Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P53277

Protein Details
Accession P53277    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
168-188LQSESKKRYEARKRQMQNAKTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000974  C:Prp19 complex  
GO:0071006  C:U2-type catalytic step 1 spliceosome  
GO:0071007  C:U2-type catalytic step 2 spliceosome  
GO:0071008  C:U2-type post-mRNA release spliceosomal complex  
GO:0071004  C:U2-type prespliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG sce:YGR129W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MDFYKLDEKLKELKRKRVDVSIKSRKLADREIQEVSANRKPRVYSMEDVNDADESVGDTESPEKEKAFHYTVQEYDAWERRHPQGKTGQSQRGGISYDQLAKLSYEKTLRNLATQTQNSSKQDSSADEEDNKNVPKKGRIGKVQKDTKTGKITIADDDKLVNKLAVSLQSESKKRYEARKRQMQNAKTLYGVESFINDKNKQFNEKLSRESKGSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.75
3 0.76
4 0.76
5 0.77
6 0.76
7 0.79
8 0.8
9 0.75
10 0.7
11 0.7
12 0.64
13 0.59
14 0.57
15 0.54
16 0.48
17 0.48
18 0.48
19 0.45
20 0.43
21 0.41
22 0.39
23 0.38
24 0.37
25 0.34
26 0.34
27 0.34
28 0.35
29 0.38
30 0.37
31 0.35
32 0.37
33 0.41
34 0.4
35 0.4
36 0.36
37 0.3
38 0.24
39 0.2
40 0.13
41 0.08
42 0.07
43 0.06
44 0.05
45 0.05
46 0.07
47 0.09
48 0.11
49 0.12
50 0.11
51 0.13
52 0.15
53 0.19
54 0.21
55 0.23
56 0.24
57 0.26
58 0.26
59 0.27
60 0.26
61 0.22
62 0.24
63 0.27
64 0.25
65 0.23
66 0.26
67 0.29
68 0.37
69 0.36
70 0.36
71 0.38
72 0.43
73 0.5
74 0.54
75 0.54
76 0.48
77 0.49
78 0.45
79 0.38
80 0.33
81 0.25
82 0.19
83 0.14
84 0.15
85 0.13
86 0.13
87 0.11
88 0.1
89 0.11
90 0.1
91 0.11
92 0.12
93 0.12
94 0.15
95 0.2
96 0.2
97 0.2
98 0.2
99 0.22
100 0.26
101 0.26
102 0.27
103 0.26
104 0.31
105 0.31
106 0.33
107 0.29
108 0.23
109 0.24
110 0.22
111 0.23
112 0.2
113 0.21
114 0.2
115 0.21
116 0.21
117 0.23
118 0.23
119 0.21
120 0.21
121 0.22
122 0.23
123 0.3
124 0.36
125 0.41
126 0.48
127 0.55
128 0.61
129 0.7
130 0.74
131 0.69
132 0.69
133 0.65
134 0.63
135 0.58
136 0.5
137 0.43
138 0.38
139 0.37
140 0.34
141 0.35
142 0.28
143 0.23
144 0.23
145 0.22
146 0.19
147 0.19
148 0.14
149 0.1
150 0.1
151 0.11
152 0.13
153 0.15
154 0.15
155 0.21
156 0.27
157 0.3
158 0.32
159 0.33
160 0.36
161 0.38
162 0.47
163 0.52
164 0.57
165 0.65
166 0.73
167 0.77
168 0.81
169 0.86
170 0.8
171 0.79
172 0.73
173 0.64
174 0.54
175 0.49
176 0.4
177 0.31
178 0.28
179 0.18
180 0.15
181 0.16
182 0.2
183 0.26
184 0.26
185 0.27
186 0.34
187 0.39
188 0.44
189 0.44
190 0.49
191 0.53
192 0.56
193 0.62
194 0.59
195 0.59