Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

Q6FM80

Protein Details
Accession Q6FM80    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
327-351KLQGQIIRERRKRQQKEIETRENAEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007149  Leo1  
Gene Ontology GO:0016593  C:Cdc73/Paf1 complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:1990269  F:RNA polymerase II C-terminal domain phosphoserine binding  
GO:0061629  F:RNA polymerase II-specific DNA-binding transcription factor binding  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006325  P:chromatin organization  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0016570  P:histone modification  
GO:2001209  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase I  
GO:0032968  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
GO:0090262  P:regulation of transcription-coupled nucleotide-excision repair  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG cgr:CAGL0K10230g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04004  Leo1  
Amino Acid Sequences MSEEEKHNMSEEQVELAPEEPPKEEAEDSVEDGKDQEETMPEKEEEMDDLFGDDEDDEDEEEITTGRGRNGTTGISDDEEDDDEEGITRRSREREDYDMEDYDDEAKEQEMYTRKFYGEDAVNYSDDDEPHTFKESNVDLIRHIIPYKTRTTNNEHDEIFYAKVPAFLTIDPVPFDPQTFEATVDERLSKSASKEDQLGDRLIDENTIRWRYSRDAEQHVFKESNAQIVQWSDGSFSLKLGDEYTDIIVNDTDNTFLTVSHDQQELMQCYDGGEITKTMMFIPTSTNSKIHQKLSKAVSRRNARQNLGPGSYIIKQDPEIEKKELEKLQGQIIRERRKRQQKEIETRENAENGFAETGEFKRGNTPSRSSRQNEYEDDGFLVDDEDEEDFIDDGEEEEEEEEDDDLDADRLRNAKRQGEHAFTEDDDEEDDNKRRKTAIISSEEDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.17
3 0.17
4 0.18
5 0.16
6 0.17
7 0.15
8 0.15
9 0.17
10 0.19
11 0.19
12 0.18
13 0.21
14 0.22
15 0.23
16 0.26
17 0.24
18 0.21
19 0.21
20 0.2
21 0.16
22 0.14
23 0.13
24 0.13
25 0.16
26 0.18
27 0.22
28 0.21
29 0.22
30 0.22
31 0.22
32 0.2
33 0.19
34 0.17
35 0.13
36 0.13
37 0.12
38 0.11
39 0.11
40 0.08
41 0.06
42 0.06
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.07
48 0.07
49 0.07
50 0.07
51 0.08
52 0.09
53 0.11
54 0.13
55 0.13
56 0.15
57 0.16
58 0.17
59 0.16
60 0.17
61 0.17
62 0.17
63 0.17
64 0.16
65 0.15
66 0.15
67 0.14
68 0.12
69 0.11
70 0.09
71 0.1
72 0.1
73 0.1
74 0.11
75 0.12
76 0.16
77 0.2
78 0.25
79 0.31
80 0.36
81 0.41
82 0.45
83 0.48
84 0.47
85 0.44
86 0.41
87 0.34
88 0.29
89 0.24
90 0.19
91 0.14
92 0.1
93 0.09
94 0.09
95 0.09
96 0.13
97 0.18
98 0.21
99 0.25
100 0.26
101 0.26
102 0.26
103 0.27
104 0.28
105 0.25
106 0.25
107 0.25
108 0.26
109 0.26
110 0.25
111 0.26
112 0.21
113 0.16
114 0.18
115 0.15
116 0.15
117 0.16
118 0.2
119 0.19
120 0.17
121 0.23
122 0.2
123 0.25
124 0.25
125 0.24
126 0.21
127 0.24
128 0.25
129 0.21
130 0.21
131 0.16
132 0.17
133 0.2
134 0.26
135 0.28
136 0.31
137 0.34
138 0.41
139 0.49
140 0.5
141 0.5
142 0.44
143 0.4
144 0.38
145 0.35
146 0.28
147 0.2
148 0.16
149 0.12
150 0.13
151 0.12
152 0.11
153 0.11
154 0.1
155 0.13
156 0.14
157 0.14
158 0.13
159 0.14
160 0.15
161 0.13
162 0.14
163 0.11
164 0.11
165 0.12
166 0.12
167 0.12
168 0.11
169 0.12
170 0.13
171 0.13
172 0.12
173 0.1
174 0.1
175 0.11
176 0.11
177 0.11
178 0.15
179 0.16
180 0.17
181 0.19
182 0.2
183 0.22
184 0.23
185 0.22
186 0.17
187 0.15
188 0.15
189 0.12
190 0.12
191 0.09
192 0.09
193 0.13
194 0.15
195 0.14
196 0.14
197 0.16
198 0.18
199 0.21
200 0.26
201 0.26
202 0.32
203 0.34
204 0.38
205 0.37
206 0.37
207 0.34
208 0.27
209 0.29
210 0.22
211 0.24
212 0.19
213 0.18
214 0.16
215 0.16
216 0.17
217 0.1
218 0.1
219 0.06
220 0.07
221 0.09
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.07
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.05
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.09
245 0.1
246 0.11
247 0.13
248 0.14
249 0.13
250 0.14
251 0.19
252 0.17
253 0.16
254 0.15
255 0.12
256 0.12
257 0.13
258 0.11
259 0.08
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.07
264 0.07
265 0.06
266 0.08
267 0.07
268 0.07
269 0.1
270 0.12
271 0.16
272 0.17
273 0.19
274 0.19
275 0.28
276 0.32
277 0.34
278 0.37
279 0.36
280 0.41
281 0.47
282 0.51
283 0.49
284 0.5
285 0.53
286 0.57
287 0.62
288 0.65
289 0.65
290 0.62
291 0.61
292 0.63
293 0.59
294 0.52
295 0.44
296 0.35
297 0.31
298 0.31
299 0.28
300 0.21
301 0.17
302 0.15
303 0.21
304 0.26
305 0.28
306 0.3
307 0.31
308 0.32
309 0.33
310 0.39
311 0.35
312 0.32
313 0.31
314 0.28
315 0.34
316 0.35
317 0.34
318 0.35
319 0.41
320 0.49
321 0.52
322 0.58
323 0.6
324 0.69
325 0.75
326 0.79
327 0.81
328 0.82
329 0.86
330 0.88
331 0.88
332 0.81
333 0.78
334 0.7
335 0.61
336 0.5
337 0.39
338 0.3
339 0.21
340 0.17
341 0.13
342 0.1
343 0.1
344 0.11
345 0.15
346 0.15
347 0.14
348 0.21
349 0.25
350 0.31
351 0.34
352 0.4
353 0.43
354 0.51
355 0.59
356 0.56
357 0.61
358 0.61
359 0.62
360 0.59
361 0.56
362 0.51
363 0.43
364 0.39
365 0.31
366 0.24
367 0.18
368 0.15
369 0.08
370 0.07
371 0.07
372 0.06
373 0.06
374 0.07
375 0.07
376 0.06
377 0.06
378 0.07
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.08
394 0.09
395 0.09
396 0.11
397 0.16
398 0.18
399 0.25
400 0.31
401 0.38
402 0.4
403 0.49
404 0.54
405 0.55
406 0.56
407 0.52
408 0.48
409 0.41
410 0.42
411 0.33
412 0.26
413 0.21
414 0.2
415 0.18
416 0.21
417 0.28
418 0.31
419 0.32
420 0.34
421 0.33
422 0.35
423 0.4
424 0.45
425 0.47
426 0.47