Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FNB4

Protein Details
Accession Q6FNB4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
124-143SAKPSETNYRKRRNEFSGNTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
119-149RLKKASAKPSETNYRKRRNEFSGNTAKRIKR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, mito_nucl 11.5, mito 4.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027141  LSm4/Sm_D1/D3  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR047575  Sm  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0120114  C:Sm-like protein family complex  
GO:0006396  P:RNA processing  
KEGG cgr:CAGL0K01287g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
Amino Acid Sequences MTLLVNFLKKLKNEQVTLELKNGTTVWGTLQSVSSQMNVTVTDVVLSLPKSQSGKVSGGPGALASVYLVNNAQPDKANNDDGSVSLQYMNIRGNTIRQIILPDSLNLDSLLVDEAQVKRLKKASAKPSETNYRKRRNEFSGNTAKRIKRGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.5
3 0.5
4 0.51
5 0.46
6 0.38
7 0.31
8 0.3
9 0.26
10 0.19
11 0.14
12 0.12
13 0.11
14 0.13
15 0.13
16 0.12
17 0.13
18 0.12
19 0.13
20 0.14
21 0.13
22 0.1
23 0.1
24 0.1
25 0.09
26 0.1
27 0.09
28 0.08
29 0.07
30 0.07
31 0.07
32 0.07
33 0.08
34 0.09
35 0.08
36 0.11
37 0.12
38 0.12
39 0.15
40 0.17
41 0.18
42 0.17
43 0.19
44 0.17
45 0.16
46 0.16
47 0.13
48 0.1
49 0.08
50 0.06
51 0.04
52 0.04
53 0.04
54 0.04
55 0.04
56 0.05
57 0.06
58 0.06
59 0.07
60 0.06
61 0.07
62 0.1
63 0.12
64 0.14
65 0.13
66 0.13
67 0.13
68 0.12
69 0.14
70 0.11
71 0.09
72 0.07
73 0.08
74 0.08
75 0.09
76 0.1
77 0.08
78 0.09
79 0.09
80 0.1
81 0.12
82 0.14
83 0.13
84 0.12
85 0.14
86 0.14
87 0.16
88 0.15
89 0.13
90 0.14
91 0.13
92 0.13
93 0.11
94 0.1
95 0.08
96 0.08
97 0.08
98 0.05
99 0.05
100 0.08
101 0.09
102 0.14
103 0.18
104 0.18
105 0.21
106 0.25
107 0.3
108 0.34
109 0.42
110 0.48
111 0.55
112 0.61
113 0.63
114 0.66
115 0.73
116 0.73
117 0.75
118 0.75
119 0.75
120 0.77
121 0.79
122 0.8
123 0.78
124 0.81
125 0.76
126 0.75
127 0.76
128 0.71
129 0.7
130 0.71
131 0.65