Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FTH7

Protein Details
Accession Q6FTH7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
333-359EKLGRVRGKDFTKNKNKMKRGSYRGGTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
339-352RGKDFTKNKNKMKR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 16, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
KEGG cgr:CAGL0G02409g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MAKEQPPKLSAKAKEAEASSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSDSESSSTSSSSSSDSSSSSSSESSSSSDSGSDSESSSSSSSSSSSSSSSSSSDSDSDSDSSSSSSSSSSSSSSSDSDSDSSSSSSSSSSDSSSSSSSSDSDSDSSSSSSSSDSSSSSSSSDSDSDSESDSSSSSSSSSSDSSSSDSSSSDSSSSDSDSSSSDSDSSSSDSDSSDSGSESDTEDSESESESNNNESTTDETTLKRAREDAKEGDSSSGSDSSESSKRAKLAIPAGKDEIKEGQRRHFSRIEREKISFEAWELTDNTYQGAAGTWGEKANEKLGRVRGKDFTKNKNKMKRGSYRGGTITMATGSYKFTD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.49
3 0.46
4 0.38
5 0.38
6 0.31
7 0.27
8 0.24
9 0.2
10 0.19
11 0.16
12 0.16
13 0.13
14 0.13
15 0.14
16 0.15
17 0.16
18 0.17
19 0.17
20 0.17
21 0.17
22 0.17
23 0.17
24 0.17
25 0.17
26 0.17
27 0.17
28 0.17
29 0.17
30 0.17
31 0.17
32 0.17
33 0.17
34 0.17
35 0.17
36 0.17
37 0.17
38 0.18
39 0.17
40 0.18
41 0.18
42 0.17
43 0.17
44 0.17
45 0.17
46 0.16
47 0.15
48 0.13
49 0.12
50 0.12
51 0.13
52 0.13
53 0.12
54 0.12
55 0.13
56 0.15
57 0.15
58 0.15
59 0.14
60 0.14
61 0.13
62 0.13
63 0.13
64 0.13
65 0.14
66 0.14
67 0.13
68 0.13
69 0.12
70 0.12
71 0.13
72 0.12
73 0.11
74 0.11
75 0.11
76 0.12
77 0.12
78 0.11
79 0.1
80 0.09
81 0.09
82 0.1
83 0.11
84 0.12
85 0.13
86 0.14
87 0.15
88 0.16
89 0.17
90 0.17
91 0.17
92 0.17
93 0.16
94 0.15
95 0.15
96 0.15
97 0.14
98 0.14
99 0.13
100 0.11
101 0.11
102 0.1
103 0.09
104 0.08
105 0.07
106 0.07
107 0.09
108 0.1
109 0.11
110 0.12
111 0.14
112 0.15
113 0.16
114 0.17
115 0.16
116 0.15
117 0.15
118 0.14
119 0.13
120 0.12
121 0.12
122 0.1
123 0.1
124 0.09
125 0.08
126 0.08
127 0.09
128 0.09
129 0.09
130 0.1
131 0.11
132 0.12
133 0.13
134 0.13
135 0.12
136 0.11
137 0.11
138 0.12
139 0.12
140 0.11
141 0.11
142 0.11
143 0.12
144 0.12
145 0.12
146 0.1
147 0.1
148 0.09
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.09
154 0.1
155 0.11
156 0.11
157 0.11
158 0.11
159 0.11
160 0.12
161 0.12
162 0.1
163 0.1
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.11
168 0.09
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.07
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.08
178 0.08
179 0.09
180 0.09
181 0.1
182 0.12
183 0.12
184 0.12
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.09
195 0.09
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.1
200 0.09
201 0.09
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.1
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.09
212 0.08
213 0.09
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.11
232 0.1
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.12
237 0.14
238 0.15
239 0.15
240 0.15
241 0.21
242 0.25
243 0.25
244 0.23
245 0.25
246 0.28
247 0.31
248 0.36
249 0.36
250 0.35
251 0.37
252 0.37
253 0.34
254 0.29
255 0.24
256 0.21
257 0.17
258 0.13
259 0.11
260 0.11
261 0.14
262 0.17
263 0.19
264 0.19
265 0.21
266 0.22
267 0.24
268 0.26
269 0.27
270 0.33
271 0.36
272 0.37
273 0.37
274 0.4
275 0.4
276 0.38
277 0.34
278 0.32
279 0.32
280 0.36
281 0.36
282 0.41
283 0.48
284 0.51
285 0.55
286 0.55
287 0.55
288 0.59
289 0.66
290 0.66
291 0.61
292 0.62
293 0.58
294 0.53
295 0.5
296 0.39
297 0.3
298 0.26
299 0.21
300 0.21
301 0.2
302 0.21
303 0.2
304 0.2
305 0.19
306 0.15
307 0.14
308 0.11
309 0.1
310 0.08
311 0.07
312 0.08
313 0.09
314 0.1
315 0.11
316 0.14
317 0.15
318 0.21
319 0.24
320 0.25
321 0.3
322 0.37
323 0.45
324 0.46
325 0.5
326 0.51
327 0.55
328 0.63
329 0.65
330 0.68
331 0.71
332 0.77
333 0.82
334 0.85
335 0.86
336 0.85
337 0.87
338 0.87
339 0.85
340 0.85
341 0.8
342 0.77
343 0.71
344 0.65
345 0.55
346 0.46
347 0.38
348 0.28
349 0.24
350 0.17
351 0.15