FuNGI

P38996

Protein Details

Accession

P38996

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
759-785	PPMSHQPPPPQQQQQQQQQQQQQQQQP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 15.333, cyto 8.5, cyto_pero 5.332

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036621 Anticodon-bd_dom_sf IPR034167 Nab3_RRM IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0035649 C:Nrd1 complex GO:0005654 C:nucleoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0003729 F:mRNA binding GO:0003723 F:RNA binding GO:0001068 F:transcription regulatory region RNA binding GO:0071041 P:antisense RNA transcript catabolic process GO:0071034 P:CUT catabolic process GO:0031124 P:mRNA 3'-end processing GO:0071028 P:nuclear mRNA surveillance GO:0031126 P:sno(s)RNA 3'-end processing GO:0034472 P:snRNA 3'-end processing GO:0030847 P:termination of RNA polymerase II transcription, exosome-dependent GO:0042780 P:tRNA 3'-end processing
KEGG	sce:YPL190C -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12342 RRM_Nab3p

Amino Acid Sequences

MSDENHNSDVQDIPSPELSVDSNSNENELMNNSSADDGIEFDAPEEEREAEREEENEEQHELEDVNDEEEEDKEEKGEENGEVINTEEEEEEEHQQKGGNDDDDDDNEEEEEEEEDDDDDDDDDDDDEEEEEEEEEEGNDNSSVGSDSAAEDGEDEEDKKDKTKDKEVELRRETLEKEQKDVDEAIKKITREENDNTHFPTNMENVNYDLLQKQVKYIMDSNMLNLPQFQHLPQEEKMSAILAMLNSNSDTALSVPPHDSTISTTASASATSGARSNDQRKPPLSDAQRRMRFPRADLSKPITEEEHDRYAAYLHGENKITEMHNIPPKSRLFIGNLPLKNVSKEDLFRIFSPYGHIMQINIKNAFGFIQFDNPQSVRDAIECESQEMNFGKKLILEVSSSNARPQFDHGDHGTNSSSTFISSAKRPFQTESGDMYNDDNGAGYKKSRRHTVSCNIFVKRTADRTYAIEVFNRFRDGTGLETDMIFLKPRMELGKLINDAAYNGVWGVVLVNKTHNVDVQTFYKGSQGETKFDEYISISADDAVAIFNNIKNNRNNSRPTDYRAMSHQQNIYGAPPLPVPNGPAVGPPPQTNYYQGYSMPPPQQQQQQPYGNYGMPPPSHDQGYGSQPPIPMNQSYGRYQTSIPPPPPQQQIPQGYGRYQAGPPPQPPSQTPMDQQQLLSAIQNLPPNVVSNLLSMAQQQQQQPHAQQQLVGLIQSMQGQAPQQQQQQLGGYSSMNSSSPPPMSTNYNGQNISAKPSAPPMSHQPPPPQQQQQQQQQQQQQQQQPAGNNVQSLLDSLAKLQK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.23
3	0.21
4	0.2
5	0.19
6	0.17
7	0.19
8	0.19
9	0.21
10	0.21
11	0.23
12	0.21
13	0.2
14	0.19
15	0.18
16	0.19
17	0.16
18	0.16
19	0.15
20	0.15
21	0.15
22	0.14
23	0.11
24	0.1
25	0.1
26	0.11
27	0.1
28	0.1
29	0.12
30	0.12
31	0.13
32	0.13
33	0.14
34	0.14
35	0.16
36	0.19
37	0.19
38	0.2
39	0.2
40	0.21
41	0.23
42	0.24
43	0.24
44	0.21
45	0.19
46	0.18
47	0.19
48	0.15
49	0.12
50	0.14
51	0.12
52	0.12
53	0.11
54	0.12
55	0.11
56	0.12
57	0.15
58	0.13
59	0.13
60	0.12
61	0.13
62	0.13
63	0.14
64	0.16
65	0.12
66	0.13
67	0.14
68	0.13
69	0.13
70	0.13
71	0.12
72	0.1
73	0.11
74	0.09
75	0.08
76	0.11
77	0.13
78	0.17
79	0.18
80	0.18
81	0.18
82	0.21
83	0.21
84	0.22
85	0.24
86	0.21
87	0.19
88	0.22
89	0.24
90	0.23
91	0.26
92	0.23
93	0.19
94	0.17
95	0.17
96	0.14
97	0.12
98	0.11
99	0.08
100	0.08
101	0.08
102	0.08
103	0.08
104	0.08
105	0.08
106	0.07
107	0.07
108	0.07
109	0.07
110	0.07
111	0.07
112	0.07
113	0.07
114	0.07
115	0.07
116	0.07
117	0.07
118	0.07
119	0.07
120	0.07
121	0.07
122	0.07
123	0.08
124	0.07
125	0.08
126	0.07
127	0.07
128	0.07
129	0.07
130	0.07
131	0.06
132	0.06
133	0.06
134	0.07
135	0.07
136	0.08
137	0.07
138	0.06
139	0.07
140	0.08
141	0.08
142	0.09
143	0.09
144	0.12
145	0.13
146	0.17
147	0.22
148	0.28
149	0.34
150	0.43
151	0.48
152	0.54
153	0.63
154	0.68
155	0.73
156	0.69
157	0.66
158	0.58
159	0.55
160	0.49
161	0.49
162	0.5
163	0.4
164	0.4
165	0.4
166	0.38
167	0.38
168	0.37
169	0.32
170	0.29
171	0.29
172	0.31
173	0.31
174	0.31
175	0.31
176	0.35
177	0.33
178	0.32
179	0.37
180	0.4
181	0.42
182	0.45
183	0.45
184	0.41
185	0.38
186	0.32
187	0.31
188	0.25
189	0.22
190	0.2
191	0.17
192	0.17
193	0.18
194	0.18
195	0.16
196	0.13
197	0.13
198	0.14
199	0.14
200	0.13
201	0.16
202	0.17
203	0.2
204	0.22
205	0.23
206	0.26
207	0.26
208	0.26
209	0.26
210	0.25
211	0.21
212	0.19
213	0.17
214	0.14
215	0.15
216	0.14
217	0.16
218	0.18
219	0.23
220	0.23
221	0.27
222	0.24
223	0.24
224	0.24
225	0.18
226	0.16
227	0.12
228	0.12
229	0.07
230	0.07
231	0.06
232	0.07
233	0.06
234	0.06
235	0.06
236	0.05
237	0.05
238	0.06
239	0.09
240	0.09
241	0.1
242	0.11
243	0.12
244	0.13
245	0.12
246	0.11
247	0.12
248	0.14
249	0.14
250	0.13
251	0.13
252	0.13
253	0.13
254	0.12
255	0.1
256	0.09
257	0.08
258	0.08
259	0.1
260	0.1
261	0.13
262	0.19
263	0.25
264	0.31
265	0.36
266	0.41
267	0.41
268	0.47
269	0.47
270	0.5
271	0.53
272	0.55
273	0.58
274	0.63
275	0.67
276	0.64
277	0.65
278	0.65
279	0.58
280	0.5
281	0.51
282	0.47
283	0.44
284	0.46
285	0.47
286	0.42
287	0.41
288	0.39
289	0.31
290	0.25
291	0.26
292	0.26
293	0.23
294	0.2
295	0.19
296	0.18
297	0.18
298	0.17
299	0.15
300	0.13
301	0.12
302	0.15
303	0.16
304	0.16
305	0.16
306	0.17
307	0.16
308	0.14
309	0.15
310	0.16
311	0.22
312	0.23
313	0.23
314	0.26
315	0.26
316	0.27
317	0.27
318	0.24
319	0.22
320	0.25
321	0.31
322	0.33
323	0.33
324	0.32
325	0.33
326	0.31
327	0.28
328	0.25
329	0.2
330	0.14
331	0.15
332	0.17
333	0.18
334	0.2
335	0.19
336	0.23
337	0.22
338	0.2
339	0.22
340	0.2
341	0.18
342	0.17
343	0.16
344	0.12
345	0.18
346	0.21
347	0.22
348	0.2
349	0.19
350	0.18
351	0.18
352	0.17
353	0.12
354	0.11
355	0.07
356	0.12
357	0.13
358	0.14
359	0.16
360	0.15
361	0.16
362	0.15
363	0.15
364	0.11
365	0.1
366	0.11
367	0.1
368	0.14
369	0.13
370	0.14
371	0.14
372	0.13
373	0.15
374	0.14
375	0.14
376	0.11
377	0.11
378	0.09
379	0.09
380	0.1
381	0.08
382	0.08
383	0.08
384	0.08
385	0.1
386	0.13
387	0.13
388	0.14
389	0.15
390	0.14
391	0.14
392	0.16
393	0.19
394	0.17
395	0.21
396	0.2
397	0.22
398	0.22
399	0.23
400	0.2
401	0.15
402	0.14
403	0.12
404	0.11
405	0.07
406	0.08
407	0.07
408	0.08
409	0.12
410	0.16
411	0.19
412	0.21
413	0.22
414	0.24
415	0.26
416	0.28
417	0.27
418	0.26
419	0.23
420	0.22
421	0.21
422	0.2
423	0.17
424	0.14
425	0.11
426	0.07
427	0.06
428	0.07
429	0.06
430	0.08
431	0.13
432	0.19
433	0.22
434	0.3
435	0.34
436	0.38
437	0.45
438	0.54
439	0.57
440	0.59
441	0.62
442	0.55
443	0.51
444	0.48
445	0.43
446	0.36
447	0.32
448	0.27
449	0.23
450	0.23
451	0.25
452	0.27
453	0.27
454	0.25
455	0.22
456	0.21
457	0.22
458	0.21
459	0.21
