Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P26343

Protein Details
Accession P26343    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
69-91SLKTDTIKSRNRKKLNNNNVNTNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039355  Transcription_factor_GATA  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0042128  P:nitrate assimilation  
GO:0090295  P:nitrogen catabolite repression of transcription  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG sce:YKR034W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00344  GATA_ZN_FINGER_1  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MVLSDSLKLPSPTLSAAAGVDDCDGEDHPTCQNCFTVKTPLWRRDEHGTVLCNACGLFLKLHGEPRPISLKTDTIKSRNRKKLNNNNVNTNANTHSNDPNKIFKRKKRLLTTGGGSLPTNNPKVSILEKFMVSGSIKPLLKPKETVPNTKECSTQRGKFSLDPCEPSGKNYLYQINGSDIYTSNIELTRLPNLSTLLEPSPFSDSAVPEIELTWKLHNEEEVIKLKTKISELELVTDLYKKHIFQLNEKCKQLEVELHSRASVQSHPQH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.14
3 0.14
4 0.14
5 0.12
6 0.11
7 0.1
8 0.08
9 0.08
10 0.08
11 0.08
12 0.1
13 0.11
14 0.12
15 0.16
16 0.2
17 0.21
18 0.21
19 0.23
20 0.22
21 0.25
22 0.27
23 0.31
24 0.31
25 0.41
26 0.48
27 0.54
28 0.58
29 0.56
30 0.58
31 0.57
32 0.58
33 0.53
34 0.48
35 0.42
36 0.4
37 0.38
38 0.33
39 0.26
40 0.21
41 0.16
42 0.13
43 0.12
44 0.09
45 0.09
46 0.13
47 0.14
48 0.2
49 0.22
50 0.24
51 0.23
52 0.27
53 0.32
54 0.29
55 0.31
56 0.27
57 0.3
58 0.29
59 0.36
60 0.36
61 0.37
62 0.45
63 0.52
64 0.61
65 0.66
66 0.72
67 0.74
68 0.8
69 0.84
70 0.86
71 0.87
72 0.8
73 0.78
74 0.75
75 0.69
76 0.59
77 0.5
78 0.41
79 0.34
80 0.31
81 0.26
82 0.27
83 0.28
84 0.3
85 0.3
86 0.37
87 0.39
88 0.48
89 0.53
90 0.54
91 0.62
92 0.66
93 0.73
94 0.73
95 0.75
96 0.7
97 0.68
98 0.63
99 0.56
100 0.49
101 0.41
102 0.32
103 0.25
104 0.22
105 0.2
106 0.19
107 0.14
108 0.14
109 0.14
110 0.16
111 0.17
112 0.16
113 0.16
114 0.15
115 0.15
116 0.15
117 0.14
118 0.14
119 0.12
120 0.11
121 0.09
122 0.13
123 0.13
124 0.14
125 0.2
126 0.21
127 0.22
128 0.23
129 0.24
130 0.3
131 0.33
132 0.4
133 0.37
134 0.42
135 0.44
136 0.44
137 0.46
138 0.36
139 0.41
140 0.4
141 0.42
142 0.37
143 0.37
144 0.38
145 0.37
146 0.39
147 0.4
148 0.36
149 0.34
150 0.32
151 0.35
152 0.33
153 0.31
154 0.33
155 0.26
156 0.25
157 0.25
158 0.26
159 0.21
160 0.22
161 0.21
162 0.18
163 0.18
164 0.17
165 0.15
166 0.12
167 0.12
168 0.12
169 0.11
170 0.1
171 0.09
172 0.1
173 0.1
174 0.11
175 0.13
176 0.13
177 0.13
178 0.14
179 0.14
180 0.15
181 0.14
182 0.16
183 0.13
184 0.14
185 0.14
186 0.14
187 0.17
188 0.16
189 0.16
190 0.15
191 0.15
192 0.17
193 0.18
194 0.17
195 0.13
196 0.14
197 0.15
198 0.15
199 0.16
200 0.15
201 0.15
202 0.16
203 0.17
204 0.17
205 0.18
206 0.18
207 0.22
208 0.26
209 0.27
210 0.27
211 0.28
212 0.29
213 0.29
214 0.28
215 0.25
216 0.23
217 0.28
218 0.26
219 0.29
220 0.28
221 0.26
222 0.25
223 0.25
224 0.22
225 0.19
226 0.21
227 0.18
228 0.23
229 0.29
230 0.31
231 0.38
232 0.49
233 0.55
234 0.61
235 0.64
236 0.58
237 0.53
238 0.52
239 0.46
240 0.42
241 0.39
242 0.39
243 0.41
244 0.41
245 0.4
246 0.38
247 0.36
248 0.3
249 0.27