Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P38779

Protein Details
Accession P38779    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-30KSTPVSTPSKEKKKVIEKKSSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-27SKEKKKVIEKK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0000502  C:proteasome complex  
GO:0042802  F:identical protein binding  
GO:0070180  F:large ribosomal subunit rRNA binding  
GO:0070628  F:proteasome binding  
GO:0030674  F:protein-macromolecule adaptor activity  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0030163  P:protein catabolic process  
KEGG sce:YHR052W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00687  Ribosomal_L1  
Amino Acid Sequences MAKKSNSKKSTPVSTPSKEKKKVIEKKSSTAIPRERVIKAVNELIKFTSKPQDENNEEGNNGKKNLLEDDEEELKKDLQLIVVNNKSFTGTSKSFKLKLLNVKHSFYKPWKEASATAVKDFKVLLILKDSDIKKVSEDDLFDQLDSEGIKVDEIICGKDLKTVYKAYEARNAFISQFSLILADDSIVTSLPKLMGGKAYNKVETTPISIRTHANKEFSLTTLTNNIKKVYMNQLPVKLPRGTTLNVHLGNLEWLRPEEFVDNVELISEQLIKAYQIRSIFIKTNRSPVLPLYYNQDVLDELEAKKDKIEETHEDDMVTIDGVQVHLSTFNKGLMEIANPSELGSIFSKQINNAKKRSSSELEKESSESEAVKKAKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.75
3 0.77
4 0.8
5 0.77
6 0.77
7 0.78
8 0.79
9 0.83
10 0.82
11 0.82
12 0.78
13 0.77
14 0.79
15 0.76
16 0.7
17 0.7
18 0.68
19 0.62
20 0.61
21 0.6
22 0.53
23 0.5
24 0.48
25 0.43
26 0.39
27 0.41
28 0.41
29 0.36
30 0.36
31 0.34
32 0.35
33 0.31
34 0.31
35 0.32
36 0.29
37 0.32
38 0.37
39 0.45
40 0.45
41 0.5
42 0.52
43 0.45
44 0.43
45 0.42
46 0.41
47 0.35
48 0.32
49 0.27
50 0.23
51 0.22
52 0.26
53 0.26
54 0.23
55 0.21
56 0.26
57 0.32
58 0.3
59 0.3
60 0.28
61 0.25
62 0.23
63 0.22
64 0.17
65 0.12
66 0.16
67 0.18
68 0.25
69 0.29
70 0.3
71 0.28
72 0.28
73 0.26
74 0.23
75 0.22
76 0.22
77 0.2
78 0.23
79 0.3
80 0.35
81 0.36
82 0.39
83 0.42
84 0.41
85 0.47
86 0.53
87 0.57
88 0.56
89 0.57
90 0.58
91 0.55
92 0.55
93 0.52
94 0.52
95 0.45
96 0.45
97 0.44
98 0.42
99 0.41
100 0.41
101 0.42
102 0.35
103 0.35
104 0.33
105 0.3
106 0.28
107 0.26
108 0.21
109 0.17
110 0.16
111 0.14
112 0.15
113 0.16
114 0.16
115 0.23
116 0.23
117 0.21
118 0.23
119 0.22
120 0.19
121 0.2
122 0.21
123 0.17
124 0.18
125 0.17
126 0.19
127 0.19
128 0.18
129 0.16
130 0.14
131 0.13
132 0.11
133 0.09
134 0.06
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.06
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.08
144 0.08
145 0.12
146 0.12
147 0.12
148 0.15
149 0.16
150 0.16
151 0.23
152 0.26
153 0.25
154 0.32
155 0.31
156 0.29
157 0.29
158 0.29
159 0.22
160 0.19
161 0.17
162 0.1
163 0.09
164 0.08
165 0.06
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.05
180 0.05
181 0.08
182 0.1
183 0.14
184 0.18
185 0.2
186 0.2
187 0.2
188 0.2
189 0.19
190 0.18
191 0.19
192 0.17
193 0.2
194 0.2
195 0.22
196 0.24
197 0.27
198 0.32
199 0.3
200 0.3
201 0.25
202 0.26
203 0.25
204 0.24
205 0.23
206 0.18
207 0.16
208 0.2
209 0.23
210 0.24
211 0.24
212 0.24
213 0.21
214 0.21
215 0.23
216 0.25
217 0.28
218 0.3
219 0.32
220 0.36
221 0.38
222 0.4
223 0.41
224 0.33
225 0.29
226 0.25
227 0.25
228 0.22
229 0.21
230 0.24
231 0.26
232 0.25
233 0.25
234 0.23
235 0.2
236 0.22
237 0.2
238 0.15
239 0.09
240 0.1
241 0.11
242 0.11
243 0.12
244 0.1
245 0.1
246 0.1
247 0.11
248 0.1
249 0.09
250 0.09
251 0.08
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.05
256 0.05
257 0.06
258 0.06
259 0.09
260 0.09
261 0.12
262 0.12
263 0.14
264 0.16
265 0.19
266 0.25
267 0.27
268 0.35
269 0.34
270 0.41
271 0.42
272 0.41
273 0.39
274 0.35
275 0.39
276 0.32
277 0.31
278 0.29
279 0.29
280 0.29
281 0.28
282 0.26
283 0.18
284 0.17
285 0.18
286 0.15
287 0.12
288 0.18
289 0.19
290 0.19
291 0.19
292 0.2
293 0.19
294 0.2
295 0.26
296 0.26
297 0.32
298 0.37
299 0.36
300 0.34
301 0.33
302 0.3
303 0.24
304 0.18
305 0.1
306 0.06
307 0.06
308 0.07
309 0.07
310 0.06
311 0.06
312 0.1
313 0.1
314 0.12
315 0.13
316 0.14
317 0.14
318 0.14
319 0.15
320 0.13
321 0.14
322 0.14
323 0.15
324 0.14
325 0.14
326 0.14
327 0.14
328 0.13
329 0.14
330 0.13
331 0.14
332 0.15
333 0.19
334 0.2
335 0.23
336 0.32
337 0.39
338 0.44
339 0.48
340 0.53
341 0.57
342 0.6
343 0.64
344 0.64
345 0.63
346 0.65
347 0.67
348 0.63
349 0.58
350 0.55
351 0.48
352 0.43
353 0.35
354 0.28
355 0.22
356 0.27