FuNGI

A0A0K6FVQ8

Protein Details

Accession

A0A0K6FVQ8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
109-128	GVAPRAKMNQQRSRRFRAAQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
418-421	KRRK
926-942	SRRGGGGRGRGGRGGPP

Subcellular Location(s)

mito 14, cyto 9, nucl 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N PF00098 zf-CCHC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLSKKYPKIVSQVVEEESTKVEDADGNLVELPLDTSGPNPNGFELDCLYLDMNGIVHPCTHPEGKPAPETEEDMMVEVFNYTDRVVSMARPRKLLFMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAQEAKEKEEERKESIKMFEALGHPVSEETKRKPWDSNAITPGTPFMDLLAQSLRYWVVQKQNSDPGWKNLQVIISDASVPGEGEHKIMDFIRRQRVNPGHDPNTRHVIYGLDADLIMLALATHEPHFRVLREDVFADSNKNACRTCGKEGHFAAQCTGIPKEKDTSKPAEKKPFIFLDVAVLREYLAIELNVPNIPFSFDLERAIDDWVFLIFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDTLLKIWKDELPRMGGYLAEHGQANKANVQIMLEGLAKREDEIFRKRREAEERQEQNAKRRKVEQQRAKEREQDAQLVEVTPASTSGGPHGLPSRPSFDVFTGSSLPNNPTFAGSNSDVVANRAALRLANLSAADAMRAELAGAAPLKPTNRATLTEVTPTTSEAPEAPVPAEAPAPEQTVEPQSEAEVPAPVSEAPEATKDVDMAVDSESGNGEVPDGAVDALIANAVNNAGADEGPRGVKRPAEAMEKDESDTPAEDEESGAKKALKVNPDGTVEQEDTVKLWEPGYKERYYRSKFGAELSDTELRKQITTSYMEGLCWVLQYYYQGAPSWTWFYPYHFAPFAADFEDVEHMDITFNLGQPFKPYEQLMGVFPAASRVHIPMPFQSLMTDEDSPIIDFYPTEFEIDMNGKKMSWQGVALLPFIDEKRLLGAMSERYPKLTDDEVRRNKWGCNHIYVSDGNDLYDFFCGLYTKRKSEKPIPLDTRLSRGISGTVLYDPSCVPESSYPSPLTKVGLPDIVANRTLSAQFYYPRQTTPHRSVLLPGVRLAPKTLGQADAEHVMRGGESRRGGGGRGRGGRGGPPRDAGFVSSTGGYSDRPGAYERNGSRFSQFDSYNGGYGSGYAGSGGPGGHGGYGGNGGGGYSGGGYGGDGGYRGNDNYRGGGAGGGYGGGGGRGGYNGYDRGSAQRGASRGGSSRGGGRGGYNGSSGYGGGGGYGGYGGRGR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.59
2	0.64
3	0.68
4	0.7
5	0.65
6	0.62
7	0.59
8	0.54
9	0.47
10	0.42
11	0.35
12	0.29
13	0.27
14	0.21
15	0.16
16	0.14
17	0.13
18	0.14
19	0.17
20	0.16
21	0.15
22	0.15
23	0.15
24	0.14
25	0.12
26	0.11
27	0.07
28	0.08
29	0.07
30	0.08
31	0.15
32	0.17
33	0.19
34	0.18
35	0.19
36	0.2
37	0.2
38	0.21
39	0.17
40	0.17
41	0.16
42	0.17
43	0.16
44	0.14
45	0.14
46	0.12
47	0.1
48	0.09
49	0.09
50	0.08
51	0.09
52	0.1
53	0.12
54	0.17
55	0.2
56	0.2
57	0.26
58	0.32
59	0.36
60	0.41
61	0.4
62	0.4
63	0.39
64	0.42
65	0.36
66	0.33
67	0.28
68	0.24
69	0.22
70	0.17
71	0.14
72	0.11
73	0.09
74	0.07
75	0.07
76	0.06
77	0.07
78	0.07
79	0.09
80	0.1
81	0.15
82	0.25
83	0.33
84	0.36
85	0.39
86	0.4
87	0.43
88	0.43
89	0.43
90	0.34
91	0.29
92	0.29
93	0.25
94	0.25
95	0.21
96	0.21
97	0.17
98	0.16
99	0.12
100	0.13
101	0.2
102	0.27
103	0.37
104	0.45
105	0.55
106	0.66
107	0.74
108	0.79
109	0.81
110	0.78
111	0.74
112	0.75
113	0.75
114	0.73
115	0.76
116	0.71
117	0.67
118	0.7
119	0.65
120	0.61
121	0.6
122	0.55
123	0.51
124	0.51
125	0.49
126	0.46
127	0.48
128	0.45
129	0.38
130	0.34
131	0.32
132	0.28
133	0.29
134	0.26
135	0.23
136	0.18
137	0.17
138	0.19
139	0.21
140	0.24
141	0.27
142	0.34
143	0.39
144	0.41
145	0.46
146	0.5
147	0.55
148	0.56
149	0.59
150	0.56
151	0.55
152	0.52
153	0.46
154	0.42
155	0.32
156	0.26
157	0.17
158	0.12
159	0.11
160	0.11
161	0.13
162	0.14
163	0.13
164	0.13
165	0.14
166	0.14
167	0.12
168	0.14
169	0.17
170	0.24
171	0.28
172	0.32
173	0.36
174	0.45
175	0.46
176	0.51
177	0.5
178	0.46
179	0.49
180	0.47
181	0.43
182	0.36
183	0.37
184	0.3
185	0.28
186	0.24
187	0.18
188	0.16
189	0.14
190	0.12
191	0.1
192	0.1
193	0.08
194	0.08
195	0.08
196	0.08
197	0.08
198	0.08
199	0.1
200	0.11
201	0.15
202	0.2
203	0.27
204	0.36
205	0.39
206	0.4
207	0.48
208	0.55
209	0.58
210	0.61
211	0.63
212	0.61
213	0.63
214	0.67
215	0.61
216	0.62
217	0.55
218	0.46
219	0.37
220	0.3
221	0.25
222	0.23
223	0.19
224	0.12
225	0.11
226	0.1
227	0.09
228	0.08
229	0.06
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.04
235	0.05
236	0.07
237	0.08
238	0.11
239	0.13
240	0.14
241	0.18
242	0.2
243	0.22
244	0.23
245	0.23
246	0.21
247	0.22
248	0.22
249	0.2
250	0.19
251	0.2
252	0.2
253	0.23
254	0.21
255	0.2
256	0.26
257	0.28
258	0.34
259	0.38
260	0.4
261	0.45
262	0.46
263	0.52
264	0.49
265	0.45
266	0.38
267	0.32
268	0.3
269	0.24
270	0.24
271	0.21
272	0.19
273	0.2
274	0.25
275	0.28
276	0.32
277	0.35
278	0.41
279	0.47
280	0.55
281	0.61
282	0.67
283	0.65
284	0.63
285	0.64
286	0.58
287	0.5
288	0.42
289	0.34
290	0.31
291	0.28
292	0.26
293	0.2
294	0.17
295	0.15
296	0.14
297	0.14
298	0.07
299	0.06
300	0.05
301	0.06
302	0.07
303	0.08
304	0.09
305	0.09
306	0.08
307	0.08
308	0.09
309	0.09
310	0.11
311	0.13
312	0.12
313	0.14
314	0.15
315	0.15
316	0.14
317	0.16
318	0.13
319	0.1
320	0.09
321	0.07
322	0.07
323	0.06
324	0.06
325	0.04
326	0.04
327	0.05
328	0.05
329	0.05
330	0.05
331	0.07
332	0.07
333	0.08
334	0.08
335	0.08
336	0.07
337	0.08
338	0.12
339	0.12
340	0.12
341	0.11
342	0.12
343	0.11
344	0.11
345	0.11
346	0.07
347	0.06
348	0.08
349	0.1
350	0.09
351	0.09
352	0.1
353	0.13
354	0.16
355	0.19
356	0.19
357	0.21
358	0.21
359	0.22
360	0.21
361	0.18
362	0.15
363	0.15
364	0.13
365	0.11
366	0.11
367	0.1
368	0.12
369	0.13
370	0.14
371	0.12
372	0.12
373	0.12
374	0.12
375	0.12
376	0.1
377	0.09
378	0.09
379	0.09
380	0.09
381	0.09
382	0.1
383	0.09
384	0.09
385	0.12
386	0.12
387	0.16
388	0.26
389	0.32
390	0.35
391	0.4
392	0.42
393	0.46
394	0.52
395	0.55
396	0.54
397	0.58
398	0.59
399	0.59
400	0.65
401	0.61
402	0.62
403	0.62
404	0.57
405	0.49
406	0.5
407	0.55
408	0.58
409	0.67
410	0.67
411	0.69
412	0.77
413	0.8
414	0.77
415	0.75
416	0.66
417	0.61
418	0.53
419	0.46
420	0.35
421	0.31
422	0.28
423	0.21
424	0.19
425	0.13
426	0.1
427	0.06
428	0.06
429	0.05
430	0.05
431	0.05
432	0.06
433	0.08
434	0.07
435	0.08
436	0.11
437	0.11
438	0.13
439	0.15
440	0.18
441	0.17
442	0.18
443	0.19
444	0.17
445	0.18
446	0.17
447	0.17
448	0.15
449	0.15
450	0.14
451	0.14
452	0.16
453	0.13
454	0.14
455	0.12
