Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q12139

Protein Details
Accession Q12139    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
80-107RKDLLIRHEKRHSKVKNRLSRPSKDQISBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
90-93RHSK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11, cyto 2.5, plas 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007219  Transcription_factor_dom_fun  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG sce:YPR022C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04082  Fungal_trans  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
CDD cd12148  fungal_TF_MHR  
Amino Acid Sequences MHGKELAGRLRKRENDNDLSPNSSSSPAERFRCPHPECNKTFSRQEHLSRHKLNHWPKEIYVCSYVLPTTNAPCNKTFVRKDLLIRHEKRHSKVKNRLSRPSKDQISSSNKDFSKNAPYNPSEVPLSTQSGTSTINLIKNSVNPPPSITQESKFRPFLQQAQQPQQVQQSQQPQQIQQLQQLQFPQQLRAPLQQPMLQQQMHPQQASPTFPSYDPRIRNNGQNGNQFFNLIFDNRTGVNGFEVDAANNNGNGNDQNMNINPAVQQQRYQDRNFASSSYQQPLQPLTQDQQQEQYFQQQKLAQQQQQQQQQQQQQQQLPPQNPFGDPLTSSSSGANLSVMQDLFSTNFLNSDPLQSFMQELSEAPQVSIEDTFSDKNTIPPNEKPVQQDEGFQNPPVMFELPQDNIKIPKAQPKFNDNPSTSVKDNLSSQKLNINELKRRSSKDSGVGNNSSLNYKEQLRHSMKSVPSFFHPDPLTKYKISKEKCQEMFSFVPELRYVSIESIHKSLKSFWLNFHPQYGLLHKPSFHVDKQPAILNLALIMTGASFLGSEYREQISDPICGPLRWIIFSHADFQPPSKTYIIQSLLLVEGYEKTSTNRYLHERSFLHHGTTIQLLRRTPSLGGHPLMVKTGKTSGENSIQDPQEVYKRWIDFEMLKRIAFYAFYMDTTHAVVFGYWNLFINSNQIQLTLPCPDQVWESYDLSYETLMEHGYGSTKRDENNTFLSALMQLMKNVIQILRNNNIRRNKVNNGGIESTPTDLESTTDWNIQSLFGKKILLAGIISILFQCQEEVNGDYFITNFRGGITDHLGLSWKDILSFAMNYWLHEVQKSCTDPKACRISTPSEETLTNRKIDEDNGDGLCDDDLDLLSSDNPSNCKIPVIHISQIVLRILHHDYYIYAGAPWRMNVPIGRDEYDMISRRILQFAKDPYNGGVAVVYAFQFLFEMFIIKENNVPTVVKSYNINSDPVITRPYAIALTSLLIWSCNFALHGCEVSIWDNTEASKDECFQPDDSNGGNILGNTDNNGSTIANNNLKEKNNYIPIESFEVYLLRMYRNLYVDSSLDVVSFQNDVWAKASLLQHISNTHFLCGMMQFMRDIFNKSYWDLGREFGKLFDNCLERSLGKTSPTCHNMFDV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.7
3 0.73
4 0.73
5 0.66
6 0.63
7 0.55
8 0.47
9 0.4
10 0.34
11 0.28
12 0.24
13 0.29
14 0.32
15 0.36
16 0.4
17 0.42
18 0.47
19 0.56
20 0.59
21 0.61
22 0.63
23 0.69
24 0.67
25 0.71
26 0.71
27 0.67
28 0.69
29 0.65
30 0.64
31 0.62
32 0.66
33 0.69
34 0.72
35 0.76
36 0.75
37 0.75
38 0.74
39 0.76
40 0.78
41 0.77
42 0.75
43 0.7
44 0.65
45 0.69
46 0.63
47 0.58
48 0.51
49 0.41
50 0.34
51 0.31
52 0.3
53 0.22
54 0.22
55 0.19
56 0.21
57 0.28
58 0.32
59 0.33
60 0.34
61 0.38
62 0.41
63 0.48
64 0.48
65 0.46
66 0.49
67 0.51
68 0.57
69 0.61
70 0.65
71 0.66
72 0.66
73 0.68
74 0.72
75 0.74
76 0.73
77 0.74
78 0.75
79 0.75
80 0.8
81 0.83
82 0.83
83 0.84
84 0.88
85 0.87
86 0.85
87 0.83
88 0.82
89 0.79
90 0.72
91 0.66
92 0.65
93 0.66
94 0.63
95 0.58
96 0.57
97 0.5
98 0.5
99 0.49
100 0.44
101 0.45
102 0.45
103 0.46
104 0.46
105 0.47
106 0.47
107 0.47
108 0.46
109 0.37
110 0.32
111 0.31
112 0.25
113 0.28
114 0.24
115 0.23
116 0.2
117 0.2
118 0.21
119 0.18
120 0.18
121 0.18
122 0.21
123 0.21
124 0.22
125 0.22
126 0.26
127 0.29
128 0.32
129 0.3
130 0.27
131 0.3
132 0.32
133 0.36
134 0.37
135 0.37
136 0.35
137 0.42
138 0.48
139 0.5
140 0.51
141 0.48
142 0.48
143 0.5
144 0.54
145 0.54
146 0.56
147 0.57
148 0.63
149 0.67
150 0.62
151 0.6
152 0.59
153 0.53
154 0.48
155 0.46
156 0.47
157 0.46
158 0.51
159 0.51
160 0.46
161 0.5
162 0.55
163 0.5
164 0.47
165 0.5
166 0.45
167 0.44
168 0.45
169 0.4
170 0.38
171 0.37
172 0.34
173 0.28
174 0.31
175 0.32
176 0.35
177 0.35
178 0.34
179 0.35
180 0.36
181 0.35
182 0.36
183 0.39
184 0.33
185 0.31
186 0.35
187 0.4
188 0.41
189 0.39
190 0.34
191 0.33
192 0.36
193 0.39
194 0.35
195 0.29
196 0.27
197 0.27
198 0.31
199 0.33
200 0.37
201 0.39
202 0.4
203 0.46
204 0.46
205 0.53
206 0.58
207 0.6
208 0.59
209 0.63
210 0.6
211 0.56
212 0.54
213 0.47
214 0.38
215 0.3
216 0.25
217 0.17
218 0.15
219 0.11
220 0.13
221 0.12
222 0.14
223 0.13
224 0.11
225 0.11
226 0.1
227 0.1
228 0.11
229 0.11
230 0.1
231 0.11
232 0.13
233 0.12
234 0.12
235 0.12
236 0.1
237 0.11
238 0.11
239 0.12
240 0.11
241 0.11
242 0.14
243 0.14
244 0.17
245 0.16
246 0.16
247 0.14
248 0.19
249 0.24
250 0.22
251 0.25
252 0.28
253 0.38
254 0.43
255 0.44
256 0.43
257 0.4
258 0.43
259 0.4
260 0.35
261 0.29
262 0.3
263 0.33
264 0.3
265 0.31
266 0.28
267 0.29
268 0.3
269 0.28
270 0.25
271 0.23
272 0.22
273 0.25
274 0.26
275 0.25
276 0.3
277 0.29
278 0.29
279 0.28
280 0.35
281 0.35
282 0.33
283 0.37
284 0.33
285 0.36
286 0.43
287 0.5
288 0.45
289 0.46
290 0.54
291 0.57
292 0.63
293 0.65
294 0.61
295 0.61
296 0.64
297 0.64
298 0.63
299 0.62
300 0.58
301 0.57
302 0.58
303 0.58
304 0.53
305 0.48
306 0.46
307 0.4
308 0.35
309 0.34
310 0.28
311 0.23
312 0.2
313 0.2
314 0.22
315 0.21
316 0.21
317 0.19
318 0.17
319 0.16
320 0.16
321 0.13
322 0.08
323 0.08
324 0.09
325 0.09
326 0.08
327 0.08
328 0.08
329 0.08
330 0.09
331 0.09
332 0.07
333 0.08
334 0.08
335 0.1
336 0.1
337 0.13
338 0.12
339 0.14
340 0.14
341 0.14
342 0.15
343 0.12
344 0.13
345 0.09
346 0.09
347 0.09
348 0.12
349 0.12
350 0.11
351 0.12
352 0.11
353 0.12
354 0.12
355 0.09
356 0.07
357 0.09
358 0.1
359 0.09
360 0.12
361 0.11
362 0.15
363 0.21
364 0.23
365 0.26
366 0.28
367 0.34
368 0.36
369 0.4
370 0.39
371 0.37
372 0.39
373 0.35
374 0.37
375 0.33
376 0.35
377 0.33
378 0.3
379 0.28
380 0.22
381 0.22
382 0.19
383 0.17
384 0.11
385 0.11
386 0.14
387 0.14
388 0.16
389 0.16
390 0.15
391 0.16
392 0.17
393 0.2
394 0.18
395 0.26
396 0.28
397 0.33
398 0.36
399 0.43
400 0.48
401 0.51
402 0.58
403 0.5
404 0.51
405 0.5
406 0.5
407 0.42
408 0.39
409 0.32
410 0.25
411 0.28
412 0.29
413 0.29
414 0.25
415 0.25
416 0.26
417 0.27
418 0.29
419 0.31
420 0.31
421 0.32
422 0.36
423 0.42
424 0.42
425 0.45
426 0.48
427 0.47
428 0.45
429 0.46
430 0.49
431 0.47
432 0.48
433 0.45
434 0.39
435 0.36
436 0.33
437 0.26
438 0.2
439 0.17
440 0.13
441 0.15
442 0.18
443 0.19
444 0.28
445 0.31
446 0.32
447 0.33
448 0.38
449 0.38
450 0.4
451 0.4
452 0.32
453 0.3
454 0.36
455 0.33
456 0.32
457 0.31
458 0.26
459 0.3
460 0.33
461 0.34
462 0.28
463 0.31
464 0.31
465 0.38
466 0.4
467 0.43
468 0.46
469 0.52
470 0.54
471 0.55
472 0.5
473 0.47
474 0.45
475 0.38
476 0.33
477 0.24
478 0.21
479 0.18
480 0.17
481 0.12
482 0.12
483 0.11
484 0.08
485 0.11
486 0.11
487 0.12
488 0.14
489 0.15
490 0.14
491 0.14
492 0.15
493 0.19
494 0.23
495 0.22
496 0.22
497 0.29
498 0.34
499 0.34
500 0.34
501 0.27
502 0.23
503 0.24
504 0.25
505 0.2
506 0.18
507 0.18
508 0.17
509 0.18
510 0.21
511 0.24
512 0.21
513 0.24
514 0.23
515 0.24
516 0.26
517 0.27
518 0.23
519 0.21
520 0.2
521 0.13
522 0.11
523 0.09
524 0.07
525 0.04
526 0.04
527 0.03
528 0.03
529 0.03
530 0.02
531 0.02
532 0.02
533 0.04
534 0.04
535 0.05
536 0.07
537 0.07
538 0.08
539 0.08
540 0.1
541 0.1
542 0.11
543 0.11
544 0.12
545 0.12
546 0.11
547 0.12
548 0.13
549 0.13
550 0.12
551 0.12
552 0.12
553 0.14
554 0.15
555 0.18
556 0.16
557 0.16
558 0.16
559 0.16
560 0.17
561 0.16
562 0.18
563 0.15
564 0.15
565 0.14
566 0.2
567 0.21
568 0.18
569 0.17
570 0.15
571 0.14
572 0.13
573 0.12
574 0.07
575 0.05
576 0.06
577 0.06
578 0.06
579 0.07
580 0.09
581 0.13
582 0.14
583 0.16
584 0.21
585 0.25
586 0.26
587 0.31
588 0.29
589 0.28
590 0.34
591 0.31
592 0.27
593 0.23
594 0.23
595 0.18
596 0.2
597 0.2
598 0.16
599 0.17
600 0.16
601 0.16
602 0.16
603 0.16
604 0.14
605 0.14
606 0.15
607 0.16
608 0.17
609 0.17
610 0.17
611 0.16
612 0.17
613 0.16
614 0.12
615 0.1
616 0.12
617 0.12
618 0.12
619 0.14
620 0.16
621 0.22
622 0.23
623 0.24
624 0.26
625 0.25
626 0.24
627 0.22
628 0.2
629 0.19
630 0.19
631 0.2
632 0.19
633 0.19
634 0.2
635 0.2
636 0.21
637 0.21
638 0.25
639 0.32
640 0.29
641 0.28
642 0.27
643 0.27
644 0.25
645 0.2
646 0.15
647 0.1
648 0.09
649 0.09
650 0.1
651 0.1
652 0.11
653 0.11
654 0.11
655 0.07
656 0.07
657 0.06
658 0.06
659 0.06
660 0.06
661 0.05
662 0.06
663 0.07
664 0.08
665 0.08
666 0.12
667 0.11
668 0.12
669 0.12
670 0.12
671 0.12
672 0.11
673 0.13
674 0.12
675 0.11
676 0.1
677 0.1
678 0.1
679 0.12
680 0.12
681 0.14
682 0.14
683 0.15
684 0.14
685 0.15
686 0.14
687 0.13
688 0.12
689 0.09
690 0.06
691 0.06
692 0.05
693 0.05
694 0.05
695 0.05
696 0.07
697 0.08
698 0.09
699 0.12
700 0.14
701 0.15
702 0.2
703 0.22
704 0.24
705 0.27
706 0.27
707 0.24
708 0.22
709 0.22
710 0.17
711 0.15
712 0.13
713 0.09
714 0.08
715 0.08
716 0.08
717 0.08
718 0.09
719 0.09
720 0.1
721 0.13
722 0.18
723 0.24
724 0.31
725 0.33
726 0.4
727 0.47
728 0.48
729 0.51
730 0.53
731 0.52
732 0.53
733 0.56
734 0.51
735 0.48
736 0.46
737 0.4
738 0.35
739 0.3
740 0.23
741 0.18
742 0.15
743 0.11
744 0.08
745 0.09
746 0.08
747 0.1
748 0.11
749 0.13
750 0.13
751 0.13
752 0.13
753 0.13
754 0.15
755 0.15
756 0.15
757 0.14
758 0.14
759 0.14
760 0.16
761 0.15
762 0.13
763 0.1
764 0.08
765 0.08
766 0.08
767 0.08
768 0.06
769 0.05
770 0.05
771 0.05
772 0.05
773 0.04
774 0.05
775 0.07
776 0.09
777 0.1
778 0.1
779 0.1
780 0.1
781 0.1
782 0.1
783 0.1
784 0.09
785 0.07
786 0.07
787 0.09
788 0.09
789 0.11
790 0.14
791 0.13
792 0.13
793 0.13
794 0.15
795 0.13
796 0.15
797 0.15
798 0.11
799 0.1
800 0.1
801 0.11
802 0.11
803 0.12
804 0.1
805 0.16
806 0.16
807 0.16
808 0.2
809 0.21
810 0.19
811 0.21
812 0.22
813 0.16
814 0.23
815 0.25
816 0.24
817 0.27
818 0.31
819 0.31
820 0.38
821 0.46
822 0.39
823 0.39
824 0.42
825 0.43
826 0.44
827 0.48
828 0.42
829 0.35
830 0.36
831 0.36
832 0.4
833 0.36
834 0.32
835 0.26
836 0.26
837 0.25
838 0.26
839 0.27
840 0.22
841 0.23
842 0.21
843 0.21
844 0.19
845 0.18
846 0.16
847 0.12
848 0.08
849 0.05
850 0.05
851 0.06
852 0.06
853 0.06
854 0.06
855 0.08
856 0.09
857 0.1
858 0.12
859 0.13
860 0.14
861 0.14
862 0.17
863 0.16
864 0.19
865 0.24
866 0.28
867 0.28
868 0.28
869 0.29
870 0.27
871 0.29
872 0.26
873 0.19
874 0.14
875 0.15
876 0.16
877 0.15
878 0.14
879 0.12
880 0.11
881 0.14
882 0.15
883 0.11
884 0.1
885 0.11
886 0.14
887 0.14
888 0.14
889 0.13
890 0.13
891 0.15
892 0.16
893 0.19
894 0.22
895 0.24
896 0.26
897 0.25
898 0.26
899 0.26
900 0.31
901 0.29
902 0.25
903 0.23
904 0.24
905 0.24
906 0.28
907 0.26
908 0.22
909 0.26
910 0.32
911 0.38
912 0.36
913 0.36
914 0.32
915 0.34
916 0.32
917 0.25
918 0.18
919 0.11
920 0.1
921 0.09
922 0.08
923 0.06
924 0.06
925 0.06
926 0.06
927 0.05
928 0.06
929 0.05
930 0.07
931 0.07
932 0.1
933 0.12
934 0.12
935 0.15
936 0.15
937 0.16
938 0.16
939 0.17
940 0.14
941 0.19
942 0.2
943 0.18
944 0.2
945 0.21
946 0.28
947 0.29
948 0.29
949 0.23
950 0.27
951 0.27
952 0.27
953 0.27
954 0.19
955 0.18
956 0.17
957 0.18
958 0.15
959 0.13
960 0.12
961 0.1
962 0.1
963 0.1
964 0.1
965 0.08
966 0.08
967 0.08
968 0.09
969 0.09
970 0.08
971 0.08
972 0.08
973 0.11
974 0.12
975 0.13
976 0.11
977 0.11
978 0.12
979 0.14
980 0.15
981 0.14
982 0.13
983 0.13
984 0.13
985 0.15
986 0.16
987 0.16
988 0.16
989 0.17
990 0.2
991 0.23
992 0.25
993 0.25
994 0.26
995 0.26
996 0.27
997 0.25
998 0.23
999 0.2
1000 0.18
1001 0.17
1002 0.13
1003 0.14
1004 0.13
1005 0.12
1006 0.12
1007 0.14
1008 0.13
1009 0.12
1010 0.14
1011 0.12
1012 0.11
1013 0.16
1014 0.21
1015 0.25
1016 0.27
1017 0.31
1018 0.36
1019 0.4
1020 0.43
1021 0.42
1022 0.43
1023 0.45
1024 0.45
1025 0.44
1026 0.4
1027 0.4
1028 0.42
1029 0.39
1030 0.32
1031 0.24
1032 0.23
1033 0.2
1034 0.2
1035 0.19
1036 0.13
1037 0.15
1038 0.16
1039 0.2
1040 0.22
1041 0.24
1042 0.22
1043 0.23
1044 0.22
1045 0.22
1046 0.22
1047 0.18
1048 0.15
1049 0.13
1050 0.12
1051 0.11
1052 0.11
1053 0.09
1054 0.14
1055 0.14
1056 0.15
1057 0.17
1058 0.18
1059 0.17
1060 0.22
1061 0.25
1062 0.23
1063 0.26
1064 0.26
1065 0.27
1066 0.29
1067 0.33
1068 0.34
1069 0.33
1070 0.29
1071 0.26
1072 0.24
1073 0.24
1074 0.2
1075 0.21
1076 0.15
1077 0.15
1078 0.15
1079 0.14
1080 0.2
1081 0.19
1082 0.24
1083 0.23
1084 0.26
1085 0.28
1086 0.28
1087 0.35
1088 0.32
1089 0.34
1090 0.3
1091 0.31
1092 0.3
1093 0.3
1094 0.3
1095 0.25
1096 0.31
1097 0.27
1098 0.29
1099 0.32
1100 0.32
1101 0.3
1102 0.31
1103 0.32
1104 0.26
1105 0.29
1106 0.3
1107 0.26
1108 0.28
1109 0.31
1110 0.33
1111 0.4
1112 0.45
1113 0.43