Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P20484

Protein Details
Accession P20484    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
384-414ELKKIMFGEKKKLNKKKRKQLKKSKVSVELEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
391-408GEKKKLNKKKRKQLKKSK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12.5, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0031965  C:nuclear membrane  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
KEGG sce:YKL021C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MSAIGDKNQFRIIVGSYEHNILCLSLDIPNQKENDAAKTPHFMPIFHFQAHSLSIKCLAVSRRYLVSGSNDEHIRIYDLQKRKELGTLLSHQGSITALQFSHPASSSEDAAVSKGSKNSKWLLSASEDHKIMVWRVKDWETVGTLKGHTARVNDVDIHPTNRIAISVSDDHSIRLWNLMTLRNAAVLKLRKYNTNGTCVRWLGAKGDYFAVGLRDRVLIYETGSAKVFKEIVFQRKTLMHIETHILPFDNKEYLSVGISDGNVHFYPCEELFEKVEENEKQEDDDDKEDISPAFSLLGHTNRIKDFKFYTNEFGTYLVTIGSDGKIVVWDMSTKEQVAVYDCGERLNCLTLCDESIEKYNTMKKRDAETADIGDQSEVESDTEELKKIMFGEKKKLNKKKRKQLKKSKVSVELE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.24
3 0.23
4 0.27
5 0.26
6 0.24
7 0.21
8 0.18
9 0.16
10 0.13
11 0.12
12 0.11
13 0.15
14 0.2
15 0.22
16 0.26
17 0.27
18 0.26
19 0.3
20 0.29
21 0.31
22 0.32
23 0.33
24 0.31
25 0.36
26 0.37
27 0.39
28 0.38
29 0.31
30 0.3
31 0.36
32 0.38
33 0.33
34 0.33
35 0.26
36 0.28
37 0.3
38 0.29
39 0.21
40 0.18
41 0.2
42 0.2
43 0.19
44 0.22
45 0.23
46 0.25
47 0.28
48 0.29
49 0.29
50 0.3
51 0.3
52 0.28
53 0.3
54 0.3
55 0.29
56 0.3
57 0.29
58 0.28
59 0.28
60 0.26
61 0.23
62 0.2
63 0.23
64 0.27
65 0.34
66 0.38
67 0.42
68 0.43
69 0.41
70 0.42
71 0.4
72 0.35
73 0.33
74 0.34
75 0.34
76 0.33
77 0.32
78 0.27
79 0.26
80 0.22
81 0.17
82 0.13
83 0.09
84 0.08
85 0.09
86 0.1
87 0.1
88 0.12
89 0.12
90 0.12
91 0.14
92 0.16
93 0.16
94 0.15
95 0.16
96 0.14
97 0.14
98 0.13
99 0.11
100 0.12
101 0.15
102 0.19
103 0.19
104 0.23
105 0.27
106 0.28
107 0.29
108 0.28
109 0.27
110 0.27
111 0.31
112 0.3
113 0.3
114 0.28
115 0.25
116 0.25
117 0.24
118 0.22
119 0.22
120 0.2
121 0.17
122 0.2
123 0.22
124 0.22
125 0.22
126 0.22
127 0.19
128 0.2
129 0.19
130 0.17
131 0.15
132 0.16
133 0.17
134 0.17
135 0.17
136 0.17
137 0.17
138 0.18
139 0.19
140 0.19
141 0.17
142 0.21
143 0.2
144 0.21
145 0.19
146 0.17
147 0.16
148 0.15
149 0.14
150 0.1
151 0.08
152 0.1
153 0.12
154 0.13
155 0.14
156 0.14
157 0.14
158 0.14
159 0.14
160 0.1
161 0.1
162 0.09
163 0.08
164 0.1
165 0.13
166 0.13
167 0.14
168 0.14
169 0.15
170 0.15
171 0.14
172 0.17
173 0.18
174 0.2
175 0.25
176 0.26
177 0.27
178 0.3
179 0.39
180 0.36
181 0.4
182 0.4
183 0.36
184 0.39
185 0.35
186 0.32
187 0.24
188 0.22
189 0.16
190 0.17
191 0.15
192 0.12
193 0.12
194 0.12
195 0.11
196 0.1
197 0.1
198 0.08
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.08
205 0.07
206 0.07
207 0.12
208 0.12
209 0.12
210 0.13
211 0.13
212 0.12
213 0.13
214 0.13
215 0.08
216 0.14
217 0.18
218 0.26
219 0.28
220 0.27
221 0.29
222 0.3
223 0.32
224 0.29
225 0.26
226 0.18
227 0.17
228 0.19
229 0.19
230 0.18
231 0.16
232 0.14
233 0.12
234 0.12
235 0.13
236 0.12
237 0.09
238 0.09
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.1
243 0.09
244 0.08
245 0.08
246 0.09
247 0.08
248 0.1
249 0.1
250 0.09
251 0.09
252 0.08
253 0.11
254 0.1
255 0.13
256 0.11
257 0.13
258 0.14
259 0.16
260 0.16
261 0.14
262 0.19
263 0.17
264 0.2
265 0.21
266 0.2
267 0.19
268 0.2
269 0.22
270 0.19
271 0.2
272 0.17
273 0.15
274 0.15
275 0.15
276 0.14
277 0.12
278 0.09
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.08
283 0.11
284 0.13
285 0.16
286 0.17
287 0.2
288 0.22
289 0.26
290 0.25
291 0.26
292 0.28
293 0.31
294 0.36
295 0.36
296 0.39
297 0.38
298 0.38
299 0.34
300 0.31
301 0.25
302 0.19
303 0.16
304 0.1
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.07
314 0.07
315 0.06
316 0.08
317 0.1
318 0.13
319 0.14
320 0.14
321 0.15
322 0.15
323 0.16
324 0.18
325 0.17
326 0.16
327 0.18
328 0.18
329 0.19
330 0.19
331 0.19
332 0.16
333 0.2
334 0.19
335 0.16
336 0.18
337 0.17
338 0.18
339 0.19
340 0.18
341 0.14
342 0.19
343 0.21
344 0.2
345 0.23
346 0.3
347 0.34
348 0.39
349 0.43
350 0.42
351 0.46
352 0.54
353 0.54
354 0.52
355 0.5
356 0.5
357 0.45
358 0.42
359 0.36
360 0.28
361 0.23
362 0.18
363 0.14
364 0.1
365 0.08
366 0.08
367 0.09
368 0.13
369 0.14
370 0.15
371 0.14
372 0.13
373 0.14
374 0.15
375 0.22
376 0.26
377 0.29
378 0.39
379 0.48
380 0.58
381 0.68
382 0.77
383 0.8
384 0.84
385 0.9
386 0.91
387 0.94
388 0.95
389 0.96
390 0.96
391 0.97
392 0.96
393 0.95
394 0.94