Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FTI2

Protein Details
Accession Q6FTI2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-41FYKTLKRFAERNKGDKFRKSCHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011709  DEAD-box_helicase_OB_fold  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR007502  Helicase-assoc_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0071007  C:U2-type catalytic step 2 spliceosome  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0008186  F:ATP-dependent activity, acting on RNA  
GO:0004386  F:helicase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000386  F:second spliceosomal transesterification activity  
GO:0000350  P:generation of catalytic spliceosome for second transesterification step  
GO:0000378  P:RNA exon ligation  
GO:0040031  P:snRNA modification  
KEGG cgr:CAGL0G02299g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF04408  HA2  
PF00271  Helicase_C  
PF07717  OB_NTP_bind  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18791  SF2_C_RHA  
Amino Acid Sequences MEDVTSWLESRGITEKLTTNFYKTLKRFAERNKGDKFRKSCVSLGKFKGQDNHFFDELKQLLLEGAGSTDTLANTGFVAKDSSLNVMKRSRNDEAPDDEEDLQLHTPVIQKDVLLRNSYNNNDATSCSFRPIEEKGEGQVTGEEDGDEEDQEDQEVLSSAISEVSEDEDMQWYNYDDDYGNTVVDEDALFNVQTGNISVTSETPRETINSLVDLTPFSVSTRKNWLPYFLNKCSEQYDLDSSVLLGSFSESSHDGLVNPFKNPEGQFALNARKGSRSVAMKRNQNDSAEKAKESTNLSGTSLGEALGLNKDSNILDNSRKTNKNIDKQTATEDVDKTRKSLPIYKARANVLQMIRDNQVSILIGETGSGKTTQLAQYLYEDGYTRDGGLIACTQPRRVAAMSVAKRVAQEMDKKVGDLVGYSIRFEDKTGPSTKIKFMTDGILLRETLIDENLEKYKVIIIDEAHERSLNTDVLLGLLKNLVKRRRDIKIIITSATLDANKFSQFFGGLPQYKVPGKTYPVQVMHTSGTVPDYVEAAVSQAVRIHLTTAIQSGDILIFMTGQEDILCCIELIKERIVDLYGKKYGINTFDKVDDVELFPIYSALPAEIQNRIFLDLDIGKRKIVVSTNIAETSLTISGIRYVIDCGYSKLKVYNPKIGLDSLAIAPISIANANQRSGRAGRTAPGIAYRLYSEETELTDMYQQTIPEIKRTNLSNIVLTLKSLGIKNVVDFPFLDPPSIETLMASMYELWFLGVLNDDGELNALGKKMVNFPLQPTLSKVLIQSISFGCSKEVVTIVAMLSVPQVFERPKERQKEADEARKRFFISESDHLTLMNVYDQWKSAKYSPKWCKKNFVLYKSLIRAREIRTQIVSLLKQQKHKLKSAGSDLSIIRKCICSGFAQQAAKASGLTKYVHLRTGMELRVHPTSSLYGLPNLPPYVIYHEMLLTEQEYICCVTSVDPLWLADYGSLLYDVQLLKSITNDNLLLDDVSSRDDYDFTEIKKAEAKVSYIVSERMQRIKQIKQVYSDQDAFQVKNQPIKSVISKGNSKSLFKRRRPL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.26
3 0.28
4 0.35
5 0.33
6 0.33
7 0.37
8 0.41
9 0.47
10 0.44
11 0.51
12 0.52
13 0.56
14 0.59
15 0.63
16 0.71
17 0.69
18 0.76
19 0.76
20 0.79
21 0.81
22 0.82
23 0.78
24 0.75
25 0.75
26 0.71
27 0.67
28 0.68
29 0.68
30 0.68
31 0.68
32 0.69
33 0.65
34 0.64
35 0.66
36 0.6
37 0.62
38 0.59
39 0.59
40 0.51
41 0.48
42 0.44
43 0.44
44 0.4
45 0.31
46 0.25
47 0.18
48 0.17
49 0.16
50 0.16
51 0.07
52 0.07
53 0.06
54 0.06
55 0.07
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.07
61 0.07
62 0.09
63 0.09
64 0.08
65 0.1
66 0.1
67 0.12
68 0.13
69 0.18
70 0.23
71 0.24
72 0.29
73 0.34
74 0.39
75 0.43
76 0.49
77 0.5
78 0.51
79 0.54
80 0.55
81 0.54
82 0.53
83 0.5
84 0.46
85 0.42
86 0.35
87 0.3
88 0.26
89 0.2
90 0.16
91 0.13
92 0.11
93 0.15
94 0.15
95 0.18
96 0.16
97 0.16
98 0.23
99 0.31
100 0.33
101 0.32
102 0.32
103 0.36
104 0.42
105 0.45
106 0.42
107 0.35
108 0.33
109 0.3
110 0.31
111 0.31
112 0.3
113 0.28
114 0.28
115 0.27
116 0.25
117 0.29
118 0.3
119 0.3
120 0.27
121 0.28
122 0.26
123 0.29
124 0.28
125 0.25
126 0.23
127 0.18
128 0.16
129 0.15
130 0.12
131 0.09
132 0.11
133 0.11
134 0.09
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.06
141 0.06
142 0.07
143 0.06
144 0.05
145 0.06
146 0.05
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.08
152 0.09
153 0.08
154 0.09
155 0.11
156 0.11
157 0.12
158 0.12
159 0.11
160 0.12
161 0.11
162 0.12
163 0.1
164 0.11
165 0.13
166 0.13
167 0.12
168 0.1
169 0.11
170 0.09
171 0.09
172 0.08
173 0.06
174 0.06
175 0.07
176 0.07
177 0.06
178 0.07
179 0.06
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.07
184 0.08
185 0.08
186 0.1
187 0.14
188 0.14
189 0.15
190 0.14
191 0.14
192 0.16
193 0.17
194 0.17
195 0.15
196 0.16
197 0.16
198 0.16
199 0.15
200 0.14
201 0.14
202 0.12
203 0.11
204 0.1
205 0.14
206 0.14
207 0.18
208 0.27
209 0.29
210 0.34
211 0.35
212 0.4
213 0.4
214 0.49
215 0.54
216 0.5
217 0.52
218 0.47
219 0.48
220 0.45
221 0.41
222 0.33
223 0.28
224 0.27
225 0.24
226 0.23
227 0.21
228 0.18
229 0.17
230 0.15
231 0.11
232 0.07
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.08
237 0.08
238 0.09
239 0.1
240 0.1
241 0.09
242 0.12
243 0.19
244 0.19
245 0.19
246 0.19
247 0.18
248 0.23
249 0.23
250 0.24
251 0.23
252 0.23
253 0.25
254 0.29
255 0.35
256 0.34
257 0.34
258 0.31
259 0.27
260 0.27
261 0.27
262 0.28
263 0.29
264 0.34
265 0.42
266 0.48
267 0.54
268 0.57
269 0.61
270 0.58
271 0.54
272 0.5
273 0.46
274 0.47
275 0.42
276 0.39
277 0.33
278 0.32
279 0.32
280 0.31
281 0.29
282 0.24
283 0.22
284 0.22
285 0.23
286 0.21
287 0.18
288 0.15
289 0.12
290 0.09
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.07
296 0.07
297 0.09
298 0.08
299 0.1
300 0.11
301 0.13
302 0.16
303 0.21
304 0.27
305 0.34
306 0.37
307 0.38
308 0.46
309 0.52
310 0.57
311 0.61
312 0.62
313 0.58
314 0.56
315 0.58
316 0.53
317 0.46
318 0.41
319 0.34
320 0.32
321 0.34
322 0.33
323 0.31
324 0.29
325 0.3
326 0.3
327 0.36
328 0.4
329 0.44
330 0.5
331 0.54
332 0.55
333 0.54
334 0.54
335 0.47
336 0.45
337 0.37
338 0.34
339 0.3
340 0.28
341 0.27
342 0.24
343 0.23
344 0.16
345 0.15
346 0.11
347 0.09
348 0.07
349 0.06
350 0.05
351 0.06
352 0.07
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.09
359 0.1
360 0.12
361 0.12
362 0.12
363 0.14
364 0.15
365 0.15
366 0.12
367 0.11
368 0.1
369 0.11
370 0.11
371 0.09
372 0.08
373 0.08
374 0.07
375 0.08
376 0.09
377 0.08
378 0.12
379 0.12
380 0.13
381 0.14
382 0.14
383 0.16
384 0.15
385 0.15
386 0.15
387 0.24
388 0.26
389 0.28
390 0.28
391 0.26
392 0.26
393 0.25
394 0.23
395 0.18
396 0.22
397 0.22
398 0.27
399 0.27
400 0.27
401 0.26
402 0.24
403 0.2
404 0.14
405 0.12
406 0.11
407 0.11
408 0.11
409 0.12
410 0.12
411 0.12
412 0.12
413 0.16
414 0.13
415 0.18
416 0.2
417 0.24
418 0.26
419 0.29
420 0.31
421 0.3
422 0.29
423 0.25
424 0.24
425 0.22
426 0.22
427 0.21
428 0.19
429 0.16
430 0.15
431 0.14
432 0.13
433 0.11
434 0.09
435 0.07
436 0.06
437 0.05
438 0.08
439 0.09
440 0.09
441 0.08
442 0.08
443 0.1
444 0.1
445 0.1
446 0.1
447 0.09
448 0.11
449 0.15
450 0.15
451 0.14
452 0.13
453 0.13
454 0.12
455 0.14
456 0.11
457 0.08
458 0.08
459 0.07
460 0.08
461 0.08
462 0.07
463 0.05
464 0.06
465 0.07
466 0.09
467 0.14
468 0.2
469 0.21
470 0.26
471 0.31
472 0.35
473 0.39
474 0.39
475 0.42
476 0.44
477 0.44
478 0.4
479 0.35
480 0.31
481 0.26
482 0.24
483 0.17
484 0.09
485 0.08
486 0.08
487 0.08
488 0.08
489 0.08
490 0.07
491 0.07
492 0.07
493 0.09
494 0.14
495 0.15
496 0.15
497 0.15
498 0.17
499 0.18
500 0.19
501 0.18
502 0.15
503 0.17
504 0.2
505 0.23
506 0.26
507 0.26
508 0.27
509 0.26
510 0.25
511 0.23
512 0.18
513 0.16
514 0.1
515 0.09
516 0.08
517 0.07
518 0.05
519 0.05
520 0.05
521 0.05
522 0.04
523 0.04
524 0.05
525 0.05
526 0.05
527 0.05
528 0.06
529 0.06
530 0.06
531 0.06
532 0.06
533 0.06
534 0.07
535 0.07
536 0.07
537 0.06
538 0.06
539 0.06
540 0.05
541 0.05
542 0.04
543 0.03
544 0.03
545 0.03
546 0.03
547 0.03
548 0.03
549 0.03
550 0.03
551 0.04
552 0.04
553 0.04
554 0.04
555 0.04
556 0.05
557 0.07
558 0.09
559 0.09
560 0.09
561 0.09
562 0.09
563 0.1
564 0.12
565 0.11
566 0.14
567 0.14
568 0.15
569 0.15
570 0.16
571 0.17
572 0.2
573 0.22
574 0.19
575 0.19
576 0.19
577 0.19
578 0.18
579 0.17
580 0.13
581 0.1
582 0.09
583 0.08
584 0.07
585 0.07
586 0.07
587 0.06
588 0.05
589 0.04
590 0.04
591 0.05
592 0.06
593 0.08
594 0.1
595 0.1
596 0.11
597 0.11
598 0.13
599 0.12
600 0.1
601 0.11
602 0.12
603 0.15
604 0.18
605 0.18
606 0.17
607 0.17
608 0.17
609 0.17
610 0.17
611 0.17
612 0.16
613 0.18
614 0.2
615 0.2
616 0.2
617 0.17
618 0.15
619 0.14
620 0.1
621 0.08
622 0.06
623 0.06
624 0.07
625 0.07
626 0.07
627 0.06
628 0.06
629 0.06
630 0.08
631 0.08
632 0.09
633 0.12
634 0.12
635 0.13
636 0.15
637 0.19
638 0.26
639 0.3
640 0.36
641 0.35
642 0.37
643 0.38
644 0.35
645 0.32
646 0.23
647 0.2
648 0.12
649 0.11
650 0.08
651 0.07
652 0.06
653 0.06
654 0.06
655 0.04
656 0.05
657 0.07
658 0.09
659 0.1
660 0.11
661 0.12
662 0.14
663 0.15
664 0.17
665 0.16
666 0.16
667 0.17
668 0.19
669 0.19
670 0.17
671 0.18
672 0.17
673 0.14
674 0.14
675 0.13
676 0.11
677 0.12
678 0.12
679 0.11
680 0.1
681 0.11
682 0.11
683 0.11
684 0.1
685 0.11
686 0.11
687 0.12
688 0.13
689 0.12
690 0.11
691 0.17
692 0.17
693 0.2
694 0.22
695 0.21
696 0.24
697 0.26
698 0.29
699 0.29
700 0.3
701 0.25
702 0.24
703 0.27
704 0.22
705 0.2
706 0.17
707 0.12
708 0.13
709 0.12
710 0.11
711 0.11
712 0.11
713 0.12
714 0.19
715 0.18
716 0.17
717 0.17
718 0.19
719 0.24
720 0.24
721 0.23
722 0.16
723 0.17
724 0.21
725 0.21
726 0.18
727 0.11
728 0.11
729 0.11
730 0.11
731 0.09
732 0.05
733 0.05
734 0.05
735 0.05
736 0.04
737 0.04
738 0.04
739 0.04
740 0.05
741 0.05
742 0.05
743 0.05
744 0.05
745 0.05
746 0.06
747 0.05
748 0.05
749 0.06
750 0.06
751 0.06
752 0.07
753 0.08
754 0.12
755 0.17
756 0.2
757 0.2
758 0.22
759 0.3
760 0.31
761 0.3
762 0.3
763 0.29
764 0.26
765 0.26
766 0.24
767 0.2
768 0.21
769 0.2
770 0.2
771 0.16
772 0.18
773 0.18
774 0.18
775 0.14
776 0.13
777 0.13
778 0.11
779 0.11
780 0.09
781 0.09
782 0.09
783 0.09
784 0.08
785 0.08
786 0.07
787 0.07
788 0.07
789 0.06
790 0.06
791 0.09
792 0.09
793 0.13
794 0.19
795 0.26
796 0.34
797 0.42
798 0.45
799 0.5
800 0.54
801 0.61
802 0.63
803 0.66
804 0.67
805 0.65
806 0.64
807 0.6
808 0.56
809 0.47
810 0.4
811 0.34
812 0.32
813 0.34
814 0.37
815 0.36
816 0.35
817 0.33
818 0.32
819 0.27
820 0.21
821 0.15
822 0.1
823 0.1
824 0.1
825 0.12
826 0.14
827 0.15
828 0.18
829 0.23
830 0.32
831 0.37
832 0.47
833 0.56
834 0.65
835 0.73
836 0.73
837 0.77
838 0.74
839 0.8
840 0.78
841 0.74
842 0.71
843 0.66
844 0.69
845 0.67
846 0.65
847 0.55
848 0.49
849 0.48
850 0.46
851 0.51
852 0.46
853 0.42
854 0.39
855 0.38
856 0.38
857 0.38
858 0.34
859 0.34
860 0.4
861 0.41
862 0.46
863 0.53
864 0.59
865 0.59
866 0.64
867 0.63
868 0.59
869 0.61
870 0.62
871 0.6
872 0.52
873 0.51
874 0.45
875 0.46
876 0.42
877 0.37
878 0.3
879 0.26
880 0.25
881 0.23
882 0.23
883 0.19
884 0.22
885 0.28
886 0.33
887 0.33
888 0.33
889 0.36
890 0.35
891 0.32
892 0.27
893 0.21
894 0.16
895 0.17
896 0.17
897 0.17
898 0.23
899 0.25
900 0.27
901 0.28
902 0.27
903 0.29
904 0.34
905 0.34
906 0.31
907 0.3
908 0.31
909 0.33
910 0.33
911 0.28
912 0.23
913 0.21
914 0.2
915 0.22
916 0.19
917 0.19
918 0.2
919 0.21
920 0.24
921 0.22
922 0.2
923 0.18
924 0.18
925 0.22
926 0.24
927 0.23
928 0.19
929 0.19
930 0.2
931 0.2
932 0.19
933 0.12
934 0.11
935 0.11
936 0.1
937 0.1
938 0.11
939 0.11
940 0.1
941 0.1
942 0.1
943 0.13
944 0.14
945 0.15
946 0.15
947 0.15
948 0.16
949 0.16
950 0.15
951 0.11
952 0.1
953 0.08
954 0.08
955 0.08
956 0.07
957 0.07
958 0.1
959 0.1
960 0.1
961 0.14
962 0.14
963 0.13
964 0.15
965 0.18
966 0.16
967 0.19
968 0.19
969 0.15
970 0.16
971 0.16
972 0.15
973 0.12
974 0.12
975 0.09
976 0.11
977 0.12
978 0.11
979 0.11
980 0.12
981 0.13
982 0.18
983 0.22
984 0.21
985 0.28
986 0.28
987 0.29
988 0.34
989 0.34
990 0.33
991 0.33
992 0.33
993 0.3
994 0.32
995 0.33
996 0.29
997 0.3
998 0.28
999 0.33
1000 0.35
1001 0.39
1002 0.38
1003 0.43
1004 0.48
1005 0.53
1006 0.57
1007 0.59
1008 0.59
1009 0.57
1010 0.63
1011 0.62
1012 0.63
1013 0.58
1014 0.51
1015 0.49
1016 0.48
1017 0.43
1018 0.39
1019 0.42
1020 0.37
1021 0.41
1022 0.41
1023 0.38
1024 0.37
1025 0.41
1026 0.42
1027 0.42
1028 0.46
1029 0.45
1030 0.52
1031 0.52
1032 0.59
1033 0.58
1034 0.58
1035 0.6
1036 0.64
1037 0.68