456	0.11
457	0.12
458	0.12
459	0.15
460	0.14
461	0.14
462	0.13
463	0.15
464	0.13
465	0.13
466	0.13
467	0.09
468	0.08
469	0.08
470	0.07
471	0.06
472	0.07
473	0.07
474	0.07
475	0.07
476	0.06
477	0.06
478	0.07
479	0.06
480	0.06
481	0.05
482	0.05
483	0.04
484	0.04
485	0.04
486	0.03
487	0.03
488	0.04
489	0.04
490	0.04
491	0.05
492	0.06
493	0.07
494	0.09
495	0.1
496	0.12
497	0.14
498	0.16
499	0.19
500	0.21
501	0.22
502	0.23
503	0.22
504	0.2
505	0.18
506	0.17
507	0.15
508	0.12
509	0.11
510	0.08
511	0.1
512	0.09
513	0.1
514	0.09
515	0.08
516	0.08
517	0.08
518	0.08
519	0.06
520	0.07
521	0.08
522	0.08
523	0.09
524	0.08
525	0.09
526	0.11
527	0.11
528	0.1
529	0.09
530	0.08
531	0.09
532	0.09
533	0.09
534	0.07
535	0.06
536	0.06
537	0.07
538	0.06
539	0.06
540	0.05
541	0.05
542	0.05
543	0.06
544	0.07
545	0.07
546	0.07
547	0.07
548	0.07
549	0.07
550	0.06
551	0.06
552	0.05
553	0.05
554	0.05
555	0.05
556	0.05
557	0.05
558	0.05
559	0.05
560	0.04
561	0.03
562	0.03
563	0.03
564	0.03
565	0.03
566	0.03
567	0.03
568	0.03
569	0.03
570	0.03
571	0.02
572	0.02
573	0.02
574	0.02
575	0.02
576	0.02
577	0.02
578	0.03
579	0.03
580	0.03
581	0.04
582	0.05
583	0.06
584	0.06
585	0.08
586	0.09
587	0.1
588	0.1
589	0.13
590	0.16
591	0.21
592	0.22
593	0.23
594	0.25
595	0.25
596	0.25
597	0.23
598	0.2
599	0.15
600	0.14
601	0.11
602	0.09
603	0.08
604	0.08
605	0.07
606	0.09
607	0.1
608	0.1
609	0.1
610	0.1
611	0.12
612	0.17
613	0.2
614	0.21
615	0.22
616	0.24
617	0.27
618	0.3
619	0.29
620	0.25
621	0.24
622	0.21
623	0.18
624	0.17
625	0.13
626	0.1
627	0.11
628	0.1
629	0.07
630	0.08
631	0.09
632	0.11
633	0.18
634	0.23
635	0.24
636	0.25
637	0.3
638	0.39
639	0.41
640	0.43
641	0.41
642	0.39
643	0.38
644	0.39
645	0.38
646	0.29
647	0.27
648	0.27
649	0.29
650	0.26
651	0.26
652	0.26
653	0.22
654	0.21
655	0.19
656	0.16
657	0.14
658	0.17
659	0.17
660	0.18
661	0.18
662	0.17
663	0.17
664	0.16
665	0.13
666	0.1
667	0.09
668	0.05
669	0.05
670	0.06
671	0.09
672	0.09
673	0.1
674	0.1
675	0.11
676	0.11
677	0.13
678	0.16
679	0.13
680	0.16
681	0.16
682	0.19
683	0.21
684	0.22
685	0.24
686	0.21
687	0.21
688	0.18
689	0.19
690	0.16
691	0.15
692	0.14
693	0.1
694	0.1
695	0.12
696	0.1
697	0.1
698	0.09
699	0.07
700	0.07
701	0.07
702	0.09
703	0.08
704	0.09
705	0.1
706	0.1
707	0.1
708	0.13
709	0.17
710	0.15
711	0.17
712	0.16
713	0.16
714	0.18
715	0.19
716	0.17
717	0.15
718	0.14
719	0.12
720	0.11
721	0.13
722	0.11
723	0.11
724	0.11
725	0.11
726	0.14
727	0.15
728	0.16
729	0.14
730	0.2
731	0.2
732	0.19
733	0.17
734	0.16
735	0.17
736	0.19
737	0.17
738	0.12
739	0.13
740	0.13
741	0.13
742	0.11
743	0.1
744	0.07
745	0.06
746	0.07
747	0.1
748	0.1
749	0.11
750	0.1
751	0.1
752	0.12
753	0.16
754	0.16
755	0.14
756	0.14
757	0.13
758	0.13
759	0.15
760	0.16
761	0.13
762	0.13
763	0.13
764	0.16
765	0.17
766	0.17
767	0.15
768	0.13
769	0.13
770	0.13
771	0.12
772	0.09
773	0.08
774	0.09
775	0.1
776	0.09
777	0.08
778	0.12
779	0.14
780	0.19
781	0.24
782	0.22
783	0.23
784	0.24
785	0.24
786	0.25
787	0.26
788	0.28
789	0.32
790	0.42
791	0.49
792	0.52
793	0.56
794	0.54
795	0.52
796	0.53
797	0.53
798	0.46
799	0.44
800	0.44
801	0.4
802	0.41
803	0.39
804	0.34
805	0.3
806	0.26
807	0.19
808	0.16
809	0.16
810	0.13
811	0.13
812	0.1
813	0.06
814	0.06
815	0.07
816	0.08
817	0.17
818	0.21
819	0.28
820	0.34
821	0.39
822	0.46
823	0.55
824	0.64
825	0.62
826	0.68
827	0.68
828	0.68
829	0.7
830	0.64
831	0.6
832	0.53
833	0.47
834	0.37
835	0.31
836	0.26
837	0.19
838	0.18
839	0.14
840	0.11
841	0.11
842	0.11
843	0.11
844	0.1
845	0.12
846	0.14
847	0.12
848	0.13
849	0.16
850	0.23
851	0.25
852	0.29
853	0.29
854	0.28
855	0.3
856	0.29
857	0.28
858	0.23
859	0.22
860	0.2
861	0.2
862	0.19
863	0.22
864	0.24
865	0.24
866	0.22
867	0.2
868	0.18
869	0.18
870	0.18
871	0.14
872	0.13
873	0.14
874	0.15
875	0.18
876	0.25
877	0.24
878	0.26
879	0.29
880	0.35
881	0.41
882	0.47
883	0.51
884	0.47
885	0.46
886	0.47
887	0.51
888	0.49
889	0.42
890	0.36
891	0.33
892	0.33
893	0.33
894	0.31
895	0.25
896	0.22
897	0.24
898	0.25
899	0.2
900	0.2
901	0.21
902	0.21
903	0.23
904	0.21
905	0.18
906	0.16
907	0.14
908	0.13
909	0.14
910	0.14
911	0.14
912	0.15
913	0.16
914	0.19
915	0.19
916	0.21
917	0.24
918	0.28
919	0.31
920	0.36
921	0.36
922	0.35
923	0.36
924	0.41
925	0.45
926	0.43
927	0.37
928	0.36
929	0.36
930	0.36
931	0.36
932	0.31
933	0.24
934	0.2
935	0.2
936	0.16
937	0.15
938	0.13
939	0.14
940	0.12
941	0.12
942	0.16
943	0.14
944	0.15
945	0.18
946	0.2
947	0.23
948	0.32
949	0.33
950	0.36
951	0.39
952	0.39
953	0.39
954	0.38
955	0.39
956	0.36
957	0.33
958	0.27
959	0.32
960	0.32
961	0.3
962	0.29
963	0.25
964	0.18
965	0.17
966	0.17
967	0.1
968	0.08
969	0.07
970	0.07
971	0.06
972	0.07
973	0.07
974	0.06
975	0.06
976	0.07
977	0.06
978	0.06
979	0.06
980	0.06
981	0.07
982	0.06
983	0.06
984	0.05
985	0.05
986	0.05
987	0.05
988	0.05
989	0.04
990	0.04
991	0.04
992	0.04
993	0.04
994	0.05
995	0.05
996	0.05
997	0.05
998	0.05
999	0.07
1000	0.09
1001	0.1
1002	0.13
1003	0.16
1004	0.17
1005	0.19
1006	0.2
1007	0.19
1008	0.17
1009	0.17
1010	0.14
1011	0.11
1012	0.09
1013	0.07
1014	0.06
1015	0.05
1016	0.05
1017	0.04
1018	0.04
1019	0.04
1020	0.04
1021	0.04
1022	0.05
1023	0.06
1024	0.09
1025	0.11
1026	0.12
1027	0.14
1028	0.15
1029	0.2
1030	0.23
1031	0.24
1032	0.25
1033	0.27
1034	0.28
1035	0.29
1036	0.31
1037	0.29
1038	0.29
1039	0.3
1040	0.3
1041	0.27
1042	0.31
1043	0.3
1044	0.29
1045	0.26
1046	0.24
1047	0.25
1048	0.25
1049	0.25
1050	0.21
1051	0.18
1052	0.18
1053	0.18
1054	0.16
1055	0.12
1056	0.09
1057	0.08
1058	0.07
1059	0.06
1060	0.05
1061	0.05
1062	0.05
1063	0.04

A0A0K6FVQ8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer