Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0K6GBR0

Protein Details
Accession A0A0K6GBR0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
220-239PPPVKASKPASSKEKKKSKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
60-80RKRGRAPKEGKRIKDPNAPKR
221-239PPVKASKPASSKEKKKSKK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 12.833, cyto 9.5, mito_nucl 8.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd22012  HMG-box_ABF2_IXR1-like_rpt2  
Amino Acid Sequences MADHPVLSAKHGQALVNQLAELSSSMRQTAGLADVFAQSIAQLFPGTVIAPQPTATVTGRKRGRAPKEGKRIKDPNAPKRPATSYIMFQNDIRDELRQKHPELPYKELLGKVSEAWAVLGEDQKKAYQNVADSNMAKYNRAVIDYKGSLNGHGPAAGASSAPTPEVDEEDEDEEEEEAPPAKKSKSKAPPPAPVTESDEDSDAASSASEESDETPAAPPPPPVKASKPASSKEKKKSKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.3
3 0.25
4 0.24
5 0.19
6 0.17
7 0.17
8 0.15
9 0.11
10 0.1
11 0.1
12 0.11
13 0.11
14 0.11
15 0.11
16 0.12
17 0.12
18 0.1
19 0.1
20 0.1
21 0.11
22 0.11
23 0.1
24 0.08
25 0.05
26 0.06
27 0.06
28 0.05
29 0.05
30 0.05
31 0.05
32 0.06
33 0.06
34 0.06
35 0.07
36 0.08
37 0.08
38 0.08
39 0.08
40 0.08
41 0.11
42 0.12
43 0.19
44 0.2
45 0.28
46 0.32
47 0.35
48 0.42
49 0.49
50 0.55
51 0.58
52 0.65
53 0.66
54 0.73
55 0.78
56 0.75
57 0.76
58 0.74
59 0.7
60 0.71
61 0.71
62 0.7
63 0.73
64 0.72
65 0.64
66 0.62
67 0.6
68 0.54
69 0.49
70 0.41
71 0.33
72 0.36
73 0.37
74 0.33
75 0.29
76 0.28
77 0.24
78 0.23
79 0.2
80 0.16
81 0.16
82 0.2
83 0.28
84 0.29
85 0.3
86 0.35
87 0.4
88 0.46
89 0.48
90 0.47
91 0.41
92 0.4
93 0.4
94 0.34
95 0.29
96 0.22
97 0.18
98 0.13
99 0.12
100 0.1
101 0.08
102 0.07
103 0.06
104 0.05
105 0.05
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.09
110 0.1
111 0.11
112 0.11
113 0.12
114 0.11
115 0.12
116 0.14
117 0.17
118 0.18
119 0.18
120 0.18
121 0.22
122 0.2
123 0.19
124 0.16
125 0.17
126 0.15
127 0.17
128 0.17
129 0.13
130 0.18
131 0.19
132 0.2
133 0.19
134 0.18
135 0.17
136 0.17
137 0.17
138 0.12
139 0.11
140 0.11
141 0.07
142 0.08
143 0.07
144 0.06
145 0.05
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.08
153 0.09
154 0.09
155 0.1
156 0.12
157 0.12
158 0.11
159 0.11
160 0.1
161 0.09
162 0.09
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.1
167 0.12
168 0.14
169 0.18
170 0.21
171 0.32
172 0.4
173 0.5
174 0.59
175 0.65
176 0.72
177 0.73
178 0.76
179 0.67
180 0.6
181 0.57
182 0.48
183 0.42
184 0.33
185 0.3
186 0.24
187 0.22
188 0.19
189 0.12
190 0.1
191 0.07
192 0.07
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.07
198 0.09
199 0.1
200 0.1
201 0.11
202 0.13
203 0.15
204 0.16
205 0.18
206 0.2
207 0.25
208 0.27
209 0.31
210 0.35
211 0.42
212 0.48
213 0.53
214 0.57
215 0.59
216 0.66
217 0.71
218 0.75
219 0.77