Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

Q12139

Protein Details
Accession Q12139    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
80-107RKDLLIRHEKRHSKVKNRLSRPSKDQISBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
90-93RHSK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11, cyto 2.5, plas 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007219  Transcription_factor_dom_fun  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG sce:YPR022C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04082  Fungal_trans  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
CDD cd12148  fungal_TF_MHR  
Amino Acid Sequences MHGKELAGRLRKRENDNDLSPNSSSSPAERFRCPHPECNKTFSRQEHLSRHKLNHWPKEIYVCSYVLPTTNAPCNKTFVRKDLLIRHEKRHSKVKNRLSRPSKDQISSSNKDFSKNAPYNPSEVPLSTQSGTSTINLIKNSVNPPPSITQESKFRPFLQQAQQPQQVQQSQQPQQIQQLQQLQFPQQLRAPLQQPMLQQQMHPQQASPTFPSYDPRIRNNGQNGNQFFNLIFDNRTGVNGFEVDAANNNGNGNDQNMNINPAVQQQRYQDRNFASSSYQQPLQPLTQDQQQEQYFQQQKLAQQQQQQQQQQQQQQQLPPQNPFGDPLTSSSSGANLSVMQDLFSTNFLNSDPLQSFMQELSEAPQVSIEDTFSDKNTIPPNEKPVQQDEGFQNPPVMFELPQDNIKIPKAQPKFNDNPSTSVKDNLSSQKLNINELKRRSSKDSGVGNNSSLNYKEQLRHSMKSVPSFFHPDPLTKYKISKEKCQEMFSFVPELRYVSIESIHKSLKSFWLNFHPQYGLLHKPSFHVDKQPAILNLALIMTGASFLGSEYREQISDPICGPLRWIIFSHADFQPPSKTYIIQSLLLVEGYEKTSTNRYLHERSFLHHGTTIQLLRRTPSLGGHPLMVKTGKTSGENSIQDPQEVYKRWIDFEMLKRIAFYAFYMDTTHAVVFGYWNLFINSNQIQLTLPCPDQVWESYDLSYETLMEHGYGSTKRDENNTFLSALMQLMKNVIQILRNNNIRRNKVNNGGIESTPTDLESTTDWNIQSLFGKKILLAGIISILFQCQEEVNGDYFITNFRGGITDHLGLSWKDILSFAMNYWLHEVQKSCTDPKACRISTPSEETLTNRKIDEDNGDGLCDDDLDLLSSDNPSNCKIPVIHISQIVLRILHHDYYIYAGAPWRMNVPIGRDEYDMISRRILQFAKDPYNGGVAVVYAFQFLFEMFIIKENNVPTVVKSYNINSDPVITRPYAIALTSLLIWSCNFALHGCEVSIWDNTEASKDECFQPDDSNGGNILGNTDNNGSTIANNNLKEKNNYIPIESFEVYLLRMYRNLYVDSSLDVVSFQNDVWAKASLLQHISNTHFLCGMMQFMRDIFNKSYWDLGREFGKLFDNCLERSLGKTSPTCHNMFDV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.7
3 0.73
4 0.73
5 0.66
6 0.63
7 0.55
8 0.47
9 0.4
10 0.34
11 0.28
12 0.24
13 0.29
14 0.32
15 0.36
16 0.4
17 0.42
18 0.47
19 0.56
20 0.59
21 0.61
22 0.63
23 0.69
24 0.67
25 0.71
26 0.71
27 0.67
28 0.69
29 0.65
30 0.64
31 0.62
32 0.66
33 0.69
34 0.72
35 0.76
36 0.75
37 0.75
38 0.74
39 0.76
40 0.78
41 0.77
42 0.75
43 0.7
44 0.65
45 0.69
46 0.63
47 0.58
48 0.51
49 0.41
50 0.34
51 0.31
52 0.3
53 0.22
54 0.22
55 0.19
56 0.21
57 0.28
58 0.32
59 0.33
60 0.34
61 0.38
62 0.41
63 0.48
64 0.48
65 0.46
66 0.49
67 0.51
68 0.57
69 0.61
70 0.65
71 0.66
72 0.66
73 0.68
74 0.72
75 0.74
76 0.73
77 0.74
78 0.75
79 0.75
80 0.8
81 0.83
82 0.83
83 0.84
84 0.88
85 0.87
86 0.85
87 0.83
88 0.82
89 0.79
90 0.72
91 0.66
92 0.65
93 0.66
94 0.63
95 0.58
96 0.57
97 0.5
98 0.5
99 0.49
100 0.44
101 0.45
102 0.45
103 0.46
104 0.46
105 0.47
106 0.47
107 0.47
108 0.46
109 0.37
110 0.32
111 0.31
112 0.25
113 0.28
114 0.24
115 0.23
116 0.2
117 0.2
118 0.21
119 0.18
120 0.18
121 0.18
122 0.21
123 0.21
124 0.22
125 0.22
126 0.26
127 0.29
128 0.32
129 0.3
130 0.27
131 0.3
132 0.32
133 0.36
134 0.37
135 0.37
136 0.35
137 0.42
138 0.48
139 0.5
140 0.51
141 0.48
142 0.48
143 0.5
144 0.54
145 0.54
146 0.56
147 0.57
148 0.63
149 0.67
150 0.62
151 0.6
152 0.59
153 0.53
154 0.48
155 0.46
156 0.47
157 0.46
158 0.51
159 0.51
160 0.46
161 0.5
162 0.55
163 0.5
164 0.47
165 0.5
166 0.45
167 0.44
168 0.45
169 0.4
170 0.38
171 0.37
172 0.34
173 0.28
174 0.31
175 0.32
176 0.35
177 0.35
178 0.34
179 0.35
180 0.36
181 0.35
182 0.36
183 0.39
184 0.33
185 0.31
186 0.35
187 0.4
188 0.41
189 0.39
190 0.34
191 0.33
192 0.36
193 0.39
194 0.35
195 0.29
196 0.27
197 0.27
198 0.31
199 0.33
200 0.37
201 0.39
202 0.4
203 0.46
204 0.46
205 0.53
206 0.58
207 0.6
208 0.59
209 0.63
210 0.6
211 0.56
212 0.54
213 0.47
214 0.38
215 0.3
216 0.25
217 0.17
218 0.15
219 0.11
220 0.13
221 0.12
222 0.14
223 0.13
224 0.11
225 0.11
226 0.1
227 0.1
228 0.11
229 0.11
230 0.1
231 0.11
232 0.13
233 0.12
234 0.12
235 0.12
236 0.1
237 0.11
238 0.11
239 0.12
240 0.11
241 0.11
242 0.14
243 0.14
244 0.17
245 0.16
246 0.16
247 0.14
248 0.19
249 0.24
250 0.22
251 0.25
252 0.28
253 0.38
254 0.43
255 0.44
256 0.43
257 0.4
258 0.43
259 0.4
260 0.35
261 0.29
262 0.3
263 0.33
264 0.3
265 0.31
266 0.28
267 0.29
268 0.3
269 0.28
270 0.25
271 0.23
272 0.22
273 0.25
274 0.26
275 0.25
276 0.3
277 0.29
278 0.29
279 0.28
280 0.35
281 0.35
282 0.33
283 0.37
284 0.33
285 0.36
286 0.43
287 0.5
288 0.45
289 0.46
290 0.54
291 0.57
292 0.63
293 0.65
294 0.61
295 0.61
296 0.64
297 0.64
298 0.63
299 0.62
300 0.58
301 0.57
302 0.58
303 0.58
304 0.53
305 0.48
306 0.46
307 0.4
308 0.35
309 0.34
310 0.28
311 0.23
312 0.2
313 0.2
314 0.22
315 0.21
316 0.21
317 0.19
318 0.17
319 0.16
320 0.16
321 0.13
322 0.08
323 0.08
324 0.09
325 0.09
326 0.08
327 0.08
328 0.08
329 0.08
330 0.09
331 0.09
332 0.07
333 0.08
334 0.08
335 0.1
336 0.1
337 0.13
338 0.12
339 0.14
340 0.14
341 0.14
342 0.15
343 0.12
344 0.13
345 0.09
346 0.09
347 0.09
348 0.12
349 0.12
350 0.11
351 0.12
352 0.11
353 0.12
354 0.12
355 0.09
356 0.07
357 0.09
358 0.1
359 0.09
360 0.12
361 0.11
362 0.15
363 0.21
364 0.23
365 0.26
366 0.28
367 0.34
368 0.36
369 0.4
370 0.39
371 0.37
372 0.39
373 0.35
374 0.37
375 0.33
376 0.35
377 0.33
378 0.3
379 0.28
380 0.22
381 0.22
382 0.19
383 0.17
384 0.11
385 0.11
386 0.14
387 0.14
388 0.16
389 0.16
390 0.15
391 0.16
392 0.17
393 0.2
394 0.18
395 0.26
396 0.28
397 0.33
398 0.36
399 0.43
400 0.48
401 0.51
402 0.58
403 0.5
404 0.51
405 0.5
406 0.5
407 0.42
408 0.39
409 0.32
410 0.25
411 0.28
412 0.29
413 0.29
414 0.25
415 0.25
416 0.26
417 0.27
418 0.29
419 0.31
420 0.31
421 0.32
422 0.36
423 0.42
424 0.42
425 0.45
426 0.48
427 0.47
428 0.45
429 0.46
430 0.49
431 0.47
432 0.48
433 0.45
434 0.39
435 0.36
436 0.33
437 0.26
438 0.2
439 0.17
440 0.13
441 0.15
442 0.18
443 0.19
444 0.28
445 0.31
446 0.32
447 0.33
448 0.38
449 0.38
450 0.4
451 0.4
452 0.32
453 0.3
454 0.36
455 0.33
456 0.32
457 0.31
458 0.26
459 0.3
460 0.33
461 0.34
462 0.28
463 0.31
464 0.31
465 0.38
466 0.4
467 0.43
468 0.46
469 0.52
470 0.54
471 0.55
472 0.5
473 0.47
474 0.45
475 0.38
476 0.33
477 0.24
478 0.21
479 0.18
480 0.17
481 0.12
482 0.12
483 0.11
484 0.08
485 0.11
486 0.11
487 0.12
488 0.14
489 0.15
490 0.14
491 0.14
492 0.15
493 0.19
494 0.23
495 0.22
496 0.22
497 0.29
498 0.34
499 0.34
500 0.34
501 0.27
502 0.23
503 0.24
504 0.25
505 0.2
506 0.18
507 0.18
508 0.17
509 0.18
510 0.21
511 0.24
512 0.21
513 0.24
514 0.23
515 0.24
516 0.26
517 0.27
518 0.23
519 0.21
520 0.2
521 0.13
522 0.11
523 0.09
524 0.07
525 0.04
526 0.04
527 0.03
528 0.03
529 0.03
530 0.02
531 0.02
532 0.02
533 0.04
534 0.04
535 0.05
536 0.07
537 0.07
538 0.08
539 0.08
540 0.1
541 0.1
542 0.11
543 0.11
544 0.12
545 0.12
546 0.11
547 0.12
548 0.13
549 0.13
550 0.12
551 0.12
552 0.12
553 0.14
554 0.15
555 0.18
556 0.16
557 0.16
558 0.16
559 0.16
560 0.17
561 0.16
562 0.18
563 0.15
564 0.15
565 0.14
566 0.2
567 0.21
568 0.18
569 0.17
570 0.15
571 0.14
572 0.13
573 0.12
574 0.07
575 0.05
576 0.06
577 0.06
578 0.06
579 0.07
580 0.09
581 0.13
582 0.14
583 0.16
584 0.21
585 0.25
586 0.26
587 0.31
588 0.29
589 0.28
590 0.34
591 0.31
592 0.27
593 0.23
594 0.23
595 0.18
596 0.2
597 0.2
598 0.16
599 0.17
600 0.16
601 0.16
602 0.16
603 0.16
604 0.14
605 0.14
606 0.15
607 0.16
608 0.17
609 0.17
610 0.17
611 0.16
612 0.17
613 0.16
614 0.12
615 0.1
616 0.12
617 0.12
618 0.12
619 0.14
620 0.16
621 0.22
622 0.23
623 0.24
624 0.26
625 0.25
626 0.24
627 0.22
628 0.2
629 0.19
630 0.19
631 0.2
632 0.19
633 0.19
634 0.2
635 0.2
636 0.21
637 0.21
638 0.25
639 0.32
640 0.29
641 0.28
642 0.27
643 0.27
644 0.25
645 0.2
646 0.15
647 0.1
648 0.09
649 0.09
650 0.1
651 0.1
652 0.11
653 0.11
654 0.11
655 0.07
656 0.07
657 0.06
658 0.06
659 0.06
660 0.06
661 0.05
662 0.06
663 0.07
664 0.08
665 0.08
666 0.12
667 0.11
668 0.12
669 0.12
670 0.12
671 0.12
672 0.11
673 0.13
674 0.12
675 0.11
676 0.1
677 0.1
678 0.1
679 0.12
680 0.12
681 0.14
682 0.14
683 0.15
684 0.14
685 0.15
686 0.14
687 0.13
688 0.12
689 0.09
690 0.06
691 0.06
692 0.05
693 0.05
694 0.05
695 0.05
696 0.07
697 0.08
698 0.09
699 0.12
700 0.14
701 0.15
702 0.2
703 0.22
704 0.24
705 0.27
706 0.27
707 0.24
708 0.22
709 0.22
710 0.17
711 0.15
712 0.13
713 0.09
714 0.08
715 0.08
716 0.08
717 0.08
718 0.09
719 0.09
720 0.1
721 0.13
722 0.18
723 0.24
724 0.31
725 0.33
726 0.4
727 0.47
728 0.48
729 0.51
730 0.53
731 0.52
732 0.53
733 0.56
734 0.51
735 0.48
736 0.46
737 0.4
738 0.35
739 0.3
740 0.23
741 0.18
742 0.15
743 0.11
744 0.08
745 0.09
746 0.08
747 0.1
748 0.11
749 0.13
750 0.13
751 0.13
752 0.13
753 0.13
754 0.15
755 0.15
756 0.15
757 0.14
758 0.14
759 0.14
760 0.16
761 0.15
762 0.13
763 0.1
764 0.08
765 0.08
766 0.08
767 0.08
768 0.06
769 0.05
770 0.05
771 0.05
772 0.05
773 0.04
774 0.05
775 0.07
776 0.09
777 0.1
778 0.1
779 0.1
780 0.1
781 0.1
782 0.1
783 0.1
784 0.09
785 0.07
786 0.07
787 0.09
788 0.09
789 0.11
790 0.14
791 0.13
792 0.13
793 0.13
794 0.15
795 0.13
796 0.15
797 0.15
798 0.11
799 0.1
800 0.1
801 0.11
802 0.11
803 0.12
804 0.1
805 0.16
806 0.16
807 0.16
808 0.2
809 0.21
810 0.19
811 0.21
812 0.22
813 0.16
814 0.23
815 0.25
816 0.24
817 0.27
818 0.31
819 0.31
820 0.38
821 0.46
822 0.39
823 0.39
824 0.42
825 0.43
826 0.44
827 0.48
828 0.42
829 0.35
830 0.36
831 0.36
832 0.4
833 0.36
834 0.32
835 0.26
836 0.26
837 0.25
838 0.26
839 0.27
840 0.22
841 0.23
842 0.21
843 0.21
844 0.19
845 0.18
846 0.16
847 0.12
848 0.08
849 0.05
850 0.05
851 0.06
852 0.06
853 0.06
854 0.06
855 0.08
856 0.09
857 0.1
858 0.12
859 0.13
860 0.14
861 0.14
862 0.17
863 0.16
864 0.19
865 0.24
866 0.28
867 0.28
868 0.28
869 0.29
870 0.27
871 0.29
872 0.26
873 0.19
874 0.14
875 0.15
876 0.16
877 0.15
878 0.14
879 0.12
880 0.11
881 0.14
882 0.15
883 0.11
884 0.1
885 0.11
886 0.14
887 0.14
888 0.14
889 0.13
890 0.13
891 0.15
892 0.16
893 0.19
894 0.22
895 0.24
896 0.26
897 0.25
898 0.26
899 0.26
900 0.31
901 0.29
902 0.25
903 0.23
904 0.24
905 0.24
906 0.28
907 0.26
908 0.22
909 0.26
910 0.32
911 0.38
912 0.36
913 0.36
914 0.32
915 0.34
916 0.32
917 0.25
918 0.18
919 0.11
920 0.1
921 0.09
922 0.08
923 0.06
924 0.06
925 0.06
926 0.06
927 0.05
928 0.06
929 0.05
930 0.07
931 0.07
932 0.1
933 0.12
934 0.12
935 0.15
936 0.15
937 0.16
938 0.16
939 0.17
940 0.14
941 0.19
942 0.2
943 0.18
944 0.2
945 0.21
946 0.28
947 0.29
948 0.29
949 0.23
950 0.27
951 0.27
952 0.27
953 0.27
954 0.19
955 0.18
956 0.17
957 0.18
958 0.15
959 0.13
960 0.12
961 0.1
962 0.1
963 0.1
964 0.1
965 0.08
966 0.08
967 0.08
968 0.09
969 0.09
970 0.08
971 0.08
972 0.08
973 0.11
974 0.12
975 0.13
976 0.11
977 0.11
978 0.12
979 0.14
980 0.15
981 0.14
982 0.13
983 0.13
984 0.13
985 0.15
986 0.16
987 0.16
988 0.16
989 0.17
990 0.2
991 0.23
992 0.25
993 0.25
994 0.26
995 0.26
996 0.27
997 0.25
998 0.23
999 0.2
1000 0.18
1001 0.17
1002 0.13
1003 0.14
1004 0.13
1005 0.12
1006 0.12
1007 0.14
1008 0.13
1009 0.12
1010 0.14
1011 0.12
1012 0.11
1013 0.16
1014 0.21
1015 0.25
1016 0.27
1017 0.31
1018 0.36
1019 0.4
1020 0.43
1021 0.42
1022 0.43
1023 0.45
1024 0.45
1025 0.44
1026 0.4
1027 0.4
1028 0.42
1029 0.39
1030 0.32
1031 0.24
1032 0.23
1033 0.2
1034 0.2
1035 0.19
1036 0.13
1037 0.15
1038 0.16
1039 0.2
1040 0.22
1041 0.24
1042 0.22
1043 0.23
1044 0.22
1045 0.22
1046 0.22
1047 0.18
1048 0.15
1049 0.13
1050 0.12
1051 0.11
1052 0.11
1053 0.09
1054 0.14
1055 0.14
1056 0.15
1057 0.17
1058 0.18
1059 0.17
1060 0.22
1061 0.25
1062 0.23
1063 0.26
1064 0.26
1065 0.27
1066 0.29
1067 0.33
1068 0.34
1069 0.33
1070 0.29
1071 0.26
1072 0.24
1073 0.24
1074 0.2
1075 0.21
1076 0.15
1077 0.15
1078 0.15
1079 0.14
1080 0.2
1081 0.19
1082 0.24
1083 0.23
1084 0.26
1085 0.28
1086 0.28
1087 0.35
1088 0.32
1089 0.34
1090 0.3
1091 0.31
1092 0.3
1093 0.3
1094 0.3
1095 0.25
1096 0.31
1097 0.27
1098 0.29
1099 0.32
1100 0.32
1101 0.3
1102 0.31
1103 0.32
1104 0.26
1105 0.29
1106 0.3
1107 0.26
1108 0.28
1109 0.31
1110 0.33
1111 0.4
1112 0.45
1113 0.43