Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q12211

Protein Details
Accession Q12211    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-59DFDDEKDKKKDNDKHIDKRPKSGPRLBasic
499-521TDAPESNKKIKQRKRMEEEEAASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
39-76KDKKKDNDKHIDKRPKSGPRLDENGNPLPKEPRLPKRK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR001406  PsdUridine_synth_TruA  
IPR020097  PsdUridine_synth_TruA_a/b_dom  
IPR020095  PsdUridine_synth_TruA_C  
IPR041708  PUS1/PUS2-like  
IPR020094  TruA/RsuA/RluB/E/F_N  
Gene Ontology GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:1990481  P:mRNA pseudouridine synthesis  
GO:0031120  P:snRNA pseudouridine synthesis  
GO:0006400  P:tRNA modification  
GO:0031119  P:tRNA pseudouridine synthesis  
KEGG sce:YPL212C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01416  PseudoU_synth_1  
CDD cd02568  PseudoU_synth_PUS1_PUS2  
Amino Acid Sequences MSEENLRPAYDDQVNEDVYKRGAQSKLTKARKADFDDEKDKKKDNDKHIDKRPKSGPRLDENGNPLPKEPRLPKRKVAVMVGYCGTGYHGMQYNPPNPTIESALFKAFVEAGAISKDNSNDLKKNGFMRAARTDKGVHAGGNLISLKMIIEDPDIKQKINEKLPEGIRVWDIERVNKAFDCRKMCSSRWYEYLLPTYSLIGPKPGSILYRDIEESKTELPGVLDEDLESKEFWEEFKKDANEKFSTEEIEAILAYVPPARDEFDINEELYQKVKKYKQLENAHRRRYRISAAKLAKFRASTSQYLGAHNFHNFTLGKDFKEPSAIRFMKDIKVSDPFVIGDAQTEWISIKIHGQSFMLHQIRKMVSMATLITRCGCPVERISQAYGQQKINIPKAPALGLLLEAPVFEGYNKRLEQFGYKAIDFSKYQDEVDKFKMKHIYDKIYKEEVDENVFNAFFSYIDSFNKVTGAQGEETADKSGPAVQKSIFEFLTAKGIPGLTDAPESNKKIKQRKRMEEEEAASKKAEISSTTQSNEPEVQPEAAAN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.31
3 0.31
4 0.27
5 0.23
6 0.25
7 0.22
8 0.24
9 0.26
10 0.32
11 0.39
12 0.48
13 0.57
14 0.63
15 0.67
16 0.66
17 0.71
18 0.72
19 0.71
20 0.69
21 0.67
22 0.67
23 0.72
24 0.74
25 0.74
26 0.71
27 0.69
28 0.67
29 0.69
30 0.7
31 0.7
32 0.74
33 0.76
34 0.81
35 0.86
36 0.9
37 0.83
38 0.83
39 0.82
40 0.81
41 0.79
42 0.77
43 0.74
44 0.71
45 0.75
46 0.7
47 0.66
48 0.63
49 0.63
50 0.58
51 0.5
52 0.44
53 0.43
54 0.41
55 0.43
56 0.46
57 0.48
58 0.54
59 0.6
60 0.66
61 0.69
62 0.74
63 0.7
64 0.67
65 0.65
66 0.57
67 0.55
68 0.47
69 0.39
70 0.31
71 0.26
72 0.22
73 0.14
74 0.12
75 0.12
76 0.15
77 0.16
78 0.21
79 0.27
80 0.32
81 0.32
82 0.33
83 0.31
84 0.28
85 0.3
86 0.29
87 0.25
88 0.23
89 0.23
90 0.23
91 0.22
92 0.21
93 0.19
94 0.15
95 0.13
96 0.1
97 0.09
98 0.08
99 0.09
100 0.09
101 0.09
102 0.11
103 0.11
104 0.13
105 0.17
106 0.21
107 0.24
108 0.26
109 0.29
110 0.31
111 0.34
112 0.35
113 0.36
114 0.33
115 0.35
116 0.42
117 0.43
118 0.4
119 0.39
120 0.38
121 0.33
122 0.35
123 0.3
124 0.21
125 0.17
126 0.18
127 0.15
128 0.17
129 0.16
130 0.11
131 0.1
132 0.09
133 0.09
134 0.08
135 0.08
136 0.05
137 0.07
138 0.1
139 0.11
140 0.21
141 0.22
142 0.21
143 0.23
144 0.29
145 0.34
146 0.39
147 0.41
148 0.35
149 0.41
150 0.42
151 0.45
152 0.4
153 0.34
154 0.28
155 0.26
156 0.24
157 0.23
158 0.22
159 0.2
160 0.24
161 0.23
162 0.24
163 0.24
164 0.27
165 0.26
166 0.32
167 0.34
168 0.33
169 0.39
170 0.43
171 0.43
172 0.48
173 0.49
174 0.47
175 0.44
176 0.45
177 0.4
178 0.37
179 0.41
180 0.33
181 0.28
182 0.24
183 0.22
184 0.19
185 0.19
186 0.16
187 0.13
188 0.13
189 0.12
190 0.12
191 0.12
192 0.11
193 0.12
194 0.14
195 0.13
196 0.14
197 0.15
198 0.15
199 0.15
200 0.15
201 0.15
202 0.13
203 0.13
204 0.11
205 0.1
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.08
210 0.07
211 0.06
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.06
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.11
221 0.12
222 0.13
223 0.19
224 0.21
225 0.24
226 0.27
227 0.32
228 0.29
229 0.29
230 0.3
231 0.25
232 0.24
233 0.2
234 0.18
235 0.12
236 0.11
237 0.09
238 0.07
239 0.06
240 0.04
241 0.04
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.06
246 0.07
247 0.07
248 0.08
249 0.09
250 0.12
251 0.13
252 0.13
253 0.13
254 0.13
255 0.13
256 0.13
257 0.13
258 0.11
259 0.16
260 0.19
261 0.25
262 0.3
263 0.37
264 0.45
265 0.55
266 0.64
267 0.69
268 0.75
269 0.79
270 0.76
271 0.71
272 0.64
273 0.57
274 0.54
275 0.51
276 0.46
277 0.46
278 0.48
279 0.52
280 0.52
281 0.5
282 0.45
283 0.37
284 0.33
285 0.31
286 0.29
287 0.25
288 0.25
289 0.3
290 0.28
291 0.29
292 0.3
293 0.24
294 0.22
295 0.21
296 0.19
297 0.13
298 0.15
299 0.14
300 0.13
301 0.18
302 0.18
303 0.19
304 0.2
305 0.21
306 0.18
307 0.26
308 0.25
309 0.2
310 0.29
311 0.29
312 0.27
313 0.29
314 0.31
315 0.28
316 0.3
317 0.29
318 0.21
319 0.24
320 0.25
321 0.22
322 0.21
323 0.17
324 0.15
325 0.14
326 0.12
327 0.09
328 0.08
329 0.09
330 0.08
331 0.08
332 0.07
333 0.07
334 0.08
335 0.08
336 0.1
337 0.12
338 0.13
339 0.14
340 0.14
341 0.14
342 0.16
343 0.24
344 0.25
345 0.22
346 0.21
347 0.26
348 0.26
349 0.27
350 0.25
351 0.17
352 0.13
353 0.14
354 0.15
355 0.12
356 0.13
357 0.12
358 0.13
359 0.12
360 0.12
361 0.13
362 0.13
363 0.12
364 0.15
365 0.19
366 0.22
367 0.24
368 0.26
369 0.27
370 0.32
371 0.35
372 0.37
373 0.33
374 0.32
375 0.36
376 0.39
377 0.41
378 0.39
379 0.35
380 0.32
381 0.33
382 0.3
383 0.25
384 0.2
385 0.15
386 0.12
387 0.1
388 0.08
389 0.07
390 0.06
391 0.06
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.08
396 0.09
397 0.16
398 0.16
399 0.17
400 0.18
401 0.19
402 0.23
403 0.24
404 0.29
405 0.27
406 0.27
407 0.27
408 0.27
409 0.29
410 0.25
411 0.25
412 0.25
413 0.22
414 0.23
415 0.28
416 0.3
417 0.31
418 0.37
419 0.42
420 0.36
421 0.4
422 0.47
423 0.41
424 0.48
425 0.5
426 0.53
427 0.53
428 0.58
429 0.59
430 0.56
431 0.55
432 0.49
433 0.47
434 0.39
435 0.37
436 0.32
437 0.27
438 0.23
439 0.23
440 0.2
441 0.16
442 0.14
443 0.08
444 0.1
445 0.11
446 0.11
447 0.13
448 0.16
449 0.16
450 0.16
451 0.17
452 0.15
453 0.14
454 0.15
455 0.17
456 0.14
457 0.15
458 0.17
459 0.17
460 0.18
461 0.19
462 0.16
463 0.13
464 0.12
465 0.17
466 0.19
467 0.19
468 0.21
469 0.2
470 0.25
471 0.27
472 0.31
473 0.25
474 0.23
475 0.22
476 0.21
477 0.27
478 0.22
479 0.2
480 0.18
481 0.18
482 0.16
483 0.17
484 0.18
485 0.11
486 0.14
487 0.15
488 0.2
489 0.27
490 0.31
491 0.36
492 0.4
493 0.48
494 0.56
495 0.65
496 0.69
497 0.73
498 0.8
499 0.83
500 0.86
501 0.85
502 0.84
503 0.79
504 0.79
505 0.71
506 0.61
507 0.52
508 0.44
509 0.37
510 0.3
511 0.27
512 0.19
513 0.22
514 0.28
515 0.33
516 0.35
517 0.36
518 0.35
519 0.37
520 0.39
521 0.35
522 0.3
523 0.28
524 0.26