FuNGI

P06839

Protein Details

Accession

P06839

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
681-701	LADRRFSRKRSQLPKWIAQGL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 11, cysk 11, cyto_nucl 8.5, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006555 ATP-dep_Helicase_C IPR010614 DEAD_2 IPR045028 DinG/Rad3-like IPR002464 DNA/RNA_helicase_DEAH_CS IPR010643 HBB IPR014013 Helic_SF1/SF2_ATP-bd_DinG/Rad3 IPR006554 Helicase-like_DEXD_c2 IPR027417 P-loop_NTPase IPR013020 Rad3/Chl1-like IPR001945 RAD3/XPD IPR042493 XPD_DNA_FeS
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0000112 C:nucleotide-excision repair factor 3 complex GO:0005634 C:nucleus GO:0000439 C:transcription factor TFIIH core complex GO:0005675 C:transcription factor TFIIH holo complex GO:0051539 F:4 iron, 4 sulfur cluster binding GO:0043139 F:5'-3' DNA helicase activity GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0008094 F:ATP-dependent activity, acting on DNA GO:0003684 F:damaged DNA binding GO:0003678 F:DNA helicase activity GO:0046872 F:metal ion binding GO:0006289 P:nucleotide-excision repair GO:0045951 P:positive regulation of mitotic recombination GO:0000019 P:regulation of mitotic recombination GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	sce:YER171W -
Pfam	View protein in Pfam PF06733 DEAD_2 PF06777 HBB PF13307 Helicase_C_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS00690 DEAH_ATP_HELICASE PS51193 HELICASE_ATP_BIND_2
CDD	cd18788 SF2_C_XPD

Amino Acid Sequences

MKFYIDDLPVLFPYPKIYPEQYNYMCDIKKTLDVGGNSILEMPSGTGKTVSLLSLTIAYQMHYPEHRKIIYCSRTMSEIEKALVELENLMDYRTKELGYQEDFRGLGLTSRKNLCLHPEVSKERKGTVVDEKCRRMTNGQAKRKLEEDPEANVELCEYHENLYNIEVEDYLPKGVFSFEKLLKYCEEKTLCPYFIVRRMISLCNIIIYSYHYLLDPKIAERVSNEVSKDSIVIFDEAHNIDNVCIESLSLDLTTDALRRATRGANALDERISEVRKVDSQKLQDEYEKLVQGLHSADILTDQEEPFVETPVLPQDLLTEAIPGNIRRAEHFVSFLKRLIEYLKTRMKVLHVISETPKSFLQHLKQLTFIERKPLRFCSERLSLLVRTLEVTEVEDFTALKDIATFATLISTYEEGFLLIIEPYEIENAAVPNPIMRFTCLDASIAIKPVFERFSSVIITSGTISPLDMYPRMLNFKTVLQKSYAMTLAKKSFLPMIITKGSDQVAISSRFEIRNDPSIVRNYGSMLVEFAKITPDGMVVFFPSYLYMESIVSMWQTMGILDEVWKHKLILVETPDAQETSLALETYRKACSNGRGAILLSVARGKVSEGIDFDHQYGRTVLMIGIPFQYTESRILKARLEFMRENYRIRENDFLSFDAMRHAAQCLGRVLRGKDDYGVMVLADRRFSRKRSQLPKWIAQGLSDADLNLSTDMAISNTKQFLRTMAQPTDPKDQEGVSVWSYEDLIKHQNSRKDQGGFIENENKEGEQDEDEDEDIEMQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.21
3	0.23
4	0.27
5	0.32
6	0.37
7	0.47
8	0.46
9	0.47
10	0.49
11	0.49
12	0.46
13	0.39
14	0.37
15	0.3
16	0.32
17	0.29
18	0.29
19	0.29
20	0.29
21	0.31
22	0.32
23	0.29
24	0.25
25	0.25
26	0.2
27	0.14
28	0.14
29	0.12
30	0.11
31	0.11
32	0.12
33	0.11
34	0.11
35	0.13
36	0.14
37	0.13
38	0.1
39	0.1
40	0.1
41	0.11
42	0.11
43	0.13
44	0.12
45	0.12
46	0.13
47	0.14
48	0.18
49	0.22
50	0.27
51	0.3
52	0.36
53	0.39
54	0.39
55	0.43
56	0.5
57	0.51
58	0.5
59	0.48
60	0.43
61	0.43
62	0.43
63	0.41
64	0.35
65	0.31
66	0.28
67	0.25
68	0.23
69	0.21
70	0.19
71	0.16
72	0.11
73	0.09
74	0.1
75	0.09
76	0.1
77	0.11
78	0.11
79	0.15
80	0.16
81	0.16
82	0.16
83	0.19
84	0.25
85	0.27
86	0.31
87	0.29
88	0.31
89	0.3
90	0.28
91	0.26
92	0.2
93	0.19
94	0.21
95	0.24
96	0.26
97	0.29
98	0.32
99	0.33
100	0.35
101	0.37
102	0.38
103	0.37
104	0.38
105	0.43
106	0.49
107	0.53
108	0.57
109	0.52
110	0.47
111	0.48
112	0.43
113	0.4
114	0.42
115	0.46
116	0.48
117	0.55
118	0.59
119	0.59
120	0.6
121	0.58
122	0.51
123	0.51
124	0.53
125	0.55
126	0.6
127	0.65
128	0.65
129	0.65
130	0.63
131	0.57
132	0.51
133	0.47
134	0.41
135	0.36
136	0.37
137	0.36
138	0.34
139	0.29
140	0.25
141	0.18
142	0.16
143	0.13
144	0.1
145	0.1
146	0.15
147	0.16
148	0.16
149	0.17
150	0.17
151	0.15
152	0.15
153	0.13
154	0.09
155	0.1
156	0.11
157	0.1
158	0.09
159	0.08
160	0.08
161	0.1
162	0.1
163	0.11
164	0.17
165	0.19
166	0.25
167	0.26
168	0.28
169	0.29
170	0.33
171	0.32
172	0.34
173	0.34
174	0.3
175	0.35
176	0.4
177	0.38
178	0.34
179	0.35
180	0.31
181	0.36
182	0.4
183	0.33
184	0.31
185	0.33
186	0.34
187	0.33
188	0.3
189	0.23
190	0.18
191	0.18
192	0.14
193	0.12
194	0.13
195	0.14
196	0.13
197	0.13
198	0.12
199	0.13
200	0.13
201	0.16
202	0.14
203	0.12
204	0.15
205	0.15
206	0.15
207	0.16
208	0.21
209	0.2
210	0.22
211	0.22
212	0.19
213	0.19
214	0.19
215	0.18
216	0.13
217	0.11
218	0.09
219	0.09
220	0.09
221	0.09
222	0.12
223	0.12
224	0.12
225	0.11
226	0.11
227	0.1
228	0.1
229	0.1
230	0.07
231	0.06
232	0.06
233	0.05
234	0.05
235	0.06
236	0.05
237	0.05
238	0.04
239	0.05
240	0.06
241	0.06
242	0.07
243	0.08
244	0.08
245	0.09
246	0.12
247	0.13
248	0.14
249	0.18
250	0.18
251	0.21
252	0.22
253	0.23
254	0.2
255	0.19
256	0.19
257	0.17
258	0.16
259	0.12
260	0.12
261	0.13
262	0.17
263	0.2
264	0.24
265	0.28
266	0.31
267	0.35
268	0.37
269	0.37
270	0.35
271	0.33
272	0.32
273	0.3
274	0.26
275	0.22
276	0.19
277	0.17
278	0.15
279	0.15
280	0.11
281	0.07
282	0.06
283	0.06
284	0.06
285	0.07
286	0.06
287	0.07
288	0.06
289	0.06
290	0.07
291	0.08
292	0.08
293	0.09
294	0.08
295	0.06
296	0.07
297	0.09
298	0.1
299	0.08
300	0.08
301	0.07
302	0.08
303	0.1
304	0.09
305	0.08
306	0.07
307	0.08
308	0.1
309	0.09
310	0.1
311	0.11
312	0.11
313	0.11
314	0.15
315	0.16
316	0.16
317	0.18
318	0.2
319	0.22
320	0.23
321	0.23
322	0.2
323	0.18
324	0.18
325	0.17
326	0.2
327	0.18
328	0.24
329	0.29
330	0.28
331	0.29
332	0.29
333	0.29
334	0.29
335	0.27
336	0.27
337	0.22
338	0.23
339	0.24
340	0.28
341	0.27
342	0.23
343	0.23
344	0.17
345	0.19
346	0.21
347	0.22
348	0.23
349	0.26
350	0.25
351	0.26
352	0.26
353	0.29
354	0.28
355	0.26
356	0.29
357	0.29
358	0.31
359	0.32
360	0.35
361	0.35
362	0.33
363	0.34
364	0.3
365	0.32
366	0.3
367	0.29
368	0.29
369	0.24
370	0.23
371	0.22
372	0.16
373	0.12
374	0.11
375	0.1
376	0.07
377	0.08
378	0.06
379	0.06
380	0.06
381	0.06
382	0.06
383	0.05
384	0.07
385	0.06
386	0.05
387	0.05
388	0.05
389	0.05
390	0.06
391	0.06
392	0.04
393	0.04
394	0.05
395	0.05
396	0.05
397	0.06
398	0.05
399	0.06
400	0.06
401	0.05
402	0.05
403	0.05
404	0.04
405	0.04
406	0.03
407	0.03
408	0.03
409	0.04
410	0.04
411	0.04
412	0.03
413	0.04
414	0.05
415	0.05
416	0.05
417	0.05
418	0.06
419	0.06
420	0.08
421	0.07
422	0.08
423	0.09
424	0.1
425	0.12
426	0.11
427	0.12
428	0.11
429	0.13
430	0.12
431	0.14
432	0.12
433	0.11
434	0.1
435	0.12
436	0.13
437	0.11
438	0.13
439	0.11
440	0.13
441	0.14
442	0.14
443	0.13
444	0.12
445	0.12
446	0.1
447	0.09
448	0.08
449	0.07
450	0.07
451	0.06
452	0.07
453	0.08
454	0.07
455	0.09
456	0.09
457	0.11
458	0.15
459	0.14
460	0.15
461	0.15
462	0.19
463	0.26
464	0.26
465	0.26
466	0.24
467	0.26
468	0.25
469	0.26
470	0.24
471	0.18
472	0.17
473	0.21
474	0.21
475	0.21
476	0.2
477	0.19
478	0.17
479	0.17
480	0.2
481	0.16
482	0.19
483	0.19
484	0.2
485	0.19
486	0.2
487	0.19
488	0.16
489	0.14
490	0.12
491	0.14
492	0.15
493	0.16
494	0.15
495	0.17
496	0.18
497	0.19
498	0.2
499	0.19
500	0.24
501	0.26
502	0.26
503	0.27
504	0.29
505	0.3
506	0.27
507	0.24
508	0.19
509	0.19
510	0.18
511	0.15
512	0.12
513	0.12
514	0.12
515	0.12
516	0.1
517	0.09
518	0.08
519	0.08
520	0.07
521	0.07
522	0.06
523	0.07
524	0.07
525	0.06
526	0.07
527	0.06
528	0.06
529	0.06
530	0.07
531	0.07
532	0.07
533	0.07
534	0.07
535	0.07
536	0.08
537	0.07
538	0.07
539	0.06
540	0.05
541	0.05
542	0.05
543	0.04
544	0.05
545	0.05
546	0.05
547	0.06
548	0.1
549	0.12
550	0.14
551	0.15
552	0.14
553	0.15
554	0.18
555	0.19
556	0.2
557	0.22
558	0.24
559	0.24
560	0.25
561	0.24
562	0.21
563	0.2
564	0.14
565	0.1
566	0.09
567	0.09
568	0.08
569	0.08
570	0.1
571	0.12
572	0.14
573	0.17
574	0.15
575	0.17
576	0.21
577	0.27
578	0.32
579	0.33
580	0.32
581	0.31
582	0.3
583	0.29
584	0.26
585	0.2
586	0.13
587	0.12
588	0.1
589	0.09
590	0.09
591	0.09
592	0.12
593	0.13
594	0.14
595	0.13
596	0.16
597	0.19
598	0.2
599	0.21
600	0.2
601	0.19
602	0.19
603	0.19
604	0.17
605	0.14
606	0.14
607	0.12
608	0.11
609	0.12
610	0.11
611	0.12
612	0.11
613	0.11
614	0.11
615	0.12
616	0.11
617	0.17
618	0.18
619	0.19
620	0.22
621	0.24
622	0.28
623	0.29
624	0.35
625	0.32
626	0.37
627	0.37
628	0.4
629	0.48
630	0.46
631	0.48
632	0.44
633	0.48
634	0.43
635	0.44
636	0.46
637	0.37
638	0.4
639	0.39
640	0.36
641	0.31
642	0.3
643	0.26
644	0.22
645	0.21
646	0.15
647	0.14
648	0.14
649	0.15
650	0.15
651	0.18
652	0.19
653	0.2
654	0.23
655	0.27
656	0.28
657	0.32
658	0.33
659	0.32
660	0.29
661	0.29
662	0.26
663	0.22
664	0.21
665	0.13
666	0.13
667	0.15
668	0.14
669	0.16
670	0.17
671	0.23
672	0.27
673	0.31
674	0.39
675	0.46
676	0.55
677	0.63
678	0.71
679	0.75
680	0.8
681	0.84
682	0.8
683	0.76
684	0.66
685	0.56
686	0.5
687	0.41
688	0.34
689	0.26
690	0.2
691	0.14
692	0.14
693	0.14
694	0.1
695	0.08
696	0.06
697	0.06
698	0.06
699	0.07
700	0.09
701	0.09
702	0.14
703	0.18
704	0.19
705	0.2
706	0.2
707	0.23
708	0.26
709	0.32
710	0.36
711	0.36
712	0.42
713	0.46
714	0.5
715	0.57
716	0.53
717	0.47
718	0.42
719	0.37
720	0.33
721	0.32
722	0.31
723	0.22
724	0.21
725	0.19
726	0.18
727	0.19
728	0.17
729	0.15
730	0.15
731	0.21
732	0.24
733	0.32
734	0.38
735	0.46
736	0.51
737	0.57
738	0.61
739	0.58
740	0.56
741	0.54
742	0.55
743	0.49
744	0.48
745	0.52
746	0.44
747	0.42
748	0.42
749	0.35
750	0.29
751	0.27
752	0.23
753	0.16
754	0.18
755	0.17
756	0.18
757	0.18
758	0.18

P06839

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer