNSVLMLCKQEKDFRKTIDLYHEMVDKKVPMDARTYTTMIHTLAAASTDSYTSEGKSDSLRILGWKLINELSKNLQYDVMKNKHILISMLSLSAYDGDLGMARALYYKIFHQKSDELYATMNPAQLENLSAKDILSYVLDPKVLNYLLLAYSRYDKGRLPLILANDEGSTLRRNVINAVDFGGHSSEMSALELANKITIPFLPYSEISENWQIIAESRALWLFNLEYGGITDISLTSSIQENAMIYRDQAIDINEFKLKIMNDLIEWKTENLNNTVLNPTLLQTFLTIPLKSGNREEFYSRLNAFTFQQHNLNSVMEKFYEYKPESEEYNDCLKYFESLKRKILMSNSHYDLVMKAATKFGDIDAANQVWKDRGEYRKTTSFAKLPTKDRIISDSNFAKLMVEFFVSQRLYSDAMAVVLSSKNFIKWDYSMVKSLHHGLIEAEDIINIEKLLDVVNRSKGTKKAVDVINEQIEELKLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.46
3 0.45
4 0.48
5 0.53
6 0.46
7 0.48
8 0.45
9 0.46
10 0.44
11 0.49
12 0.52
13 0.49
14 0.48
15 0.44
16 0.43
17 0.35
18 0.29
19 0.21
20 0.15
21 0.13
22 0.13
23 0.14
24 0.13
25 0.13
26 0.14
27 0.14
28 0.13
29 0.15
30 0.15
31 0.14
32 0.14
33 0.14
34 0.13
35 0.15
36 0.16
37 0.14
38 0.14
39 0.15
40 0.14
41 0.16
42 0.18
43 0.16
44 0.2
45 0.21
46 0.29
47 0.33
48 0.36
49 0.35
50 0.39
51 0.44
52 0.46
53 0.51
54 0.49
55 0.51
56 0.5
57 0.51
58 0.54
59 0.57
60 0.59
61 0.63
62 0.67
63 0.65
64 0.74
65 0.81
66 0.82
67 0.85
68 0.85
69 0.85
70 0.84
71 0.88
72 0.8
73 0.74
74 0.69
75 0.62
76 0.52
77 0.42
78 0.35
79 0.26
80 0.24
81 0.19
82 0.14
83 0.11
84 0.13
85 0.13
86 0.11
87 0.1
88 0.1
89 0.11
90 0.12
91 0.18
92 0.16
93 0.17
94 0.19
95 0.2
96 0.19
97 0.21
98 0.25
99 0.24
100 0.3
101 0.31
102 0.34
103 0.34
104 0.34
105 0.33
106 0.29
107 0.26
108 0.21
109 0.2
110 0.17
111 0.16
112 0.18
113 0.17
114 0.16
115 0.14
116 0.13
117 0.11
118 0.12
119 0.12
120 0.1
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.12
125 0.13
126 0.16
127 0.17
128 0.2
129 0.24
130 0.27
131 0.27
132 0.24
133 0.27
134 0.25
135 0.24
136 0.2
137 0.18
138 0.17
139 0.19
140 0.21
141 0.17
142 0.18
143 0.2
144 0.25
145 0.24
146 0.22
147 0.21
148 0.21
149 0.24
150 0.21
151 0.19
152 0.17
153 0.17
154 0.17
155 0.16
156 0.16
157 0.13
158 0.16
159 0.17
160 0.18
161 0.24
162 0.29
163 0.3
164 0.29
165 0.28
166 0.3
167 0.31
168 0.32
169 0.27
170 0.28
171 0.27
172 0.32
173 0.34
174 0.32
175 0.29
176 0.31
177 0.37
178 0.34
179 0.4
180 0.46
181 0.49
182 0.51
183 0.53
184 0.53
185 0.49
186 0.46
187 0.44
188 0.34
189 0.3
190 0.25
191 0.22
192 0.17
193 0.12
194 0.12
195 0.08
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.07
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.1
205 0.11
206 0.11
207 0.11
208 0.17
209 0.18
210 0.22
211 0.24
212 0.24
213 0.23
214 0.26
215 0.27
216 0.2
217 0.27
218 0.26
219 0.28
220 0.28
221 0.28
222 0.28
223 0.29
224 0.29
225 0.28
226 0.31
227 0.32
228 0.32
229 0.32
230 0.29
231 0.3
232 0.35
233 0.31
234 0.27
235 0.25
236 0.25