460	0.17
461	0.14
462	0.15
463	0.13
464	0.13
465	0.13
466	0.13
467	0.11
468	0.11
469	0.11
470	0.11
471	0.11
472	0.09
473	0.07
474	0.07
475	0.07
476	0.08
477	0.1
478	0.1
479	0.12
480	0.14
481	0.2
482	0.2
483	0.2
484	0.19
485	0.18
486	0.16
487	0.15
488	0.12
489	0.06
490	0.05
491	0.05
492	0.04
493	0.04
494	0.04
495	0.05
496	0.06
497	0.06
498	0.08
499	0.09
500	0.11
501	0.11
502	0.13
503	0.13
504	0.14
505	0.16
506	0.17
507	0.18
508	0.18
509	0.18
510	0.19
511	0.17
512	0.17
513	0.22
514	0.22
515	0.22
516	0.24
517	0.27
518	0.24
519	0.24
520	0.23
521	0.16
522	0.15
523	0.14
524	0.12
525	0.09
526	0.08
527	0.08
528	0.07
529	0.06
530	0.06
531	0.04
532	0.04
533	0.05
534	0.06
535	0.12
536	0.15
537	0.19
538	0.24
539	0.32
540	0.37
541	0.43
542	0.48
543	0.49
544	0.54
545	0.53
546	0.55
547	0.55
548	0.5
549	0.46
550	0.45
551	0.45
552	0.4
553	0.42
554	0.38
555	0.31
556	0.31
557	0.3
558	0.25
559	0.22
560	0.2
561	0.15
562	0.14
563	0.14
564	0.15
565	0.14
566	0.15
567	0.13
568	0.13
569	0.13
570	0.13
571	0.14
572	0.16
573	0.18
574	0.17
575	0.21
576	0.22
577	0.23
578	0.25
579	0.27
580	0.25
581	0.24
582	0.24
583	0.23
584	0.24
585	0.29
586	0.3
587	0.3
588	0.3
589	0.34
590	0.42
591	0.44
592	0.47
593	0.5
594	0.52
595	0.5
596	0.51
597	0.49
598	0.41
599	0.36
600	0.32
601	0.27
602	0.21
603	0.23
604	0.24
605	0.23
606	0.23
607	0.23
608	0.23
609	0.22
610	0.3
611	0.31
612	0.27
613	0.27
614	0.27
615	0.29
616	0.29
617	0.28
618	0.21
619	0.21
620	0.25
621	0.26
622	0.28
623	0.3
624	0.29
625	0.28
626	0.28
627	0.32
628	0.36
629	0.41
630	0.41
631	0.44
632	0.47
633	0.52
634	0.57
635	0.53
636	0.5
637	0.51
638	0.54
639	0.52
640	0.53
641	0.48
642	0.43
643	0.44
644	0.4
645	0.33
646	0.28
647	0.29
648	0.31
649	0.34
650	0.35
651	0.37
652	0.38
653	0.38
654	0.39
655	0.39
656	0.38
657	0.36
658	0.37
659	0.39
660	0.42
661	0.4
662	0.39
663	0.36
664	0.32
665	0.28
666	0.26
667	0.2
668	0.16
669	0.18
670	0.21
671	0.19
672	0.18
673	0.18
674	0.19
675	0.17
676	0.18
677	0.15
678	0.13
679	0.14
680	0.14
681	0.13
682	0.13
683	0.16
684	0.18
685	0.22
686	0.25
687	0.28
688	0.31
689	0.36
690	0.38
691	0.42
692	0.44
693	0.4
694	0.38
695	0.35
696	0.35
697	0.3
698	0.27
699	0.19
700	0.14
701	0.14
702	0.14
703	0.14
704	0.09
705	0.1
706	0.11
707	0.16
708	0.22
709	0.28
710	0.31
711	0.35
712	0.36
713	0.38
714	0.4
715	0.36
716	0.31
717	0.26
718	0.21
719	0.18
720	0.17
721	0.16
722	0.13
723	0.12
724	0.14
725	0.17
726	0.18
727	0.19
728	0.21
729	0.22
730	0.28
731	0.31
732	0.37
733	0.39
734	0.44
735	0.42
736	0.41
737	0.44
738	0.39
739	0.42
740	0.35
741	0.29
742	0.24
743	0.31
744	0.35
745	0.3
746	0.33
747	0.36
748	0.41
749	0.47
750	0.51
751	0.54
752	0.58
753	0.64
754	0.69
755	0.7
756	0.7
757	0.74
758	0.79
759	0.8
760	0.82
761	0.83
762	0.83
763	0.82
764	0.83
765	0.82
766	0.82
767	0.78
768	0.75
769	0.72
770	0.68
771	0.63
772	0.61
773	0.59
774	0.51
775	0.44
776	0.37
777	0.32
778	0.27
779	0.24
780	0.2
781	0.15
782	0.14

P38996

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer