FuNGI

P38959

Protein Details

Accession

P38959

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
230-256	GNRIDIVLNKKKKKKTRKDDLSSDMKG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
239-247	KKKKKKTRK

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR000547 Clathrin_H-chain/VPS_repeat IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf IPR016902 VPS41 IPR045111 Vps41/Vps8 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005768 C:endosome GO:0000329 C:fungal-type vacuole membrane GO:0030897 C:HOPS complex GO:0005770 C:late endosome GO:0031267 F:small GTPase binding GO:0009267 P:cellular response to starvation GO:0032258 P:cytoplasm to vacuole transport by the Cvt pathway GO:0034058 P:endosomal vesicle fusion GO:0016236 P:macroautophagy GO:0034727 P:piecemeal microautophagy of the nucleus GO:0006623 P:protein targeting to vacuole GO:0015031 P:protein transport GO:0035542 P:regulation of SNARE complex assembly GO:0006624 P:vacuolar protein processing GO:0042144 P:vacuole fusion, non-autophagic GO:0007033 P:vacuole organization GO:0099022 P:vesicle tethering GO:0016192 P:vesicle-mediated transport
KEGG	sce:YDR080W -
Pfam	View protein in Pfam PF00637 Clathrin
PROSITE	View protein in PROSITE PS50236 CHCR

