Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

Q6FMF9

Protein Details
Accession Q6FMF9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
37-74IEDSKKRQALQKNNQPLKKRPKLKRYKAKKVDPTSPLGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
47-66QKNNQPLKKRPKLKRYKAKK
Subcellular Location(s) nucl 12, mito_nucl 11.333, mito 9.5, cyto_nucl 8.833, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR030390  MeTrfase_TrmA_AS  
IPR030391  MeTrfase_TrmA_CS  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR002792  TRAM_dom  
IPR025795  tRNA_(uracil-5-)_MeTrfase  
IPR010280  U5_MeTrfase_fam  
Gene Ontology GO:0051908  F:double-stranded DNA 5'-3' exodeoxyribonuclease activity  
GO:0030697  F:S-adenosylmethionine-dependent tRNA (m5U54) methyltransferase activity  
GO:0000014  F:single-stranded DNA endodeoxyribonuclease activity  
KEGG cgr:CAGL0K08360g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01938  TRAM  
PF05958  tRNA_U5-meth_tr  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51687  SAM_MT_RNA_M5U  
PS51622  SAM_MT_RNA_M5U_2  
PS50926  TRAM  
PS01230  TRMA_1  
PS01231  TRMA_2  
CDD cd02440  AdoMet_MTases  
Amino Acid Sequences MNLLVKGSLVNIGLRSGILRRSIKRCFKMEALNNQNIEDSKKRQALQKNNQPLKKRPKLKRYKAKKVDPTSPLGVLQFEIDELLRENNLEKSQVENDVTAILNDTSFVTGPIASKYHREVSDVKVLKLGSNGDGLAIIPNPVETDKKQVAIVPFGLPGDLVRIKVFKTHPLYVESDLLDVIEKSPIRKDELIKDKYFGKYSGSQFEFLDYSEQLKIKKSTIANAYKHFAPLLLAESLVPEISDTVASPLQYGYRTKITPHFDMPHKVKQLEVRPPLGFGQKGRPKWRKETLEVGGTGPILDIEECALATDILNKGLSNERARFEKEFKNYKKGATILLRENTIILDPSKPTEEQLEEGSRDENGDISFIEVTDETTGVKLAKTCVTNTRQIVTEYVDGYTFKFSAGEFFQNNNSILPLVTKYVRDNLQLGNGDKPRYLVDAYCGSGLFSICSSKGVDKVIGVEISADSVSFAERNAKNNGVENCKFIVGKAEKLFESIDTPADSTSVILDPPRKGCDELFLKQLAAYNPARIVYISCNVHSQARDVQYFLKDTPEGKNYRVESIRGFDFFPQTHHVESVCVLSRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.13
3 0.13
4 0.16
5 0.22
6 0.29
7 0.36
8 0.44
9 0.54
10 0.63
11 0.68
12 0.69
13 0.67
14 0.66
15 0.69
16 0.7
17 0.71
18 0.69
19 0.69
20 0.65
21 0.59
22 0.55
23 0.46
24 0.43
25 0.38
26 0.35
27 0.37
28 0.42
29 0.45
30 0.5
31 0.59
32 0.64
33 0.69
34 0.74
35 0.77
36 0.8
37 0.84
38 0.83
39 0.84
40 0.84
41 0.83
42 0.83
43 0.82
44 0.84
45 0.89
46 0.93
47 0.93
48 0.93
49 0.94
50 0.94
51 0.95
52 0.94
53 0.91
54 0.89
55 0.83
56 0.78
57 0.71
58 0.62
59 0.52
60 0.42
61 0.35
62 0.25
63 0.21
64 0.14
65 0.1
66 0.09
67 0.08
68 0.07
69 0.08
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.11
74 0.14
75 0.15
76 0.16
77 0.16
78 0.19
79 0.21
80 0.25
81 0.25
82 0.21
83 0.2
84 0.2
85 0.2
86 0.15
87 0.15
88 0.1
89 0.09
90 0.09
91 0.09
92 0.08
93 0.08
94 0.08
95 0.07
96 0.08
97 0.09
98 0.11
99 0.13
100 0.13
101 0.16
102 0.2
103 0.26
104 0.26
105 0.28
106 0.29
107 0.33
108 0.42
109 0.41
110 0.38
111 0.34
112 0.34
113 0.31
114 0.3
115 0.26
116 0.17
117 0.15
118 0.15
119 0.12
120 0.12
121 0.11
122 0.1
123 0.08
124 0.07
125 0.05
126 0.06
127 0.06
128 0.08
129 0.1
130 0.1
131 0.18
132 0.19
133 0.21
134 0.21
135 0.24
136 0.25
137 0.25
138 0.25
139 0.19
140 0.18
141 0.16
142 0.16
143 0.12
144 0.1
145 0.12
146 0.11
147 0.11
148 0.11
149 0.12
150 0.13
151 0.19
152 0.2
153 0.24
154 0.29
155 0.32
156 0.33
157 0.36
158 0.39
159 0.35
160 0.36
161 0.28
162 0.22
163 0.18
164 0.16
165 0.13
166 0.1
167 0.08
168 0.09
169 0.09
170 0.1
171 0.14
172 0.15
173 0.2
174 0.23
175 0.26
176 0.32
177 0.42
178 0.47
179 0.44
180 0.44
181 0.44
182 0.44
183 0.42
184 0.33
185 0.27
186 0.29
187 0.31
188 0.37
189 0.34
190 0.33
191 0.31
192 0.32
193 0.28
194 0.21
195 0.2
196 0.12
197 0.12
198 0.13
199 0.15
200 0.14
201 0.18
202 0.19
203 0.18
204 0.24
205 0.22
206 0.25
207 0.33
208 0.4
209 0.4
210 0.42
211 0.43
212 0.38
213 0.38
214 0.32
215 0.23
216 0.15
217 0.12
218 0.11
219 0.09
220 0.08
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.07
225 0.06
226 0.03
227 0.03
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.05
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.07
236 0.08
237 0.09
238 0.1
239 0.11
240 0.14
241 0.15
242 0.17
243 0.23
244 0.27
245 0.28
246 0.31
247 0.33
248 0.33
249 0.4
250 0.43
251 0.43
252 0.41
253 0.39
254 0.36
255 0.37
256 0.41
257 0.43
258 0.41
259 0.38
260 0.35
261 0.36
262 0.36
263 0.32
264 0.26
265 0.19
266 0.25
267 0.27
268 0.33
269 0.41
270 0.47
271 0.49
272 0.56
273 0.64
274 0.6
275 0.57
276 0.6
277 0.53
278 0.49
279 0.45
280 0.37
281 0.29
282 0.23
283 0.19
284 0.11
285 0.08
286 0.05
287 0.04
288 0.03
289 0.03
290 0.03
291 0.03
292 0.03
293 0.04
294 0.03
295 0.03
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.07
300 0.06
301 0.08
302 0.11
303 0.15
304 0.16
305 0.19
306 0.2
307 0.22
308 0.25
309 0.27
310 0.28
311 0.32
312 0.36
313 0.44
314 0.46
315 0.51
316 0.51
317 0.49
318 0.48
319 0.42
320 0.4
321 0.35
322 0.35
323 0.32
324 0.32
325 0.32
326 0.28
327 0.27
328 0.21
329 0.16
330 0.13
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.09
335 0.11
336 0.11
337 0.11
338 0.13
339 0.13
340 0.13
341 0.16
342 0.17
343 0.16
344 0.17
345 0.16
346 0.14
347 0.13
348 0.12
349 0.09
350 0.07
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.05
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.05
362 0.05
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.07
367 0.08
368 0.12
369 0.13
370 0.15
371 0.22
372 0.26
373 0.31
374 0.32
375 0.32
376 0.3
377 0.3
378 0.29
379 0.25
380 0.23
381 0.17
382 0.16
383 0.15
384 0.13
385 0.13
386 0.13
387 0.1
388 0.08
389 0.08
390 0.08
391 0.1
392 0.13
393 0.16
394 0.16
395 0.17
396 0.2
397 0.22
398 0.23
399 0.19
400 0.17
401 0.13
402 0.12
403 0.12
404 0.1
405 0.1
406 0.11
407 0.13
408 0.14
409 0.19
410 0.21
411 0.22
412 0.23
413 0.22
414 0.26
415 0.28
416 0.28
417 0.3
418 0.31
419 0.3
420 0.28
421 0.28
422 0.23
423 0.22
424 0.22
425 0.15
426 0.16
427 0.18
428 0.19
429 0.19
430 0.17
431 0.15
432 0.15
433 0.14
434 0.11
435 0.08
436 0.09
437 0.08
438 0.1
439 0.11
440 0.12
441 0.14
442 0.16
443 0.16
444 0.15
445 0.17
446 0.18
447 0.16
448 0.14
449 0.13
450 0.1
451 0.11
452 0.1
453 0.08
454 0.05
455 0.06
456 0.06
457 0.06
458 0.06
459 0.14
460 0.17
461 0.21
462 0.25
463 0.28
464 0.29
465 0.36
466 0.41
467 0.41
468 0.4
469 0.39
470 0.36
471 0.35
472 0.34
473 0.27
474 0.31
475 0.25
476 0.31
477 0.31
478 0.33
479 0.31
480 0.32
481 0.33
482 0.24
483 0.24
484 0.18
485 0.17
486 0.14
487 0.15
488 0.13
489 0.13
490 0.12
491 0.1
492 0.1
493 0.09
494 0.08
495 0.11
496 0.16
497 0.19
498 0.23
499 0.26
500 0.27
501 0.28
502 0.28
503 0.34
504 0.36
505 0.35
506 0.37
507 0.35
508 0.33
509 0.31
510 0.35
511 0.27
512 0.27
513 0.25
514 0.23
515 0.23
516 0.24
517 0.23
518 0.19
519 0.2
520 0.18
521 0.25
522 0.25
523 0.24
524 0.27
525 0.28
526 0.32
527 0.31
528 0.3
529 0.3
530 0.33
531 0.33
532 0.32
533 0.35
534 0.34
535 0.36
536 0.33
537 0.31
538 0.27
539 0.28
540 0.33
541 0.37
542 0.36
543 0.35
544 0.43
545 0.4
546 0.46
547 0.48
548 0.43
549 0.39
550 0.41
551 0.43
552 0.36
553 0.36
554 0.31
555 0.33
556 0.31
557 0.31
558 0.31
559 0.31
560 0.31
561 0.31
562 0.28
563 0.24
564 0.24
565 0.26