Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q12221

Protein Details
Accession Q12221    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
872-897SAGISPKQSSKNHRKQHPQGFHSPGRHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR033133  PUM-HD  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000932  C:P-body  
GO:0035925  F:mRNA 3'-UTR AU-rich region binding  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000288  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay  
KEGG sce:YPR042C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00806  PUF  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50302  PUM  
PS50303  PUM_HD  
PS50102  RRM  
CDD cd21616  RRM_ScJSN1_like  
Amino Acid Sequences MDNKRLYNGNLSNIPEVIDPGITIPIYEEDIRNDTRMNTNARSVRVSDKRGRSSSTSPQKIGSYRTRAGRFSDTLTNLLPSISAKLHHSKKSTPVVVVPPTSSTPDSLNSTTYAPRVSSDSFTVATPLSLQSTTTRTRTRNNTVSSQITASSSLTTDVGNATSANIWSANAESNTSSSPLFDYPLATSYFEPLTRFKSTDNYTLPQTAQLNSFLEKNGNPNIWSSAGNSNTDHLNTPIVNRQRSQSQSTTNRVYTDAPYYQQPAQNYQVQVPPRVPKSTSISPVILDDVDPASINWITANQKVPLVNQISALLPTNTISISNVFPLQPTQQHQQNAVNLTSTSLATLCSQYGKVLSARTLRGLNMALVEFSTVESAICALEALQGKELSKVGAPSTVSFARVLPMYEQPLNVNGFNNTPKQPLLQEQLNHGVLNYQLQQSLQQPELQQQPTSFNQPNLTYCNPTQNLSHLQLSSNENEPYPFPLPPPSLSDSKKDILHTISSFKLEYDHLELNHLLQNALKNKGVSDTNYFGPLPEHNSKVPKRKDTFDAPKLRELRKQFDSNSLSTIEMEQLAIVMLDQLPELSSDYLGNTVIQKLFENSSNIIRDIMLRKCNKYLTSMGVHKNGTWVCQKIIKMANTPRQINLVTSGVSDYCTPLFNDQFGNYVIQGILKFGFPWNSFIFESVLSHFWTIVQNRYGSRAVRACLEADSIITQCQLLTITSLIIVLSPYLATDTNGTLLITWLLDTCTLPNKNLILCDKLVNKNLVKLCCHKLGSLTVLKILNLRGGEEEALSKNKIIHAIFDGPISSDSILFQILDEGNYGPTFIYKVLTSRILDNSVRDEAITKIRQLILNSNINLQSRQLLEEVGLSSAGISPKQSSKNHRKQHPQGFHSPGRARGVSVSSVRSSNSRHNSVIQMNNAGPTPALNFNPAPMSEINSYFNNQQVVYSGNQNQNQNGNSNGLDELNSQFDSFRIANGTNLSLPIVNLPNVSNNNNNYNNSGYSSQMNPLSRSVSHNNNNNTNNYNNNDNDNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNSNNSNNNNNNDTSLYRYRSYGY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.28
3 0.26
4 0.2
5 0.14
6 0.11
7 0.1
8 0.12
9 0.1
10 0.1
11 0.1
12 0.11
13 0.14
14 0.16
15 0.16
16 0.18
17 0.23
18 0.25
19 0.24
20 0.25
21 0.24
22 0.29
23 0.33
24 0.36
25 0.34
26 0.41
27 0.45
28 0.47
29 0.47
30 0.44
31 0.48
32 0.5
33 0.55
34 0.56
35 0.61
36 0.66
37 0.67
38 0.69
39 0.65
40 0.64
41 0.67
42 0.68
43 0.66
44 0.59
45 0.59
46 0.59
47 0.56
48 0.57
49 0.56
50 0.53
51 0.52
52 0.59
53 0.6
54 0.57
55 0.59
56 0.58
57 0.51
58 0.48
59 0.5
60 0.43
61 0.41
62 0.39
63 0.35
64 0.28
65 0.25
66 0.21
67 0.14
68 0.14
69 0.13
70 0.14
71 0.17
72 0.27
73 0.35
74 0.41
75 0.45
76 0.47
77 0.55
78 0.63
79 0.62
80 0.55
81 0.53
82 0.54
83 0.54
84 0.51
85 0.43
86 0.36
87 0.34
88 0.35
89 0.3
90 0.25
91 0.22
92 0.23
93 0.27
94 0.25
95 0.25
96 0.23
97 0.24
98 0.25
99 0.24
100 0.22
101 0.18
102 0.18
103 0.21
104 0.22
105 0.22
106 0.22
107 0.24
108 0.23
109 0.22
110 0.22
111 0.18
112 0.16
113 0.14
114 0.13
115 0.12
116 0.11
117 0.12
118 0.13
119 0.19
120 0.23
121 0.28
122 0.34
123 0.36
124 0.44
125 0.52
126 0.59
127 0.62
128 0.63
129 0.63
130 0.62
131 0.62
132 0.55
133 0.48
134 0.39
135 0.32
136 0.28
137 0.22
138 0.17
139 0.14
140 0.12
141 0.12
142 0.1
143 0.1
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.08
148 0.08
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.09
156 0.12
157 0.11
158 0.13
159 0.12
160 0.14
161 0.15
162 0.15
163 0.14
164 0.11
165 0.13
166 0.12
167 0.14
168 0.13
169 0.13
170 0.13
171 0.16
172 0.17
173 0.16
174 0.16
175 0.16
176 0.18
177 0.17
178 0.18
179 0.18
180 0.22
181 0.24
182 0.25
183 0.24
184 0.3
185 0.33
186 0.39
187 0.41
188 0.39
189 0.38
190 0.4
191 0.39
192 0.36
193 0.33
194 0.27
195 0.24
196 0.23
197 0.22
198 0.2
199 0.21
200 0.17
201 0.18
202 0.17
203 0.2
204 0.22
205 0.22
206 0.22
207 0.22
208 0.24
209 0.23
210 0.23
211 0.22
212 0.23
213 0.24
214 0.25
215 0.24
216 0.23
217 0.23
218 0.23
219 0.21
220 0.15
221 0.16
222 0.14
223 0.17
224 0.23
225 0.28
226 0.3
227 0.3
228 0.32
229 0.37
230 0.41
231 0.45
232 0.42
233 0.45
234 0.5
235 0.56
236 0.58
237 0.52
238 0.49
239 0.44
240 0.42
241 0.34
242 0.32
243 0.28
244 0.23
245 0.24
246 0.27
247 0.29
248 0.3
249 0.29
250 0.28
251 0.3
252 0.34
253 0.33
254 0.32
255 0.33
256 0.32
257 0.33
258 0.32
259 0.34
260 0.32
261 0.34
262 0.33
263 0.33
264 0.39
265 0.43
266 0.43
267 0.4
268 0.38
269 0.35
270 0.34
271 0.3
272 0.23
273 0.16
274 0.13
275 0.09
276 0.09
277 0.08
278 0.07
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.07
283 0.1
284 0.12
285 0.15
286 0.18
287 0.17
288 0.19
289 0.2
290 0.2
291 0.24
292 0.25
293 0.22
294 0.2
295 0.2
296 0.18
297 0.18
298 0.19
299 0.12
300 0.09
301 0.09
302 0.09
303 0.08
304 0.08
305 0.08
306 0.08
307 0.09
308 0.1
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.12
313 0.14
314 0.16
315 0.2
316 0.24
317 0.29
318 0.31
319 0.34
320 0.37
321 0.38
322 0.37
323 0.33
324 0.28
325 0.22
326 0.21
327 0.18
328 0.14
329 0.1
330 0.07
331 0.08
332 0.08
333 0.09
334 0.08
335 0.09
336 0.09
337 0.09
338 0.1
339 0.11
340 0.11
341 0.12
342 0.15
343 0.17
344 0.18
345 0.2
346 0.21
347 0.19
348 0.19
349 0.19
350 0.16
351 0.13
352 0.12
353 0.09
354 0.08
355 0.08
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.03
366 0.03
367 0.07
368 0.09
369 0.09
370 0.11
371 0.12
372 0.12
373 0.13
374 0.14
375 0.1
376 0.09
377 0.1
378 0.09
379 0.11
380 0.11
381 0.1
382 0.14
383 0.14
384 0.14
385 0.14
386 0.14
387 0.12
388 0.12
389 0.12
390 0.1
391 0.12
392 0.15
393 0.15
394 0.15
395 0.15
396 0.17
397 0.18
398 0.17
399 0.15
400 0.12
401 0.14
402 0.16
403 0.19
404 0.17
405 0.17
406 0.17
407 0.17
408 0.18
409 0.2
410 0.23
411 0.23
412 0.23
413 0.24
414 0.29
415 0.29
416 0.27
417 0.22
418 0.18
419 0.14
420 0.15
421 0.14
422 0.09
423 0.09
424 0.09
425 0.11
426 0.14
427 0.16
428 0.15
429 0.15
430 0.15
431 0.19
432 0.26
433 0.25
434 0.23
435 0.21
436 0.24
437 0.24
438 0.3
439 0.27
440 0.22
441 0.24
442 0.24
443 0.25
444 0.26
445 0.26
446 0.23
447 0.22
448 0.28
449 0.27
450 0.26
451 0.25
452 0.24
453 0.27
454 0.26
455 0.27
456 0.2
457 0.2
458 0.22
459 0.23
460 0.21
461 0.2
462 0.18
463 0.16
464 0.16
465 0.16
466 0.16
467 0.16
468 0.14
469 0.12
470 0.16
471 0.17
472 0.18
473 0.21
474 0.2
475 0.24
476 0.26
477 0.28
478 0.28
479 0.3
480 0.3
481 0.27
482 0.25
483 0.22
484 0.23
485 0.2
486 0.19
487 0.17
488 0.16
489 0.16
490 0.14
491 0.13
492 0.11
493 0.12
494 0.13
495 0.14
496 0.13
497 0.14
498 0.14
499 0.14
500 0.16
501 0.15
502 0.11
503 0.1
504 0.14
505 0.15
506 0.18
507 0.17
508 0.15
509 0.15
510 0.17
511 0.17
512 0.15
513 0.16
514 0.17
515 0.16
516 0.18
517 0.18
518 0.15
519 0.15
520 0.14
521 0.16
522 0.16
523 0.18
524 0.18
525 0.25
526 0.3
527 0.39
528 0.43
529 0.46
530 0.46
531 0.48
532 0.51
533 0.54
534 0.58
535 0.58
536 0.61
537 0.55
538 0.58
539 0.6
540 0.57
541 0.53
542 0.48
543 0.45
544 0.42
545 0.44
546 0.38
547 0.42
548 0.43
549 0.38
550 0.36
551 0.3
552 0.25
553 0.21
554 0.2
555 0.12
556 0.08
557 0.07
558 0.05
559 0.04
560 0.04
561 0.04
562 0.03
563 0.03
564 0.03
565 0.03
566 0.03
567 0.03
568 0.03
569 0.03
570 0.04
571 0.04
572 0.05
573 0.05
574 0.05
575 0.06
576 0.06
577 0.06
578 0.06
579 0.07
580 0.07
581 0.08
582 0.08
583 0.09
584 0.1
585 0.11
586 0.13
587 0.13
588 0.16
589 0.16
590 0.16
591 0.15
592 0.14
593 0.15
594 0.18
595 0.2
596 0.24
597 0.26
598 0.27
599 0.3
600 0.32
601 0.3
602 0.3
603 0.28
604 0.25
605 0.27
606 0.31
607 0.32
608 0.33
609 0.33
610 0.29
611 0.31
612 0.27
613 0.25
614 0.22
615 0.2
616 0.18
617 0.22
618 0.22
619 0.23
620 0.28
621 0.27
622 0.31
623 0.36
624 0.43
625 0.44
626 0.45
627 0.4
628 0.38
629 0.36
630 0.3
631 0.26
632 0.19
633 0.13
634 0.12
635 0.12
636 0.1
637 0.1
638 0.09
639 0.08
640 0.07
641 0.08
642 0.08
643 0.1
644 0.11
645 0.11
646 0.12
647 0.11
648 0.13
649 0.13
650 0.13
651 0.1
652 0.1
653 0.09
654 0.09
655 0.08
656 0.07
657 0.07
658 0.06
659 0.07
660 0.07
661 0.12
662 0.11
663 0.15
664 0.15
665 0.18
666 0.18
667 0.19
668 0.19
669 0.15
670 0.15
671 0.13
672 0.13
673 0.11
674 0.11
675 0.1
676 0.1
677 0.14
678 0.14
679 0.16
680 0.17
681 0.18
682 0.19
683 0.23
684 0.25
685 0.22
686 0.25
687 0.24
688 0.23
689 0.23
690 0.24
691 0.2
692 0.18
693 0.18
694 0.13
695 0.11
696 0.11
697 0.09
698 0.08
699 0.08
700 0.07
701 0.06
702 0.06
703 0.06
704 0.05
705 0.05
706 0.05
707 0.05
708 0.05
709 0.06
710 0.05
711 0.05
712 0.05
713 0.04
714 0.04
715 0.03
716 0.03
717 0.04
718 0.05
719 0.05
720 0.06
721 0.07
722 0.08
723 0.08
724 0.08
725 0.07
726 0.07
727 0.07
728 0.06
729 0.05
730 0.05
731 0.05
732 0.06
733 0.06
734 0.07
735 0.14
736 0.15
737 0.16
738 0.18
739 0.19
740 0.19
741 0.23
742 0.24
743 0.2
744 0.2
745 0.24
746 0.27
747 0.3
748 0.33
749 0.35
750 0.33
751 0.36
752 0.4
753 0.39
754 0.36
755 0.38
756 0.39
757 0.4
758 0.4
759 0.34
760 0.32
761 0.31
762 0.33
763 0.31
764 0.27
765 0.25
766 0.24
767 0.24
768 0.23
769 0.21
770 0.19
771 0.15
772 0.15
773 0.12
774 0.12
775 0.12
776 0.11
777 0.13
778 0.12
779 0.14
780 0.14
781 0.14
782 0.14
783 0.15
784 0.19
785 0.17
786 0.17
787 0.18
788 0.22
789 0.21
790 0.21
791 0.19
792 0.16
793 0.16
794 0.15
795 0.11
796 0.08
797 0.08
798 0.08
799 0.08
800 0.07
801 0.07
802 0.08
803 0.08
804 0.08
805 0.09
806 0.09
807 0.09
808 0.09
809 0.09
810 0.07
811 0.07
812 0.07
813 0.07
814 0.08
815 0.07
816 0.09
817 0.12
818 0.16
819 0.17
820 0.19
821 0.22
822 0.25
823 0.25
824 0.25
825 0.27
826 0.24
827 0.23
828 0.2
829 0.19
830 0.17
831 0.24
832 0.24
833 0.21
834 0.22
835 0.25
836 0.27
837 0.28
838 0.32
839 0.31
840 0.36
841 0.35
842 0.36
843 0.36
844 0.35
845 0.34
846 0.28
847 0.24
848 0.19
849 0.2
850 0.16
851 0.13
852 0.12
853 0.14
854 0.14
855 0.1
856 0.09
857 0.08
858 0.07
859 0.09
860 0.1
861 0.08
862 0.09
863 0.11
864 0.17
865 0.25
866 0.31
867 0.39
868 0.5
869 0.6
870 0.69
871 0.76
872 0.81
873 0.84
874 0.89
875 0.89
876 0.84
877 0.83
878 0.81
879 0.77
880 0.75
881 0.68
882 0.62
883 0.57
884 0.51
885 0.43
886 0.37
887 0.35
888 0.31
889 0.3
890 0.28
891 0.24
892 0.25
893 0.25
894 0.26
895 0.27
896 0.32
897 0.37
898 0.39
899 0.39
900 0.41
901 0.46
902 0.5
903 0.52
904 0.45
905 0.41
906 0.36
907 0.36
908 0.33
909 0.27
910 0.19
911 0.14
912 0.15
913 0.15
914 0.15
915 0.18
916 0.17
917 0.19
918 0.22
919 0.21
920 0.21
921 0.17
922 0.21
923 0.2
924 0.22
925 0.24
926 0.23
927 0.26
928 0.24
929 0.26
930 0.23
931 0.21
932 0.19
933 0.17
934 0.18
935 0.17
936 0.22
937 0.26
938 0.31
939 0.36
940 0.38
941 0.4
942 0.44
943 0.43
944 0.39
945 0.34
946 0.3
947 0.25
948 0.25
949 0.22
950 0.17
951 0.16
952 0.15
953 0.15
954 0.15
955 0.16
956 0.14
957 0.14
958 0.13
959 0.17
960 0.15
961 0.15
962 0.16
963 0.16
964 0.18
965 0.2
966 0.22
967 0.18
968 0.18
969 0.18
970 0.15
971 0.14
972 0.17
973 0.17
974 0.15
975 0.16
976 0.16
977 0.22
978 0.25
979 0.29
980 0.31
981 0.32
982 0.4
983 0.44
984 0.45
985 0.41
986 0.41
987 0.39
988 0.36
989 0.34
990 0.27
991 0.26
992 0.26
993 0.27
994 0.3
995 0.31
996 0.29
997 0.3
998 0.32
999 0.3
1000 0.35
1001 0.37
1002 0.4
1003 0.46
1004 0.53
1005 0.58
1006 0.63
1007 0.65
1008 0.63
1009 0.61
1010 0.55
1011 0.53
1012 0.48
1013 0.48
1014 0.41
1015 0.43
1016 0.43
1017 0.42
1018 0.46
1019 0.46
1020 0.49
1021 0.48
1022 0.52
1023 0.49
1024 0.52
1025 0.54
1026 0.54
1027 0.55
1028 0.56
1029 0.58
1030 0.59
1031 0.64
1032 0.64
1033 0.66
1034 0.66
1035 0.65
1036 0.64
1037 0.62
1038 0.59
1039 0.56
1040 0.54
1041 0.52
1042 0.52
1043 0.5
1044 0.54
1045 0.54
1046 0.56
1047 0.55
1048 0.52
1049 0.48
1050 0.43
1051 0.4
1052 0.39
1053 0.4
1054 0.38
1055 0.36