FuNGI

P15424

Protein Details

Accession

P15424

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
52-78	QRNNNSNRYRNSRFNSRPRTRSREDDD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 17, nucl 6, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR000629 RNA-helicase_DEAD-box_CS
Gene Ontology	GO:0005759 C:mitochondrial matrix GO:0005739 C:mitochondrion GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0003729 F:mRNA binding GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0033592 F:RNA strand annealing activity GO:0000372 P:Group I intron splicing GO:0000373 P:Group II intron splicing GO:0000963 P:mitochondrial RNA processing GO:0006397 P:mRNA processing GO:0006417 P:regulation of translation GO:0034337 P:RNA folding GO:0006392 P:transcription elongation by mitochondrial RNA polymerase
KEGG	sce:YDR194C -
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF00271 Helicase_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS00039 DEAD_ATP_HELICASE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER PS51195 Q_MOTIF
CDD	cd17964 DEADc_MSS116 cd18787 SF2_C_DEAD

Amino Acid Sequences

MLTSILIKGRTPVLASRNLLAALSNCNHITWAVSRRLYNDGNRDQRNFGRNQRNNNSNRYRNSRFNSRPRTRSREDDDEVHFDKTTFSKLIHVPKEDNSKEVTLDSLLEEGVLDKEIHKAITRMEFPGLTPVQQKTIKPILSSEDHDVIARAKTGTGKTFAFLIPIFQHLINTKFDSQYMVKAVIVAPTRDLALQIEAEVKKIHDMNYGLKKYACVSLVGGTDFRAAMNKMNKLRPNIVIATPGRLIDVLEKYSNKFFRFVDYKVLDEADRLLEIGFRDDLETISGILNEKNSKSADNIKTLLFSATLDDKVQKLANNIMNKKECLFLDTVDKNEPEAHERIDQSVVISEKFANSIFAAVEHIKKQIKERDSNYKAIIFAPTVKFTSFLCSILKNEFKKDLPILEFHGKITQNKRTSLVKRFKKDESGILVCTDVGARGMDFPNVHEVLQIGVPSELANYIHRIGRTARSGKEGSSVLFICKDELPFVRELEDAKNIVIAKQEKYEPSEEIKSEVLEAVTEEPEDISDIVISLISSYRSCIKEYRFSERRILPEIASTYGVLLNDPQLKIPVSRRFLDKLGLSRSPIGKAMFEIRDYSSRDGNNKSYDYDDDSEISFRGNKNYNNRSQNRDYDDEPFRRSNNNRRSFSRSNDKNNYSSRNSNIY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.35
3	0.34
4	0.34
5	0.33
6	0.3
7	0.26
8	0.22
9	0.2
10	0.2
11	0.22
12	0.2
13	0.2
14	0.2
15	0.19
16	0.2
17	0.2
18	0.25
19	0.3
20	0.33
21	0.34
22	0.37
23	0.43
24	0.46
25	0.47
26	0.5
27	0.52
28	0.58
29	0.63
30	0.64
31	0.63
32	0.65
33	0.65
34	0.62
35	0.62
36	0.64
37	0.64
38	0.72
39	0.75
40	0.78
41	0.77
42	0.8
43	0.8
44	0.77
45	0.8
46	0.78
47	0.76
48	0.76
49	0.78
50	0.78
51	0.78
52	0.8
53	0.83
54	0.83
55	0.86
56	0.86
57	0.88
58	0.83
59	0.82
60	0.8
61	0.78
62	0.73
63	0.69
64	0.65
65	0.63
66	0.59
67	0.51
68	0.43
69	0.33
70	0.31
71	0.26
72	0.25
73	0.19
74	0.17
75	0.21
76	0.27
77	0.37
78	0.4
79	0.43
80	0.42
81	0.47
82	0.57
83	0.52
84	0.48
85	0.42
86	0.37
87	0.34
88	0.31
