Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

Q6FS32

Protein Details
Accession Q6FS32    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
200-219TTNVTKPKKAVKPQKKGYELHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
28-83RPSNDGRPPAERGPRPGSSRGGRGHERRRFNGAGPSERGGVNKFRRDKEKAARTKG
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003682  F:chromatin binding  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0071028  P:nuclear mRNA surveillance  
KEGG cgr:CAGL0H03861g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd21605  RRM1_HRB1_GBP2  
cd21606  RRM2_HRB1_GBP2  
cd21607  RRM3_HRB1_GBP2  
Amino Acid Sequences MSEAQRSRSRSPVRRSLSSYATRRGFERPSNDGRPPAERGPRPGSSRGGRGHERRRFNGAGPSERGGVNKFRRDKEKAARTKGDFGPRLARELDSTYEEKVNRNYTNSIFVGNLTYDCTPEDLKDFFSQVGKVVRADIITSRGHHRGMGTVEFTSGEEVDEAIRKFDGAYLMNRQIFVRQDNPPPESSSTHSSGSNSGHTTNVTKPKKAVKPQKKGYELMILNLPYSISWQTLKTMFKEFGDVLKANVEVDSTGMSIGVGNVIFKNQEDMVKAYEHFNGFEIEGKVLEVRGQIPDPTQISSTRKTDDLTVNQDNEDIEMDIDTAEGGDEKALKADVSSDGGARAQNKFSSDDYVKTEDKSKIILCDNLPGATTEGDLYDLFETLGKVKTAGFINTDNAGETVSAIVIYNEQDDAEVCYGRLQGYNYGGCDLKISYVKDKNIDY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.77
3 0.73
4 0.72
5 0.72
6 0.69
7 0.68
8 0.65
9 0.59
10 0.54
11 0.55
12 0.53
13 0.51
14 0.51
15 0.5
16 0.54
17 0.6
18 0.62
19 0.61
20 0.57
21 0.55
22 0.54
23 0.54
24 0.55
25 0.52
26 0.56
27 0.57
28 0.6
29 0.6
30 0.59
31 0.59
32 0.54
33 0.58
34 0.56
35 0.57
36 0.59
37 0.64
38 0.69
39 0.7
40 0.73
41 0.7
42 0.71
43 0.67
44 0.61
45 0.61
46 0.57
47 0.55
48 0.51
49 0.49
50 0.43
51 0.41
52 0.39
53 0.33
54 0.36
55 0.37
56 0.42
57 0.47
58 0.52
59 0.59
60 0.64
61 0.71
62 0.72
63 0.75
64 0.76
65 0.77
66 0.79
67 0.75
68 0.77
69 0.73
70 0.72
71 0.64
72 0.57
73 0.57
74 0.5
75 0.49
76 0.42
77 0.36
78 0.28
79 0.28
80 0.27
81 0.23
82 0.23
83 0.22
84 0.26
85 0.26
86 0.27
87 0.3
88 0.34
89 0.31
90 0.33
91 0.35
92 0.32
93 0.36
94 0.33
95 0.3
96 0.23
97 0.21
98 0.19
99 0.16
100 0.15
101 0.11
102 0.11
103 0.1
104 0.1
105 0.12
106 0.11
107 0.11
108 0.14
109 0.12
110 0.15
111 0.16
112 0.16
113 0.16
114 0.17
115 0.16
116 0.16
117 0.19
118 0.17
119 0.16
120 0.16
121 0.16
122 0.15
123 0.15
124 0.13
125 0.13
126 0.14
127 0.15
128 0.19
129 0.2
130 0.21
131 0.21
132 0.2
133 0.2
134 0.21
135 0.21
136 0.18
137 0.16
138 0.16
139 0.15
140 0.15
141 0.12
142 0.09
143 0.07
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.09
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.08
152 0.08
153 0.1
154 0.11
155 0.1
156 0.12
157 0.17
158 0.22
159 0.22
160 0.23
161 0.21
162 0.21
163 0.22
164 0.22
165 0.22
166 0.21
167 0.27
168 0.31
169 0.33
170 0.32
171 0.33
172 0.32
173 0.29
174 0.28
175 0.27
176 0.26
177 0.24
178 0.24
179 0.22
180 0.22
181 0.22
182 0.21
183 0.17
184 0.15
185 0.14
186 0.14
187 0.16
188 0.19
189 0.27
190 0.27
191 0.27
192 0.29
193 0.38
194 0.44
195 0.52
196 0.57
197 0.58
198 0.67
199 0.74
200 0.8
201 0.75
202 0.69
203 0.62
204 0.6
205 0.49
206 0.39
207 0.34
208 0.24
209 0.2
210 0.19
211 0.16
212 0.07
213 0.09
214 0.08
215 0.06
216 0.07
217 0.08
218 0.1
219 0.14
220 0.15
221 0.16
222 0.18
223 0.18
224 0.17
225 0.19
226 0.18
227 0.15
228 0.18
229 0.16
230 0.14
231 0.14
232 0.14
233 0.11
234 0.11
235 0.09
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.03
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.05
251 0.05
252 0.07
253 0.07
254 0.09
255 0.1
256 0.11
257 0.13
258 0.14
259 0.15
260 0.14
261 0.16
262 0.15
263 0.14
264 0.14
265 0.13
266 0.12
267 0.15
268 0.14
269 0.12
270 0.11
271 0.11
272 0.1
273 0.09
274 0.1
275 0.07
276 0.07
277 0.09
278 0.09
279 0.1
280 0.11
281 0.14
282 0.14
283 0.15
284 0.15
285 0.18
286 0.21
287 0.25
288 0.27
289 0.25
290 0.25
291 0.25
292 0.29
293 0.31
294 0.32
295 0.35
296 0.36
297 0.35
298 0.34
299 0.34
300 0.29
301 0.23
302 0.19
303 0.11
304 0.07
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.05
309 0.05
310 0.04
311 0.03
312 0.03
313 0.03
314 0.04
315 0.05
316 0.05
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.08
322 0.08
323 0.1
324 0.11
325 0.11
326 0.11
327 0.12
328 0.14
329 0.15
330 0.16
331 0.16
332 0.17
333 0.19
334 0.21
335 0.21
336 0.27
337 0.26
338 0.27
339 0.3
340 0.33
341 0.33
342 0.31
343 0.36
344 0.32
345 0.31
346 0.32
347 0.29
348 0.28
349 0.31
350 0.34
351 0.28
352 0.31
353 0.31
354 0.28
355 0.27
356 0.22
357 0.2
358 0.16
359 0.16
360 0.1
361 0.09
362 0.1
363 0.09
364 0.1
365 0.09
366 0.09
367 0.08
368 0.09
369 0.09
370 0.1
371 0.13
372 0.11
373 0.11
374 0.11
375 0.16
376 0.18
377 0.19
378 0.2
379 0.2
380 0.22
381 0.24
382 0.24
383 0.2
384 0.17
385 0.16
386 0.13
387 0.11
388 0.09
389 0.07
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.07
394 0.08
395 0.08
396 0.08
397 0.08
398 0.08
399 0.08
400 0.12
401 0.13
402 0.12
403 0.12
404 0.13
405 0.14
406 0.15
407 0.18
408 0.16
409 0.19
410 0.24
411 0.27
412 0.26
413 0.28
414 0.27
415 0.24
416 0.24
417 0.2
418 0.2
419 0.22
420 0.25
421 0.31
422 0.38
423 0.43