FuNGI

P39985

Protein Details

Accession

P39985

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
303-330	KLENTSHISKKRKKTNNKKVQNSIQFPE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
312-316	KKRKK

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 13, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR017964 DNA-dir_DNA_pol_B_CS IPR007015 DNA_pol_V/MYBBP1A
Gene Ontology	GO:0030685 C:nucleolar preribosome GO:0005730 C:nucleolus GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0000166 F:nucleotide binding GO:0000182 F:rDNA binding GO:0042134 F:rRNA primary transcript binding GO:0030490 P:maturation of SSU-rRNA GO:0090070 P:positive regulation of ribosome biogenesis GO:0006355 P:regulation of DNA-templated transcription GO:0000027 P:ribosomal large subunit assembly GO:0006364 P:rRNA processing GO:0009303 P:rRNA transcription
KEGG	sce:YEL055C -
Pfam	View protein in Pfam PF04931 DNA_pol_phi
PROSITE	View protein in PROSITE PS00116 DNA_POLYMERASE_B

Amino Acid Sequences

MTGKVNRDLFFKLASDLREERLHAAVALIKDLSALDLPDDAEEWSYVLNRLIKGLSSDRNSARLGFSLCLTEVINLAVNMPPGQRPKGLESTNEFLSTLSTILNVNVNEGTKKSMKGKDERGILFGKLFGLKSLLNEPLFSEIFVKDLEKGNTEFFIRFTEQLIDLALKKNWIKEPCFFTLFQTMKMLLPFMDESSAEKILLIYDKYDLTLTNEGLSTYLLLKYEGDESLIPSVLDLKNPGWKDNDPLARGNLPLLTKVLRNSSVIPDANGGLKETKKQKNTNWNPRLHFVWSVLLPLFGNGKLENTSHISKKRKKTNNKKVQNSIQFPEFWKMAVDESFFNEKASSERKYLGFLIIDAAFKAVPGSYIGFCFSQNVMRTLINQSIDSQRVLNKISQLTLDSIVKACEEDSANRLVPCLNAMLFGPHGSINFDKLTKSGTVSKLIAIKELPSTVLAQLLDVFFLQLQDKKGVLSHTLFALDSILHIVRAHKVEINDMDIMKPVLRPIVYMAFFKHTSDDLKLEQLHELAKERLYSILGELTINKEIRCKDPEINSWQYLTLKLILDIENSHVGDLINPLDENLENIKNEAISCLSKVCRSRTAQSWGLSTLLSMCLVQLYAGDTDSISVIEELCEFSKHENNSMVGITEILLSLLAQKKALLRKLSLIIWQQFIEEVGLEELQILLDILKARENKQGFAQLFEGEEEFEEIKEENDASEDESKTGSESESESESDSDDADEKDEEDEANEDILNIDKEATSALVKALNLPDNIVNDKGEVDLDQLEGLSDDGGDDEDEESMDDEKMMELDDQLSEIFKRRKEALSSISTGNQRKFEVKQSRENVISFKHRVVDMLAVYVKYCEKLTLANKSEHSNNLGGSLSKLVYFIIPMLKCVNETLDRPLADKISKLLKGKIFKIKVTAFKDMNKDIELMDLLKKTHKLMLTSKPGQHAAVFYSMCSTSSLFLSKLYVEIGGNDKLDELIDLYTATTKEWMQKGKCGPNIFIDFINWLSSKKQTVMDKE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.3
3	0.29
4	0.31
5	0.32
6	0.33
7	0.31
8	0.3
9	0.29
10	0.22
11	0.21
12	0.21
13	0.18
14	0.18
15	0.15
16	0.13
17	0.13
18	0.12
19	0.12
20	0.09
21	0.09
22	0.08
23	0.09
24	0.1
25	0.1
26	0.1
27	0.09
28	0.09
29	0.09
30	0.09
31	0.09
32	0.1
33	0.1
34	0.14
35	0.18
36	0.17
37	0.19
38	0.19
39	0.19
40	0.23
41	0.28
42	0.31
43	0.32
44	0.39
45	0.39
46	0.42
47	0.43
48	0.4
49	0.35
50	0.32
51	0.3
52	0.24
53	0.23
54	0.21
55	0.2
56	0.2
57	0.18
58	0.15
59	0.13
60	0.13
61	0.13
62	0.11
63	0.11
64	0.11
65	0.12
66	0.12
67	0.13
68	0.17
69	0.21
70	0.24
71	0.26
72	0.29
73	0.34
74	0.42
75	0.43
76	0.44
77	0.45
78	0.47
79	0.46
80	0.43
81	0.36
82	0.27
83	0.26
84	0.21
85	0.15
86	0.1
87	0.09
88	0.08
89	0.09
90	0.14
91	0.12
92	0.13
93	0.15
94	0.16
95	0.17
96	0.17
97	0.21
98	0.2
99	0.24
100	0.3
101	0.35
102	0.42
103	0.49
104	0.58
105	0.6
106	0.65
107	0.63
108	0.59
109	0.54
110	0.48
111	0.4
112	0.31
113	0.26
114	0.2
115	0.18
116	0.15
117	0.15
118	0.15
119	0.16
120	0.19
121	0.23
122	0.2
123	0.21
124	0.21
125	0.23
126	0.23
127	0.21
128	0.19
129	0.13
130	0.14
131	0.15
132	0.15
133	0.13
134	0.18
135	0.19
136	0.2
137	0.22
138	0.22
139	0.24
140	0.25
141	0.22
142	0.18
143	0.21
144	0.2
145	0.2
146	0.2
147	0.21
148	0.19
149	0.19
150	0.2
151	0.16
152	0.16
153	0.19
154	0.18
155	0.2
156	0.2
157	0.25
158	0.31
159	0.36
160	0.38
161	0.41
162	0.47
163	0.48
164	0.49
165	0.45
166	0.41
167	0.44
168	0.42
169	0.37
170	0.33
171	0.28
172	0.26
173	0.26
174	0.23
175	0.13
176	0.15
177	0.14
178	0.12
179	0.12
180	0.11
181	0.13
182	0.16
183	0.17
184	0.14
185	0.13
186	0.12
187	0.13
188	0.15
189	0.13
190	0.1
191	0.11
192	0.11
193	0.12
194	0.12
195	0.11
196	0.13
197	0.16
198	0.16
199	0.15
200	0.15
201	0.14
202	0.14
203	0.14
204	0.1
205	0.08
206	0.09
207	0.08
208	0.08
209	0.09
210	0.1
211	0.11
212	0.1
213	0.11
214	0.1
215	0.11
216	0.12
217	0.12
218	0.11
219	0.09
220	0.14
221	0.13
222	0.13
223	0.14
224	0.14
225	0.2
226	0.21
227	0.23
228	0.23
229	0.23
230	0.28
231	0.34
232	0.39
233	0.35
234	0.36
235	0.37
236	0.35
237	0.34
238	0.29
239	0.24
240	0.18
241	0.17
242	0.16
243	0.15
244	0.15
245	0.17
246	0.2
247	0.19
248	0.2
249	0.21
250	0.23
251	0.28
252	0.26
253	0.25
254	0.22
255	0.21
256	0.22
257	0.19
258	0.17
259	0.14
260	0.15
261	0.21
262	0.29
263	0.36
264	0.42
265	0.48
266	0.55
267	0.64
268	0.74
269	0.79
270	0.78
271	0.78
272	0.74
273	0.71
274	0.65
275	0.57
276	0.47
277	0.37
278	0.32
279	0.24
280	0.23
281	0.19
282	0.17
283	0.14
284	0.13
285	0.13
286	0.09
287	0.1
288	0.08
289	0.09
290	0.1
291	0.11
292	0.12
293	0.15
294	0.19
295	0.23
296	0.31
297	0.4
298	0.47
299	0.57
300	0.65
301	0.71
302	0.78
303	0.84
304	0.88
305	0.89
306	0.91
307	0.91
308	0.89
309	0.89
310	0.87
311	0.81
312	0.73
313	0.64
314	0.55
315	0.48
316	0.42
317	0.32
318	0.23
319	0.18
320	0.16
321	0.15
322	0.14
323	0.13
324	0.1
325	0.14
326	0.18
327	0.17
328	0.17
329	0.16
330	0.15
331	0.17
332	0.2
333	0.19
334	0.17
335	0.21
336	0.21
337	0.23
338	0.24
339	0.22
340	0.18
341	0.16
342	0.16
343	0.14
344	0.13
345	0.11
346	0.1
347	0.08
348	0.07
349	0.07
350	0.05
351	0.04
352	0.05
353	0.07
354	0.07
355	0.08
356	0.09
357	0.1
358	0.1
359	0.11
360	0.11
361	0.14
362	0.14
363	0.16
364	0.16
365	0.16
366	0.18
367	0.19
368	0.21
369	0.18
370	0.17
371	0.17
372	0.19
373	0.2
374	0.19
375	0.17
376	0.16
377	0.17
378	0.19
379	0.18
380	0.18
381	0.18
382	0.18
383	0.17
384	0.16
385	0.15
386	0.16
387	0.15
388	0.12
389	0.11
390	0.11
391	0.1
392	0.09
393	0.08
394	0.08
395	0.08
396	0.09
397	0.11
398	0.14
399	0.15
400	0.15
401	0.15
402	0.13
403	0.12
404	0.11
405	0.1
406	0.07
407	0.06
408	0.06
409	0.07
410	0.07
411	0.07
412	0.07
413	0.06
414	0.06
415	0.08
416	0.08
417	0.09
418	0.1
419	0.11
420	0.1
421	0.1
422	0.12
423	0.11
424	0.13
425	0.16
426	0.17
427	0.2
428	0.2
429	0.22
430	0.24
431	0.23
432	0.22
433	0.17
434	0.16
435	0.13
436	0.13
437	0.11
438	0.08
439	0.09
440	0.08
441	0.09
442	0.08
443	0.07
444	0.08
445	0.07
446	0.07
447	0.06
448	0.06
449	0.04
450	0.05
451	0.06
452	0.07
453	0.09
454	0.1
455	0.1
456	0.1
457	0.11
458	0.12
459	0.13
460	0.12
461	0.11
462	0.1
463	0.11
464	0.11
465	0.09
466	0.09
467	0.06
468	0.05
469	0.06
470	0.05
471	0.05
472	0.05
473	0.06
474	0.08
475	0.1
476	0.1
477	0.11
478	0.11
479	0.14
480	0.14
481	0.15
482	0.14
483	0.13
484	0.12
485	0.11
486	0.11
487	0.09
488	0.08
489	0.06
490	0.06
491	0.06
492	0.06
493	0.08
494	0.12
495	0.12
496	0.13
497	0.14
498	0.16
499	0.16
500	0.16
501	0.15
502	0.12
503	0.13
504	0.13
505	0.15
506	0.12
507	0.14
508	0.15
509	0.14
510	0.14
511	0.13
512	0.12
513	0.11
514	0.12
515	0.1
516	0.1
517	0.1
518	0.1
519	0.1
520	0.1
521	0.09
522	0.07
523	0.07
524	0.07
525	0.07
526	0.07
527	0.08
528	0.11
529	0.11
530	0.11
531	0.13
532	0.14
533	0.18
534	0.21
535	0.22
536	0.24
537	0.28
538	0.33
539	0.37
540	0.4
541	0.37
542	0.34
543	0.32
544	0.28
545	0.24
546	0.2
547	0.15
548	0.11
549	0.1
550	0.11
551	0.1
552	0.1
553	0.1
554	0.11
555	0.11
556	0.1
557	0.1
558	0.09
559	0.09
560	0.08
561	0.09
562	0.07
563	0.06
564	0.05
565	0.06
566	0.06
567	0.06
568	0.07
569	0.09
570	0.1
571	0.09
572	0.1
573	0.1
574	0.1
575	0.1
576	0.09
577	0.08
578	0.07
579	0.08
580	0.1
581	0.1
582	0.14
583	0.17
584	0.2
585	0.25
586	0.28
587	0.32
588	0.36
589	0.42
590	0.43
591	0.41
592	0.4
593	0.34
594	0.31
595	0.26
596	0.2
597	0.14
598	0.09
599	0.08
600	0.06
601	0.05
602	0.04
603	0.04
604	0.04
605	0.04
606	0.05
607	0.05
608	0.05
609	0.05
610	0.05
611	0.05
612	0.06
613	0.05
614	0.04
615	0.04
616	0.04
617	0.04
618	0.05
619	0.05
620	0.06
621	0.06
622	0.07
623	0.09
624	0.14
625	0.15
626	0.17
627	0.19
628	0.19
629	0.2
630	0.19
631	0.17
632	0.12
633	0.11
634	0.09
635	0.06
636	0.06
637	0.04
638	0.04
639	0.03
640	0.07
641	0.11
642	0.11
643	0.1
644	0.11
645	0.16
646	0.21
647	0.26
648	0.25
649	0.23
650	0.26
651	0.29
652	0.29
653	0.3
654	0.3
655	0.27
656	0.27
657	0.26
658	0.22
659	0.19
660	0.18
661	0.14
662	0.08
663	0.07
664	0.05
665	0.05
666	0.05
667	0.05
668	0.04
669	0.04
670	0.04
671	0.03
672	0.03
673	0.04
674	0.05
675	0.06
676	0.1
677	0.12
678	0.14
679	0.21
680	0.22
681	0.23
682	0.24
683	0.32
684	0.28
685	0.29
686	0.28
687	0.22
688	0.21
689	0.2
690	0.18
691	0.1
692	0.1
693	0.09
694	0.08
695	0.07
696	0.08
697	0.07
698	0.07
699	0.08
700	0.08
701	0.06
702	0.07
703	0.07
704	0.09
705	0.13
706	0.13
707	0.13
708	0.13
709	0.13
710	0.13
711	0.13
712	0.11
713	0.07
714	0.08
715	0.1
716	0.11
717	0.12
718	0.12
719	0.12
720	0.12
721	0.11
722	0.1
723	0.09
724	0.09
725	0.09
726	0.09
727	0.09
728	0.09
729	0.09
730	0.09
731	0.08
732	0.07
733	0.08
734	0.08
735	0.08
736	0.07
737	0.07
738	0.06
739	0.08
740	0.08
741	0.07
742	0.07
743	0.06
744	0.06
745	0.07
746	0.07
747	0.06
748	0.06
749	0.07
750	0.09
751	0.09
752	0.11
753	0.14
754	0.16
755	0.16
756	0.17
757	0.18
758	0.19
759	0.21
760	0.19
761	0.16
762	0.13
763	0.14
764	0.12
765	0.11
766	0.09
767	0.08
768	0.08
769	0.08
770	0.07
771	0.07
772	0.06
773	0.06
774	0.06
775	0.04
776	0.04
777	0.03
778	0.04
779	0.04
780	0.04
781	0.04
782	0.05
783	0.05
784	0.05
785	0.05
786	0.06
787	0.07
788	0.07
789	0.06
790	0.06
791	0.06
792	0.06
793	0.07
794	0.06
795	0.06
796	0.07
797	0.07
798	0.07
799	0.07
800	0.08
801	0.08
802	0.15
803	0.2
804	0.21
805	0.25
806	0.28
807	0.34
808	0.38
809	0.43
810	0.43
811	0.43
812	0.45
813	0.43
814	0.44
815	0.45
816	0.46
817	0.43
818	0.39
819	0.36
820	0.37
821	0.38
822	0.43
823	0.47
824	0.48
825	0.54
826	0.56
827	0.6
828	0.59
829	0.57
830	0.5
831	0.45
832	0.47
833	0.4
834	0.38
835	0.35
836	0.32
837	0.31
838	0.3
839	0.28
840	0.21
841	0.21
842	0.21
843	0.17
844	0.17
845	0.18
846	0.17
847	0.14
848	0.14
849	0.11
850	0.1
851	0.17
852	0.23
853	0.32
854	0.35
855	0.39
856	0.41
857	0.44
858	0.47
859	0.42
860	0.41
861	0.32
862	0.29
863	0.25
864	0.24
865	0.21
866	0.18
867	0.18
868	0.14
869	0.12
870	0.12
871	0.11
872	0.1
873	0.1
874	0.1
875	0.15
876	0.15
877	0.16
878	0.18
879	0.18
880	0.19
881	0.19
882	0.22
883	0.18
884	0.2
885	0.25
886	0.29
887	0.29
888	0.3
889	0.31
890	0.3
891	0.28
892	0.27
893	0.25
894	0.27
895	0.32
896	0.34
897	0.38
898	0.41
899	0.47
900	0.53
901	0.6
902	0.56
903	0.53
904	0.58
905	0.58
906	0.6
907	0.6
908	0.6
909	0.53
910	0.55
911	0.6
912	0.56
913	0.52
914	0.44
915	0.39
916	0.31
917	0.29
918	0.24
919	0.19
920	0.19
921	0.18
922	0.18
923	0.22
924	0.24
925	0.24
926	0.28
927	0.29
928	0.3
929	0.36
930	0.45
931	0.5
932	0.56
933	0.58
934	0.58
935	0.57
936	0.53
937	0.47
938	0.38
939	0.31
940	0.3
941	0.26
942	0.2
943	0.22
944	0.21
945	0.2
946	0.19
947	0.17
948	0.13
949	0.15
950	0.17
951	0.14
952	0.15
953	0.16
954	0.15
955	0.15
956	0.15
957	0.14
958	0.11
959	0.14
960	0.17
961	0.18
962	0.18
963	0.17
964	0.17
965	0.15
966	0.15
967	0.13
968	0.1
969	0.07
970	0.07
971	0.07
972	0.08
973	0.11
974	0.11
975	0.11
976	0.12
977	0.14
978	0.21
979	0.27
980	0.36
981	0.36
982	0.44
983	0.53
984	0.6
985	0.64
986	0.61
987	0.57
988	0.57
989	0.6
990	0.54
991	0.45
992	0.37
993	0.33
994	0.29
995	0.31
996	0.22
997	0.18
998	0.19
999	0.22
1000	0.25
1001	0.26
1002	0.32

P39985

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer