Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6FNG8

Protein Details
Accession Q6FNG8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
22-52QYINILSRKYHAKRRSKRRRQANSLPTPENSHydrophilic
130-149NSVNTKKKHELKKTHIHYTRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-41KYHAKRRSKRRR
Subcellular Location(s) nucl 23, mito_nucl 13.333, cyto_nucl 12.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007224  TIF_Rrn11  
IPR016850  TIF_Rrn11_budding_yeast  
Gene Ontology GO:0070860  C:RNA polymerase I core factor complex  
GO:0001164  F:RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding  
GO:0001181  F:RNA polymerase I general transcription initiation factor activity  
GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0042790  P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I  
KEGG cgr:CAGL0J11792g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04090  RNA_pol_I_TF  
Amino Acid Sequences MFEVPITYNCRRLNVERRVRYQYINILSRKYHAKRRSKRRRQANSLPTPENSAVENDQSESQLPSREQIKEKKMKLGEDYSDSEAETSSEGEDTTKDDNEFANDMNKFEKLFYRKYEKPEHSFEVWYDGNSVNTKKKHELKKTHIHYTRLNRVERIAKKRVEKNVVHMPLVNKRYFDIKSEGYEVLEPLVDIDSYLLKHIEILTQILFSSVSQGNWDIAYRTFSLLIRIPEVDIRNIWGLGTRILMERGQTTRSLEFLKWMSTVYSSKQNFVQSHCHRKAPVFRSGSRTHTPKYALTWLWNCLIKVTELISIEEEKGVNTNEEENDNGSKQSAMDKLTELIDKISEMVLVPPYLDDPEIWFIYSMCHMVHADYLSGKFNCQRLSGSRRDIARNQVTQHIHYVKTYLQNCSQKGNFEYPKQFIQSRLEEFEKRMYEDESKPENMKLQESYDNTSYSNEDDEENPFQIDESNSFLGNLVEEGIDPVIKTHWEPTMNMDALKFNYNSTDDSSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.66
3 0.67
4 0.73
5 0.77
6 0.75
7 0.7
8 0.66
9 0.64
10 0.62
11 0.61
12 0.57
13 0.53
14 0.5
15 0.51
16 0.55
17 0.53
18 0.54
19 0.56
20 0.65
21 0.71
22 0.81
23 0.88
24 0.89
25 0.93
26 0.94
27 0.95
28 0.94
29 0.94
30 0.94
31 0.93
32 0.9
33 0.84
34 0.73
35 0.69
36 0.59
37 0.5
38 0.4
39 0.32
40 0.26
41 0.24
42 0.24
43 0.19
44 0.19
45 0.19
46 0.19
47 0.17
48 0.17
49 0.2
50 0.19
51 0.22
52 0.27
53 0.32
54 0.38
55 0.45
56 0.54
57 0.59
58 0.61
59 0.66
60 0.65
61 0.63
62 0.62
63 0.6
64 0.53
65 0.49
66 0.49
67 0.43
68 0.4
69 0.35
70 0.29
71 0.22
72 0.18
73 0.13
74 0.1
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.08
80 0.1
81 0.12
82 0.14
83 0.14
84 0.14
85 0.15
86 0.17
87 0.18
88 0.16
89 0.2
90 0.18
91 0.19
92 0.19
93 0.2
94 0.17
95 0.18
96 0.24
97 0.23
98 0.28
99 0.34
100 0.41
101 0.46
102 0.53
103 0.62
104 0.62
105 0.63
106 0.64
107 0.63
108 0.58
109 0.54
110 0.47
111 0.43
112 0.35
113 0.29
114 0.25
115 0.19
116 0.19
117 0.2
118 0.23
119 0.24
120 0.27
121 0.31
122 0.37
123 0.45
124 0.53
125 0.61
126 0.68
127 0.7
128 0.77
129 0.8
130 0.82
131 0.79
132 0.74
133 0.72
134 0.71
135 0.72
136 0.68
137 0.63
138 0.54
139 0.52
140 0.57
141 0.57
142 0.56
143 0.54
144 0.52
145 0.58
146 0.64
147 0.68
148 0.68
149 0.61
150 0.6
151 0.62
152 0.59
153 0.51
154 0.47
155 0.41
156 0.41
157 0.44
158 0.38
159 0.28
160 0.26
161 0.3
162 0.29
163 0.29
164 0.26
165 0.23
166 0.24
167 0.27
168 0.27
169 0.22
170 0.22
171 0.18
172 0.13
173 0.11
174 0.09
175 0.06
176 0.06
177 0.05
178 0.04
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.06
183 0.06
184 0.05
185 0.06
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.08
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.06
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.1
202 0.1
203 0.11
204 0.08
205 0.07
206 0.1
207 0.09
208 0.1
209 0.1
210 0.1
211 0.12
212 0.14
213 0.15
214 0.14
215 0.13
216 0.13
217 0.15
218 0.16
219 0.14
220 0.11
221 0.12
222 0.12
223 0.11
224 0.11
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.09
233 0.08
234 0.1
235 0.1
236 0.11
237 0.11
238 0.13
239 0.12
240 0.13
241 0.15
242 0.13
243 0.14
244 0.14
245 0.14
246 0.12
247 0.12
248 0.11
249 0.11
250 0.12
251 0.11
252 0.2
253 0.19
254 0.2
255 0.23
256 0.27
257 0.27
258 0.29
259 0.37
260 0.35
261 0.46
262 0.47
263 0.46
264 0.42
265 0.45
266 0.51
267 0.45
268 0.47
269 0.41
270 0.41
271 0.46
272 0.48
273 0.5
274 0.46
275 0.46
276 0.38
277 0.37
278 0.37
279 0.32
280 0.32
281 0.31
282 0.27
283 0.28
284 0.28
285 0.26
286 0.27
287 0.27
288 0.23
289 0.19
290 0.18
291 0.14
292 0.13
293 0.12
294 0.11
295 0.11
296 0.11
297 0.12
298 0.12
299 0.12
300 0.12
301 0.11
302 0.08
303 0.09
304 0.09
305 0.08
306 0.08
307 0.1
308 0.1
309 0.11
310 0.11
311 0.12
312 0.13
313 0.13
314 0.13
315 0.11
316 0.1
317 0.1
318 0.13
319 0.13
320 0.13
321 0.14
322 0.14
323 0.15
324 0.17
325 0.17
326 0.14
327 0.11
328 0.1
329 0.09
330 0.09
331 0.08
332 0.06
333 0.06
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.06
339 0.07
340 0.08
341 0.08
342 0.06
343 0.08
344 0.11
345 0.12
346 0.12
347 0.11
348 0.11
349 0.12
350 0.12
351 0.11
352 0.07
353 0.09
354 0.09
355 0.09
356 0.11
357 0.1
358 0.1
359 0.1
360 0.12
361 0.15
362 0.15
363 0.16
364 0.18
365 0.21
366 0.22
367 0.22
368 0.24
369 0.27
370 0.34
371 0.4
372 0.42
373 0.43
374 0.46
375 0.5
376 0.51
377 0.53
378 0.54
379 0.51
380 0.47
381 0.51
382 0.49
383 0.45
384 0.49
385 0.43
386 0.36
387 0.32
388 0.32
389 0.27
390 0.33
391 0.34
392 0.31
393 0.36
394 0.42
395 0.43
396 0.48
397 0.46
398 0.43
399 0.44
400 0.49
401 0.46
402 0.46
403 0.5
404 0.47
405 0.49
406 0.49
407 0.47
408 0.42
409 0.43
410 0.42
411 0.41
412 0.43
413 0.43
414 0.41
415 0.42
416 0.45
417 0.4
418 0.36
419 0.33
420 0.32
421 0.33
422 0.35
423 0.4
424 0.38
425 0.4
426 0.4
427 0.4
428 0.42
429 0.38
430 0.37
431 0.32
432 0.31
433 0.34
434 0.35
435 0.39
436 0.35
437 0.34
438 0.31
439 0.31
440 0.28
441 0.22
442 0.21
443 0.17
444 0.16
445 0.16
446 0.21
447 0.22
448 0.22
449 0.21
450 0.18
451 0.18
452 0.18
453 0.18
454 0.15
455 0.17
456 0.17
457 0.17
458 0.17
459 0.18
460 0.15
461 0.14
462 0.13
463 0.08
464 0.07
465 0.07
466 0.08
467 0.08
468 0.08
469 0.08
470 0.08
471 0.09
472 0.1
473 0.11
474 0.14
475 0.19
476 0.21
477 0.22
478 0.28
479 0.35
480 0.35
481 0.35
482 0.32
483 0.3
484 0.3
485 0.35
486 0.29
487 0.2
488 0.23
489 0.24
490 0.25