Amino Acid Sequences

MTTDNHQNDSVLDQQSGERTIDESNSISDENNVDNKREDVNVTSPTKSVSCISQAENGVASRTDESTITGSATDAETGDDDDDDDDDDDEDEDDEDEPPLLKYTRISQLPKNFFQRDSISSCLFGDTFFAFGTHSGILHLTTCAFEPIKTIKCHRSSILCINTDGKYFATGSIDGTVIIGSMDDPQNITQYDFKRPINSVALHSNFQASRMFVSGGMAGDVVLSQRNWLGNRIDIVLNKKKKKKTRKDDLSSDMKGPIMGIYTMGDLILWMDDDGITFCDVPTRSQLLNIPFPSRIFNVQDVRPDLFRPHVHFLESDRVVIGWGSNIWLFKVSFTKDSNSIKSGDSNSQSNNMSHFNPTTNIGSLLSSAASSFRGTPDKKVELECHFTVSMLITGLASFKDDQLLCLGFDIDIEEEATIDEDMKEGKNFSKRPENLLAKGNAPELKIVDLFNGDEIYNDEVIMKNYEKLSINDYHLGKHIDKTTPEYYLISSNDAIRVQELSLKDHFDWFMERKQYYKAWKIGKYVIGSEERFSIGLKFLNSLVTKKDWGTLVDHLNIIFEETLNSLDSNSYDVTQNVLKEWADIIEILITSGNIVEIAPLIPKKPALRKSVYDDVLHYFLANDMINKFHEYITKWDLKLFSVEDFEEELETRIEAASEPTASSKEEGSNITYRTELVHLYLKENKYTKAIPHLLKAKDLRALTIIKIQNLLPQYLDQIVDIILLPYKGEISHISKLSIFEIQTIFNKPIDLLFENRHTISVARIYEIFEHDCPKSFKKILFCYLIKFLDTDDSFMISPYENQLIELYSEYDRQSLLPFLQKHNNYNVESAIEVCSSKLGLYNELIYLWGKIGETKKALSLIIDELKNPQLAIDFVKNWGDSELWEFMINYSLDKPNFTKAILTCSDETSEIYLKVIRGMSDDLQIDNLQDIIKHIVQENSLSLEVRDNILVIINDETKKFANEFLKIRSQGKLFQVDESDIEINDDLNGVL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.25
3	0.26
4	0.23
5	0.17
6	0.16
7	0.18
8	0.18
9	0.18
10	0.17
11	0.16
12	0.17
13	0.17
14	0.16
15	0.17
16	0.17
17	0.19
18	0.26
19	0.26
20	0.26
21	0.28
22	0.29
23	0.3
24	0.3
25	0.28
26	0.25
27	0.28
28	0.34
29	0.35
30	0.35
31	0.32
32	0.33
33	0.31
34	0.29
35	0.26
36	0.21
37	0.23
38	0.25
39	0.28
40	0.31
41	0.32
42	0.31
43	0.31
44	0.28
45	0.24
46	0.21
47	0.2
48	0.15
49	0.15
50	0.16
51	0.14
52	0.16
53	0.16
54	0.16
55	0.15
56	0.13
57	0.12
58	0.12
59	0.12
60	0.1
61	0.08
62	0.09
63	0.09
64	0.09
65	0.1
66	0.09
67	0.08
68	0.08
69	0.09
70	0.09
71	0.09
72	0.08
73	0.08
74	0.09
75	0.09
76	0.09
77	0.09
78	0.08
79	0.08
80	0.08
81	0.08
82	0.08
83	0.08
84	0.09
85	0.09
86	0.11
87	0.11
88	0.12
89	0.13
90	0.19
91	0.27
92	0.33
93	0.38
94	0.43
95	0.53
96	0.6
97	0.66
98	0.69
99	0.64
100	0.58
101	0.58
102	0.55
103	0.5
104	0.47
105	0.44
106	0.37
107	0.34
108	0.33
109	0.3
110	0.24
111	0.19
112	0.16
113	0.12
114	0.12
115	0.1
116	0.1
117	0.09
118	0.09
119	0.12
120	0.09
121	0.09
122	0.09
123	0.09
124	0.09
125	0.1
126	0.1
127	0.08
128	0.08
129	0.09
130	0.12
131	0.12
132	0.11
133	0.15
134	0.21
135	0.27
136	0.31
137	0.36
138	0.42
139	0.46
140	0.5
141	0.5
142	0.5
143	0.5
144	0.56
145	0.57
146	0.5
147	0.47
148	0.47
149	0.44
150	0.38
151	0.33
152	0.23
153	0.17
154	0.16
155	0.15
156	0.14
157	0.13
158	0.13
159	0.14
160	0.13
161	0.11
162	0.11
163	0.09
164	0.07
165	0.06
166	0.05
167	0.04
168	0.07
169	0.08
170	0.08
171	0.1
172	0.1
173	0.13
174	0.14
175	0.15
176	0.18
177	0.2
178	0.28
179	0.32
180	0.34
181	0.35
182	0.37
183	0.4
184	0.4
185	0.39
186	0.35
187	0.38
188	0.39
189	0.36
190	0.34
191	0.34
192	0.28
193	0.27
194	0.25
195	0.17
196	0.15
197	0.16
198	0.16
199	0.11
200	0.13
201	0.12
202	0.11
203	0.1
204	0.09
205	0.07
206	0.06
207	0.06
208	0.06
209	0.06
210	0.05
211	0.06
212	0.08
213	0.11
214	0.12
215	0.16
216	0.17
217	0.18
218	0.2
219	0.22
220	0.22
221	0.22
222	0.29
223	0.35
224	0.43
225	0.49
226	0.57
227	0.63
228	0.71
229	0.8
230	0.83
231	0.85
232	0.87
233	0.9
234	0.9
235	0.9
236	0.88
237	0.85
238	0.76
239	0.67
240	0.56
241	0.45
242	0.35
243	0.26
244	0.19
245	0.12
246	0.09
247	0.07
248	0.07
249	0.07
250	0.07
251	0.06
252	0.06
253	0.04
254	0.04
255	0.04
256	0.04
257	0.03
258	0.03
259	0.03
260	0.04
261	0.05
262	0.05
263	0.06
264	0.06
265	0.06
266	0.1
267	0.11
268	0.12
269	0.15
270	0.18
271	0.18
272	0.2
273	0.25
274	0.25
275	0.31
276	0.32
277	0.3
278	0.27
279	0.28
280	0.28
281	0.26
282	0.25
283	0.21
284	0.25
285	0.27
286	0.28
287	0.33
288	0.33
289	0.33
290	0.3
291	0.28
292	0.24
293	0.25
294	0.26
295	0.27
296	0.3
297	0.29
298	0.29
299	0.29
300	0.3
301	0.33
302	0.3
303	0.25
304	0.19
305	0.18
306	0.17
307	0.16
308	0.13
309	0.05
310	0.05
311	0.06
312	0.07
313	0.07
314	0.07
315	0.09
316	0.09
317	0.09
318	0.14
319	0.14
320	0.18
321	0.19
322	0.22
323	0.27
324	0.31
325	0.32
326	0.3
327	0.3
328	0.26
329	0.28
330	0.28
331	0.27
332	0.25
333	0.25
334	0.24
335	0.26
336	0.27
337	0.24
338	0.23
339	0.21
340	0.2
341	0.2
342	0.2
343	0.17
344	0.17
345	0.19
346	0.18
347	0.16
348	0.15
349	0.13
350	0.12
351	0.12
352	0.11
353	0.08
354	0.06
355	0.06
356	0.06
357	0.06
358	0.06
359	0.06
360	0.08
361	0.15
362	0.16
363	0.21
364	0.26
365	0.29
366	0.3
367	0.32
368	0.34
369	0.32
370	0.37
371	0.33
372	0.29
373	0.26
374	0.24
375	0.22
376	0.18
377	0.14
378	0.08
379	0.08
380	0.05
381	0.05
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.05
387	0.09
388	0.09
389	0.09
390	0.11
391	0.11
392	0.1
393	0.1
394	0.1
395	0.06
396	0.06
397	0.06
398	0.05
399	0.04
400	0.05
401	0.04
402	0.04
403	0.04
404	0.05
405	0.04
406	0.04
407	0.04
408	0.04
409	0.05
410	0.05
411	0.06
412	0.07
413	0.1
414	0.17
415	0.19
416	0.23
417	0.32
418	0.33
419	0.39
420	0.47
421	0.48
422	0.44
423	0.47
424	0.44
425	0.36
426	0.35
427	0.32
428	0.24
429	0.2
430	0.18
431	0.13
432	0.12
433	0.12
434	0.11
435	0.09
436	0.08
437	0.07
438	0.07
439	0.07
440	0.06
441	0.06
442	0.07
443	0.08
444	0.07
445	0.07
446	0.07
447	0.07
448	0.08
449	0.1
450	0.09
451	0.09
452	0.09
453	0.12
454	0.13
455	0.13
456	0.17
457	0.18
458	0.19
459	0.23
460	0.23
461	0.21
462	0.22
463	0.24
464	0.21
465	0.2
466	0.22
467	0.19
468	0.19
469	0.24
470	0.23
471	0.22
472	0.22
473	0.2
474	0.17
475	0.18
476	0.18
477	0.14
478	0.13
479	0.12
480	0.13
481	0.12
482	0.11
483	0.08
484	0.08
485	0.07
486	0.1
487	0.1
488	0.11
489	0.12
490	0.14
491	0.14
492	0.14
493	0.14
494	0.11
495	0.14
496	0.14
497	0.17
498	0.2
499	0.2
500	0.2
501	0.23
502	0.27
503	0.3
504	0.34
505	0.36
506	0.39
507	0.42
508	0.44
509	0.45
510	0.44
511	0.39
512	0.34
513	0.3
514	0.27
515	0.24
516	0.21
517	0.18
518	0.15
519	0.14
520	0.13
521	0.11
522	0.08
523	0.09
524	0.09
525	0.09
526	0.09
527	0.12
528	0.13
529	0.13
530	0.14
531	0.14
532	0.15
533	0.15
534	0.16
535	0.13
536	0.14
537	0.16
538	0.17
539	0.18
540	0.18
541	0.18
542	0.16
543	0.15
544	0.14
545	0.12
546	0.08
547	0.05
548	0.05
549	0.05
550	0.06
551	0.06
552	0.06
553	0.05
554	0.06
555	0.06
556	0.07
557	0.07
558	0.07
559	0.07
560	0.07
561	0.09
562	0.1
563	0.1
564	0.09
565	0.11
566	0.1
567	0.09
568	0.09
569	0.08
570	0.07
571	0.07
572	0.06
573	0.05
574	0.05
575	0.05
576	0.04
577	0.04
578	0.04
579	0.03
580	0.03
581	0.03
582	0.03
583	0.03
584	0.03
585	0.03
586	0.05
587	0.05
588	0.06
589	0.07
590	0.09
591	0.13
592	0.21
593	0.28
594	0.32
595	0.37
596	0.4
597	0.47
598	0.53
599	0.51
600	0.44
601	0.39
602	0.35
603	0.32
604	0.28
605	0.21
606	0.13
607	0.1
608	0.11
609	0.1
610	0.08
611	0.07
612	0.08
613	0.09
614	0.11
615	0.11
616	0.11
617	0.13
618	0.14
619	0.19
620	0.24
621	0.28
622	0.27
623	0.28
624	0.28
625	0.25
626	0.26
627	0.22
628	0.17
629	0.14
630	0.14
631	0.12
632	0.12
633	0.12
634	0.1
635	0.1
636	0.09
637	0.08
638	0.07
639	0.07
640	0.06
641	0.06
642	0.05
643	0.06
644	0.06
645	0.07
646	0.07
647	0.08
648	0.09
649	0.09
650	0.1
651	0.1
652	0.1
653	0.12
654	0.13
655	0.15
656	0.18
657	0.19
658	0.19
659	0.17
660	0.16
661	0.16
662	0.16
663	0.12
664	0.11
665	0.16
666	0.16
667	0.19
668	0.26
669	0.25
670	0.3
671	0.31
672	0.31
673	0.29
674	0.3
675	0.29
676	0.32
677	0.38
678	0.35
679	0.39
680	0.46
681	0.43
682	0.47
683	0.47
684	0.4
685	0.38
686	0.36
687	0.3
688	0.26
689	0.26
690	0.21
691	0.27
692	0.26
693	0.22
694	0.23
695	0.22
696	0.23
697	0.23
698	0.22
699	0.15
700	0.13
701	0.14
702	0.14
703	0.14
704	0.1
705	0.09
706	0.09
707	0.08
708	0.08
709	0.06
710	0.06
711	0.05
712	0.05
713	0.05
714	0.05
715	0.05
716	0.06
717	0.1
718	0.14
719	0.2
720	0.21
721	0.22
722	0.23
723	0.24
724	0.24
725	0.23
726	0.18
727	0.15
728	0.15
729	0.16
730	0.18
731	0.2
732	0.2
733	0.17
734	0.17
735	0.15
736	0.15
737	0.17
738	0.17
739	0.17
740	0.19
741	0.23
742	0.25
743	0.25
744	0.25
745	0.21
746	0.19
747	0.19
748	0.21
749	0.18
750	0.16
751	0.17
752	0.18
753	0.19
754	0.21
755	0.22
756	0.17
757	0.2
758	0.19
759	0.24
760	0.27
761	0.28
762	0.33
763	0.33
764	0.36
765	0.41
766	0.47
767	0.48
768	0.52
769	0.5
770	0.46
771	0.49
772	0.46
773	0.37
774	0.31
775	0.25
776	0.25
777	0.24
778	0.22
779	0.17
780	0.18
781	0.17
782	0.17
783	0.17
784	0.1
785	0.11
786	0.12
787	0.14
788	0.12
789	0.13
790	0.13
791	0.13
792	0.13
793	0.13
794	0.13
795	0.11
796	0.14
797	0.13
798	0.14
799	0.13
800	0.13
801	0.14
802	0.14
803	0.15
804	0.2
805	0.23
806	0.28
807	0.36
808	0.4
809	0.42
810	0.48
811	0.52
812	0.46
813	0.45
814	0.4
815	0.32
816	0.29
817	0.26
818	0.2
819	0.14
820	0.12
821	0.11
822	0.1
823	0.09
824	0.09
825	0.12
826	0.12
827	0.14
828	0.15
829	0.16
830	0.16
831	0.16
832	0.17
833	0.13
834	0.12
835	0.1
836	0.09
837	0.08
838	0.13
839	0.16
840	0.2
841	0.22
842	0.22
843	0.24
844	0.25
845	0.25
846	0.21
847	0.2
848	0.2
849	0.24
850	0.23
851	0.22
852	0.23
853	0.26
854	0.25
855	0.23
856	0.18
857	0.13
858	0.14
859	0.18
860	0.19
861	0.18
862	0.2
863	0.23
864	0.23
865	0.22
866	0.22
867	0.18
868	0.14
869	0.17
870	0.17
871	0.15
872	0.15
873	0.15
874	0.14
875	0.19
876	0.17
877	0.14
878	0.16
879	0.21
880	0.21
881	0.24
882	0.26
883	0.28
884	0.29
885	0.28
886	0.3
887	0.26
888	0.33
889	0.32
890	0.35
891	0.3
892	0.31
893	0.32
894	0.27
895	0.26
896	0.23
897	0.22
898	0.18
899	0.18
900	0.18
901	0.16
902	0.2
903	0.2
904	0.16
905	0.17
906	0.2
907	0.21
908	0.23
909	0.24
910	0.21
911	0.22
912	0.22
913	0.19
914	0.16
915	0.15
916	0.1
917	0.09
918	0.11
919	0.14
920	0.15
921	0.17
922	0.19
923	0.2
924	0.21
925	0.23
926	0.22
927	0.21
928	0.2
929	0.19
930	0.17
931	0.19
932	0.19
933	0.19
934	0.18
935	0.14
936	0.13
937	0.16
938	0.15
939	0.12
940	0.15
941	0.18
942	0.19
943	0.19
944	0.22
945	0.2
946	0.23
947	0.22
948	0.26
949	0.28
950	0.33
951	0.37
952	0.41
953	0.49
954	0.51
955	0.53
956	0.52
957	0.48
958	0.48
959	0.5
960	0.53
961	0.45
962	0.44
963	0.44
964	0.4
965	0.38
966	0.36
967	0.3
968	0.21
969	0.22
970	0.18
971	0.15
972	0.14

P38959

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer