Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FRP8

Protein Details
Accession Q6FRP8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
142-163TQESTVPVKEKKKRTKKAKVKSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
150-163KEKKKRTKKAKVKS
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
KEGG cgr:CAGL0H06897g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
CDD cd07978  TAF13  
Amino Acid Sequences MSRRRLKKTNLFHKDINSLLYAYGDVAQPLNKTVQCLDELVSSYLVDICAEAAHVANSSSRNKIRLEDFKFVLRKDPIKLARAEELISTNALITEAKKQFNENENQNLKRYKEDEDDDDDEDDDEDDDEDSKPKEAPVTVETQESTVPVKEKKKRTKKAKVKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.59
3 0.5
4 0.4
5 0.31
6 0.25
7 0.21
8 0.16
9 0.11
10 0.11
11 0.09
12 0.08
13 0.09
14 0.1
15 0.1
16 0.11
17 0.15
18 0.14
19 0.15
20 0.16
21 0.17
22 0.16
23 0.17
24 0.17
25 0.14
26 0.16
27 0.15
28 0.15
29 0.12
30 0.11
31 0.11
32 0.1
33 0.08
34 0.06
35 0.05
36 0.04
37 0.04
38 0.04
39 0.04
40 0.04
41 0.04
42 0.05
43 0.06
44 0.1
45 0.12
46 0.16
47 0.18
48 0.2
49 0.21
50 0.23
51 0.28
52 0.34
53 0.38
54 0.38
55 0.38
56 0.41
57 0.43
58 0.4
59 0.39
60 0.33
61 0.3
62 0.27
63 0.33
64 0.3
65 0.31
66 0.32
67 0.29
68 0.28
69 0.26
70 0.25
71 0.18
72 0.15
73 0.13
74 0.11
75 0.09
76 0.07
77 0.06
78 0.06
79 0.05
80 0.05
81 0.12
82 0.15
83 0.17
84 0.17
85 0.19
86 0.24
87 0.29
88 0.35
89 0.31
90 0.38
91 0.43
92 0.45
93 0.47
94 0.47
95 0.42
96 0.41
97 0.39
98 0.34
99 0.33
100 0.34
101 0.34
102 0.37
103 0.38
104 0.35
105 0.34
106 0.29
107 0.23
108 0.2
109 0.16
110 0.1
111 0.07
112 0.06
113 0.06
114 0.07
115 0.07
116 0.09
117 0.1
118 0.1
119 0.11
120 0.11
121 0.13
122 0.13
123 0.17
124 0.18
125 0.23
126 0.23
127 0.24
128 0.24
129 0.23
130 0.22
131 0.19
132 0.18
133 0.15
134 0.18
135 0.23
136 0.33
137 0.41
138 0.51
139 0.62
140 0.71
141 0.79
142 0.86
143 0.91