Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

Q6FVB7

Protein Details
Accession Q6FVB7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MSDPRKRNTRHQLTPDNLSTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 12.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025742  CSTF2_hinge  
IPR026896  CSTF_C  
IPR038192  CSTF_C_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005847  C:mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006378  P:mRNA polyadenylation  
GO:0098789  P:pre-mRNA cleavage required for polyadenylation  
GO:0031126  P:sno(s)RNA 3'-end processing  
GO:0030847  P:termination of RNA polymerase II transcription, exosome-dependent  
KEGG cgr:CAGL0E03179g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF14327  CSTF2_hinge  
PF14304  CSTF_C  
Amino Acid Sequences MSDPRKRNTRHQLTPDNLSTSILVTNIPSDWNQDVVSSVVAGSGPIIDISSRKDPRTGKVNGLVYDYREPQDCRRAYDLLQRVEKLPFELERIIPSNYKNRTESVKDKPEIQLDRENFPWNAQLSLPFDMISEVPLPKKAPTATATSSNTTKNNDNNIVNSIGSNGVVVFPEILIKSSQNLPKLEKEALESSDPISANLSKIPPAQMIEVISNLKMLANQHNTKRSQLETFLKSNNDILMTMSQAMLEMGFIDYEVVTQVMKDVTKESKSGKSTNSNSNSNSNSNSATPIMPQFNTMATPPMAMGGMVPPVNNMNMGGMVPMQGFMPAAPQFNYSPPPPVPAPMQVPMSGPVSTPTQAPPVPMPAPVQMNEPEINVIKLQQLPENQREMVKQVLKLTDSQIAALPEQQRAMVTNLRKEYLY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.76
3 0.69
4 0.59
5 0.5
6 0.4
7 0.31
8 0.26
9 0.18
10 0.14
11 0.1
12 0.11
13 0.11
14 0.12
15 0.11
16 0.15
17 0.16
18 0.17
19 0.16
20 0.15
21 0.16
22 0.15
23 0.14
24 0.1
25 0.09
26 0.07
27 0.07
28 0.07
29 0.06
30 0.05
31 0.05
32 0.05
33 0.05
34 0.05
35 0.07
36 0.12
37 0.22
38 0.26
39 0.27
40 0.34
41 0.37
42 0.43
43 0.51
44 0.5
45 0.47
46 0.51
47 0.55
48 0.5
49 0.52
50 0.47
51 0.42
52 0.42
53 0.38
54 0.32
55 0.31
56 0.33
57 0.33
58 0.42
59 0.4
60 0.4
61 0.41
62 0.42
63 0.41
64 0.47
65 0.49
66 0.47
67 0.49
68 0.45
69 0.43
70 0.43
71 0.41
72 0.33
73 0.28
74 0.22
75 0.21
76 0.23
77 0.21
78 0.23
79 0.25
80 0.25
81 0.24
82 0.27
83 0.32
84 0.34
85 0.38
86 0.36
87 0.36
88 0.4
89 0.45
90 0.49
91 0.51
92 0.55
93 0.52
94 0.53
95 0.54
96 0.56
97 0.52
98 0.49
99 0.47
100 0.4
101 0.42
102 0.41
103 0.41
104 0.33
105 0.31
106 0.3
107 0.22
108 0.21
109 0.18
110 0.19
111 0.18
112 0.2
113 0.19
114 0.15
115 0.14
116 0.14
117 0.14
118 0.12
119 0.11
120 0.1
121 0.1
122 0.12
123 0.13
124 0.13
125 0.17
126 0.16
127 0.17
128 0.18
129 0.23
130 0.24
131 0.3
132 0.32
133 0.31
134 0.33
135 0.32
136 0.32
137 0.3
138 0.32
139 0.29
140 0.32
141 0.35
142 0.33
143 0.32
144 0.32
145 0.3
146 0.25
147 0.21
148 0.16
149 0.11
150 0.1
151 0.08
152 0.06
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.04
157 0.04
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.08
164 0.14
165 0.17
166 0.2
167 0.22
168 0.24
169 0.26
170 0.29
171 0.29
172 0.23
173 0.24
174 0.22
175 0.21
176 0.2
177 0.17
178 0.14
179 0.17
180 0.16
181 0.13
182 0.13
183 0.11
184 0.11
185 0.12
186 0.12
187 0.09
188 0.1
189 0.11
190 0.1
191 0.11
192 0.11
193 0.1
194 0.11
195 0.1
196 0.1
197 0.1
198 0.09
199 0.08
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.12
205 0.18
206 0.22
207 0.26
208 0.32
209 0.33
210 0.35
211 0.36
212 0.32
213 0.27
214 0.29
215 0.32
216 0.3
217 0.32
218 0.33
219 0.31
220 0.3
221 0.28
222 0.23
223 0.17
224 0.13
225 0.11
226 0.09
227 0.08
228 0.08
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.04
234 0.04
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.04
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.04
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.09
251 0.12
252 0.14
253 0.16
254 0.19
255 0.25
256 0.28
257 0.31
258 0.34
259 0.39
260 0.42
261 0.5
262 0.52
263 0.49
264 0.48
265 0.5
266 0.49
267 0.42
268 0.39
269 0.31
270 0.28
271 0.24
272 0.23
273 0.19
274 0.16
275 0.15
276 0.17
277 0.18
278 0.16
279 0.17
280 0.16
281 0.15
282 0.15
283 0.14
284 0.13
285 0.11
286 0.11
287 0.1
288 0.09
289 0.09
290 0.07
291 0.07
292 0.05
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.08
298 0.09
299 0.09
300 0.08
301 0.06
302 0.06
303 0.07
304 0.06
305 0.05
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.09
314 0.09
315 0.11
316 0.11
317 0.14
318 0.15
319 0.18
320 0.22
321 0.19
322 0.23
323 0.22
324 0.26
325 0.24
326 0.26
327 0.26
328 0.28
329 0.31
330 0.29
331 0.3
332 0.27
333 0.27
334 0.27
335 0.26
336 0.21
337 0.17
338 0.16
339 0.16
340 0.16
341 0.16
342 0.16
343 0.19
344 0.19
345 0.22
346 0.22
347 0.25
348 0.25
349 0.25
350 0.26
351 0.25
352 0.28
353 0.26
354 0.28
355 0.24
356 0.27
357 0.26
358 0.24
359 0.23
360 0.21
361 0.21
362 0.18
363 0.17
364 0.17
365 0.19
366 0.2
367 0.22
368 0.28
369 0.34
370 0.4
371 0.43
372 0.41
373 0.41
374 0.41
375 0.39
376 0.4
377 0.38
378 0.35
379 0.36
380 0.38
381 0.37
382 0.38
383 0.38
384 0.35
385 0.31
386 0.29
387 0.27
388 0.24
389 0.24
390 0.27
391 0.26
392 0.22
393 0.22
394 0.22
395 0.19
396 0.2
397 0.23
398 0.25
399 0.29
400 0.35
401 0.38