Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P40561

Protein Details
Accession P40561    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
200-220RSPYNNKNRTFQKKHFNSAKDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 16, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0008143  F:poly(A) binding  
GO:0016071  P:mRNA metabolic process  
KEGG sce:YIR001C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12306  RRM_II_PABPs  
Amino Acid Sequences MSQEEKVDAKATLKTEISNNKKNDKQELELDELVGKLSIEGTPQVSQKLSKEEKHAHQLEADSRSIFVGNITPDVTPEQIEDHFKDCGQIKRITLLYDRNTGTPKGYGYIEFESPAYREKALQLNGGELKGKKIAVSRKRTNIPGFNRHYNSQNQYFQQWQWNYPLMAYPNPDTFPYYPPYPPNQSPNQNFGYNKNNYYRSPYNNKNRTFQKKHFNSAKDSTKNIRSTSQKPVVMPSDNVKSSTQEKDSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.3
3 0.39
4 0.46
5 0.5
6 0.54
7 0.58
8 0.63
9 0.66
10 0.68
11 0.63
12 0.59
13 0.59
14 0.58
15 0.55
16 0.5
17 0.46
18 0.37
19 0.31
20 0.26
21 0.18
22 0.13
23 0.06
24 0.07
25 0.06
26 0.06
27 0.08
28 0.1
29 0.13
30 0.14
31 0.16
32 0.16
33 0.18
34 0.2
35 0.28
36 0.31
37 0.32
38 0.39
39 0.45
40 0.5
41 0.58
42 0.58
43 0.5
44 0.46
45 0.46
46 0.43
47 0.38
48 0.33
49 0.24
50 0.21
51 0.2
52 0.18
53 0.15
54 0.1
55 0.09
56 0.09
57 0.1
58 0.11
59 0.1
60 0.11
61 0.12
62 0.12
63 0.09
64 0.09
65 0.1
66 0.11
67 0.14
68 0.15
69 0.15
70 0.16
71 0.15
72 0.18
73 0.2
74 0.24
75 0.26
76 0.27
77 0.25
78 0.29
79 0.3
80 0.29
81 0.27
82 0.28
83 0.27
84 0.29
85 0.29
86 0.27
87 0.28
88 0.27
89 0.25
90 0.2
91 0.17
92 0.14
93 0.13
94 0.12
95 0.13
96 0.15
97 0.14
98 0.13
99 0.13
100 0.12
101 0.12
102 0.13
103 0.11
104 0.09
105 0.09
106 0.11
107 0.16
108 0.16
109 0.19
110 0.17
111 0.18
112 0.18
113 0.18
114 0.18
115 0.13
116 0.13
117 0.12
118 0.12
119 0.1
120 0.14
121 0.23
122 0.3
123 0.39
124 0.44
125 0.5
126 0.54
127 0.58
128 0.58
129 0.58
130 0.56
131 0.56
132 0.56
133 0.56
134 0.55
135 0.52
136 0.51
137 0.48
138 0.47
139 0.44
140 0.42
141 0.36
142 0.36
143 0.37
144 0.34
145 0.37
146 0.33
147 0.28
148 0.28
149 0.29
150 0.27
151 0.24
152 0.25
153 0.19
154 0.19
155 0.2
156 0.19
157 0.18
158 0.19
159 0.19
160 0.2
161 0.19
162 0.2
163 0.22
164 0.23
165 0.23
166 0.26
167 0.32
168 0.35
169 0.37
170 0.41
171 0.45
172 0.51
173 0.52
174 0.54
175 0.53
176 0.51
177 0.48
178 0.47
179 0.47
180 0.42
181 0.43
182 0.44
183 0.44
184 0.4
185 0.47
186 0.49
187 0.48
188 0.54
189 0.6
190 0.64
191 0.69
192 0.72
193 0.72
194 0.76
195 0.79
196 0.78
197 0.76
198 0.77
199 0.75
200 0.81
201 0.82
202 0.76
203 0.73
204 0.72
205 0.74
206 0.68
207 0.66
208 0.63
209 0.63
210 0.63
211 0.58
212 0.57
213 0.55
214 0.55
215 0.59
216 0.61
217 0.56
218 0.52
219 0.56
220 0.54
221 0.5
222 0.48
223 0.44
224 0.43
225 0.41
226 0.42
227 0.37
228 0.36
229 0.37
230 0.41