FuNGI

P53973

Protein Details

Accession

P53973

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
650-679	SNNSHQCWKENESRKPRKKFGRVLRCDTDG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
664-668	KPRKK

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019154 Arb2_domain IPR000286 His_deacetylse IPR023801 His_deacetylse_dom IPR037138 His_deacetylse_dom_sf IPR017321 Hist_deAcase_II_yeast IPR017320 Histone_deAcase_II_euk IPR023696 Ureohydrolase_dom_sf
Gene Ontology	GO:0070823 C:HDA1 complex GO:0000118 C:histone deacetylase complex GO:0003682 F:chromatin binding GO:0004407 F:histone deacetylase activity GO:0042802 F:identical protein binding GO:0016575 P:histone deacetylation GO:0000122 P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II GO:0010621 P:negative regulation of transcription by transcription factor localization GO:0045944 P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II
KEGG	sce:YNL021W -
Pfam	View protein in Pfam PF09757 Arb2 PF00850 Hist_deacetyl
CDD	cd11600 HDAC_Clr3

Amino Acid Sequences

MDSVMVKKEVLENPDHDLKRKLEENKEEENSLSTTSKSKRQVIVPVCMPKIHYSPLKTGLCYDVRMRYHAKIFTSYFEYIDPHPEDPRRIYRIYKILAENGLINDPTLSGVDDLGDLMLKIPVRAATSEEILEVHTKEHLEFIESTEKMSREELLKETEKGDSVYFNNDSYASARLPCGGAIEACKAVVEGRVKNSLAVVRPPGHHAEPQAAGGFCLFSNVAVAAKNILKNYPESVRRIMILDWDIHHGNGTQKSFYQDDQVLYVSLHRFEMGKYYPGTIQGQYDQTGEGKGEGFNCNITWPVGGVGDAEYMWAFEQVVMPMGREFKPDLVIISSGFDAADGDTIGQCHVTPSCYGHMTHMLKSLARGNLCVVLEGGYNLDAIARSALSVAKVLIGEPPDELPDPLSDPKPEVIEMIDKVIRLQSKYWNCFRRRHANSGCNFNEPINDSIISKNFPLQKAIRQQQQHYLSDEFNFVTLPLVSMDLPDNTVLCTPNISESNTIIIVVHDTSDIWAKRNVISGTIDLSSSVIIDNSLDFIKWGLDRKYGIIDVNIPLTLFEPDNYSGMITSQEVLIYLWDNYIKYFPSVAKIAFIGIGDSYSGIVHLLGHRDTRAVTKTVINFLGDKQLKPLVPLVDETLSEWYFKNSLIFSNNSHQCWKENESRKPRKKFGRVLRCDTDGLNNIIEERFEEATDFILDSFEEWSDEE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.46
3	0.42
4	0.44
5	0.43
6	0.45
7	0.51
8	0.52
9	0.53
10	0.61
11	0.65
12	0.68
13	0.69
14	0.63
15	0.56
16	0.5
17	0.42
18	0.35
19	0.3
20	0.22
21	0.25
22	0.28
23	0.35
24	0.4
25	0.46
26	0.49
27	0.53
28	0.62
29	0.6
30	0.65
31	0.64
32	0.64
33	0.59
34	0.54
35	0.5
36	0.45
37	0.43
38	0.41
39	0.39
40	0.36
41	0.4
42	0.48
43	0.49
44	0.45
45	0.44
46	0.44
47	0.4
48	0.38
49	0.37
50	0.36
51	0.35
52	0.39
53	0.41
54	0.39
55	0.44
56	0.45
57	0.43
58	0.41
59	0.41
60	0.4
61	0.42
62	0.38
63	0.32
64	0.29
65	0.29
66	0.24
67	0.3
68	0.28
69	0.24
70	0.3
71	0.32
72	0.36
73	0.4
74	0.47
75	0.45
76	0.45
77	0.48
78	0.49
79	0.54
80	0.53
81	0.53
82	0.48
83	0.46
84	0.45
85	0.41
86	0.35
87	0.28
88	0.27
89	0.2
90	0.17
91	0.13
92	0.11
93	0.11
94	0.09
95	0.08
96	0.06
97	0.07
98	0.07
99	0.07
100	0.07
101	0.06
102	0.06
103	0.05
104	0.05
105	0.07
106	0.07
107	0.07
108	0.08
109	0.09
110	0.11
111	0.12
112	0.14
113	0.14
114	0.16
115	0.16
116	0.16
117	0.14
118	0.14
119	0.15
120	0.13
121	0.11
122	0.11
123	0.11
124	0.11
125	0.13
126	0.12
127	0.13
128	0.13
129	0.16
130	0.23
131	0.22
132	0.24
133	0.25
134	0.26
135	0.24
136	0.24
137	0.23
138	0.18
139	0.21
140	0.22
141	0.24
142	0.27
143	0.27
144	0.27
145	0.26
146	0.24
147	0.22
148	0.2
149	0.17
150	0.15
151	0.19
152	0.19
153	0.18
154	0.18
155	0.17
156	0.17
157	0.15
158	0.17
159	0.12
160	0.12
161	0.12
162	0.13
163	0.13
164	0.12
165	0.12
166	0.1
167	0.1
168	0.11
169	0.13
170	0.12
171	0.11
172	0.11
173	0.09
174	0.09
175	0.13
176	0.16
177	0.16
178	0.19
179	0.24
180	0.24
181	0.24
182	0.26
183	0.24
184	0.22
185	0.22
186	0.24
187	0.23
188	0.24
189	0.27
190	0.29
191	0.28
192	0.28
193	0.26
194	0.25
195	0.23
196	0.23
197	0.22
198	0.18
199	0.16
200	0.14
201	0.13
202	0.09
203	0.09
204	0.08
205	0.05
206	0.06
207	0.06
208	0.06
209	0.06
210	0.07
211	0.08
212	0.1
213	0.12
214	0.12
215	0.13
216	0.14
217	0.15
218	0.18
219	0.22
220	0.24
221	0.26
222	0.28
223	0.28
224	0.28
225	0.28
226	0.25
227	0.21
228	0.19
229	0.17
230	0.15
231	0.17
232	0.17
233	0.15
234	0.15
235	0.13
236	0.16
237	0.19
238	0.19
239	0.16
240	0.17
241	0.2
242	0.21
243	0.2
244	0.21
245	0.18
246	0.18
247	0.18
248	0.18
249	0.15
250	0.14
251	0.16
252	0.12
253	0.1
254	0.1
255	0.09
256	0.09
257	0.09
258	0.14
259	0.13
260	0.15
261	0.15
262	0.16
263	0.17
264	0.19
265	0.21
266	0.17
267	0.16
268	0.16
269	0.17
270	0.16
271	0.16
272	0.14
273	0.12
274	0.12
275	0.1
276	0.08
277	0.07
278	0.07
279	0.09
280	0.09
281	0.09
282	0.1
283	0.09
284	0.09
285	0.09
286	0.09
287	0.07
288	0.06
289	0.06
290	0.06
291	0.05
292	0.05
293	0.05
294	0.05
295	0.05
296	0.05
297	0.04
298	0.04
299	0.04
300	0.04
301	0.04
302	0.04
303	0.04
304	0.04
305	0.07
306	0.07
307	0.07
308	0.08
309	0.1
310	0.1
311	0.11
312	0.12
313	0.1
314	0.12
315	0.12
316	0.12
317	0.1
318	0.1
319	0.09
320	0.09
321	0.08
322	0.06
323	0.06
324	0.05
325	0.04
326	0.04
327	0.04
328	0.03
329	0.03
330	0.03
331	0.04
332	0.04
333	0.04
334	0.04
335	0.04
336	0.04
337	0.05
338	0.06
339	0.07
340	0.09
341	0.1
342	0.11
343	0.11
344	0.19
345	0.2
346	0.2
347	0.22
348	0.21
349	0.2
350	0.21
351	0.24
352	0.19
353	0.17
354	0.17
355	0.13
356	0.16
357	0.16
358	0.15
359	0.11
360	0.09
361	0.09
362	0.08
363	0.08
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.03
369	0.03
370	0.04
371	0.03
372	0.03
373	0.04
374	0.04
375	0.04
376	0.05
377	0.05
378	0.05
379	0.05
380	0.06
381	0.07
382	0.07
383	0.07
384	0.07
385	0.08
386	0.08
387	0.08
388	0.08
389	0.08
390	0.07
391	0.1
392	0.11
393	0.12
394	0.12
395	0.12
396	0.14
397	0.14
398	0.13
399	0.11
400	0.1
401	0.11
402	0.11
403	0.13
404	0.12
405	0.11
406	0.12
407	0.14
408	0.14
409	0.13
410	0.15
411	0.21
412	0.28
413	0.34
414	0.42
415	0.48
416	0.51
417	0.58
418	0.63
419	0.65
420	0.63
421	0.68
422	0.68
423	0.68
424	0.67
425	0.69
426	0.63
427	0.55
428	0.5
429	0.4
430	0.34
431	0.28
432	0.25
433	0.18
434	0.16
435	0.14
436	0.15
437	0.16
438	0.15
439	0.13
440	0.16
441	0.19
442	0.19
443	0.23
444	0.23
445	0.29
446	0.38
447	0.44
448	0.46
449	0.46
450	0.48
451	0.53
452	0.57
453	0.52
454	0.46
455	0.42
456	0.36
457	0.32
458	0.31
459	0.22
460	0.16
461	0.14
462	0.1
463	0.09
464	0.07
465	0.07
466	0.06
467	0.07
468	0.06
469	0.07
470	0.08
471	0.07
472	0.08
473	0.08
474	0.08
475	0.07
476	0.09
477	0.09
478	0.08
479	0.08
480	0.08
481	0.12
482	0.13
483	0.14
484	0.14
485	0.14
486	0.16
487	0.15
488	0.15
489	0.11
490	0.1
491	0.09
492	0.08
493	0.08
494	0.06
495	0.06
496	0.07
497	0.12
498	0.13
499	0.14
500	0.16
501	0.17
502	0.18
503	0.24
504	0.24
505	0.2
506	0.21
507	0.2
508	0.2
509	0.19
510	0.18
511	0.12
512	0.12
513	0.09
514	0.08
515	0.07
516	0.05
517	0.04
518	0.05
519	0.04
520	0.06
521	0.06
522	0.06
523	0.06
524	0.06
525	0.08
526	0.1
527	0.15
528	0.16
529	0.19
530	0.2
531	0.21
532	0.24
533	0.24
534	0.23
535	0.19
536	0.19
537	0.17
538	0.18
539	0.16
540	0.13
541	0.12
542	0.12
543	0.12
544	0.1
545	0.09
546	0.11
547	0.12
548	0.13
549	0.13
550	0.12
551	0.1
552	0.1
553	0.11
554	0.08
555	0.08
556	0.07
557	0.07
558	0.07
559	0.07
560	0.07
561	0.07
562	0.07
563	0.08
564	0.09
565	0.09
566	0.1
567	0.12
568	0.12
569	0.12
570	0.14
571	0.14
572	0.17
573	0.19
574	0.19
575	0.19
576	0.18
577	0.17
578	0.16
579	0.15
580	0.11
581	0.08
582	0.08
583	0.07
584	0.07
585	0.06
586	0.05
587	0.05
588	0.05
589	0.05
590	0.06
591	0.08
592	0.11
593	0.12
594	0.14
595	0.14
596	0.15
597	0.16
598	0.2
599	0.22
600	0.21
601	0.22
602	0.26
603	0.29
604	0.33
605	0.33
606	0.3
607	0.27
608	0.26
609	0.35
610	0.31
611	0.28
612	0.27
613	0.31
614	0.3
615	0.3
616	0.34
617	0.26
618	0.25
619	0.26
620	0.26
621	0.22
622	0.22
623	0.21
624	0.22
625	0.19
626	0.19
627	0.18
628	0.17
629	0.16
630	0.17
631	0.18
632	0.14
633	0.18
634	0.21
635	0.23
636	0.25
637	0.35
638	0.4
639	0.4
640	0.43
641	0.41
642	0.4
643	0.44
644	0.46
645	0.46
646	0.51
647	0.59
648	0.66
649	0.76
650	0.83
651	0.87
652	0.9
653	0.9
654	0.91
655	0.91
656	0.91
657	0.91
658	0.9
659	0.89
660	0.85
661	0.78
662	0.69
663	0.6
664	0.56
665	0.49
666	0.43
667	0.34
668	0.28
669	0.26
670	0.24
671	0.23
672	0.16
673	0.16
674	0.14
675	0.13
676	0.14
677	0.13
678	0.14
679	0.15
680	0.14
681	0.1
682	0.1
683	0.09
684	0.09
685	0.1
686	0.09

P53973

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer