Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FWM4

Protein Details
Accession Q6FWM4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
117-138EEEEEKKKKQKEEEEKRKKELEAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
105-154KLLELERKKKEQEEEEEKKKKQKEEEEKRKKELEEQERKKKEQEEEEKRR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11.833, cyto 5, cyto_pero 3.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021017  Mediator_Med2_fun  
Gene Ontology GO:0070847  C:core mediator complex  
GO:0005829  C:cytosol  
GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0061629  F:RNA polymerase II-specific DNA-binding transcription factor binding  
GO:0003713  F:transcription coactivator activity  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0032968  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
GO:0060261  P:positive regulation of transcription initiation by RNA polymerase II  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
KEGG cgr:CAGL0C04477g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11214  Med2  
Amino Acid Sequences MSYKNRLTACFDDILKVSAEMMMQQQLKNVQLDPYMVNGFSAQQQNTLKEKIHMFHGILDDLENMLSKSTYYVDTLANLGKESKRQKELELEKQREQEEEEKKQKLLELERKKKEQEEEEEKKKKQKEEEEKRKKELEEQERKKKEQEEEEKRRRQQEQDGDKQQSMFDGLDFTNADLDTSQPGTSGQNDIKSPTMGAGPQTAGTDKPNTADGPDKTNPPIAAFGLGDSQSGGLYNDLNTMDLSMFSELDGGGFDASGFDTANTSNANATTNSVPNNNNPATNDSNMNNDPTAAINAFDGTAAGNNETLGQGEKLEFDQSNPSAMLGNDINMGDNGEDYLTLNDFNDLNIDWSAAGEGGDLDLNGFNI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.26
3 0.22
4 0.17
5 0.14
6 0.13
7 0.11
8 0.12
9 0.17
10 0.19
11 0.19
12 0.22
13 0.24
14 0.27
15 0.28
16 0.27
17 0.23
18 0.22
19 0.24
20 0.21
21 0.22
22 0.21
23 0.18
24 0.17
25 0.15
26 0.15
27 0.18
28 0.23
29 0.19
30 0.24
31 0.27
32 0.32
33 0.36
34 0.38
35 0.34
36 0.34
37 0.37
38 0.33
39 0.35
40 0.34
41 0.3
42 0.31
43 0.31
44 0.27
45 0.23
46 0.22
47 0.17
48 0.13
49 0.13
50 0.09
51 0.07
52 0.07
53 0.07
54 0.06
55 0.07
56 0.08
57 0.09
58 0.1
59 0.12
60 0.12
61 0.13
62 0.15
63 0.16
64 0.14
65 0.14
66 0.16
67 0.15
68 0.22
69 0.29
70 0.34
71 0.39
72 0.4
73 0.43
74 0.5
75 0.57
76 0.61
77 0.64
78 0.63
79 0.61
80 0.64
81 0.62
82 0.53
83 0.48
84 0.46
85 0.44
86 0.47
87 0.5
88 0.48
89 0.47
90 0.47
91 0.45
92 0.42
93 0.43
94 0.44
95 0.47
96 0.55
97 0.62
98 0.66
99 0.66
100 0.65
101 0.62
102 0.59
103 0.57
104 0.57
105 0.59
106 0.65
107 0.71
108 0.69
109 0.7
110 0.68
111 0.64
112 0.62
113 0.64
114 0.65
115 0.68
116 0.77
117 0.81
118 0.82
119 0.81
120 0.78
121 0.68
122 0.65
123 0.63
124 0.63
125 0.63
126 0.66
127 0.71
128 0.73
129 0.74
130 0.7
131 0.65
132 0.6
133 0.59
134 0.61
135 0.61
136 0.66
137 0.75
138 0.79
139 0.77
140 0.78
141 0.71
142 0.65
143 0.63
144 0.62
145 0.61
146 0.62
147 0.64
148 0.61
149 0.58
150 0.53
151 0.44
152 0.34
153 0.26
154 0.16
155 0.09
156 0.08
157 0.07
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.07
163 0.07
164 0.05
165 0.06
166 0.06
167 0.07
168 0.06
169 0.05
170 0.06
171 0.07
172 0.08
173 0.1
174 0.1
175 0.12
176 0.12
177 0.14
178 0.14
179 0.13
180 0.12
181 0.1
182 0.1
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.07
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.09
192 0.11
193 0.1
194 0.1
195 0.11
196 0.11
197 0.12
198 0.17
199 0.16
200 0.22
201 0.23
202 0.24
203 0.24
204 0.27
205 0.25
206 0.2
207 0.21
208 0.14
209 0.14
210 0.12
211 0.11
212 0.1
213 0.1
214 0.09
215 0.07
216 0.07
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.04
221 0.05
222 0.05
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.06
232 0.06
233 0.05
234 0.06
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.03
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.08
254 0.09
255 0.09
256 0.11
257 0.13
258 0.15
259 0.16
260 0.19
261 0.2
262 0.22
263 0.3
264 0.28
265 0.27
266 0.27
267 0.31
268 0.31
269 0.31
270 0.31
271 0.25
272 0.3
273 0.29
274 0.29
275 0.24
276 0.2
277 0.19
278 0.16
279 0.18
280 0.12
281 0.11
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.08
286 0.07
287 0.05
288 0.07
289 0.07
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.09
296 0.09
297 0.08
298 0.08
299 0.09
300 0.1
301 0.1
302 0.14
303 0.13
304 0.13
305 0.2
306 0.19
307 0.21
308 0.2
309 0.2
310 0.18
311 0.18
312 0.2
313 0.14
314 0.14
315 0.13
316 0.13
317 0.14
318 0.12
319 0.13
320 0.09
321 0.09
322 0.08
323 0.06
324 0.07
325 0.07
326 0.08
327 0.08
328 0.09
329 0.09
330 0.1
331 0.1
332 0.1
333 0.11
334 0.1
335 0.12
336 0.11
337 0.12
338 0.1
339 0.1
340 0.1
341 0.09
342 0.08
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.06