Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FNL9

Protein Details
Accession Q6FNL9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-58KRNTGFIKKLRKGFTKENKPSLIKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR003890  MIF4G-like_typ-3  
IPR039762  Nmd2/UPF2  
IPR007193  Upf2/Nmd2_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005844  C:polysome  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0070478  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, 3'-5' exonucleolytic nonsense-mediated decay  
KEGG cgr:CAGL0J10670g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02854  MIF4G  
PF04050  Upf2  
Amino Acid Sequences MNDERRNELYLLNSKAWLGEDVYPLKTMKLDSSIKRNTGFIKKLRKGFTKENKPSLIKDLGEVSFQKYLSEIVSTTNEALTNVQSKNEEVETAVEVVSGLHQRFNVAFTEPLSLAFLQNFNFKNIDPTITKDEMAFSAKLKNNLRVFTELYLVNVFANLDEMTDKELPSFLMKKGQKKEPILLSILKEALNYNFKTGHSSIVAIYFAKKFPEFFSTDDQSTQSVPLNKDIKESVVSIYRLFFGALSTNASKLQTQVNKLIKEHHKCQIRTGKASDEYLEKYEEISPIFERFKSSTLFLSQYLDVEAPQFEIIDINGSQHEQKEDIITNKILPPSQRLWENDETRKLYEVLPDISDIVKEHSQSNKDPKPETLNSFFTELQNIESKGHLDDLVRKYWSLNLNNKATRNRIIKFFIETVDWSKISLYARFFAINAPYMKETVDEFIQYLDNGFRSQLHNTKFNIKNVIFFGEMVKFSLIPQFMVFHKIRTLIINMNITNNVEILTILFENCGKFLLNKAEYKDEMDKLVDRLKSRRTDHSLNMNTKASIEMLLRILFPPSTKSLNTEVVQLTPEENFYTVLLRSELGNIGFKDTVRLIRKAHWKDPNTEKLFFTLFTEPEKVSYQNIPILTQVLSGLYSFNRNFAIMCIDQVLENIENGLESNTYAENTSRIANIRYLVEIFNYEMMKSNVLMDTMHHIVKYGHPNGQPNPFKLNPNDLPNNYFRIHLIVTILSNIRRTPSSLTSSLQLLLRFFEYYIFTKEFPLPKETEYAVNNLFEKLSTLIEKKDKTKFTRSANLLESLQKFQEYLVLTKRSTTENQKGTDTSTLKTDLLEDGPAQDLDDDIGQENDEGLEMIEEFEIIEDDGESYEENNLDTEVNTGSISSDESGTDLESDSELESADEDDSDDSMDSDSDSESDSDSGSEDEEDEFDAVLDGEDTPFRNYEDERESEQQRIFDEYKKQLQTEEEIKAQAELDKQFDLMMSESLEARKSETSTNDRGLLMVHPSGTKLKDSLNEFNTPEKRPKEKVAFAFLTKTGRKTQSRVVNLSRDIKFVSNVVEEGKKLETEREKIKNIVLNRQFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.31
3 0.31
4 0.25
5 0.2
6 0.19
7 0.23
8 0.26
9 0.27
10 0.28
11 0.27
12 0.26
13 0.25
14 0.22
15 0.19
16 0.24
17 0.31
18 0.35
19 0.44
20 0.51
21 0.54
22 0.54
23 0.54
24 0.54
25 0.56
26 0.58
27 0.57
28 0.61
29 0.64
30 0.71
31 0.76
32 0.77
33 0.75
34 0.78
35 0.8
36 0.8
37 0.82
38 0.83
39 0.83
40 0.78
41 0.73
42 0.69
43 0.64
44 0.53
45 0.46
46 0.43
47 0.35
48 0.35
49 0.33
50 0.3
51 0.27
52 0.26
53 0.24
54 0.19
55 0.19
56 0.17
57 0.17
58 0.14
59 0.13
60 0.16
61 0.18
62 0.18
63 0.18
64 0.17
65 0.16
66 0.17
67 0.17
68 0.2
69 0.19
70 0.21
71 0.21
72 0.21
73 0.24
74 0.24
75 0.21
76 0.16
77 0.17
78 0.16
79 0.16
80 0.15
81 0.11
82 0.1
83 0.1
84 0.12
85 0.14
86 0.13
87 0.14
88 0.14
89 0.16
90 0.17
91 0.18
92 0.17
93 0.15
94 0.16
95 0.15
96 0.19
97 0.18
98 0.18
99 0.19
100 0.17
101 0.16
102 0.16
103 0.17
104 0.14
105 0.2
106 0.21
107 0.21
108 0.22
109 0.21
110 0.25
111 0.25
112 0.29
113 0.24
114 0.28
115 0.33
116 0.33
117 0.34
118 0.28
119 0.29
120 0.26
121 0.28
122 0.23
123 0.17
124 0.25
125 0.28
126 0.35
127 0.38
128 0.44
129 0.45
130 0.48
131 0.5
132 0.45
133 0.44
134 0.37
135 0.37
136 0.28
137 0.25
138 0.23
139 0.19
140 0.15
141 0.13
142 0.11
143 0.07
144 0.09
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.12
150 0.13
151 0.13
152 0.12
153 0.12
154 0.13
155 0.17
156 0.2
157 0.17
158 0.25
159 0.3
160 0.39
161 0.46
162 0.54
163 0.58
164 0.6
165 0.66
166 0.63
167 0.62
168 0.57
169 0.53
170 0.46
171 0.41
172 0.37
173 0.3
174 0.24
175 0.21
176 0.22
177 0.25
178 0.23
179 0.22
180 0.23
181 0.23
182 0.29
183 0.28
184 0.27
185 0.22
186 0.22
187 0.2
188 0.19
189 0.2
190 0.15
191 0.17
192 0.15
193 0.15
194 0.17
195 0.17
196 0.16
197 0.18
198 0.23
199 0.23
200 0.24
201 0.3
202 0.32
203 0.33
204 0.33
205 0.31
206 0.27
207 0.25
208 0.24
209 0.21
210 0.22
211 0.22
212 0.29
213 0.32
214 0.31
215 0.33
216 0.33
217 0.3
218 0.26
219 0.26
220 0.21
221 0.22
222 0.22
223 0.2
224 0.2
225 0.19
226 0.17
227 0.16
228 0.14
229 0.09
230 0.1
231 0.1
232 0.13
233 0.13
234 0.14
235 0.15
236 0.16
237 0.15
238 0.15
239 0.22
240 0.23
241 0.26
242 0.34
243 0.4
244 0.42
245 0.42
246 0.5
247 0.51
248 0.54
249 0.56
250 0.55
251 0.57
252 0.55
253 0.64
254 0.64
255 0.61
256 0.59
257 0.57
258 0.55
259 0.49
260 0.5
261 0.42
262 0.36
263 0.32
264 0.28
265 0.27
266 0.2
267 0.18
268 0.19
269 0.18
270 0.15
271 0.15
272 0.14
273 0.17
274 0.18
275 0.17
276 0.19
277 0.19
278 0.21
279 0.21
280 0.21
281 0.19
282 0.21
283 0.23
284 0.2
285 0.22
286 0.19
287 0.18
288 0.17
289 0.15
290 0.12
291 0.11
292 0.1
293 0.08
294 0.08
295 0.07
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.08
303 0.09
304 0.1
305 0.11
306 0.12
307 0.1
308 0.11
309 0.13
310 0.16
311 0.17
312 0.19
313 0.19
314 0.2
315 0.22
316 0.23
317 0.21
318 0.19
319 0.22
320 0.22
321 0.26
322 0.29
323 0.28
324 0.34
325 0.4
326 0.46
327 0.46
328 0.49
329 0.48
330 0.43
331 0.43
332 0.37
333 0.3
334 0.27
335 0.24
336 0.2
337 0.18
338 0.17
339 0.16
340 0.15
341 0.14
342 0.11
343 0.12
344 0.12
345 0.12
346 0.15
347 0.19
348 0.23
349 0.28
350 0.37
351 0.38
352 0.41
353 0.42
354 0.41
355 0.45
356 0.46
357 0.46
358 0.42
359 0.4
360 0.37
361 0.39
362 0.37
363 0.29
364 0.26
365 0.21
366 0.18
367 0.18
368 0.17
369 0.14
370 0.14
371 0.14
372 0.13
373 0.13
374 0.12
375 0.1
376 0.17
377 0.19
378 0.22
379 0.22
380 0.22
381 0.21
382 0.25
383 0.31
384 0.3
385 0.35
386 0.39
387 0.45
388 0.49
389 0.52
390 0.51
391 0.48
392 0.48
393 0.46
394 0.42
395 0.4
396 0.4
397 0.37
398 0.37
399 0.35
400 0.28
401 0.23
402 0.23
403 0.21
404 0.2
405 0.19
406 0.15
407 0.14
408 0.16
409 0.16
410 0.18
411 0.15
412 0.14
413 0.15
414 0.15
415 0.15
416 0.14
417 0.14
418 0.15
419 0.14
420 0.15
421 0.14
422 0.14
423 0.14
424 0.13
425 0.12
426 0.1
427 0.1
428 0.08
429 0.08
430 0.08
431 0.09
432 0.08
433 0.08
434 0.07
435 0.07
436 0.07
437 0.07
438 0.08
439 0.1
440 0.13
441 0.19
442 0.21
443 0.25
444 0.27
445 0.36
446 0.39
447 0.39
448 0.43
449 0.37
450 0.37
451 0.33
452 0.34
453 0.25
454 0.21
455 0.2
456 0.14
457 0.14
458 0.12
459 0.11
460 0.09
461 0.08
462 0.11
463 0.1
464 0.08
465 0.09
466 0.1
467 0.1
468 0.16
469 0.16
470 0.13
471 0.14
472 0.15
473 0.16
474 0.15
475 0.17
476 0.14
477 0.16
478 0.19
479 0.18
480 0.18
481 0.17
482 0.16
483 0.14
484 0.12
485 0.09
486 0.06
487 0.06
488 0.05
489 0.05
490 0.05
491 0.05
492 0.05
493 0.05
494 0.05
495 0.05
496 0.06
497 0.05
498 0.05
499 0.08
500 0.14
501 0.16
502 0.18
503 0.2
504 0.22
505 0.23
506 0.26
507 0.26
508 0.2
509 0.19
510 0.17
511 0.16
512 0.15
513 0.2
514 0.19
515 0.18
516 0.21
517 0.26
518 0.32
519 0.34
520 0.4
521 0.41
522 0.44
523 0.46
524 0.53
525 0.54
526 0.49
527 0.49
528 0.43
529 0.36
530 0.32
531 0.28
532 0.18
533 0.13
534 0.1
535 0.08
536 0.08
537 0.08
538 0.08
539 0.08
540 0.08
541 0.07
542 0.07
543 0.08
544 0.1
545 0.12
546 0.12
547 0.15
548 0.18
549 0.22
550 0.22
551 0.23
552 0.21
553 0.19
554 0.2
555 0.17
556 0.14
557 0.09
558 0.1
559 0.07
560 0.06
561 0.06
562 0.06
563 0.07
564 0.07
565 0.07
566 0.07
567 0.07
568 0.07
569 0.07
570 0.08
571 0.07
572 0.1
573 0.09
574 0.11
575 0.11
576 0.11
577 0.11
578 0.11
579 0.17
580 0.18
581 0.2
582 0.2
583 0.26
584 0.36
585 0.4
586 0.47
587 0.49
588 0.49
589 0.53
590 0.6
591 0.64
592 0.59
593 0.55
594 0.48
595 0.41
596 0.39
597 0.32
598 0.27
599 0.2
600 0.16
601 0.16
602 0.17
603 0.15
604 0.17
605 0.18
606 0.16
607 0.15
608 0.16
609 0.15
610 0.16
611 0.17
612 0.15
613 0.14
614 0.14
615 0.12
616 0.11
617 0.09
618 0.06
619 0.06
620 0.06
621 0.06
622 0.05
623 0.09
624 0.09
625 0.1
626 0.11
627 0.1
628 0.11
629 0.1
630 0.15
631 0.11
632 0.11
633 0.11
634 0.1
635 0.1
636 0.1
637 0.11
638 0.07
639 0.07
640 0.06
641 0.05
642 0.05
643 0.05
644 0.06
645 0.04
646 0.04
647 0.05
648 0.05
649 0.06
650 0.06
651 0.06
652 0.07
653 0.08
654 0.09
655 0.09
656 0.1
657 0.11
658 0.12
659 0.13
660 0.13
661 0.13
662 0.13
663 0.12
664 0.11
665 0.1
666 0.1
667 0.11
668 0.11
669 0.1
670 0.11
671 0.12
672 0.12
673 0.11
674 0.12
675 0.09
676 0.1
677 0.09
678 0.07
679 0.11
680 0.13
681 0.13
682 0.12
683 0.12
684 0.12
685 0.18
686 0.25
687 0.23
688 0.26
689 0.28
690 0.33
691 0.36
692 0.45
693 0.44
694 0.38
695 0.43
696 0.4
697 0.41
698 0.39
699 0.44
700 0.38
701 0.41
702 0.45
703 0.39
704 0.41
705 0.39
706 0.41
707 0.34
708 0.3
709 0.23
710 0.2
711 0.19
712 0.16
713 0.15
714 0.11
715 0.1
716 0.12
717 0.13
718 0.11
719 0.12
720 0.12
721 0.12
722 0.12
723 0.14
724 0.17
725 0.2
726 0.24
727 0.26
728 0.26
729 0.26
730 0.26
731 0.27
732 0.24
733 0.2
734 0.15
735 0.14
736 0.14
737 0.12
738 0.11
739 0.11
740 0.12
741 0.14
742 0.17
743 0.18
744 0.18
745 0.2
746 0.24
747 0.27
748 0.26
749 0.29
750 0.26
751 0.25
752 0.28
753 0.27
754 0.27
755 0.24
756 0.25
757 0.22
758 0.23
759 0.22
760 0.19
761 0.18
762 0.13
763 0.13
764 0.11
765 0.11
766 0.12
767 0.13
768 0.18
769 0.24
770 0.27
771 0.32
772 0.38
773 0.44
774 0.47
775 0.55
776 0.58
777 0.59
778 0.66
779 0.63
780 0.61
781 0.57
782 0.54
783 0.46
784 0.44
785 0.39
786 0.32
787 0.29
788 0.23
789 0.2
790 0.17
791 0.2
792 0.16
793 0.17
794 0.21
795 0.24
796 0.24
797 0.26
798 0.28
799 0.27
800 0.31
801 0.36
802 0.39
803 0.41
804 0.44
805 0.44
806 0.43
807 0.42
808 0.44
809 0.37
810 0.29
811 0.26
812 0.26
813 0.23
814 0.23
815 0.21
816 0.16
817 0.15
818 0.15
819 0.12
820 0.11
821 0.12
822 0.12
823 0.11
824 0.09
825 0.08
826 0.07
827 0.08
828 0.07
829 0.06
830 0.06
831 0.06
832 0.07
833 0.07
834 0.06
835 0.05
836 0.05
837 0.04
838 0.04
839 0.04
840 0.05
841 0.05
842 0.04
843 0.04
844 0.04
845 0.05
846 0.04
847 0.04
848 0.04
849 0.04
850 0.05
851 0.05
852 0.05
853 0.05
854 0.07
855 0.07
856 0.07
857 0.07
858 0.08
859 0.08
860 0.08
861 0.09
862 0.08
863 0.08
864 0.08
865 0.07
866 0.07
867 0.07
868 0.08
869 0.07
870 0.08
871 0.07
872 0.08
873 0.08
874 0.08
875 0.08
876 0.07
877 0.07
878 0.07
879 0.08
880 0.07
881 0.07
882 0.07
883 0.06
884 0.06
885 0.07
886 0.07
887 0.06
888 0.06
889 0.07
890 0.07
891 0.07
892 0.07
893 0.06
894 0.07
895 0.07
896 0.06
897 0.06
898 0.07
899 0.06
900 0.08
901 0.08
902 0.08
903 0.09
904 0.09
905 0.08
906 0.09
907 0.09
908 0.08
909 0.08
910 0.08
911 0.08
912 0.08
913 0.09
914 0.08
915 0.08
916 0.07
917 0.07
918 0.06
919 0.06
920 0.06
921 0.05
922 0.06
923 0.07
924 0.09
925 0.1
926 0.11
927 0.12
928 0.14
929 0.15
930 0.2
931 0.24
932 0.27
933 0.32
934 0.37
935 0.39
936 0.42
937 0.43
938 0.38
939 0.34
940 0.37
941 0.33
942 0.33
943 0.39
944 0.41
945 0.47
946 0.49
947 0.48
948 0.44
949 0.45
950 0.46
951 0.44
952 0.41
953 0.35
954 0.33
955 0.33
956 0.3
957 0.28
958 0.24
959 0.22
960 0.2
961 0.2
962 0.19
963 0.19
964 0.18
965 0.18
966 0.17
967 0.13
968 0.12
969 0.1
970 0.11
971 0.12
972 0.13
973 0.15
974 0.14
975 0.15
976 0.17
977 0.18
978 0.22
979 0.28
980 0.34
981 0.37
982 0.41
983 0.41
984 0.38
985 0.37
986 0.33
987 0.28
988 0.25
989 0.2
990 0.18
991 0.15
992 0.17
993 0.22
994 0.22
995 0.22
996 0.2
997 0.23
998 0.28
999 0.34
1000 0.41
1001 0.4
1002 0.44
1003 0.44
1004 0.51
1005 0.53
1006 0.51
1007 0.54
1008 0.53
1009 0.57
1010 0.57
1011 0.66
1012 0.66
1013 0.69
1014 0.71
1015 0.71
1016 0.68
1017 0.63
1018 0.61
1019 0.54
1020 0.53
1021 0.47
1022 0.44
1023 0.43
1024 0.47
1025 0.5
1026 0.51
1027 0.57
1028 0.59
1029 0.65
1030 0.69
1031 0.68
1032 0.67
1033 0.68
1034 0.72
1035 0.64
1036 0.56
1037 0.5
1038 0.44
1039 0.39
1040 0.32
1041 0.3
1042 0.23
1043 0.22
1044 0.24
1045 0.24
1046 0.22
1047 0.23
1048 0.24
1049 0.22
1050 0.21
1051 0.28
1052 0.32
1053 0.36
1054 0.45
1055 0.51
1056 0.54
1057 0.55
1058 0.59
1059 0.57
1060 0.54
1061 0.58