Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FPW2

Protein Details
Accession Q6FPW2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
339-365VEEKTPVKKGKNDSKQVKGKKSPKSKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
330-333KRAR
341-365EKTPVKKGKNDSKQVKGKKSPKSKK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 10.833, cyto_mito 6.833, mito 6.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0042802  F:identical protein binding  
GO:0070180  F:large ribosomal subunit rRNA binding  
GO:0070628  F:proteasome binding  
GO:0030674  F:protein-macromolecule adaptor activity  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0030163  P:protein catabolic process  
KEGG cgr:CAGL0J00473g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00687  Ribosomal_L1  
CDD cd00403  Ribosomal_L1  
Amino Acid Sequences MAKKGVKKQVKNKEEGLSRERIGRALGSLKKYLEAQEGGEKTQLLEDESLGDLQLLFTNAESFTGSKKSFKLKLVDVKHSLYAKWKAASATEIKDFKVLLILKDSDVSKVTQDELYDQLNESGIEIDEIICGKDLKTTYKAYEARNAFISQFSLVIADDSVVTALPKLLGGKAYSKVETTPIPIRCNLKGQFSLNALTNQIKKIYLHKLPVRAPRGNMLNVHLGRVNWFTDEEIIDNIESVADALIKDAKIRNIMLKTTTSPSLPIYRNDNVIDEMVKENTVDDEKAEDVKTVKIGEVDVELSNFDRALMEVANPEEYETMFSKQISKAKRAREEEPEVEEKTPVKKGKNDSKQVKGKKSPKSKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.72
3 0.68
4 0.63
5 0.56
6 0.56
7 0.5
8 0.42
9 0.36
10 0.3
11 0.28
12 0.3
13 0.34
14 0.32
15 0.35
16 0.34
17 0.35
18 0.35
19 0.35
20 0.32
21 0.27
22 0.25
23 0.3
24 0.31
25 0.3
26 0.3
27 0.27
28 0.22
29 0.23
30 0.21
31 0.14
32 0.13
33 0.12
34 0.13
35 0.13
36 0.13
37 0.11
38 0.1
39 0.08
40 0.08
41 0.09
42 0.08
43 0.07
44 0.07
45 0.08
46 0.08
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.11
51 0.16
52 0.18
53 0.2
54 0.24
55 0.31
56 0.36
57 0.41
58 0.44
59 0.46
60 0.55
61 0.58
62 0.62
63 0.58
64 0.55
65 0.55
66 0.5
67 0.43
68 0.41
69 0.4
70 0.36
71 0.33
72 0.32
73 0.28
74 0.28
75 0.31
76 0.28
77 0.25
78 0.28
79 0.28
80 0.26
81 0.27
82 0.26
83 0.22
84 0.24
85 0.21
86 0.15
87 0.18
88 0.19
89 0.18
90 0.21
91 0.21
92 0.16
93 0.16
94 0.16
95 0.13
96 0.13
97 0.14
98 0.12
99 0.12
100 0.13
101 0.14
102 0.15
103 0.14
104 0.13
105 0.12
106 0.11
107 0.11
108 0.09
109 0.08
110 0.06
111 0.06
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.06
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.09
121 0.09
122 0.13
123 0.16
124 0.19
125 0.19
126 0.28
127 0.32
128 0.31
129 0.38
130 0.36
131 0.34
132 0.34
133 0.33
134 0.25
135 0.21
136 0.2
137 0.12
138 0.11
139 0.09
140 0.07
141 0.06
142 0.06
143 0.05
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.04
155 0.04
156 0.05
157 0.06
158 0.09
159 0.12
160 0.13
161 0.13
162 0.13
163 0.13
164 0.14
165 0.14
166 0.15
167 0.19
168 0.21
169 0.22
170 0.24
171 0.27
172 0.26
173 0.32
174 0.3
175 0.27
176 0.27
177 0.27
178 0.27
179 0.25
180 0.26
181 0.21
182 0.2
183 0.17
184 0.17
185 0.17
186 0.15
187 0.15
188 0.14
189 0.13
190 0.18
191 0.24
192 0.25
193 0.3
194 0.33
195 0.39
196 0.44
197 0.51
198 0.52
199 0.48
200 0.45
201 0.43
202 0.43
203 0.39
204 0.34
205 0.28
206 0.3
207 0.27
208 0.27
209 0.23
210 0.2
211 0.19
212 0.2
213 0.18
214 0.11
215 0.11
216 0.1
217 0.1
218 0.11
219 0.1
220 0.08
221 0.09
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.05
226 0.05
227 0.04
228 0.04
229 0.03
230 0.03
231 0.04
232 0.06
233 0.06
234 0.08
235 0.1
236 0.12
237 0.14
238 0.15
239 0.21
240 0.21
241 0.23
242 0.23
243 0.23
244 0.24
245 0.25
246 0.25
247 0.2
248 0.19
249 0.2
250 0.26
251 0.26
252 0.26
253 0.29
254 0.3
255 0.33
256 0.32
257 0.31
258 0.25
259 0.23
260 0.21
261 0.16
262 0.16
263 0.13
264 0.13
265 0.11
266 0.1
267 0.11
268 0.12
269 0.11
270 0.09
271 0.11
272 0.12
273 0.14
274 0.14
275 0.14
276 0.13
277 0.14
278 0.16
279 0.15
280 0.14
281 0.13
282 0.13
283 0.12
284 0.12
285 0.13
286 0.11
287 0.11
288 0.11
289 0.11
290 0.11
291 0.1
292 0.09
293 0.07
294 0.07
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.1
299 0.11
300 0.12
301 0.12
302 0.12
303 0.11
304 0.11
305 0.14
306 0.14
307 0.15
308 0.16
309 0.16
310 0.2
311 0.25
312 0.31
313 0.33
314 0.4
315 0.44
316 0.53
317 0.62
318 0.63
319 0.64
320 0.67
321 0.71
322 0.66
323 0.67
324 0.62
325 0.55
326 0.5
327 0.46
328 0.39
329 0.36
330 0.39
331 0.37
332 0.38
333 0.43
334 0.53
335 0.62
336 0.69
337 0.76
338 0.77
339 0.81
340 0.86
341 0.88
342 0.89
343 0.88
344 0.87
345 0.86