Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FMH7

Protein Details
Accession Q6FMH7    Localization Confidence Low Confidence Score 6.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
343-362VEKDRIAKSDKKRDTPTPGPBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 11, cyto_nucl 7.5, cyto 7, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013763  Cyclin-like_dom  
IPR036915  Cyclin-like_sf  
IPR000812  TFIIB  
IPR023486  TFIIB_CS  
IPR013150  TFIIB_cyclin  
IPR013137  Znf_TFIIB  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0097550  C:transcription preinitiation complex  
GO:0001139  F:RNA polymerase II complex recruiting activity  
GO:0016251  F:RNA polymerase II general transcription initiation factor activity  
GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:2000679  P:positive regulation of transcription regulatory region DNA binding  
GO:0001113  P:transcription open complex formation at RNA polymerase II promoter  
GO:0001174  P:transcriptional start site selection at RNA polymerase II promoter  
KEGG cgr:CAGL0K07964g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08271  TF_Zn_Ribbon  
PF00382  TFIIB  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00782  TFIIB  
PS51134  ZF_TFIIB  
CDD cd20551  CYCLIN_TFIIB_rpt1  
Amino Acid Sequences MSAPVTSLRRSVGRKGPNLNIVLTCPECKVYPPKIVERFSEGDVVCALCGLVLSDKLVDTRSEWRTFSNDDQNGDDPSRVGEASNPLLDGNNLSTKIGQGETTDMRFTKELNRAQGKNVLDKKDNEIQAAFAKITMLCDASELPKIVKDCAKEAYKLCHDEKALKGKSSESIMAASILLGCRRAEVARTFKEIQSIIHVKTKEFGKTLGIMKNILREKSADGFIKIDTDNMSGAQNLTYIPRFCSHLGLPMQVTTSAEYTAKKCKEIEEIAGKSPITIAVVSIYLNILLFKIPVSAARVGQILQVTEGTIKSGYKILFDHKEKVVDPQLIASGVVSLSDLPRVEKDRIAKSDKKRDTPTPGPA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.62
3 0.66
4 0.66
5 0.64
6 0.58
7 0.5
8 0.42
9 0.4
10 0.35
11 0.3
12 0.24
13 0.23
14 0.21
15 0.24
16 0.31
17 0.32
18 0.38
19 0.42
20 0.51
21 0.57
22 0.6
23 0.58
24 0.57
25 0.54
26 0.47
27 0.48
28 0.38
29 0.31
30 0.28
31 0.25
32 0.18
33 0.15
34 0.13
35 0.06
36 0.06
37 0.05
38 0.06
39 0.06
40 0.07
41 0.07
42 0.08
43 0.09
44 0.1
45 0.1
46 0.11
47 0.19
48 0.25
49 0.27
50 0.28
51 0.29
52 0.32
53 0.36
54 0.4
55 0.42
56 0.4
57 0.38
58 0.41
59 0.41
60 0.4
61 0.36
62 0.3
63 0.2
64 0.17
65 0.17
66 0.13
67 0.11
68 0.11
69 0.14
70 0.16
71 0.16
72 0.16
73 0.14
74 0.14
75 0.14
76 0.13
77 0.12
78 0.13
79 0.13
80 0.13
81 0.13
82 0.13
83 0.14
84 0.14
85 0.11
86 0.09
87 0.13
88 0.15
89 0.16
90 0.17
91 0.16
92 0.17
93 0.17
94 0.18
95 0.21
96 0.27
97 0.3
98 0.36
99 0.43
100 0.42
101 0.45
102 0.5
103 0.44
104 0.45
105 0.47
106 0.43
107 0.4
108 0.4
109 0.43
110 0.45
111 0.44
112 0.36
113 0.3
114 0.27
115 0.24
116 0.24
117 0.18
118 0.11
119 0.1
120 0.09
121 0.1
122 0.09
123 0.08
124 0.06
125 0.07
126 0.08
127 0.08
128 0.1
129 0.1
130 0.09
131 0.11
132 0.12
133 0.13
134 0.15
135 0.15
136 0.16
137 0.21
138 0.23
139 0.24
140 0.25
141 0.29
142 0.31
143 0.34
144 0.33
145 0.31
146 0.3
147 0.32
148 0.34
149 0.38
150 0.35
151 0.32
152 0.31
153 0.29
154 0.3
155 0.27
156 0.24
157 0.14
158 0.13
159 0.12
160 0.11
161 0.1
162 0.08
163 0.06
164 0.06
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.06
170 0.06
171 0.08
172 0.12
173 0.19
174 0.2
175 0.26
176 0.27
177 0.27
178 0.3
179 0.28
180 0.23
181 0.24
182 0.24
183 0.21
184 0.24
185 0.24
186 0.21
187 0.25
188 0.27
189 0.22
190 0.2
191 0.19
192 0.16
193 0.19
194 0.24
195 0.23
196 0.21
197 0.21
198 0.2
199 0.27
200 0.28
201 0.24
202 0.21
203 0.18
204 0.2
205 0.22
206 0.25
207 0.19
208 0.17
209 0.18
210 0.17
211 0.19
212 0.16
213 0.14
214 0.11
215 0.11
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.08
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.06
224 0.08
225 0.1
226 0.1
227 0.11
228 0.13
229 0.16
230 0.16
231 0.19
232 0.18
233 0.22
234 0.23
235 0.23
236 0.22
237 0.2
238 0.2
239 0.17
240 0.17
241 0.11
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.12
246 0.14
247 0.22
248 0.23
249 0.24
250 0.25
251 0.26
252 0.31
253 0.32
254 0.37
255 0.37
256 0.38
257 0.38
258 0.39
259 0.37
260 0.3
261 0.27
262 0.2
263 0.12
264 0.1
265 0.08
266 0.06
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.06
279 0.06
280 0.08
281 0.12
282 0.14
283 0.14
284 0.15
285 0.16
286 0.15
287 0.17
288 0.17
289 0.13
290 0.12
291 0.11
292 0.1
293 0.11
294 0.11
295 0.1
296 0.1
297 0.09
298 0.1
299 0.14
300 0.14
301 0.15
302 0.17
303 0.23
304 0.31
305 0.35
306 0.4
307 0.39
308 0.43
309 0.41
310 0.46
311 0.46
312 0.4
313 0.36
314 0.32
315 0.3
316 0.26
317 0.26
318 0.19
319 0.13
320 0.09
321 0.09
322 0.07
323 0.06
324 0.07
325 0.1
326 0.1
327 0.11
328 0.17
329 0.21
330 0.24
331 0.28
332 0.35
333 0.41
334 0.48
335 0.54
336 0.58
337 0.64
338 0.73
339 0.77
340 0.79
341 0.78
342 0.79
343 0.8