Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FTR3

Protein Details
Accession Q6FTR3    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
117-146DELIADRIKNKGKKKKKRAQKHDGPLSIKVBasic
620-644NKINTCNSKEERKQLRKDLNEELKDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
123-138RIKNKGKKKKKRAQKH
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013520  Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3  
IPR034922  REX1-like_exo  
IPR047021  REXO1/3/4-like  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000175  F:3'-5'-RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000467  P:exonucleolytic trimming to generate mature 3'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0002107  P:generation of mature 3'-end of 5S rRNA generated by RNA polymerase III  
GO:0034415  P:tRNA 3'-trailer cleavage, exonucleolytic  
GO:0034476  P:U5 snRNA 3'-end processing  
KEGG cgr:CAGL0G00374g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00929  RNase_T  
CDD cd06145  REX1_like  
Amino Acid Sequences MRDSVMDKQPTERAMEADLSPTKSANTPITNCEDIPIKMINPFLSNDSTTNYTVPKLQVDDNATVNRSVARLSISEVPVVEVENFKAKRMTNTGKRRRSSAAISAPGSTLRLSSHSDELIADRIKNKGKKKKKRAQKHDGPLSIKVGTEKLASINVMTGLIKYLYDITDEHRWWEEITGKNSLKKNVLLFIPGLEPQDFGLPQDQRFADNVDELATKGLTGLNPFDNQITFPMSAPGSNTAIFSAYNAFINPPLLPKQRRELLSDLSKKTITIYDLLASVDQLLERDYPIHEGTKSLTDIFKSQVIDINNEVNSKATWKNTKEFEHDGSHIFALDCEMCKCETGFIVARVSLVNFENEVIYDELVIPEAPIVDYVTKYSGMTKEKLDGATKTVEQVQDDLLNIISANDILIGHSLSNDLSVLRIRHPNIVDTAIIYDHQGGPPFKPSLKYLASEYLNKDIQAENGDDGHDSIEDARTCMELTKLKIQRGMAFGSHLRTENIFDLLDARGIKSLVLNNTVPKSHFKTDSNIGTIFCDNDDEVFNSIINNIEQYDFFVGRLRALEFARGYAIPKNGVVLNQEDVLKNICEQINNIYEKVPSGSLITILSGSGNTKQWMALMNKINTCNSKEERKQLRKDLNEELKDTIKIARDAVVEIIIKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.3
3 0.26
4 0.27
5 0.3
6 0.28
7 0.27
8 0.26
9 0.25
10 0.24
11 0.28
12 0.28
13 0.31
14 0.31
15 0.36
16 0.42
17 0.43
18 0.4
19 0.39
20 0.36
21 0.29
22 0.29
23 0.27
24 0.21
25 0.21
26 0.23
27 0.22
28 0.21
29 0.22
30 0.22
31 0.23
32 0.24
33 0.23
34 0.24
35 0.26
36 0.25
37 0.26
38 0.24
39 0.22
40 0.24
41 0.25
42 0.24
43 0.24
44 0.25
45 0.29
46 0.32
47 0.34
48 0.34
49 0.35
50 0.33
51 0.3
52 0.28
53 0.23
54 0.19
55 0.17
56 0.13
57 0.12
58 0.12
59 0.15
60 0.22
61 0.21
62 0.22
63 0.22
64 0.22
65 0.2
66 0.2
67 0.18
68 0.12
69 0.12
70 0.2
71 0.2
72 0.2
73 0.24
74 0.25
75 0.3
76 0.38
77 0.46
78 0.48
79 0.59
80 0.69
81 0.74
82 0.76
83 0.74
84 0.71
85 0.67
86 0.62
87 0.61
88 0.59
89 0.55
90 0.53
91 0.49
92 0.44
93 0.39
94 0.33
95 0.24
96 0.16
97 0.11
98 0.12
99 0.15
100 0.18
101 0.2
102 0.19
103 0.2
104 0.19
105 0.2
106 0.23
107 0.21
108 0.19
109 0.18
110 0.23
111 0.31
112 0.38
113 0.46
114 0.51
115 0.61
116 0.71
117 0.81
118 0.85
119 0.88
120 0.93
121 0.94
122 0.94
123 0.94
124 0.93
125 0.92
126 0.9
127 0.82
128 0.74
129 0.66
130 0.56
131 0.45
132 0.36
133 0.26
134 0.2
135 0.17
136 0.14
137 0.12
138 0.12
139 0.12
140 0.11
141 0.1
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.08
146 0.07
147 0.08
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.07
152 0.08
153 0.09
154 0.12
155 0.19
156 0.19
157 0.21
158 0.21
159 0.22
160 0.21
161 0.23
162 0.26
163 0.24
164 0.27
165 0.33
166 0.33
167 0.39
168 0.42
169 0.43
170 0.4
171 0.37
172 0.36
173 0.32
174 0.31
175 0.26
176 0.23
177 0.2
178 0.19
179 0.17
180 0.17
181 0.13
182 0.12
183 0.11
184 0.13
185 0.12
186 0.11
187 0.16
188 0.16
189 0.16
190 0.21
191 0.21
192 0.2
193 0.21
194 0.22
195 0.17
196 0.15
197 0.15
198 0.12
199 0.12
200 0.11
201 0.1
202 0.08
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.06
207 0.07
208 0.09
209 0.1
210 0.11
211 0.12
212 0.12
213 0.11
214 0.11
215 0.12
216 0.12
217 0.11
218 0.11
219 0.12
220 0.12
221 0.12
222 0.12
223 0.14
224 0.12
225 0.12
226 0.12
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.09
231 0.09
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.09
238 0.09
239 0.09
240 0.14
241 0.21
242 0.23
243 0.26
244 0.32
245 0.37
246 0.39
247 0.41
248 0.39
249 0.38
250 0.45
251 0.49
252 0.44
253 0.41
254 0.39
255 0.34
256 0.32
257 0.27
258 0.19
259 0.13
260 0.13
261 0.11
262 0.12
263 0.12
264 0.1
265 0.08
266 0.07
267 0.06
268 0.05
269 0.04
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.06
274 0.06
275 0.08
276 0.09
277 0.11
278 0.1
279 0.1
280 0.11
281 0.13
282 0.13
283 0.12
284 0.12
285 0.11
286 0.12
287 0.13
288 0.14
289 0.12
290 0.12
291 0.15
292 0.15
293 0.16
294 0.16
295 0.17
296 0.15
297 0.15
298 0.14
299 0.11
300 0.1
301 0.12
302 0.13
303 0.14
304 0.19
305 0.22
306 0.27
307 0.31
308 0.34
309 0.36
310 0.37
311 0.37
312 0.34
313 0.33
314 0.29
315 0.25
316 0.22
317 0.18
318 0.14
319 0.1
320 0.08
321 0.07
322 0.07
323 0.06
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.06
330 0.09
331 0.1
332 0.1
333 0.1
334 0.1
335 0.1
336 0.1
337 0.1
338 0.09
339 0.08
340 0.07
341 0.06
342 0.07
343 0.06
344 0.06
345 0.08
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.05
351 0.06
352 0.05
353 0.04
354 0.03
355 0.04
356 0.03
357 0.03
358 0.04
359 0.04
360 0.05
361 0.05
362 0.06
363 0.07
364 0.07
365 0.09
366 0.13
367 0.16
368 0.17
369 0.18
370 0.19
371 0.21
372 0.23
373 0.22
374 0.18
375 0.18
376 0.18
377 0.17
378 0.16
379 0.17
380 0.16
381 0.14
382 0.14
383 0.13
384 0.11
385 0.12
386 0.11
387 0.08
388 0.07
389 0.07
390 0.06
391 0.05
392 0.04
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.03
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.05
402 0.04
403 0.05
404 0.05
405 0.04
406 0.05
407 0.07
408 0.08
409 0.11
410 0.16
411 0.18
412 0.23
413 0.23
414 0.24
415 0.24
416 0.24
417 0.21
418 0.16
419 0.16
420 0.11
421 0.11
422 0.09
423 0.09
424 0.08
425 0.09
426 0.12
427 0.12
428 0.13
429 0.17
430 0.19
431 0.19
432 0.2
433 0.21
434 0.23
435 0.25
436 0.25
437 0.24
438 0.29
439 0.3
440 0.32
441 0.32
442 0.31
443 0.3
444 0.28
445 0.27
446 0.21
447 0.2
448 0.18
449 0.17
450 0.12
451 0.12
452 0.12
453 0.11
454 0.11
455 0.1
456 0.07
457 0.06
458 0.06
459 0.1
460 0.09
461 0.1
462 0.1
463 0.1
464 0.1
465 0.11
466 0.13
467 0.13
468 0.17
469 0.26
470 0.31
471 0.32
472 0.35
473 0.36
474 0.37
475 0.36
476 0.35
477 0.26
478 0.25
479 0.25
480 0.24
481 0.24
482 0.21
483 0.19
484 0.17
485 0.19
486 0.17
487 0.17
488 0.14
489 0.12
490 0.13
491 0.12
492 0.14
493 0.12
494 0.11
495 0.11
496 0.11
497 0.11
498 0.12
499 0.15
500 0.15
501 0.19
502 0.2
503 0.23
504 0.25
505 0.27
506 0.26
507 0.28
508 0.32
509 0.33
510 0.37
511 0.36
512 0.39
513 0.45
514 0.49
515 0.46
516 0.41
517 0.36
518 0.33
519 0.32
520 0.26
521 0.19
522 0.15
523 0.12
524 0.12
525 0.13
526 0.12
527 0.13
528 0.13
529 0.12
530 0.11
531 0.11
532 0.12
533 0.1
534 0.09
535 0.09
536 0.09
537 0.09
538 0.11
539 0.15
540 0.13
541 0.13
542 0.18
543 0.17
544 0.17
545 0.19
546 0.17
547 0.18
548 0.18
549 0.23
550 0.18
551 0.19
552 0.2
553 0.19
554 0.2
555 0.21
556 0.23
557 0.19
558 0.19
559 0.2
560 0.19
561 0.2
562 0.2
563 0.18
564 0.18
565 0.19
566 0.21
567 0.19
568 0.19
569 0.2
570 0.18
571 0.16
572 0.19
573 0.19
574 0.17
575 0.19
576 0.24
577 0.28
578 0.3
579 0.3
580 0.27
581 0.25
582 0.26
583 0.27
584 0.21
585 0.14
586 0.14
587 0.14
588 0.13
589 0.13
590 0.13
591 0.1
592 0.1
593 0.1
594 0.08
595 0.1
596 0.12
597 0.14
598 0.15
599 0.15
600 0.15
601 0.16
602 0.22
603 0.24
604 0.29
605 0.34
606 0.39
607 0.43
608 0.46
609 0.5
610 0.47
611 0.47
612 0.47
613 0.45
614 0.5
615 0.52
616 0.6
617 0.67
618 0.73
619 0.79
620 0.81
621 0.85
622 0.83
623 0.82
624 0.82
625 0.81
626 0.76
627 0.69
628 0.63
629 0.56
630 0.48
631 0.44
632 0.37
633 0.32
634 0.29
635 0.27
636 0.27
637 0.25
638 0.25
639 0.25
640 0.25