Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P37838

Protein Details
Accession P37838    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
271-291DQASKNKESKRKAQNKREDFSHydrophilic
612-641ENSNVVKRRREQLKQARTKRTRPDNEDTGDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
396-406AKRKEALGKAP
671-685KRIIGFKRKRKHAKK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034805  Nop4_RRM1  
IPR034806  Nop4_RRM2  
IPR034809  Nop4_RRM4  
IPR034808  Nop4p_RRM3  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0042802  F:identical protein binding  
GO:0070180  F:large ribosomal subunit rRNA binding  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
KEGG sce:YPL043W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12674  RRM1_Nop4p  
cd12675  RRM2_Nop4p  
cd12676  RRM3_Nop4p  
cd12677  RRM4_Nop4p  
Amino Acid Sequences MEETIENVEVPSSNVSKQNDDGLDMKTLFVRSIPQDVTDEQLADFFSNFAPIKHAVVVKDTNKRSRGFGFVSFAVEDDTKEALAKARKTKFNGHILRVDIAKRRDRSKKTSEVVEKSTPESSEKITGQNNEDEDDADGEDSMLKGKPKLIIRNMPWSCRDPVKLKKIFGRYGTVVEATIPRKRDGKLCGFAFVTMKKISNCRIALENTKDLKIDGRKVAVDFAVQKNRWEDYKKAQPEMNDKDDNESGNEDAEENHDDEEDENEEEDRQVDQASKNKESKRKAQNKREDFSVFVRNVPYDATEESLAPHFSKFGSVKYALPVIDKSTGLAKGTAFVAFKDQYTYNECIKNAPAAGSTSLLIGDDVMPEYVYEGRVLSITPTLVREDAGRMAEKNAAKRKEALGKAPGEKDRRNLYLLNEGRVVEGSKMADLLTNTDMEIREKSYKLRVEQLKKNPSLHLSMTRLAIRNLPRAMNDKALKALARKAVVEFATEVKNKERHPLSKEEIIRSTKEKYKFMGPDEIEAQKKKDKKSGVVKQAKVIMEVKGSTAGRSRGYGFVEFRDHKNALMGLRWLNCHAVTSDEILEGLNDDEKKQVDNDLGKGRRLCVEFAIENSNVVKRRREQLKQARTKRTRPDNEDTGDVGESENKKPKKEEATTPTNPDDKKMGDDIKRIIGFKRKRKHAKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.26
3 0.29
4 0.31
5 0.37
6 0.33
7 0.34
8 0.34
9 0.29
10 0.32
11 0.28
12 0.27
13 0.22
14 0.22
15 0.19
16 0.17
17 0.2
18 0.18
19 0.25
20 0.25
21 0.24
22 0.27
23 0.27
24 0.31
25 0.27
26 0.25
27 0.18
28 0.19
29 0.17
30 0.15
31 0.14
32 0.1
33 0.09
34 0.14
35 0.14
36 0.13
37 0.17
38 0.17
39 0.19
40 0.23
41 0.25
42 0.21
43 0.26
44 0.34
45 0.37
46 0.45
47 0.5
48 0.54
49 0.56
50 0.57
51 0.56
52 0.52
53 0.52
54 0.47
55 0.45
56 0.41
57 0.37
58 0.38
59 0.33
60 0.3
61 0.25
62 0.21
63 0.17
64 0.14
65 0.14
66 0.11
67 0.11
68 0.12
69 0.15
70 0.22
71 0.28
72 0.35
73 0.43
74 0.5
75 0.55
76 0.64
77 0.66
78 0.7
79 0.71
80 0.67
81 0.64
82 0.6
83 0.58
84 0.51
85 0.48
86 0.44
87 0.43
88 0.47
89 0.46
90 0.53
91 0.6
92 0.65
93 0.69
94 0.71
95 0.74
96 0.71
97 0.76
98 0.76
99 0.73
100 0.71
101 0.68
102 0.61
103 0.53
104 0.51
105 0.42
106 0.35
107 0.3
108 0.27
109 0.27
110 0.26
111 0.29
112 0.31
113 0.33
114 0.34
115 0.36
116 0.34
117 0.3
118 0.28
119 0.24
120 0.2
121 0.17
122 0.14
123 0.1
124 0.09
125 0.07
126 0.08
127 0.07
128 0.08
129 0.09
130 0.1
131 0.11
132 0.13
133 0.19
134 0.25
135 0.34
136 0.4
137 0.47
138 0.5
139 0.6
140 0.61
141 0.59
142 0.57
143 0.52
144 0.48
145 0.44
146 0.45
147 0.42
148 0.48
149 0.54
150 0.57
151 0.57
152 0.61
153 0.63
154 0.64
155 0.59
156 0.56
157 0.47
158 0.44
159 0.41
160 0.34
161 0.26
162 0.22
163 0.23
164 0.2
165 0.22
166 0.22
167 0.22
168 0.25
169 0.27
170 0.32
171 0.34
172 0.4
173 0.44
174 0.43
175 0.44
176 0.4
177 0.4
178 0.37
179 0.31
180 0.26
181 0.19
182 0.21
183 0.2
184 0.23
185 0.26
186 0.3
187 0.3
188 0.29
189 0.31
190 0.32
191 0.38
192 0.39
193 0.43
194 0.38
195 0.38
196 0.36
197 0.32
198 0.34
199 0.32
200 0.32
201 0.27
202 0.27
203 0.27
204 0.28
205 0.29
206 0.23
207 0.2
208 0.19
209 0.22
210 0.29
211 0.28
212 0.29
213 0.3
214 0.32
215 0.34
216 0.33
217 0.31
218 0.31
219 0.41
220 0.43
221 0.44
222 0.44
223 0.45
224 0.5
225 0.53
226 0.51
227 0.44
228 0.4
229 0.41
230 0.41
231 0.37
232 0.29
233 0.23
234 0.16
235 0.13
236 0.13
237 0.09
238 0.08
239 0.09
240 0.1
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.1
247 0.09
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.07
255 0.06
256 0.06
257 0.08
258 0.11
259 0.16
260 0.21
261 0.26
262 0.32
263 0.38
264 0.45
265 0.48
266 0.55
267 0.61
268 0.67
269 0.72
270 0.77
271 0.81
272 0.82
273 0.79
274 0.74
275 0.64
276 0.56
277 0.5
278 0.46
279 0.36
280 0.29
281 0.27
282 0.22
283 0.21
284 0.18
285 0.15
286 0.1
287 0.09
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.1
292 0.1
293 0.1
294 0.09
295 0.08
296 0.07
297 0.07
298 0.11
299 0.11
300 0.11
301 0.14
302 0.15
303 0.16
304 0.17
305 0.19
306 0.15
307 0.15
308 0.15
309 0.13
310 0.13
311 0.12
312 0.11
313 0.12
314 0.12
315 0.11
316 0.12
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.1
321 0.08
322 0.08
323 0.1
324 0.1
325 0.1
326 0.12
327 0.12
328 0.12
329 0.17
330 0.2
331 0.2
332 0.22
333 0.22
334 0.21
335 0.21
336 0.2
337 0.16
338 0.13
339 0.11
340 0.09
341 0.09
342 0.09
343 0.08
344 0.07
345 0.07
346 0.06
347 0.05
348 0.05
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.03
355 0.04
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.06
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.08
371 0.08
372 0.08
373 0.1
374 0.11
375 0.11
376 0.1
377 0.11
378 0.16
379 0.17
380 0.23
381 0.29
382 0.29
383 0.3
384 0.32
385 0.35
386 0.39
387 0.39
388 0.36
389 0.35
390 0.37
391 0.39
392 0.41
393 0.43
394 0.4
395 0.4
396 0.41
397 0.4
398 0.38
399 0.37
400 0.34
401 0.31
402 0.35
403 0.35
404 0.32
405 0.28
406 0.26
407 0.24
408 0.22
409 0.21
410 0.11
411 0.11
412 0.09
413 0.07
414 0.07
415 0.07
416 0.08
417 0.07
418 0.09
419 0.09
420 0.09
421 0.09
422 0.1
423 0.11
424 0.11
425 0.12
426 0.12
427 0.15
428 0.16
429 0.18
430 0.23
431 0.27
432 0.28
433 0.36
434 0.42
435 0.47
436 0.56
437 0.63
438 0.66
439 0.66
440 0.66
441 0.59
442 0.53
443 0.48
444 0.42
445 0.38
446 0.32
447 0.3
448 0.31
449 0.31
450 0.3
451 0.27
452 0.29
453 0.26
454 0.29
455 0.29
456 0.28
457 0.27
458 0.31
459 0.32
460 0.35
461 0.33
462 0.28
463 0.28
464 0.28
465 0.27
466 0.25
467 0.27
468 0.23
469 0.23
470 0.22
471 0.21
472 0.24
473 0.23
474 0.22
475 0.18
476 0.16
477 0.2
478 0.21
479 0.22
480 0.23
481 0.28
482 0.27
483 0.35
484 0.39
485 0.4
486 0.43
487 0.5
488 0.5
489 0.53
490 0.57
491 0.53
492 0.53
493 0.5
494 0.48
495 0.43
496 0.44
497 0.42
498 0.43
499 0.41
500 0.38
501 0.44
502 0.45
503 0.46
504 0.49
505 0.43
506 0.41
507 0.42
508 0.44
509 0.4
510 0.37
511 0.37
512 0.34
513 0.39
514 0.39
515 0.43
516 0.43
517 0.48
518 0.58
519 0.64
520 0.69
521 0.73
522 0.71
523 0.68
524 0.7
525 0.61
526 0.53
527 0.45
528 0.35
529 0.28
530 0.26
531 0.22
532 0.21
533 0.21
534 0.19
535 0.21
536 0.22
537 0.21
538 0.23
539 0.24
540 0.22
541 0.25
542 0.28
543 0.25
544 0.26
545 0.33
546 0.34
547 0.35
548 0.38
549 0.35
550 0.31
551 0.33
552 0.32
553 0.25
554 0.25
555 0.25
556 0.22
557 0.24
558 0.25
559 0.24
560 0.23
561 0.22
562 0.21
563 0.18
564 0.16
565 0.16
566 0.17
567 0.16
568 0.14
569 0.14
570 0.13
571 0.12
572 0.1
573 0.09
574 0.11
575 0.1
576 0.11
577 0.14
578 0.14
579 0.16
580 0.16
581 0.18
582 0.2
583 0.24
584 0.29
585 0.36
586 0.38
587 0.42
588 0.42
589 0.42
590 0.42
591 0.4
592 0.36
593 0.29
594 0.32
595 0.28
596 0.3
597 0.33
598 0.26
599 0.26
600 0.26
601 0.28
602 0.28
603 0.29
604 0.34
605 0.34
606 0.44
607 0.53
608 0.59
609 0.65
610 0.7
611 0.79
612 0.83
613 0.88
614 0.89
615 0.88
616 0.89
617 0.89
618 0.89
619 0.88
620 0.86
621 0.85
622 0.82
623 0.77
624 0.71
625 0.62
626 0.53
627 0.43
628 0.34
629 0.26
630 0.24
631 0.23
632 0.26
633 0.34
634 0.35
635 0.38
636 0.42
637 0.5
638 0.53
639 0.58
640 0.62
641 0.61
642 0.68
643 0.7
644 0.73
645 0.71
646 0.67
647 0.6
648 0.53
649 0.49
650 0.41
651 0.4
652 0.41
653 0.43
654 0.42
655 0.48
656 0.49
657 0.52
658 0.54
659 0.5
660 0.49
661 0.51
662 0.55
663 0.59
664 0.66
665 0.68