Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P36106

Protein Details
Accession P36106    Localization Confidence High Confidence Score 22
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-48LQEETEAPKKKRTKKKVDSAIEKNKKSDHydrophilic
191-213IHIKSKQVKKSNGSKKRNKSIDAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
28-43PKKKRTKKKVDSAIEK
178-209PRKRKRSPDSAKGIHIKSKQVKKSNGSKKRNK
Subcellular Location(s) nucl 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012921  SPOC_C  
IPR003618  TFIIS_cen_dom  
IPR036575  TFIIS_cen_dom_sf  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003682  F:chromatin binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0035064  F:methylated histone binding  
GO:0000977  F:RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG sce:YKL005C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
PF07744  SPOC  
PF07500  TFIIS_M  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51321  TFIIS_CENTRAL  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
CDD cd15570  PHD_Bye1p_SIZ1_like  
cd21542  SPOC_Bye1p-like  
Amino Acid Sequences MSVRTSSRSNKGQNKYIEYLLQEETEAPKKKRTKKKVDSAIEKNKKSDSSQEPRKDTENVRTDEVDEADEGYVRCLCGANNENYDAAEYSHGDMVQCDGCDTWQHIKCMTDGKDTIDGLMSEDSKYYCELCDPSLYAHLETSKEAEVSEDEDYHDDVYKPVNDHDDNDADVFLDEESPRKRKRSPDSAKGIHIKSKQVKKSNGSKKRNKSIDAAKSDTAENEMPTRKDFESEKEHKLRYNAEKMFSTLFSKFIVPETIEAKLYELPDGKDVISISQEFAHNLEEELYKACLNVEFGTLDKIYTEKVRSLYSNLKDKKNLELKAHVVEGKLPLNKLVNMNASELANPDLQEFKEKRDKIILENFIVEVPDKPMYVKTHKGDELIEDIAEPQEDILYSKDSIRLHNIDSIDSDKSKIEQTHAISKEPSPSTIINEESLNCAFLYPGLGLEFTGYLNYIGASQKLRRDIFKEAIGDGKLYVEGRLPTTTAAPYLKEISCSRAILVYQLFPSNDSESKTTFADVVDSLENKGRIAGIKPKTRYEKDFYIVPSKGGEIPEILKDILGSHNDERSERFSRMKSDERTLFAFVVVKQEFIH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.71
3 0.65
4 0.59
5 0.51
6 0.47
7 0.4
8 0.33
9 0.25
10 0.23
11 0.25
12 0.3
13 0.36
14 0.34
15 0.42
16 0.51
17 0.61
18 0.7
19 0.76
20 0.79
21 0.82
22 0.91
23 0.92
24 0.93
25 0.93
26 0.93
27 0.93
28 0.92
29 0.84
30 0.77
31 0.71
32 0.63
33 0.56
34 0.55
35 0.54
36 0.55
37 0.62
38 0.68
39 0.68
40 0.68
41 0.69
42 0.66
43 0.61
44 0.61
45 0.59
46 0.53
47 0.52
48 0.49
49 0.47
50 0.43
51 0.38
52 0.29
53 0.2
54 0.18
55 0.14
56 0.15
57 0.14
58 0.12
59 0.12
60 0.11
61 0.11
62 0.1
63 0.1
64 0.16
65 0.22
66 0.26
67 0.29
68 0.3
69 0.3
70 0.29
71 0.31
72 0.23
73 0.18
74 0.14
75 0.12
76 0.13
77 0.14
78 0.14
79 0.13
80 0.12
81 0.14
82 0.14
83 0.13
84 0.11
85 0.1
86 0.1
87 0.12
88 0.16
89 0.23
90 0.26
91 0.27
92 0.29
93 0.3
94 0.31
95 0.37
96 0.36
97 0.33
98 0.3
99 0.32
100 0.35
101 0.34
102 0.32
103 0.25
104 0.22
105 0.17
106 0.18
107 0.15
108 0.11
109 0.12
110 0.12
111 0.11
112 0.12
113 0.11
114 0.09
115 0.11
116 0.13
117 0.13
118 0.16
119 0.15
120 0.16
121 0.21
122 0.21
123 0.19
124 0.19
125 0.19
126 0.18
127 0.18
128 0.19
129 0.14
130 0.13
131 0.12
132 0.12
133 0.11
134 0.12
135 0.13
136 0.11
137 0.11
138 0.12
139 0.13
140 0.12
141 0.13
142 0.11
143 0.1
144 0.13
145 0.15
146 0.15
147 0.16
148 0.21
149 0.2
150 0.22
151 0.26
152 0.24
153 0.22
154 0.21
155 0.2
156 0.14
157 0.13
158 0.11
159 0.07
160 0.07
161 0.06
162 0.11
163 0.15
164 0.22
165 0.26
166 0.3
167 0.35
168 0.43
169 0.53
170 0.6
171 0.65
172 0.68
173 0.74
174 0.74
175 0.75
176 0.73
177 0.66
178 0.61
179 0.55
180 0.53
181 0.52
182 0.57
183 0.58
184 0.6
185 0.64
186 0.65
187 0.72
188 0.75
189 0.77
190 0.79
191 0.81
192 0.82
193 0.85
194 0.84
195 0.76
196 0.73
197 0.71
198 0.7
199 0.66
200 0.61
201 0.51
202 0.46
203 0.44
204 0.36
205 0.29
206 0.21
207 0.15
208 0.15
209 0.17
210 0.17
211 0.18
212 0.21
213 0.18
214 0.2
215 0.21
216 0.22
217 0.3
218 0.34
219 0.41
220 0.44
221 0.45
222 0.44
223 0.46
224 0.48
225 0.45
226 0.49
227 0.43
228 0.4
229 0.39
230 0.38
231 0.37
232 0.3
233 0.26
234 0.17
235 0.16
236 0.14
237 0.14
238 0.13
239 0.12
240 0.13
241 0.1
242 0.11
243 0.12
244 0.12
245 0.12
246 0.12
247 0.12
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.11
253 0.12
254 0.13
255 0.12
256 0.11
257 0.11
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.08
262 0.09
263 0.09
264 0.08
265 0.09
266 0.09
267 0.08
268 0.08
269 0.09
270 0.07
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.06
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.07
287 0.06
288 0.06
289 0.08
290 0.09
291 0.1
292 0.12
293 0.13
294 0.14
295 0.18
296 0.24
297 0.27
298 0.35
299 0.38
300 0.4
301 0.42
302 0.43
303 0.47
304 0.47
305 0.46
306 0.4
307 0.39
308 0.38
309 0.36
310 0.36
311 0.29
312 0.21
313 0.19
314 0.18
315 0.18
316 0.17
317 0.15
318 0.15
319 0.15
320 0.17
321 0.17
322 0.17
323 0.16
324 0.16
325 0.17
326 0.17
327 0.15
328 0.14
329 0.13
330 0.13
331 0.1
332 0.09
333 0.09
334 0.1
335 0.09
336 0.17
337 0.17
338 0.2
339 0.29
340 0.29
341 0.3
342 0.35
343 0.37
344 0.35
345 0.42
346 0.4
347 0.32
348 0.33
349 0.31
350 0.25
351 0.23
352 0.18
353 0.11
354 0.1
355 0.09
356 0.09
357 0.09
358 0.12
359 0.17
360 0.21
361 0.27
362 0.27
363 0.32
364 0.33
365 0.34
366 0.31
367 0.28
368 0.26
369 0.2
370 0.18
371 0.11
372 0.11
373 0.1
374 0.09
375 0.07
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.05
380 0.06
381 0.07
382 0.08
383 0.09
384 0.14
385 0.14
386 0.16
387 0.21
388 0.22
389 0.22
390 0.25
391 0.25
392 0.21
393 0.22
394 0.22
395 0.19
396 0.18
397 0.17
398 0.13
399 0.14
400 0.18
401 0.17
402 0.18
403 0.21
404 0.24
405 0.33
406 0.34
407 0.34
408 0.32
409 0.32
410 0.37
411 0.32
412 0.29
413 0.23
414 0.22
415 0.24
416 0.26
417 0.26
418 0.2
419 0.2
420 0.19
421 0.19
422 0.18
423 0.15
424 0.12
425 0.11
426 0.09
427 0.08
428 0.09
429 0.06
430 0.07
431 0.06
432 0.06
433 0.06
434 0.07
435 0.07
436 0.06
437 0.06
438 0.06
439 0.05
440 0.05
441 0.06
442 0.07
443 0.07
444 0.09
445 0.12
446 0.15
447 0.2
448 0.27
449 0.29
450 0.31
451 0.34
452 0.39
453 0.4
454 0.41
455 0.39
456 0.32
457 0.34
458 0.31
459 0.28
460 0.21
461 0.18
462 0.14
463 0.13
464 0.12
465 0.11
466 0.12
467 0.14
468 0.14
469 0.14
470 0.14
471 0.15
472 0.15
473 0.16
474 0.16
475 0.15
476 0.16
477 0.21
478 0.2
479 0.23
480 0.23
481 0.25
482 0.28
483 0.27
484 0.25
485 0.23
486 0.23
487 0.22
488 0.23
489 0.2
490 0.19
491 0.21
492 0.21
493 0.19
494 0.22
495 0.22
496 0.23
497 0.23
498 0.24
499 0.22
500 0.25
501 0.24
502 0.22
503 0.18
504 0.16
505 0.16
506 0.13
507 0.15
508 0.16
509 0.16
510 0.17
511 0.2
512 0.2
513 0.18
514 0.18
515 0.17
516 0.16
517 0.2
518 0.28
519 0.32
520 0.41
521 0.45
522 0.53
523 0.61
524 0.65
525 0.67
526 0.66
527 0.65
528 0.6
529 0.61
530 0.57
531 0.56
532 0.51
533 0.45
534 0.38
535 0.33
536 0.32
537 0.27
538 0.24
539 0.17
540 0.19
541 0.2
542 0.21
543 0.19
544 0.16
545 0.15
546 0.16
547 0.17
548 0.18
549 0.2
550 0.21
551 0.25
552 0.27
553 0.28
554 0.3
555 0.33
556 0.36
557 0.34
558 0.38
559 0.38
560 0.44
561 0.51
562 0.56
563 0.56
564 0.6
565 0.62
566 0.6
567 0.59
568 0.54
569 0.47
570 0.39
571 0.37
572 0.28
573 0.31
574 0.27