Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P40078

Protein Details
Accession P40078    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-39ERHIKQHGKRLDHEERKRKREARESHKISERABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-74HGKRLDHEERKRKREARESHKISERAQKLTGWKGKQFAKKRYAEKVSMRKKIKAHEQSKVK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 11.166, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039411  NSA2_fam  
IPR022309  Ribosomal_S8e/biogenesis_NSA2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0000460  P:maturation of 5.8S rRNA  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000470  P:maturation of LSU-rRNA  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
KEGG sce:YER126C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01201  Ribosomal_S8e  
CDD cd11381  NSA2  
Amino Acid Sequences MPQNDYIERHIKQHGKRLDHEERKRKREARESHKISERAQKLTGWKGKQFAKKRYAEKVSMRKKIKAHEQSKVKGSSKPLDTDGDALPTYLLDREQNNTAKAISSSIKQKRLEKADKFSVPLPKVRGISEEEMFKVIKTGKSRSKSWKRMITKHTFVGEGFTRRPVKMERIIRPSALRQKKANVTHPELGVTVFLPILAVKKNPQSPMYTQLGVLTKGTIIEVNVSELGMVTAGGKVVWGKYAQVTNEPDRDGCVNAVLLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.58
3 0.63
4 0.69
5 0.72
6 0.74
7 0.79
8 0.8
9 0.82
10 0.83
11 0.86
12 0.83
13 0.82
14 0.81
15 0.81
16 0.81
17 0.82
18 0.82
19 0.8
20 0.82
21 0.76
22 0.7
23 0.69
24 0.64
25 0.57
26 0.51
27 0.46
28 0.43
29 0.49
30 0.53
31 0.48
32 0.47
33 0.49
34 0.55
35 0.61
36 0.65
37 0.65
38 0.67
39 0.7
40 0.73
41 0.76
42 0.75
43 0.72
44 0.73
45 0.74
46 0.74
47 0.76
48 0.74
49 0.7
50 0.68
51 0.67
52 0.68
53 0.68
54 0.65
55 0.64
56 0.69
57 0.68
58 0.7
59 0.7
60 0.61
61 0.54
62 0.53
63 0.51
64 0.46
65 0.43
66 0.39
67 0.34
68 0.32
69 0.31
70 0.26
71 0.21
72 0.18
73 0.15
74 0.12
75 0.1
76 0.1
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.08
81 0.11
82 0.16
83 0.19
84 0.19
85 0.19
86 0.19
87 0.17
88 0.17
89 0.17
90 0.12
91 0.13
92 0.21
93 0.27
94 0.34
95 0.36
96 0.41
97 0.46
98 0.54
99 0.61
100 0.56
101 0.57
102 0.57
103 0.55
104 0.52
105 0.48
106 0.46
107 0.38
108 0.37
109 0.33
110 0.29
111 0.29
112 0.27
113 0.26
114 0.22
115 0.23
116 0.21
117 0.19
118 0.16
119 0.16
120 0.16
121 0.13
122 0.12
123 0.11
124 0.13
125 0.15
126 0.21
127 0.27
128 0.31
129 0.37
130 0.46
131 0.55
132 0.61
133 0.66
134 0.7
135 0.7
136 0.74
137 0.78
138 0.75
139 0.69
140 0.64
141 0.57
142 0.48
143 0.4
144 0.36
145 0.3
146 0.24
147 0.21
148 0.23
149 0.24
150 0.23
151 0.26
152 0.25
153 0.28
154 0.33
155 0.41
156 0.43
157 0.47
158 0.49
159 0.48
160 0.48
161 0.49
162 0.51
163 0.51
164 0.48
165 0.44
166 0.49
167 0.56
168 0.6
169 0.62
170 0.59
171 0.58
172 0.57
173 0.54
174 0.48
175 0.4
176 0.34
177 0.25
178 0.17
179 0.11
180 0.07
181 0.06
182 0.05
183 0.05
184 0.06
185 0.08
186 0.09
187 0.12
188 0.19
189 0.23
190 0.27
191 0.29
192 0.32
193 0.33
194 0.39
195 0.41
196 0.35
197 0.31
198 0.32
199 0.32
200 0.28
201 0.25
202 0.18
203 0.13
204 0.13
205 0.13
206 0.09
207 0.07
208 0.09
209 0.09
210 0.11
211 0.11
212 0.1
213 0.1
214 0.09
215 0.09
216 0.06
217 0.06
218 0.04
219 0.04
220 0.05
221 0.04
222 0.05
223 0.06
224 0.06
225 0.09
226 0.09
227 0.1
228 0.14
229 0.19
230 0.21
231 0.26
232 0.32
233 0.36
234 0.4
235 0.4
236 0.36
237 0.35
238 0.35
239 0.3
240 0.25
241 0.2