FuNGI

Q6FM44

Protein Details

Accession

Q6FM44

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
38-57	WKNLDRIRKLHKNSDKVLKR	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 11, mito 3, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043954 Snu56_snRNP
Gene Ontology	GO:0016020 C:membrane GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
KEGG	cgr:CAGL0K11132g -
Pfam	View protein in Pfam PF19097 Snu56_snRNP

Amino Acid Sequences

MMRKRARNGYDGDRENRSALNKKAKRHPALTQDSYDLWKNLDRIRKLHKNSDKVLKRSVVLIPLSCETNNTIVQCIQHLLRYVDQERLHFKTVSGQLYTHVVILRNFSVLDFCLVVPVLLSAVKRLNSKTSDYFKFDSHIFCNGTFFVPDNTVISIDRTTLQLKETALRLIPGFKELNCTPTESNNIQDMINTLANFISKVKFGKNKDDIYATFKRELALFSKRTRFGLGEVSMLEKGMLIDSQAVIDKNLPLVQNTKAKLQTYVQTLLDENEDKITTEVQTTAAKSSDAISSTNGNNNVASKPIQSRFQNNQSHNVPSSRYSHQATSTAIRKPYTAKEASPLPTQSRASPGRPRFMTIEEIRGRCIATVRASIDSVKKISAYQIVKVYVKFPKKDSDTLFSNLDELRNKSNCNIVVLHYNNEHESKQWLDGLDLTRYIRGQDEPNASTVRILSIGGVAEYIVTALEGILALLQEQT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.58
2	0.53
3	0.5
4	0.47
5	0.45
6	0.47
7	0.53
8	0.53
9	0.59
10	0.68
11	0.75
12	0.77
13	0.75
14	0.75
15	0.74
16	0.78
17	0.75
18	0.68
19	0.61
20	0.55
21	0.52
22	0.47
23	0.37
24	0.29
25	0.28
26	0.28
27	0.31
28	0.38
29	0.39
30	0.42
31	0.52
32	0.6
33	0.63
34	0.7
35	0.73
36	0.73
37	0.76
38	0.81
39	0.79
40	0.74
41	0.75
42	0.67
43	0.58
44	0.54
45	0.49
46	0.44
47	0.38
48	0.34
49	0.3
50	0.28
51	0.29
52	0.25
53	0.23
54	0.19
55	0.2
56	0.22
57	0.19
58	0.2
59	0.19
60	0.19
61	0.2
62	0.2
63	0.17
64	0.17
65	0.19
66	0.2
67	0.21
68	0.27
69	0.27
70	0.32
71	0.33
72	0.34
73	0.37
74	0.39
75	0.39
76	0.33
77	0.32
78	0.34
79	0.38
80	0.38
81	0.33
82	0.29
83	0.26
84	0.29
85	0.29
86	0.22
87	0.18
88	0.16
89	0.16
90	0.19
91	0.18
92	0.15
93	0.15
94	0.13
95	0.12
96	0.11
97	0.12
98	0.1
99	0.09
100	0.09
101	0.09
102	0.08
103	0.07
104	0.07
105	0.06
106	0.06
107	0.07
108	0.08
109	0.11
110	0.14
111	0.16
112	0.18
113	0.23
114	0.25
115	0.3
116	0.35
117	0.39
118	0.42
119	0.45
120	0.45
121	0.4
122	0.39
123	0.36
124	0.32
125	0.27
126	0.28
127	0.24
128	0.22
129	0.23
130	0.21
131	0.2
132	0.17
133	0.16
134	0.12
135	0.12
136	0.12
137	0.11
138	0.11
139	0.11
140	0.11
141	0.11
142	0.1
143	0.09
144	0.1
145	0.11
146	0.11
147	0.11
148	0.12
149	0.13
150	0.13
151	0.15
152	0.16
153	0.15
154	0.14
155	0.14
156	0.14
157	0.14
158	0.14
159	0.15
160	0.15
161	0.13
162	0.19
163	0.18
164	0.21
165	0.19
166	0.22
167	0.19
168	0.2
169	0.26
170	0.21
171	0.23
172	0.22
173	0.22
174	0.19
175	0.18
176	0.16
177	0.14
178	0.14
179	0.12
180	0.1
181	0.09
182	0.09
183	0.1
184	0.1
185	0.08
186	0.08
187	0.1
188	0.14
189	0.21
190	0.24
191	0.33
192	0.38
193	0.39
194	0.4
195	0.41
196	0.38
197	0.38
198	0.41
199	0.34
200	0.29
201	0.27
202	0.26
203	0.23
204	0.23
205	0.2
206	0.21
207	0.23
208	0.25
209	0.31
210	0.31
211	0.32
212	0.32
213	0.28
214	0.24
215	0.25
216	0.22
217	0.17
218	0.16
219	0.17
220	0.15
221	0.14
222	0.12
223	0.06
224	0.05
225	0.05
226	0.04
227	0.03
228	0.03
229	0.04
230	0.04
231	0.05
232	0.05
233	0.05
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.09
238	0.08
239	0.08
240	0.1
241	0.14
242	0.19
243	0.2
244	0.23
245	0.24
246	0.24
247	0.25
248	0.25
249	0.26
250	0.25
251	0.27
252	0.23
253	0.21
254	0.21
255	0.2
256	0.2
257	0.16
258	0.12
259	0.1
260	0.1
261	0.09
262	0.09
263	0.09
264	0.08
265	0.08
266	0.08
267	0.08
268	0.1
269	0.1
270	0.11
271	0.11
272	0.1
273	0.1
274	0.11
275	0.11
276	0.1
277	0.1
278	0.1
279	0.13
280	0.14
281	0.18
282	0.17
283	0.16
284	0.15
285	0.16
286	0.15
287	0.14
288	0.14
289	0.13
290	0.17
291	0.19
292	0.26
293	0.27
294	0.34
295	0.39
296	0.48
297	0.54
298	0.51
299	0.56
300	0.52
301	0.53
302	0.48
303	0.42
304	0.34
305	0.29
306	0.32
307	0.27
308	0.29
309	0.28
310	0.28
311	0.28
312	0.29
313	0.28
314	0.29
315	0.31
316	0.31
317	0.31
318	0.29
319	0.28
320	0.3
321	0.33
322	0.35
323	0.32
324	0.28
325	0.3
326	0.35
327	0.37
328	0.38
329	0.35
330	0.31
331	0.34
332	0.34
333	0.32
334	0.34
335	0.34
336	0.36
337	0.43
338	0.45
339	0.48
340	0.48
341	0.49
342	0.44
343	0.43
344	0.45
345	0.37
346	0.42
347	0.39
348	0.39
349	0.37
350	0.35
351	0.33
352	0.26
353	0.26
354	0.2
355	0.17
356	0.2
357	0.21
358	0.22
359	0.23
360	0.25
361	0.26
362	0.26
363	0.24
364	0.21
365	0.19
366	0.18
367	0.2
368	0.25
369	0.24
370	0.24
371	0.28
372	0.31
373	0.33
374	0.33
375	0.35
376	0.35
377	0.41
378	0.4
379	0.38
380	0.44
381	0.47
382	0.54
383	0.54
384	0.52
385	0.49
386	0.5
387	0.49
388	0.4
389	0.37
390	0.3
391	0.29
392	0.27
393	0.25
394	0.29
395	0.3
396	0.32
397	0.31
398	0.37
399	0.34
400	0.34
401	0.32
402	0.26
403	0.33
404	0.34
405	0.36
406	0.31
407	0.32
408	0.31
409	0.32
410	0.3
411	0.22
412	0.24
413	0.22
414	0.22
415	0.23
416	0.21
417	0.19
418	0.24
419	0.26
420	0.24
421	0.24
422	0.23
423	0.22
424	0.22
425	0.22
426	0.2
427	0.2
428	0.22
429	0.28
430	0.33
431	0.33
432	0.36
433	0.37
434	0.34
435	0.32
436	0.28
437	0.21
438	0.15
439	0.14
440	0.11
441	0.11
442	0.11
443	0.1
444	0.09
445	0.07
446	0.07
447	0.06
448	0.06
449	0.04
450	0.03
451	0.03
452	0.03
453	0.04
454	0.03
455	0.04
456	0.04
457	0.04

Q6FM44

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer