FuNGI

Q6FWB9

Protein Details

Accession

Q6FWB9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
424-445	NSMSLQRRRRSSNKAKRPSMSE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
432-438	RRSSNKA

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019680 Mediator_Med1
Gene Ontology	GO:0070847 C:core mediator complex GO:0016592 C:mediator complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity GO:0000122 P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0060261 P:positive regulation of transcription initiation by RNA polymerase II GO:0051123 P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly
KEGG	cgr:CAGL0D01386g -
Pfam	View protein in Pfam PF10744 Med1

Amino Acid Sequences

MADQYVEVLGDLIGLLKDYKPGTITIENITKLCQSMGLESFIDELDNDISRLSTASKIIVIDIDYNKTQSTVQDVKLVLASNFDNFDYSNEQLEEAGDKQSNILLNSLTNYDSLKQFHHNLEFLYLLDTYSSVESDNQISSGNNLGSGNGTNGSSLTNKTDKKSVSSGNGLDSKLNEGKLNLFKYFRELKKYINTFFKESCDNRFKVVANVDNRFGLYIYETHGYSMRSRPLAKVYFERAKVPQQRFYEYIYSSETGSWINENSENYSVGVNLILEVNFDDTDEDVFWFPKEFVPTDLFIDEKDQLTSRKVSDVLCHAFYELGSSKKQTIELMNDFTTDLIQIRRFNINNDNLDLIADILNWTIWYRTVLRPIYLKLVSSISDDDDQHIRADIANTKDEFTVENTNPEIMKGPTNKNASFMQRNSMSLQRRRRSSNKAKRPSMSEAVVFKDEGLQQFSLHEIMADTTTEPDQKPDNLNISNNSESFIGQQELMEGSNIINDDKMDIDEEAINDDDSDSQSGEEGNIPVLLVNEDHVSFKGLGSCSFYDDKDKWAKFVEDLFNVFS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.06
2	0.07
3	0.07
4	0.11
5	0.12
6	0.13
7	0.14
8	0.15
9	0.21
10	0.23
11	0.25
12	0.27
13	0.32
14	0.33
15	0.32
16	0.32
17	0.27
18	0.25
19	0.22
20	0.19
21	0.14
22	0.18
23	0.2
24	0.21
25	0.2
26	0.19
27	0.2
28	0.17
29	0.16
30	0.11
31	0.1
32	0.1
33	0.1
34	0.1
35	0.09
36	0.09
37	0.09
38	0.1
39	0.1
40	0.11
41	0.11
42	0.12
43	0.14
44	0.14
45	0.14
46	0.15
47	0.14
48	0.17
49	0.19
50	0.22
51	0.21
52	0.21
53	0.21
54	0.21
55	0.2
56	0.16
57	0.22
58	0.23
59	0.24
60	0.29
61	0.29
62	0.29
63	0.3
64	0.31
65	0.22
66	0.19
67	0.18
68	0.14
69	0.15
70	0.14
71	0.13
72	0.12
73	0.15
74	0.17
75	0.17
76	0.19
77	0.17
78	0.18
79	0.17
80	0.17
81	0.17
82	0.13
83	0.16
84	0.13
85	0.13
86	0.13
87	0.15
88	0.17
89	0.15
90	0.15
91	0.12
92	0.12
93	0.13
94	0.14
95	0.13
96	0.11
97	0.12
98	0.13
99	0.15
100	0.16
101	0.18
102	0.21
103	0.25
104	0.29
105	0.32
106	0.31
107	0.29
108	0.29
109	0.27
110	0.22
111	0.19
112	0.15
113	0.1
114	0.09
115	0.09
116	0.08
117	0.08
118	0.08
119	0.07
120	0.07
121	0.09
122	0.1
123	0.11
124	0.1
125	0.1
126	0.1
127	0.11
128	0.13
129	0.12
130	0.11
131	0.11
132	0.11
133	0.11
134	0.11
135	0.11
136	0.09
137	0.09
138	0.08
139	0.08
140	0.09
141	0.09
142	0.1
143	0.14
144	0.2
145	0.22
146	0.24
147	0.3
148	0.3
149	0.33
150	0.37
151	0.37
152	0.34
153	0.37
154	0.36
155	0.35
156	0.38
157	0.34
158	0.29
159	0.25
160	0.25
161	0.23
162	0.23
163	0.18
164	0.15
165	0.2
166	0.25
167	0.27
168	0.25
169	0.24
170	0.23
171	0.29
172	0.37
173	0.35
174	0.37
175	0.36
176	0.39
177	0.47
178	0.52
179	0.51
180	0.51
181	0.51
182	0.47
183	0.46
184	0.44
185	0.42
186	0.38
187	0.41
188	0.4
189	0.37
190	0.35
191	0.37
192	0.35
193	0.32
194	0.34
195	0.33
196	0.3
197	0.32
198	0.31
199	0.28
200	0.27
201	0.23
202	0.19
203	0.13
204	0.09
205	0.07
206	0.09
207	0.1
208	0.1
209	0.1
210	0.12
211	0.13
212	0.14
213	0.17
214	0.18
215	0.2
216	0.21
217	0.22
218	0.27
219	0.29
220	0.29
221	0.3
222	0.34
223	0.37
224	0.37
225	0.38
226	0.34
227	0.4
228	0.46
229	0.45
230	0.46
231	0.42
232	0.45
233	0.44
234	0.45
235	0.4
236	0.32
237	0.3
238	0.24
239	0.22
240	0.19
241	0.17
242	0.14
243	0.1
244	0.1
245	0.09
246	0.07
247	0.08
248	0.09
249	0.09
250	0.11
251	0.11
252	0.11
253	0.11
254	0.11
255	0.1
256	0.08
257	0.07
258	0.05
259	0.05
260	0.05
261	0.04
262	0.04
263	0.04
264	0.05
265	0.04
266	0.05
267	0.04
268	0.04
269	0.05
270	0.05
271	0.06
272	0.05
273	0.06
274	0.06
275	0.06
276	0.06
277	0.08
278	0.09
279	0.09
280	0.11
281	0.13
282	0.13
283	0.14
284	0.14
285	0.12
286	0.11
287	0.12
288	0.11
289	0.1
290	0.09
291	0.09
292	0.1
293	0.12
294	0.14
295	0.13
296	0.14
297	0.15
298	0.14
299	0.16
300	0.2
301	0.21
302	0.2
303	0.19
304	0.18
305	0.16
306	0.16
307	0.17
308	0.13
309	0.12
310	0.12
311	0.13
312	0.15
313	0.15
314	0.16
315	0.15
316	0.15
317	0.19
318	0.21
319	0.23
320	0.22
321	0.22
322	0.21
323	0.19
324	0.16
325	0.11
326	0.09
327	0.08
328	0.1
329	0.11
330	0.13
331	0.19
332	0.19
333	0.22
334	0.28
335	0.32
336	0.32
337	0.32
338	0.3
339	0.24
340	0.24
341	0.21
342	0.14
343	0.08
344	0.06
345	0.05
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.04
351	0.05
352	0.07
353	0.1
354	0.12
355	0.2
356	0.21
357	0.23
358	0.25
359	0.26
360	0.3
361	0.27
362	0.25
363	0.19
364	0.19
365	0.18
366	0.18
367	0.17
368	0.13
369	0.15
370	0.15
371	0.16
372	0.16
373	0.16
374	0.15
375	0.14
376	0.12
377	0.11
378	0.13
379	0.15
380	0.16
381	0.19
382	0.19
383	0.2
384	0.2
385	0.2
386	0.18
387	0.17
388	0.22
389	0.19
390	0.21
391	0.2
392	0.21
393	0.21
394	0.2
395	0.19
396	0.13
397	0.18
398	0.21
399	0.25
400	0.32
401	0.37
402	0.37
403	0.38
404	0.41
405	0.42
406	0.44
407	0.41
408	0.4
409	0.37
410	0.38
411	0.38
412	0.41
413	0.43
414	0.44
415	0.53
416	0.53
417	0.58
418	0.64
419	0.69
420	0.72
421	0.76
422	0.78
423	0.79
424	0.82
425	0.84
426	0.81
427	0.79
428	0.76
429	0.71
430	0.62
431	0.56
432	0.48
433	0.43
434	0.4
435	0.33
436	0.26
437	0.23
438	0.23
439	0.2
440	0.2
441	0.17
442	0.16
443	0.16
444	0.18
445	0.14
446	0.12
447	0.1
448	0.07
449	0.08
450	0.08
451	0.08
452	0.08
453	0.09
454	0.11
455	0.14
456	0.13
457	0.15
458	0.18
459	0.21
460	0.25
461	0.28
462	0.33
463	0.33
464	0.36
465	0.38
466	0.41
467	0.4
468	0.36
469	0.32
470	0.26
471	0.23
472	0.22
473	0.2
474	0.16
475	0.13
476	0.13
477	0.12
478	0.13
479	0.13
480	0.11
481	0.09
482	0.07
483	0.09
484	0.09
485	0.08
486	0.08
487	0.08
488	0.09
489	0.09
490	0.1
491	0.1
492	0.09
493	0.11
494	0.12
495	0.12
496	0.14
497	0.14
498	0.13
499	0.11
500	0.12
501	0.11
502	0.11
503	0.12
504	0.1
505	0.09
506	0.1
507	0.1
508	0.1
509	0.12
510	0.11
511	0.1
512	0.1
513	0.1
514	0.1
515	0.1
516	0.1
517	0.08
518	0.09
519	0.1
520	0.1
521	0.12
522	0.12
523	0.14
524	0.14
525	0.15
526	0.19
527	0.18
528	0.19
529	0.23
530	0.23
531	0.25
532	0.27
533	0.28
534	0.3
535	0.3
536	0.37
537	0.41
538	0.41
539	0.39
540	0.42
541	0.43
542	0.38
543	0.45
544	0.44
545	0.38

Q6FWB9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer