FuNGI

P53628

Protein Details

Accession

P53628

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
22-43	PDTKNFFHAKKKDPVNQDKANN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 13, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036885 SWIB_MDM2_dom_sf
Gene Ontology	GO:0000785 C:chromatin GO:0005829 C:cytosol GO:0005634 C:nucleus GO:0016514 C:SWI/SNF complex GO:0006338 P:chromatin remodeling GO:1905168 P:positive regulation of double-strand break repair via homologous recombination GO:0045944 P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
KEGG	sce:YNR023W -
CDD	cd10568 SWIB_like

Amino Acid Sequences

MSKVMKPSNGKGSRKSSKAATPDTKNFFHAKKKDPVNQDKANNASQITPTVPHSHPSDMVIPDHLAELIPELYSFQQLVDSEKRLDHFIHLRNLHMKRMVAQWERSKLSQEFLYPHLNFPNVKFLRIFISNVSENQPWQMDTNNEADLMALENATWTMRIEGRLLDNVQANDPAREKFSSFIESIVVDFKNKENDNVPSTKFNAAPEENATEGPSDKKLNLNLPLQFSLPNGDNSTTTNTDQNNATMGEETAKKDMSSTTPKLESVKWQYDPNNPVDFDGLDIKRVGSENVECTISILRKSSPEEPFMSYSPQLTAIIGLKSGTSHDAIFSIYKYIHLNELLTNDESAFENLMGNRNNHNSNTSTSKMLDAASSQVSIVKLDTQLITLLPSSLKESSPDTMKLTDLLSLINSTHLLPLQPIEIDYTVRVDKASTYGELVLDIEVPDVNALKFNNTQRESQIGAAELNENARELEQIKPKIALQDKEITSVLSNLHESNKRYRFFKKISEDPVKALNECIASTSNALKVLSGDEGYNEDMVRRANFYKENEAMLRENIEVILSNGRM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.71
2	0.69
3	0.64
4	0.62
5	0.65
6	0.67
7	0.66
8	0.65
9	0.7
10	0.72
11	0.68
12	0.64
13	0.62
14	0.58
15	0.59
16	0.58
17	0.58
18	0.61
19	0.68
20	0.73
21	0.77
22	0.82
23	0.81
24	0.81
25	0.78
26	0.76
27	0.71
28	0.66
29	0.58
30	0.48
31	0.41
32	0.34
33	0.31
34	0.25
35	0.22
36	0.22
37	0.26
38	0.26
39	0.27
40	0.3
41	0.3
42	0.3
43	0.31
44	0.33
45	0.28
46	0.29
47	0.27
48	0.24
49	0.21
50	0.2
51	0.17
52	0.11
53	0.09
54	0.1
55	0.08
56	0.08
57	0.07
58	0.08
59	0.09
60	0.1
61	0.1
62	0.08
63	0.1
64	0.11
65	0.17
66	0.2
67	0.23
68	0.23
69	0.25
70	0.27
71	0.26
72	0.27
73	0.27
74	0.3
75	0.34
76	0.4
77	0.4
78	0.42
79	0.49
80	0.5
81	0.49
82	0.45
83	0.39
84	0.34
85	0.39
86	0.44
87	0.41
88	0.46
89	0.49
90	0.52
91	0.55
92	0.52
93	0.52
94	0.44
95	0.42
96	0.37
97	0.32
98	0.28
99	0.28
100	0.36
101	0.31
102	0.32
103	0.31
104	0.31
105	0.29
106	0.28
107	0.35
108	0.27
109	0.28
110	0.26
111	0.24
112	0.27
113	0.28
114	0.27
115	0.18
116	0.23
117	0.23
118	0.24
119	0.28
120	0.24
121	0.22
122	0.23
123	0.22
124	0.17
125	0.16
126	0.17
127	0.14
128	0.16
129	0.19
130	0.17
131	0.16
132	0.15
133	0.14
134	0.11
135	0.11
136	0.09
137	0.06
138	0.05
139	0.05
140	0.06
141	0.06
142	0.06
143	0.04
144	0.06
145	0.08
146	0.09
147	0.1
148	0.12
149	0.14
150	0.17
151	0.17
152	0.18
153	0.19
154	0.19
155	0.19
156	0.21
157	0.19
158	0.18
159	0.19
160	0.18
161	0.17
162	0.17
163	0.17
164	0.16
165	0.17
166	0.19
167	0.17
168	0.17
169	0.15
170	0.14
171	0.14
172	0.16
173	0.13
174	0.1
175	0.11
176	0.12
177	0.19
178	0.19
179	0.21
180	0.21
181	0.25
182	0.29
183	0.31
184	0.32
185	0.27
186	0.29
187	0.3
188	0.28
189	0.25
190	0.26
191	0.23
192	0.23
193	0.22
194	0.21
195	0.19
196	0.18
197	0.17
198	0.12
199	0.12
200	0.12
201	0.12
202	0.12
203	0.12
204	0.15
205	0.17
206	0.2
207	0.25
208	0.27
209	0.28
210	0.29
211	0.3
212	0.27
213	0.25
214	0.21
215	0.18
216	0.15
217	0.14
218	0.12
219	0.12
220	0.12
221	0.13
222	0.17
223	0.16
224	0.16
225	0.18
226	0.18
227	0.19
228	0.19
229	0.18
230	0.15
231	0.13
232	0.13
233	0.09
234	0.09
235	0.09
236	0.11
237	0.11
238	0.11
239	0.11
240	0.1
241	0.1
242	0.11
243	0.14
244	0.19
245	0.21
246	0.22
247	0.23
248	0.24
249	0.26
250	0.26
251	0.28
252	0.27
253	0.3
254	0.29
255	0.32
256	0.34
257	0.39
258	0.41
259	0.39
260	0.35
261	0.3
262	0.29
263	0.25
264	0.22
265	0.16
266	0.19
267	0.14
268	0.12
269	0.12
270	0.12
271	0.12
272	0.12
273	0.11
274	0.07
275	0.08
276	0.09
277	0.1
278	0.11
279	0.1
280	0.1
281	0.12
282	0.11
283	0.11
284	0.1
285	0.1
286	0.12
287	0.15
288	0.21
289	0.21
290	0.23
291	0.25
292	0.26
293	0.28
294	0.27
295	0.26
296	0.2
297	0.18
298	0.15
299	0.14
300	0.12
301	0.09
302	0.1
303	0.09
304	0.09
305	0.08
306	0.08
307	0.07
308	0.06
309	0.07
310	0.07
311	0.07
312	0.06
313	0.07
314	0.07
315	0.08
316	0.08
317	0.08
318	0.08
319	0.07
320	0.08
321	0.09
322	0.09
323	0.1
324	0.1
325	0.11
326	0.11
327	0.12
328	0.13
329	0.12
330	0.12
331	0.1
332	0.1
333	0.1
334	0.09
335	0.08
336	0.06
337	0.07
338	0.08
339	0.12
340	0.13
341	0.14
342	0.17
343	0.2
344	0.22
345	0.22
346	0.24
347	0.21
348	0.23
349	0.27
350	0.25
351	0.24
352	0.22
353	0.22
354	0.2
355	0.19
356	0.16
357	0.11
358	0.12
359	0.1
360	0.1
361	0.09
362	0.1
363	0.1
364	0.1
365	0.09
366	0.09
367	0.09
368	0.1
369	0.1
370	0.09
371	0.09
372	0.09
373	0.09
374	0.07
375	0.08
376	0.07
377	0.07
378	0.09
379	0.1
380	0.11
381	0.11
382	0.14
383	0.16
384	0.19
385	0.2
386	0.2
387	0.2
388	0.2
389	0.19
390	0.17
391	0.16
392	0.13
393	0.11
394	0.1
395	0.09
396	0.09
397	0.09
398	0.09
399	0.08
400	0.08
401	0.08
402	0.08
403	0.08
404	0.09
405	0.09
406	0.08
407	0.08
408	0.09
409	0.1
410	0.1
411	0.1
412	0.12
413	0.12
414	0.12
415	0.12
416	0.1
417	0.1
418	0.12
419	0.14
420	0.11
421	0.12
422	0.13
423	0.13
424	0.13
425	0.13
426	0.1
427	0.08
428	0.08
429	0.07
430	0.06
431	0.06
432	0.06
433	0.06
434	0.06
435	0.08
436	0.08
437	0.11
438	0.17
439	0.22
440	0.31
441	0.33
442	0.35
443	0.35
444	0.38
445	0.37
446	0.34
447	0.3
448	0.22
449	0.2
450	0.19
451	0.18
452	0.14
453	0.13
454	0.11
455	0.1
456	0.09
457	0.09
458	0.1
459	0.1
460	0.17
461	0.24
462	0.27
463	0.28
464	0.29
465	0.3
466	0.37
467	0.42
468	0.38
469	0.34
470	0.41
471	0.4
472	0.42
473	0.41
474	0.33
475	0.27
476	0.27
477	0.23
478	0.16
479	0.17
480	0.15
481	0.21
482	0.26
483	0.29
484	0.37
485	0.44
486	0.46
487	0.49
488	0.54
489	0.57
490	0.58
491	0.65
492	0.64
493	0.65
494	0.71
495	0.76
496	0.72
497	0.64
498	0.66
499	0.58
500	0.5
501	0.42
502	0.35
503	0.26
504	0.24
505	0.23
506	0.17
507	0.16
508	0.17
509	0.19
510	0.18
511	0.19
512	0.19
513	0.17
514	0.16
515	0.16
516	0.16
517	0.15
518	0.13
519	0.12
520	0.14
521	0.15
522	0.15
523	0.14
524	0.12
525	0.13
526	0.16
527	0.16
528	0.18
529	0.19
530	0.24
531	0.31
532	0.35
533	0.42
534	0.42
535	0.45
536	0.43
537	0.45
538	0.42
539	0.38
540	0.35
541	0.26
542	0.25
543	0.19
544	0.18
545	0.14
546	0.13

P53628

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer