Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P33417

Protein Details
Accession P33417    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
344-367SSTQSRIERRKQLKKQGPKRPSSAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
352-363RRKQLKKQGPKR
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0001046  F:core promoter sequence-specific DNA binding  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0071456  P:cellular response to hypoxia  
GO:0000122  P:negative regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:2000819  P:regulation of nucleotide-excision repair  
GO:0090069  P:regulation of ribosome biogenesis  
KEGG sce:YKL032C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd22012  HMG-box_ABF2_IXR1-like_rpt2  
cd22011  HMG-box_IXR1-like_rpt1  
Amino Acid Sequences MNTGISPKQDDASNSNLLNIGQDHSLQYQGLEHNDSQYRDASHQTPHQYLNQFQAQPQQQQQQQQQQQQQQQQAPYQGHFQQSPQQQQQNVYYPLPPQSLTQPTSQSQQQQQQQQQQQYANSNSNSNNNVNVNALPQDFGYMQQTGSGQNYPTINQQQFSEFYNSFLSHLTQKQTNPSVTGTGASSNNNSNNNNVSSGNNSTSSNPAQLAASQLNPATAAAAAANNAAGPASYLSQLPQVQRYYPNNMNALSSLLDPSSAGNAAGNANTATHPGLLPPNLQPQLTHHQQQMQQQLQLQQQQQLQQQQQLQQQHQLQQQQQLQQQHHHLQQQQQQQQHPVVKKLSSTQSRIERRKQLKKQGPKRPSSAYFLFSMSIRNELLQQFPEAKVPELSKLASARWKELTDDQKKPFYEEFRTNWEKYRVVRDAYEKTLPPKRPSGPFIQFTQEIRPTVVKENPDKGLIEITKIIGERWRELDPAKKAEYTETYKKRLKEWESCYPDENDPNGNPTGHSHKAMNMNLNMDTKIMENQDSIEHITANAIDSVTGSNSNSTNPNTPVSPPISLQQQPLQQQQQQQQQQQHMLLADPTTNGSIIKNE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.31
3 0.29
4 0.26
5 0.25
6 0.22
7 0.18
8 0.14
9 0.15
10 0.16
11 0.16
12 0.18
13 0.16
14 0.15
15 0.17
16 0.18
17 0.21
18 0.23
19 0.22
20 0.27
21 0.31
22 0.33
23 0.31
24 0.31
25 0.3
26 0.28
27 0.33
28 0.3
29 0.31
30 0.37
31 0.41
32 0.42
33 0.43
34 0.48
35 0.47
36 0.47
37 0.48
38 0.49
39 0.44
40 0.41
41 0.47
42 0.45
43 0.47
44 0.51
45 0.52
46 0.49
47 0.56
48 0.63
49 0.65
50 0.68
51 0.7
52 0.72
53 0.72
54 0.77
55 0.75
56 0.75
57 0.7
58 0.66
59 0.62
60 0.6
61 0.54
62 0.46
63 0.45
64 0.41
65 0.39
66 0.36
67 0.34
68 0.35
69 0.4
70 0.48
71 0.5
72 0.52
73 0.51
74 0.54
75 0.58
76 0.58
77 0.54
78 0.47
79 0.4
80 0.37
81 0.39
82 0.36
83 0.3
84 0.24
85 0.26
86 0.32
87 0.32
88 0.33
89 0.33
90 0.33
91 0.37
92 0.39
93 0.39
94 0.4
95 0.46
96 0.49
97 0.54
98 0.6
99 0.65
100 0.69
101 0.68
102 0.66
103 0.62
104 0.59
105 0.57
106 0.53
107 0.49
108 0.43
109 0.41
110 0.37
111 0.39
112 0.39
113 0.33
114 0.33
115 0.28
116 0.28
117 0.25
118 0.23
119 0.2
120 0.18
121 0.17
122 0.13
123 0.12
124 0.13
125 0.11
126 0.12
127 0.13
128 0.11
129 0.11
130 0.12
131 0.13
132 0.12
133 0.14
134 0.15
135 0.13
136 0.15
137 0.16
138 0.16
139 0.22
140 0.28
141 0.27
142 0.26
143 0.26
144 0.26
145 0.26
146 0.28
147 0.28
148 0.2
149 0.21
150 0.23
151 0.22
152 0.2
153 0.2
154 0.18
155 0.17
156 0.2
157 0.22
158 0.23
159 0.24
160 0.3
161 0.34
162 0.34
163 0.31
164 0.29
165 0.27
166 0.24
167 0.23
168 0.17
169 0.15
170 0.15
171 0.14
172 0.15
173 0.17
174 0.2
175 0.23
176 0.23
177 0.22
178 0.24
179 0.24
180 0.24
181 0.22
182 0.19
183 0.19
184 0.21
185 0.2
186 0.19
187 0.18
188 0.18
189 0.2
190 0.2
191 0.18
192 0.16
193 0.15
194 0.13
195 0.13
196 0.15
197 0.12
198 0.12
199 0.11
200 0.11
201 0.1
202 0.1
203 0.09
204 0.07
205 0.05
206 0.05
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.04
218 0.04
219 0.05
220 0.05
221 0.06
222 0.1
223 0.13
224 0.13
225 0.17
226 0.17
227 0.19
228 0.26
229 0.28
230 0.32
231 0.34
232 0.36
233 0.34
234 0.33
235 0.32
236 0.25
237 0.23
238 0.17
239 0.13
240 0.09
241 0.07
242 0.07
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.05
247 0.05
248 0.04
249 0.05
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.08
262 0.08
263 0.1
264 0.1
265 0.16
266 0.17
267 0.17
268 0.16
269 0.19
270 0.26
271 0.27
272 0.28
273 0.23
274 0.27
275 0.31
276 0.36
277 0.39
278 0.35
279 0.33
280 0.32
281 0.36
282 0.33
283 0.35
284 0.31
285 0.27
286 0.27
287 0.3
288 0.31
289 0.32
290 0.31
291 0.3
292 0.31
293 0.32
294 0.35
295 0.36
296 0.33
297 0.34
298 0.35
299 0.37
300 0.38
301 0.38
302 0.35
303 0.37
304 0.4
305 0.39
306 0.41
307 0.41
308 0.38
309 0.37
310 0.4
311 0.38
312 0.38
313 0.38
314 0.37
315 0.37
316 0.43
317 0.48
318 0.49
319 0.48
320 0.46
321 0.45
322 0.47
323 0.46
324 0.41
325 0.36
326 0.33
327 0.29
328 0.28
329 0.29
330 0.33
331 0.32
332 0.33
333 0.35
334 0.43
335 0.51
336 0.57
337 0.6
338 0.62
339 0.66
340 0.74
341 0.76
342 0.78
343 0.78
344 0.83
345 0.86
346 0.86
347 0.86
348 0.8
349 0.77
350 0.73
351 0.67
352 0.63
353 0.55
354 0.46
355 0.39
356 0.34
357 0.29
358 0.22
359 0.22
360 0.15
361 0.15
362 0.13
363 0.11
364 0.13
365 0.14
366 0.15
367 0.13
368 0.14
369 0.14
370 0.15
371 0.17
372 0.15
373 0.16
374 0.16
375 0.16
376 0.17
377 0.17
378 0.16
379 0.16
380 0.16
381 0.17
382 0.21
383 0.21
384 0.22
385 0.24
386 0.24
387 0.24
388 0.3
389 0.38
390 0.4
391 0.47
392 0.47
393 0.5
394 0.5
395 0.52
396 0.49
397 0.44
398 0.42
399 0.41
400 0.4
401 0.43
402 0.49
403 0.46
404 0.48
405 0.47
406 0.45
407 0.41
408 0.47
409 0.42
410 0.38
411 0.4
412 0.41
413 0.41
414 0.42
415 0.44
416 0.36
417 0.39
418 0.44
419 0.46
420 0.44
421 0.47
422 0.48
423 0.5
424 0.52
425 0.55
426 0.54
427 0.52
428 0.5
429 0.48
430 0.45
431 0.4
432 0.43
433 0.37
434 0.31
435 0.3
436 0.29
437 0.27
438 0.3
439 0.32
440 0.31
441 0.33
442 0.37
443 0.37
444 0.37
445 0.35
446 0.3
447 0.33
448 0.27
449 0.24
450 0.2
451 0.18
452 0.19
453 0.18
454 0.18
455 0.16
456 0.18
457 0.19
458 0.21
459 0.22
460 0.22
461 0.24
462 0.32
463 0.34
464 0.37
465 0.37
466 0.35
467 0.34
468 0.37
469 0.41
470 0.41
471 0.45
472 0.46
473 0.52
474 0.55
475 0.57
476 0.58
477 0.61
478 0.61
479 0.61
480 0.62
481 0.65
482 0.67
483 0.67
484 0.64
485 0.59
486 0.55
487 0.5
488 0.44
489 0.38
490 0.32
491 0.33
492 0.32
493 0.28
494 0.24
495 0.23
496 0.29
497 0.27
498 0.29
499 0.26
500 0.3
501 0.38
502 0.41
503 0.43
504 0.38
505 0.37
506 0.38
507 0.38
508 0.33
509 0.25
510 0.23
511 0.17
512 0.18
513 0.18
514 0.16
515 0.14
516 0.15
517 0.17
518 0.18
519 0.19
520 0.16
521 0.14
522 0.13
523 0.13
524 0.13
525 0.12
526 0.11
527 0.09
528 0.08
529 0.08
530 0.09
531 0.1
532 0.11
533 0.1
534 0.12
535 0.12
536 0.15
537 0.19
538 0.21
539 0.26
540 0.27
541 0.29
542 0.29
543 0.3
544 0.34
545 0.33
546 0.32
547 0.28
548 0.29
549 0.34
550 0.35
551 0.37
552 0.37
553 0.4
554 0.43
555 0.51
556 0.54
557 0.51
558 0.57
559 0.61
560 0.65
561 0.67
562 0.69
563 0.68
564 0.68
565 0.69
566 0.63
567 0.57
568 0.48
569 0.4
570 0.34
571 0.28
572 0.22
573 0.17
574 0.16
575 0.14
576 0.14
577 0.13