237 0.27
238 0.29
239 0.27
240 0.25
241 0.26
242 0.28
243 0.3
244 0.33
245 0.34
246 0.42
247 0.43
248 0.45
249 0.46
250 0.43
251 0.38
252 0.35
253 0.34
254 0.28
255 0.26
256 0.21
257 0.17
258 0.18
259 0.18
260 0.18
261 0.16
262 0.12
263 0.11
264 0.11
265 0.1
266 0.08
267 0.08
268 0.09
269 0.08
270 0.1
271 0.1
272 0.1
273 0.13
274 0.16
275 0.18
276 0.19
277 0.19
278 0.19
279 0.21
280 0.24
281 0.25
282 0.24
283 0.22
284 0.24
285 0.24
286 0.25
287 0.25
288 0.23
289 0.27
290 0.29
291 0.37
292 0.36
293 0.38
294 0.42
295 0.5
296 0.52
297 0.52
298 0.5
299 0.45
300 0.46
301 0.47
302 0.42
303 0.35
304 0.32
305 0.26
306 0.26
307 0.23
308 0.21
309 0.17
310 0.18
311 0.16
312 0.15
313 0.15
314 0.14
315 0.13
316 0.18
317 0.19
318 0.18
319 0.18
320 0.17
321 0.17
322 0.2
323 0.21
324 0.18
325 0.17
326 0.18
327 0.18
328 0.18
329 0.18
330 0.18
331 0.2
332 0.23
333 0.28
334 0.26
335 0.3
336 0.34
337 0.35
338 0.33
339 0.3
340 0.25
341 0.21
342 0.22
343 0.2
344 0.17
345 0.17
346 0.16
347 0.17
348 0.18
349 0.25
350 0.27
351 0.32
352 0.34
353 0.33
354 0.38
355 0.38
356 0.38
357 0.39
358 0.36
359 0.31
360 0.28
361 0.3
362 0.25
363 0.24
364 0.23
365 0.16
366 0.13
367 0.13
368 0.13
369 0.1
370 0.13
371 0.14
372 0.16
373 0.19
374 0.19
375 0.17
376 0.17
377 0.17
378 0.14
379 0.13
380 0.1
381 0.07
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.05
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.07
393 0.07
394 0.07
395 0.08
396 0.09
397 0.08
398 0.08
399 0.08
400 0.08
401 0.09
402 0.1
403 0.11
404 0.1
405 0.11
406 0.12
407 0.14
408 0.13
409 0.14
410 0.14
411 0.16
412 0.16
413 0.15
414 0.16
415 0.15
416 0.19
417 0.26
418 0.27
419 0.25
420 0.25
421 0.26
422 0.24
423 0.24
424 0.2
425 0.13
426 0.12
427 0.11
428 0.1
429 0.09
430 0.08
431 0.07
432 0.07
433 0.06
434 0.04
435 0.03
436 0.03
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.03
441 0.03
442 0.04
443 0.04
444 0.05
445 0.05
446 0.08
447 0.17
448 0.18
449 0.19
450 0.21
451 0.24
452 0.26
453 0.3
454 0.27
455 0.19
456 0.19
457 0.19
458 0.18
459 0.16
460 0.15
461 0.11
462 0.1
463 0.1
464 0.09
465 0.1
466 0.08
467 0.08
468 0.07
469 0.07
470 0.07
471 0.07
472 0.07
473 0.07
474 0.06
475 0.06
476 0.07
477 0.08
478 0.09
479 0.08
480 0.09
481 0.11
482 0.1
483 0.1
484 0.08
485 0.08
486 0.08
487 0.09
488 0.09
489 0.07
490 0.1
491 0.12
492 0.13
493 0.13
494 0.13
495 0.15
496 0.2
497 0.19
498 0.2
499 0.2
500 0.22
501 0.22
502 0.21
503 0.19
504 0.14
505 0.14
506 0.11
507 0.1
508 0.09
509 0.08
510 0.1
511 0.1
512 0.1
513 0.12
514 0.15
515 0.15
516 0.14
517 0.15
518 0.14
519 0.13
520 0.13
521 0.12
522 0.09
523 0.07
524 0.07
525 0.06
526 0.06
527 0.06
528 0.06
529 0.05
530 0.06
531 0.07
532 0.07
533 0.06
534 0.06
535 0.06
536 0.06
537 0.07
538 0.08
539 0.08
540 0.09
541 0.11
542 0.11
543 0.15
544 0.16
545 0.17
546 0.17
547 0.2
548 0.19
549 0.17
550 0.17
551 0.12
552 0.11
553 0.12
554 0.1
555 0.07
556 0.08
557 0.08
558 0.08
559 0.08
560 0.08
561 0.07
562 0.07
563 0.07
564 0.06
565 0.06
566 0.06
567 0.07
568 0.06
569 0.06
570 0.06
571 0.05
572 0.06
573 0.06
574 0.06
575 0.05
576 0.07
577 0.08
578 0.08
579 0.08
580 0.08
581 0.08
582 0.1
583 0.09
584 0.08
585 0.1
586 0.11
587 0.11
588 0.12
589 0.12
590 0.14
591 0.15
592 0.17
593 0.15
594 0.15
595 0.15
596 0.17
597 0.16
598 0.15
599 0.16
600 0.14
601 0.14
602 0.2
603 0.2
604 0.19
605 0.2
606 0.18
607 0.2
608 0.21
609 0.23
610 0.19
611 0.21
612 0.19
613 0.2
614 0.21
615 0.17
616 0.16
617 0.14
618 0.13
619 0.11
620 0.11
621 0.09
622 0.09
623 0.09
624 0.14
625 0.16
626 0.15
627 0.15
628 0.21
629 0.23
630 0.24
631 0.28
632 0.28
633 0.28
634 0.31
635 0.33
636 0.29
637 0.29
638 0.33
639 0.29
640 0.25
641 0.23
642 0.23
643 0.22
644 0.26
645 0.28
646 0.24
647 0.29
648 0.28
649 0.29
650 0.29
651 0.28
652 0.22
653 0.2
654 0.19
655 0.14
656 0.16
657 0.17
658 0.17
659 0.25
660 0.26
661 0.26
662 0.28
663 0.29
664 0.28
665 0.3
666 0.31
667 0.26
668 0.33
669 0.31
670 0.28
671 0.27
672 0.26
673 0.24
674 0.27
675 0.3
676 0.31
677 0.37
678 0.42
679 0.45
680 0.45
681 0.46
682 0.49
683 0.5
684 0.47
685 0.48
686 0.47
687 0.44
688 0.43
689 0.39
690 0.33
691 0.26
692 0.22
693 0.16
694 0.13
695 0.14
696 0.14
697 0.15
698 0.15
699 0.13
700 0.17
701 0.15
702 0.17
703 0.19
704 0.2
705 0.2
706 0.19
707 0.2
708 0.16
709 0.17
710 0.18
711 0.21
712 0.29
713 0.36
714 0.42
715 0.48
716 0.54
717 0.55
718 0.56
719 0.55
720 0.52
721 0.53
722 0.57
723 0.57
724 0.55
725 0.61
726 0.62
727 0.59
728 0.56
729 0.54
730 0.49
731 0.44
732 0.46
733 0.41
734 0.37
735 0.34
736 0.32
737 0.27
738 0.22
739 0.21
740 0.15
741 0.13
742 0.12
743 0.12
744 0.19
745 0.18
746 0.18
747 0.17
748 0.18
749 0.18
750 0.17
751 0.18
752 0.12
753 0.12
754 0.12
755 0.11
756 0.1
757 0.1
758 0.1
759 0.11
760 0.11
761 0.13
762 0.14
763 0.15
764 0.18
765 0.18
766 0.26
767 0.3
768 0.32
769 0.37
770 0.37
771 0.38
772 0.36
773 0.4
774 0.35
775 0.29
776 0.26
777 0.2
778 0.21
779 0.2
780 0.18
781 0.13
782 0.1
783 0.1
784 0.11
785 0.11
786 0.08
787 0.07
788 0.06
789 0.07
790 0.09
791 0.1
792 0.13
793 0.18
794 0.25
795 0.28
796 0.31
797 0.36
798 0.39
799 0.45
800 0.48
801 0.47
802 0.49
803 0.51
804 0.55
805 0.53
806 0.56
807 0.54
808 0.48
809 0.44
810 0.36