Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FYB2

Protein Details
Accession Q6FYB2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
188-222KGPSKKAAAVKARKQKPKAKKEKQPKKNLEDLDKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-55KKTARPSNRTRAGHAARPKRAAKQINPRRRVVPGRRAVSK
177-214ERVVAQKAKPVKGPSKKAAAVKARKQKPKAKKEKQPKK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12.333, mito_nucl 10.333, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005576  C:extracellular region  
GO:0000346  C:transcription export complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:1990119  F:RNA helicase inhibitor activity  
GO:0006406  P:mRNA export from nucleus  
GO:0006283  P:transcription-coupled nucleotide-excision repair  
KEGG cgr:CAGL0A03117g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSANLDKSLDEIIGSKKTARPSNRTRAGHAARPKRAAKQINPRRRVVPGRRAVSKPVAAPASAAVARAASLLHGTREARVTVEGLPRDIKQDAVREFFQSQVGGVQRVLLSYNERGQSTGMANVTFRNGELAKKAVAQFSGAPIDGGKSRLRLNIVVDPTVQPARPLTERIRAISRERVVAQKAKPVKGPSKKAAAVKARKQKPKAKKEKQPKKNLEDLDKEMADYFGEGKN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.2
3 0.23
4 0.31
5 0.39
6 0.43
7 0.49
8 0.56
9 0.66
10 0.73
11 0.72
12 0.7
13 0.72
14 0.7
15 0.7
16 0.7
17 0.68
18 0.65
19 0.7
20 0.68
21 0.65
22 0.69
23 0.69
24 0.68
25 0.69
26 0.74
27 0.77
28 0.79
29 0.75
30 0.69
31 0.68
32 0.7
33 0.68
34 0.67
35 0.66
36 0.67
37 0.69
38 0.68
39 0.65
40 0.61
41 0.54
42 0.45
43 0.4
44 0.35
45 0.28
46 0.26
47 0.22
48 0.19
49 0.16
50 0.15
51 0.1
52 0.09
53 0.09
54 0.08
55 0.08
56 0.04
57 0.06
58 0.06
59 0.07
60 0.09
61 0.1
62 0.11
63 0.12
64 0.12
65 0.12
66 0.12
67 0.12
68 0.13
69 0.17
70 0.16
71 0.16
72 0.18
73 0.17
74 0.19
75 0.18
76 0.17
77 0.14
78 0.2
79 0.21
80 0.23
81 0.24
82 0.24
83 0.24
84 0.23
85 0.21
86 0.15
87 0.13
88 0.12
89 0.12
90 0.1
91 0.1
92 0.1
93 0.09
94 0.09
95 0.1
96 0.07
97 0.09
98 0.09
99 0.13
100 0.13
101 0.14
102 0.14
103 0.13
104 0.14
105 0.13
106 0.13
107 0.1
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.1
112 0.08
113 0.07
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.1
118 0.11
119 0.1
120 0.13
121 0.14
122 0.12
123 0.12
124 0.12
125 0.11
126 0.12
127 0.13
128 0.1
129 0.09
130 0.08
131 0.09
132 0.09
133 0.11
134 0.1
135 0.11
136 0.12
137 0.15
138 0.17
139 0.17
140 0.2
141 0.24
142 0.24
143 0.23
144 0.23
145 0.21
146 0.22
147 0.23
148 0.19
149 0.13
150 0.13
151 0.16
152 0.16
153 0.2
154 0.21
155 0.28
156 0.3
157 0.32
158 0.37
159 0.36
160 0.39
161 0.42
162 0.41
163 0.36
164 0.36
165 0.38
166 0.38
167 0.41
168 0.39
169 0.39
170 0.43
171 0.42
172 0.46
173 0.48
174 0.53
175 0.56
176 0.63
177 0.6
178 0.62
179 0.65
180 0.64
181 0.66
182 0.66
183 0.67
184 0.68
185 0.73
186 0.74
187 0.78
188 0.82
189 0.83
190 0.84
191 0.85
192 0.87
193 0.88
194 0.89
195 0.91
196 0.94
197 0.94
198 0.95
199 0.94
200 0.9
201 0.89
202 0.86
203 0.83
204 0.8
205 0.75
206 0.71
207 0.6
208 0.53
209 0.44
210 0.36
211 0.28
212 0.21