89	0.26
90	0.16
91	0.16
92	0.14
93	0.11
94	0.09
95	0.08
96	0.08
97	0.07
98	0.07
99	0.07
100	0.07
101	0.07
102	0.1
103	0.11
104	0.12
105	0.13
106	0.13
107	0.16
108	0.23
109	0.25
110	0.24
111	0.25
112	0.24
113	0.23
114	0.3
115	0.26
116	0.22
117	0.24
118	0.23
119	0.28
120	0.31
121	0.31
122	0.31
123	0.38
124	0.38
125	0.34
126	0.35
127	0.33
128	0.33
129	0.36
130	0.33
131	0.28
132	0.27
133	0.26
134	0.25
135	0.22
136	0.19
137	0.16
138	0.12
139	0.11
140	0.14
141	0.17
142	0.18
143	0.2
144	0.2
145	0.19
146	0.21
147	0.2
148	0.18
149	0.15
150	0.15
151	0.13
152	0.14
153	0.16
154	0.13
155	0.15
156	0.15
157	0.18
158	0.18
159	0.21
160	0.21
161	0.2
162	0.2
163	0.23
164	0.21
165	0.22
166	0.22
167	0.19
168	0.17
169	0.17
170	0.17
171	0.17
172	0.18
173	0.15
174	0.13
175	0.13
176	0.13
177	0.12
178	0.13
179	0.09
180	0.08
181	0.08
182	0.08
183	0.14
184	0.13
185	0.14
186	0.14
187	0.13
188	0.15
189	0.16
190	0.17
191	0.15
192	0.17
193	0.24
194	0.33
195	0.35
196	0.33
197	0.32
198	0.32
199	0.29
200	0.3
201	0.23
202	0.14
203	0.14
204	0.16
205	0.17
206	0.17
207	0.15
208	0.12
209	0.12
210	0.11
211	0.1
212	0.09
213	0.08
214	0.13
215	0.18
216	0.24
217	0.28
218	0.35
219	0.39
220	0.41
221	0.44
222	0.41
223	0.4
224	0.36
225	0.32
226	0.32
227	0.28
228	0.27
229	0.24
230	0.21
231	0.17
232	0.15
233	0.14
234	0.12
235	0.13
236	0.12
237	0.14
238	0.15
239	0.17
240	0.22
241	0.26
242	0.23
243	0.24
244	0.22
245	0.27
246	0.3
247	0.3
248	0.33
249	0.31
250	0.31
251	0.29
252	0.29
253	0.22
254	0.18
255	0.18
256	0.09
257	0.08
258	0.07
259	0.06
260	0.07
261	0.07
262	0.08
263	0.07
264	0.06
265	0.07
266	0.07
267	0.07
268	0.07
269	0.07
270	0.06
271	0.06
272	0.06
273	0.06
274	0.07
275	0.08
276	0.09
277	0.09
278	0.11
279	0.11
280	0.12
281	0.14
282	0.23
283	0.24
284	0.26
285	0.27
286	0.25
287	0.25
288	0.25
289	0.23
290	0.14
291	0.11
292	0.09
293	0.09
294	0.09
295	0.09
296	0.09
297	0.09
298	0.1
299	0.12
300	0.11
301	0.11
302	0.16
303	0.21
304	0.26
305	0.28
306	0.32
307	0.33
308	0.32
309	0.32
310	0.28
311	0.24
312	0.19
313	0.18
314	0.13
315	0.18
316	0.19
317	0.2
318	0.19
319	0.19
320	0.17
321	0.18
322	0.17
323	0.14
324	0.14
325	0.14
326	0.15
327	0.16
328	0.16
329	0.16
330	0.15
331	0.12
332	0.13
333	0.11
334	0.09
335	0.09
336	0.08
337	0.07
338	0.08
339	0.08
340	0.06
341	0.06
342	0.06
343	0.06
344	0.06
345	0.07
346	0.08
347	0.1
348	0.1
349	0.14
350	0.15
351	0.16
352	0.22
353	0.27
354	0.32
355	0.37
356	0.41
357	0.49
358	0.51
359	0.53
360	0.48
361	0.43
362	0.38
363	0.31
364	0.28
365	0.17
366	0.17
367	0.15
368	0.15
369	0.15
370	0.14
371	0.14
372	0.13
373	0.17
374	0.14
375	0.14
376	0.14
377	0.14
378	0.16
379	0.2
380	0.26
381	0.23
382	0.25
383	0.27
384	0.26
385	0.28
386	0.28
387	0.27
388	0.22
389	0.22
390	0.25
391	0.25
392	0.25
393	0.22
394	0.26
395	0.24
396	0.28
397	0.32
398	0.36
399	0.35
400	0.36
401	0.4
402	0.43
403	0.47
404	0.53
405	0.56
406	0.57
407	0.6
408	0.64
409	0.63
410	0.62
411	0.58
412	0.54
413	0.51
414	0.45
415	0.39
416	0.34
417	0.31
418	0.23
419	0.21
420	0.15
421	0.08
422	0.06
423	0.05
424	0.04
425	0.07
426	0.07
427	0.09
428	0.09
429	0.1
430	0.14
431	0.15
432	0.14
433	0.12
434	0.12
435	0.11
436	0.12
437	0.11
438	0.07
439	0.06
440	0.06
441	0.06
442	0.06
443	0.06
444	0.06
445	0.07
446	0.08
447	0.1
448	0.13
449	0.13
450	0.14
451	0.16
452	0.21
453	0.27
454	0.3
455	0.3
456	0.33
457	0.34
458	0.33
459	0.35
460	0.3
461	0.24
462	0.23
463	0.22
464	0.17
465	0.18
466	0.18
467	0.15
468	0.16
469	0.16
470	0.14
471	0.15
472	0.17
473	0.17
474	0.17
475	0.17
476	0.16
477	0.17
478	0.18
479	0.19
480	0.17
481	0.15
482	0.18
483	0.16
484	0.16
485	0.2
486	0.2
487	0.19
488	0.22
489	0.25
490	0.24
491	0.28
492	0.3
493	0.27
494	0.29
495	0.32
496	0.29
497	0.28
498	0.27
499	0.23
500	0.22
501	0.2
502	0.14
503	0.1
504	0.1
505	0.09
506	0.09
507	0.09
508	0.08
509	0.07
510	0.07
511	0.08
512	0.07
513	0.06
514	0.05
515	0.05
516	0.05
517	0.05
518	0.05
519	0.05
520	0.05
521	0.07
522	0.07
523	0.08
524	0.15
525	0.16
526	0.19
527	0.24
528	0.28
529	0.37
530	0.41
531	0.5
532	0.5
533	0.53
534	0.59
535	0.59
536	0.58
537	0.55
538	0.52
539	0.42
540	0.41
541	0.39
542	0.33
543	0.28
544	0.24
545	0.18
546	0.18
547	0.17
548	0.12
549	0.11
550	0.14
551	0.18
552	0.18
553	0.17
554	0.18
555	0.19
556	0.23
557	0.31
558	0.35
559	0.35
560	0.38
561	0.42
562	0.44
563	0.45
564	0.46
565	0.43
566	0.41
567	0.43
568	0.42
569	0.4
570	0.42
571	0.42
572	0.39
573	0.38
574	0.32
575	0.26
576	0.26
577	0.31
578	0.27
579	0.26
580	0.27
581	0.26
582	0.3
583	0.34
584	0.34
585	0.33
586	0.34
587	0.38
588	0.42
589	0.44
590	0.45
591	0.43
592	0.42
593	0.39
594	0.38
595	0.39
596	0.36
597	0.32
598	0.28
599	0.27
600	0.26
601	0.23
602	0.22
603	0.19
604	0.18
605	0.23
606	0.29
607	0.35
608	0.44
609	0.53
610	0.61
611	0.68
612	0.72
613	0.74
614	0.75
615	0.77
616	0.74
617	0.69
618	0.62
619	0.6
620	0.63
621	0.6
622	0.58
623	0.54
624	0.49
625	0.54
626	0.59
627	0.62
628	0.64
629	0.69
630	0.69
631	0.71
632	0.78
633	0.76
634	0.76
635	0.77
636	0.76
637	0.76
638	0.8
639	0.79
640	0.78
641	0.78
642	0.77
643	0.73
644	0.7

P15424

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer