FuNGI

P40161

Protein Details

Accession

P40161

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
40-60	NENSNDRSGRHKKPRIDVSSD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011993 PH-like_dom_sf IPR013719 RTT106/SPT16-like_middle_dom IPR040993 Rtt106_N IPR044891 Rtt106_N_sf IPR040770 Rtt106_PH
Gene Ontology	GO:0005694 C:chromosome GO:0005634 C:nucleus GO:0003690 F:double-stranded DNA binding GO:0042393 F:histone binding GO:0042802 F:identical protein binding GO:0031491 F:nucleosome binding GO:0006325 P:chromatin organization GO:0006335 P:DNA replication-dependent chromatin assembly GO:0031507 P:heterochromatin formation GO:0000122 P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II GO:0032196 P:transposition
KEGG	sce:YNL206C -
Pfam	View protein in Pfam PF18469 PH_18 PF08512 Rtt106 PF18215 Rtt106_N
CDD	cd13303 PH1-like_Rtt106 cd13304 PH2-like_Rtt106 cd11604 RTT106_N

Amino Acid Sequences

MSKLFLDELPESLSRKIGTVVRVLPSSLEIFEELYKYALNENSNDRSGRHKKPRIDVSSDLLKTDEISETNTIFKLEGVSVLSPLRKKLDLVFYLSNVDGSPVITLLKGNDRELSIYQLNKNIKMASFLPVPEKPNLIYLFMTYTSCEDNKFSEPVVMTLNKENTLNQFKNLGLLDSNVTDFEKCVEYIRKQAILTGFKISNPFVNSTLVDTDAEKINSFHLQCHRGTKEGTLYFLPDHIIFGFKKPILLFDASDIESITYSSITRLTFNASLVTKDGEKYEFSMIDQTEYAKIDDYVKRKQMKDKSMSEELKAKSKSKGQATDGTADQPSILQEATRQMQDEKKAGVFSDDDEENDQNFEAESDLSDGSGQESSDGAEDGEEAEEDDEEDDEEEDKKGQSALNRDNSFASINGQPEQELQYKEFKEPLELEDIPIEIDNDDDEDDEDGSGVEYD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.2
3	0.23
4	0.23
5	0.24
6	0.28
7	0.31
8	0.32
9	0.33
10	0.32
11	0.28
12	0.26
13	0.25
14	0.19
15	0.16
16	0.13
17	0.14
18	0.15
19	0.15
20	0.13
21	0.12
22	0.12
23	0.11
24	0.15
25	0.17
26	0.18
27	0.2
28	0.26
29	0.3
30	0.34
31	0.34
32	0.31
33	0.38
34	0.45
35	0.52
36	0.57
37	0.61
38	0.65
39	0.74
40	0.84
41	0.81
42	0.79
43	0.72
44	0.68
45	0.69
46	0.61
47	0.51
48	0.41
49	0.34
50	0.27
51	0.25
52	0.21
53	0.12
54	0.14
55	0.16
56	0.16
57	0.18
58	0.17
59	0.16
60	0.14
61	0.13
62	0.12
63	0.1
64	0.11
65	0.11
66	0.11
67	0.12
68	0.14
69	0.18
70	0.17
71	0.19
72	0.22
73	0.2
74	0.21
75	0.25
76	0.32
77	0.31
78	0.36
79	0.36
80	0.33
81	0.35
82	0.34
83	0.28
84	0.19
85	0.17
86	0.11
87	0.09
88	0.08
89	0.06
90	0.06
91	0.06
92	0.07
93	0.08
94	0.15
95	0.16
96	0.17
97	0.19
98	0.19
99	0.22
100	0.22
101	0.26
102	0.22
103	0.24
104	0.25
105	0.29
106	0.31
107	0.3
108	0.31
109	0.27
110	0.24
111	0.24
112	0.23
113	0.21
114	0.2
115	0.2
116	0.23
117	0.25
118	0.28
119	0.26
120	0.26
121	0.22
122	0.25
123	0.25
124	0.22
125	0.19
126	0.16
127	0.17
128	0.16
129	0.16
130	0.11
131	0.12
132	0.13
133	0.13
134	0.13
135	0.12
136	0.14
137	0.17
138	0.17
139	0.16
140	0.16
141	0.16
142	0.16
143	0.18
144	0.17
145	0.16
146	0.19
147	0.2
148	0.18
149	0.18
150	0.18
151	0.21
152	0.28
153	0.27
154	0.24
155	0.25
156	0.24
157	0.26
158	0.26
159	0.2
160	0.12
161	0.12
162	0.12
163	0.1
164	0.11
165	0.08
166	0.08
167	0.08
168	0.07
169	0.08
170	0.08
171	0.08
172	0.11
173	0.15
174	0.16
175	0.22
176	0.24
177	0.25
178	0.24
179	0.26
180	0.28
181	0.27
182	0.27
183	0.25
184	0.22
185	0.21
186	0.22
187	0.2
188	0.18
189	0.16
190	0.17
191	0.14
192	0.15
193	0.15
194	0.14
195	0.14
196	0.12
197	0.11
198	0.1
199	0.1
200	0.1
201	0.1
202	0.09
203	0.09
204	0.09
205	0.12
206	0.12
207	0.14
208	0.17
209	0.2
210	0.21
211	0.27
212	0.27
213	0.26
214	0.26
215	0.24
216	0.26
217	0.23
218	0.24
219	0.17
220	0.17
221	0.16
222	0.15
223	0.15
224	0.08
225	0.08
226	0.07
227	0.09
228	0.08
229	0.09
230	0.12
231	0.12
232	0.13
233	0.13
234	0.14
235	0.14
236	0.15
237	0.14
238	0.12
239	0.15
240	0.13
241	0.14
242	0.12
243	0.09
244	0.08
245	0.08
246	0.07
247	0.05
248	0.04
249	0.05
250	0.07
251	0.07
252	0.08
253	0.09
254	0.12
255	0.13
256	0.13
257	0.16
258	0.14
259	0.14
260	0.14
261	0.15
262	0.12
263	0.11
264	0.12
265	0.1
266	0.1
267	0.12
268	0.13
269	0.12
270	0.12
271	0.16
272	0.14
273	0.14
274	0.14
275	0.13
276	0.13
277	0.13
278	0.13
279	0.1
280	0.1
281	0.14
282	0.19
283	0.23
284	0.28
285	0.34
286	0.41
287	0.43
288	0.51
289	0.55
290	0.6
291	0.63
292	0.64
293	0.63
294	0.66
295	0.65
296	0.58
297	0.57
298	0.49
299	0.49
300	0.45
301	0.41
302	0.36
303	0.41
304	0.45
305	0.45
306	0.5
307	0.46
308	0.51
309	0.52
310	0.51
311	0.45
312	0.4
313	0.33
314	0.26
315	0.22
316	0.14
317	0.12
318	0.09
319	0.08
320	0.06
321	0.07
322	0.12
323	0.14
324	0.15
325	0.16
326	0.17
327	0.22
328	0.26
329	0.28
330	0.26
331	0.25
332	0.25
333	0.24
334	0.23
335	0.19
336	0.16
337	0.18
338	0.16
339	0.15
340	0.18
341	0.18
342	0.17
343	0.17
344	0.15
345	0.11
346	0.1
347	0.09
348	0.07
349	0.06
350	0.06
351	0.08
352	0.08
353	0.08
354	0.08
355	0.08
356	0.08
357	0.09
358	0.08
359	0.07
360	0.07
361	0.07
362	0.08
363	0.08
364	0.06
365	0.06
366	0.06
367	0.06
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.06
374	0.06
375	0.06
376	0.06
377	0.07
378	0.07
379	0.07
380	0.08
381	0.09
382	0.1
383	0.1
384	0.11
385	0.11
386	0.13
387	0.17
388	0.25
389	0.34
390	0.42
391	0.43
392	0.44
393	0.44
394	0.43
395	0.4
396	0.31
397	0.26
398	0.2
399	0.21
400	0.22
401	0.21
402	0.2
403	0.2
404	0.25
405	0.27
406	0.25
407	0.26
408	0.32
409	0.34
410	0.36
411	0.38
412	0.33
413	0.33
414	0.33
415	0.33
416	0.32
417	0.31
418	0.3
419	0.27
420	0.26
421	0.21
422	0.2
423	0.17
424	0.1
425	0.1
426	0.08
427	0.08
428	0.09
429	0.08
430	0.09
431	0.09
432	0.1
433	0.09
434	0.09
435	0.08

P40161

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer