Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q07623

Protein Details
Accession Q07623    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-27GSEEDKKLTKKQLKAQQFRKSKEEKDHydrophilic
49-77NDGEEPVKKKRKTRRGRGGKGKNGKKGNRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-76KQLKAQQFRKSKEEKDQEKDVKKEQAPEGKRPNSAAGNDGEEPVKKKRKTRRGRGGKGKNGKKGN
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0030515  F:snoRNA binding  
GO:0030490  P:maturation of SSU-rRNA  
GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
KEGG sce:YDL213C  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MGSEEDKKLTKKQLKAQQFRKSKEEKDQEKDVKKEQAPEGKRPNSAAGNDGEEPVKKKRKTRRGRGGKGKNGKKGNRFIVFVGSLPRDITAVELQNHFKNSSPDQIRLRADKGIAFLEFDADKDRTGIQRRMDIALLQHGTLLKEKKINVELTVGGGGNSQERLEKLKNKNIKLDEERKERLTKMINDGNQKKIAKTTATAAQTSGTDNKPVPAGIHPDRAKLLK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.81
3 0.85
4 0.84
5 0.85
6 0.83
7 0.82
8 0.8
9 0.76
10 0.76
11 0.77
12 0.75
13 0.73
14 0.78
15 0.78
16 0.78
17 0.77
18 0.72
19 0.71
20 0.64
21 0.65
22 0.61
23 0.62
24 0.58
25 0.63
26 0.66
27 0.62
28 0.61
29 0.56
30 0.54
31 0.48
32 0.44
33 0.37
34 0.29
35 0.29
36 0.27
37 0.26
38 0.22
39 0.2
40 0.22
41 0.28
42 0.35
43 0.35
44 0.42
45 0.52
46 0.62
47 0.71
48 0.79
49 0.82
50 0.84
51 0.91
52 0.94
53 0.93
54 0.92
55 0.92
56 0.88
57 0.86
58 0.84
59 0.8
60 0.76
61 0.74
62 0.72
63 0.65
64 0.59
65 0.51
66 0.46
67 0.39
68 0.32
69 0.27
70 0.2
71 0.16
72 0.15
73 0.14
74 0.1
75 0.09
76 0.1
77 0.09
78 0.11
79 0.12
80 0.14
81 0.16
82 0.18
83 0.19
84 0.18
85 0.17
86 0.18
87 0.18
88 0.24
89 0.25
90 0.28
91 0.3
92 0.34
93 0.35
94 0.34
95 0.34
96 0.27
97 0.25
98 0.21
99 0.19
100 0.15
101 0.13
102 0.1
103 0.09
104 0.09
105 0.08
106 0.08
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.1
112 0.13
113 0.19
114 0.23
115 0.22
116 0.26
117 0.27
118 0.28
119 0.27
120 0.24
121 0.19
122 0.19
123 0.18
124 0.14
125 0.13
126 0.12
127 0.13
128 0.16
129 0.17
130 0.14
131 0.17
132 0.18
133 0.21
134 0.25
135 0.25
136 0.22
137 0.23
138 0.21
139 0.19
140 0.19
141 0.15
142 0.11
143 0.1
144 0.09
145 0.08
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.08
150 0.13
151 0.18
152 0.27
153 0.33
154 0.42
155 0.5
156 0.52
157 0.6
158 0.59
159 0.62
160 0.62
161 0.65
162 0.65
163 0.65
164 0.66
165 0.63
166 0.62
167 0.54
168 0.51
169 0.49
170 0.45
171 0.45
172 0.48
173 0.49
174 0.55
175 0.59
176 0.58
177 0.58
178 0.54
179 0.47
180 0.44
181 0.43
182 0.36
183 0.33
184 0.32
185 0.32
186 0.34
187 0.33
188 0.29
189 0.27
190 0.25
191 0.26
192 0.27
193 0.21
194 0.21
195 0.22
196 0.23
197 0.23
198 0.23
199 0.21
200 0.2
201 0.27
202 0.28
203 0.38
204 0.38
205 0.39