Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6CTM6

Protein Details
Accession Q6CTM6    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-35MGKSTDKKVSKKVSKKDLKLKKKQDEKKVKAVEPEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-30KKVSKKVSKKDLKLKKKQDEKKVK
394-410RGGRGGRGGSRGGRGGF
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG kla:KLLA0_C11495g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12447  RRM1_gar2  
Amino Acid Sequences MGKSTDKKVSKKVSKKDLKLKKKQDEKKVKAVEPESSSDSSSDSSSDSSSDSSSDSSSDSDSSSSSDSSDSSDEEEEPKKETKKEESSSDSESSSDSDSESEKEEAKKEESSDSDSSSDSSSDSDSDSDEEEEKKEEKKKEESSASSSDSDSSSDSDSSSDDDEEEEKSSNKRKADDDEEKSESKKPKTELAGEPATIFVGRLSWSIDDEWLKTEFEPIGGVISARVMYERGTDRSRGYGYVDFEDKSYAEKAIKEMHGKEIDGRPINCDMSTSKPAGAPRDDRAKKFGDVPSEPSDTLFLGNLSFEADRDNLYEIFGKYGEIVSVRIPTHPETEQPKGFGYVQYGSIEDATKAFEGLQGEYINNRPVRLDYSIPKQNFGNNQRGGFNRGGSDRGGRGGRGGSRGGRGGFGGNRGGREFSSGSNASPLGATRQTASFQGTKKTFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.89
3 0.9
4 0.9
5 0.91
6 0.92
7 0.92
8 0.92
9 0.92
10 0.92
11 0.92
12 0.93
13 0.89
14 0.89
15 0.88
16 0.81
17 0.79
18 0.73
19 0.69
20 0.62
21 0.59
22 0.53
23 0.45
24 0.41
25 0.33
26 0.3
27 0.24
28 0.2
29 0.17
30 0.13
31 0.13
32 0.12
33 0.13
34 0.12
35 0.12
36 0.12
37 0.12
38 0.12
39 0.12
40 0.12
41 0.12
42 0.12
43 0.12
44 0.13
45 0.13
46 0.13
47 0.12
48 0.12
49 0.13
50 0.13
51 0.13
52 0.12
53 0.12
54 0.11
55 0.13
56 0.14
57 0.13
58 0.14
59 0.15
60 0.15
61 0.19
62 0.22
63 0.21
64 0.23
65 0.28
66 0.3
67 0.33
68 0.38
69 0.43
70 0.48
71 0.52
72 0.55
73 0.56
74 0.56
75 0.57
76 0.53
77 0.44
78 0.35
79 0.31
80 0.26
81 0.21
82 0.17
83 0.12
84 0.11
85 0.12
86 0.13
87 0.15
88 0.15
89 0.17
90 0.19
91 0.22
92 0.24
93 0.26
94 0.27
95 0.26
96 0.28
97 0.27
98 0.3
99 0.29
100 0.28
101 0.26
102 0.24
103 0.23
104 0.2
105 0.18
106 0.12
107 0.11
108 0.1
109 0.09
110 0.1
111 0.09
112 0.09
113 0.1
114 0.11
115 0.11
116 0.12
117 0.12
118 0.12
119 0.15
120 0.16
121 0.21
122 0.27
123 0.31
124 0.35
125 0.42
126 0.47
127 0.52
128 0.57
129 0.55
130 0.54
131 0.52
132 0.49
133 0.42
134 0.37
135 0.3
136 0.24
137 0.21
138 0.16
139 0.13
140 0.11
141 0.1
142 0.1
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.1
147 0.09
148 0.08
149 0.08
150 0.09
151 0.1
152 0.1
153 0.1
154 0.1
155 0.14
156 0.2
157 0.24
158 0.25
159 0.28
160 0.29
161 0.35
162 0.43
163 0.49
164 0.48
165 0.49
166 0.51
167 0.49
168 0.47
169 0.47
170 0.44
171 0.38
172 0.37
173 0.33
174 0.35
175 0.38
176 0.43
177 0.4
178 0.4
179 0.39
180 0.34
181 0.32
182 0.26
183 0.22
184 0.16
185 0.12
186 0.06
187 0.04
188 0.05
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.07
193 0.07
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.11
198 0.11
199 0.11
200 0.1
201 0.11
202 0.09
203 0.09
204 0.08
205 0.06
206 0.06
207 0.05
208 0.05
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.07
217 0.09
218 0.12
219 0.14
220 0.16
221 0.16
222 0.19
223 0.19
224 0.17
225 0.18
226 0.18
227 0.18
228 0.18
229 0.19
230 0.17
231 0.16
232 0.16
233 0.13
234 0.12
235 0.11
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.12
240 0.16
241 0.18
242 0.2
243 0.21
244 0.25
245 0.25
246 0.24
247 0.27
248 0.26
249 0.28
250 0.29
251 0.28
252 0.25
253 0.26
254 0.27
255 0.22
256 0.2
257 0.16
258 0.18
259 0.21
260 0.2
261 0.18
262 0.2
263 0.22
264 0.24
265 0.27
266 0.25
267 0.26
268 0.36
269 0.39
270 0.38
271 0.4
272 0.4
273 0.37
274 0.4
275 0.38
276 0.34
277 0.32
278 0.36
279 0.37
280 0.36
281 0.35
282 0.29
283 0.27
284 0.2
285 0.19
286 0.14
287 0.09
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.07
292 0.06
293 0.06
294 0.07
295 0.08
296 0.08
297 0.09
298 0.11
299 0.1
300 0.11
301 0.14
302 0.13
303 0.14
304 0.13
305 0.12
306 0.1
307 0.11
308 0.1
309 0.07
310 0.08
311 0.08
312 0.12
313 0.12
314 0.13
315 0.15
316 0.17
317 0.2
318 0.2
319 0.25
320 0.27
321 0.33
322 0.34
323 0.33
324 0.32
325 0.31
326 0.32
327 0.27
328 0.25
329 0.2
330 0.2
331 0.19
332 0.18
333 0.16
334 0.16
335 0.15
336 0.12
337 0.1
338 0.1
339 0.09
340 0.09
341 0.09
342 0.1
343 0.11
344 0.11
345 0.14
346 0.13
347 0.13
348 0.15
349 0.17
350 0.21
351 0.21
352 0.2
353 0.18
354 0.19
355 0.23
356 0.25
357 0.28
358 0.27
359 0.35
360 0.44
361 0.43
362 0.44
363 0.41
364 0.43
365 0.48
366 0.48
367 0.49
368 0.45
369 0.47
370 0.49
371 0.5
372 0.49
373 0.42
374 0.37
375 0.32
376 0.29
377 0.29
378 0.26
379 0.28
380 0.24
381 0.27
382 0.27
383 0.23
384 0.23
385 0.26
386 0.28
387 0.27
388 0.3
389 0.27
390 0.29
391 0.33
392 0.31
393 0.27
394 0.25
395 0.26
396 0.25
397 0.24
398 0.28
399 0.26
400 0.28
401 0.29
402 0.3
403 0.25
404 0.27
405 0.26
406 0.2
407 0.26
408 0.25
409 0.24
410 0.25
411 0.25
412 0.21
413 0.2
414 0.19
415 0.17
416 0.18
417 0.19
418 0.18
419 0.2
420 0.21
421 0.22
422 0.27
423 0.27
424 0.28
425 0.37