FuNGI

A0A0K6G2D9

Protein Details

Accession

A0A0K6G2D9

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
4-29	LPAPIFKCTKSRPNRVRPPSPSAENN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 19.5, cyto_mito 11.833, nucl 4.5, cyto_nucl 4.333

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR007073 RNA_pol_Rpb1_7 IPR038593 RNA_pol_Rpb1_7_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04990 RNA_pol_Rpb1_7

Amino Acid Sequences

MSDLPAPIFKCTKSRPNRVRPPSPSAENNEAVEEDTGTGAMGLVAKVKSEQKARAKSAAKLSFGQDEEGDSSEGAAAPKVRKSKLANPSVLRMPDTLEHATISNIGPVYDKAYLDQLKAATLHESHSFDDNSEKLILCCRPIVMQDKDNEEFENTEEDIFVCQIEHNMLDSVTLCSVKNIRQLFMVEHGKPMIGAAGELQPRSMKEWMPETDGVNFKNVLGVDGLTLRLPTPTSELCNGNAIDFDSSYVNYSRLALLTDLMTNRGTLMASTRQCINQADTGALMRCSSEETVEILMEAATVGEKDDCYSVTENVLFGQMAPMGTGSFHVALDLDMLKDVIVNQWLPIQNMMATRMGGGMTPAGGLSMTPYDCASPMQAEAWKSEGAAFLALRTSADEGLGNFPFPAFPQSPMGQGRFGGGYSPSSPGYSPTSLATFLYRSRLTCLVATL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.63
2	0.69
3	0.77
4	0.86
5	0.88
6	0.91
7	0.88
8	0.87
9	0.84
10	0.8
11	0.76
12	0.73
13	0.7
14	0.62
15	0.56
16	0.48
17	0.4
18	0.34
19	0.28
20	0.2
21	0.14
22	0.11
23	0.09
24	0.08
25	0.07
26	0.06
27	0.06
28	0.06
29	0.05
30	0.09
31	0.09
32	0.09
33	0.13
34	0.17
35	0.22
36	0.28
37	0.37
38	0.43
39	0.53
40	0.57
41	0.63
42	0.63
43	0.64
44	0.68
45	0.65
46	0.58
47	0.52
48	0.5
49	0.47
50	0.43
51	0.39
52	0.29
53	0.24
54	0.23
55	0.21
56	0.19
57	0.13
58	0.12
59	0.11
60	0.12
61	0.1
62	0.1
63	0.12
64	0.14
65	0.19
66	0.25
67	0.26
68	0.32
69	0.38
70	0.46
71	0.53
72	0.59
73	0.62
74	0.59
75	0.63
76	0.62
77	0.56
78	0.48
79	0.38
80	0.32
81	0.26
82	0.28
83	0.24
84	0.19
85	0.18
86	0.17
87	0.17
88	0.16
89	0.14
90	0.12
91	0.1
92	0.1
93	0.1
94	0.1
95	0.13
96	0.14
97	0.13
98	0.12
99	0.18
100	0.2
101	0.19
102	0.21
103	0.18
104	0.17
105	0.18
106	0.18
107	0.13
108	0.12
109	0.14
110	0.16
111	0.17
112	0.17
113	0.2
114	0.2
115	0.18
116	0.21
117	0.19
118	0.17
119	0.17
120	0.16
121	0.12
122	0.17
123	0.18
124	0.16
125	0.16
126	0.14
127	0.14
128	0.17
129	0.25
130	0.24
131	0.27
132	0.29
133	0.34
134	0.36
135	0.35
136	0.32
137	0.25
138	0.22
139	0.18
140	0.18
141	0.13
142	0.11
143	0.1
144	0.1
145	0.1
146	0.09
147	0.08
148	0.05
149	0.05
150	0.05
151	0.06
152	0.06
153	0.06
154	0.07
155	0.06
156	0.06
157	0.07
158	0.07
159	0.08
160	0.08
161	0.07
162	0.08
163	0.1
164	0.13
165	0.19
166	0.19
167	0.19
168	0.19
169	0.2
170	0.2
171	0.25
172	0.28
173	0.22
174	0.21
175	0.21
176	0.19
177	0.18
178	0.17
179	0.1
180	0.05
181	0.05
182	0.05
183	0.09
184	0.1
185	0.1
186	0.1
187	0.1
188	0.11
189	0.14
190	0.15
191	0.11
192	0.12
193	0.17
194	0.19
195	0.22
196	0.23
197	0.21
198	0.23
199	0.25
200	0.23
201	0.19
202	0.18
203	0.14
204	0.14
205	0.13
206	0.09
207	0.08
208	0.07
209	0.06
210	0.07
211	0.07
212	0.05
213	0.05
214	0.05
215	0.05
216	0.05
217	0.05
218	0.08
219	0.08
220	0.1
221	0.13
222	0.14
223	0.15
224	0.17
225	0.17
226	0.14
227	0.13
228	0.12
229	0.09
230	0.08
231	0.08
232	0.06
233	0.06
234	0.08
235	0.08
236	0.08
237	0.08
238	0.08
239	0.08
240	0.08
241	0.08
242	0.07
243	0.07
244	0.07
245	0.08
246	0.08
247	0.09
248	0.09
249	0.08
250	0.08
251	0.08
252	0.07
253	0.05
254	0.08
255	0.13
256	0.14
257	0.15
258	0.17
259	0.17
260	0.19
261	0.2
262	0.2
263	0.16
264	0.16
265	0.15
266	0.14
267	0.14
268	0.13
269	0.12
270	0.1
271	0.07
272	0.06
273	0.08
274	0.08
275	0.07
276	0.07
277	0.09
278	0.09
279	0.09
280	0.09
281	0.07
282	0.07
283	0.06
284	0.05
285	0.03
286	0.03
287	0.03
288	0.03
289	0.04
290	0.04
291	0.05
292	0.05
293	0.06
294	0.09
295	0.11
296	0.11
297	0.12
298	0.13
299	0.12
300	0.12
301	0.12
302	0.1
303	0.08
304	0.08
305	0.07
306	0.06
307	0.06
308	0.06
309	0.05
310	0.05
311	0.06
312	0.07
313	0.07
314	0.06
315	0.06
316	0.06
317	0.06
318	0.08
319	0.08
320	0.06
321	0.06
322	0.06
323	0.06
324	0.06
325	0.06
326	0.06
327	0.08
328	0.08
329	0.08
330	0.13
331	0.15
332	0.16
333	0.16
334	0.15
335	0.15
336	0.16
337	0.18
338	0.14
339	0.12
340	0.12
341	0.12
342	0.11
343	0.09
344	0.08
345	0.06
346	0.05
347	0.05
348	0.05
349	0.04
350	0.04
351	0.04
352	0.05
353	0.08
354	0.08
355	0.08
356	0.09
357	0.1
358	0.1
359	0.11
360	0.11
361	0.1
362	0.11
363	0.13
364	0.15
365	0.16
366	0.17
367	0.19
368	0.17
369	0.16
370	0.16
371	0.15
372	0.12
373	0.13
374	0.12
375	0.1
376	0.11
377	0.11
378	0.1
379	0.1
380	0.11
381	0.09
382	0.1
383	0.1
384	0.11
385	0.15
386	0.16
387	0.15
388	0.13
389	0.13
390	0.12
391	0.12
392	0.17
393	0.14
394	0.17
395	0.22
396	0.23
397	0.29
398	0.34
399	0.35
400	0.3
401	0.28
402	0.28
403	0.23
404	0.22
405	0.18
406	0.15
407	0.16
408	0.16
409	0.19
410	0.18
411	0.18
412	0.18
413	0.2
414	0.24
415	0.23
416	0.22
417	0.22
418	0.23
419	0.23
420	0.23
421	0.23
422	0.2
423	0.2
424	0.26
425	0.26
426	0.25
427	0.29
428	0.32
429	0.32

A0A0K6G2D9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer