Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P47077

Protein Details
Accession P47077    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MGKTKTRGRRHQDKQRKDEFEPSSBasic
632-658IFPNSKPLQPKPEKHSRERNNSKEGSAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
642-663KPEKHSRERNNSKEGSAFKKQK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 10.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR040000  NOP9  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0030490  P:maturation of SSU-rRNA  
GO:0000056  P:ribosomal small subunit export from nucleus  
KEGG sce:YJL010C  -  
Amino Acid Sequences MGKTKTRGRRHQDKQRKDEFEPSSNSAKEHIQQEESTYNDEAEIKETQPQMFFGVLDREELEYFKQAESTLQLDAFEAPEEKFQFVTSIIEEAKGKELKLVTSQITSKLMERVILECDETQLKDIFQSFNGVFFGLSCHKYASHVLETLFVRSAALVERELLTPSFDNNEKEGPYVTMENMFLFMLNELKPHLKTMMNHQYASHVLRLLILILSSKTLPNSTKANSTLRSKKSKIARKMIDIKDNDDFNKVYQTPESFKSELRDIITTLYKGFTNGAESRSDISQSTITKFREYSVDKVASPVIQLIIQVEGIFDRDRSFWRLVFNTADEKDPKEESFLEYLLSDPVGSHFLENVIGSARLKYVERLYRLYMKDRIVKLAKRDTTGAFVVRALLEHLKEKDVKQILDAVVPELSMLLNSNMDFGTAIINASNKQGGYLRDDVIAQLIQKYYPEKSDAKNILESCLLLSASTLGNTRDDWPTAEERRRSVFLEQLIDYDDKFLNITIDSMLALPEERLIQMCYHGVFSHVVEHVLQTTRVDIIKRKMLLNILSKESVNLACNVYGSHIMDKLWEFTAKLTLYKERIARALVLETEKVKNSIYGRQVWKNWKLELYVRKMWDWKKLIKEQEFEIFPNSKPLQPKPEKHSRERNNSKEGSAFKKQKHYR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.92
2 0.92
3 0.9
4 0.83
5 0.83
6 0.78
7 0.75
8 0.7
9 0.65
10 0.62
11 0.55
12 0.51
13 0.44
14 0.41
15 0.39
16 0.38
17 0.38
18 0.34
19 0.34
20 0.38
21 0.39
22 0.37
23 0.35
24 0.3
25 0.25
26 0.22
27 0.23
28 0.19
29 0.18
30 0.19
31 0.16
32 0.21
33 0.23
34 0.24
35 0.23
36 0.24
37 0.22
38 0.21
39 0.2
40 0.17
41 0.19
42 0.18
43 0.18
44 0.18
45 0.18
46 0.18
47 0.19
48 0.18
49 0.18
50 0.19
51 0.18
52 0.17
53 0.16
54 0.17
55 0.19
56 0.18
57 0.16
58 0.15
59 0.15
60 0.14
61 0.15
62 0.14
63 0.12
64 0.12
65 0.1
66 0.15
67 0.17
68 0.17
69 0.16
70 0.16
71 0.16
72 0.15
73 0.16
74 0.12
75 0.14
76 0.14
77 0.16
78 0.16
79 0.16
80 0.22
81 0.22
82 0.21
83 0.21
84 0.22
85 0.22
86 0.26
87 0.28
88 0.24
89 0.26
90 0.28
91 0.27
92 0.29
93 0.28
94 0.25
95 0.25
96 0.23
97 0.21
98 0.21
99 0.2
100 0.2
101 0.19
102 0.19
103 0.16
104 0.18
105 0.18
106 0.17
107 0.17
108 0.15
109 0.14
110 0.15
111 0.17
112 0.16
113 0.14
114 0.19
115 0.17
116 0.17
117 0.18
118 0.15
119 0.13
120 0.12
121 0.15
122 0.14
123 0.16
124 0.15
125 0.16
126 0.16
127 0.18
128 0.22
129 0.23
130 0.22
131 0.23
132 0.23
133 0.27
134 0.27
135 0.27
136 0.24
137 0.18
138 0.15
139 0.12
140 0.13
141 0.1
142 0.11
143 0.09
144 0.09
145 0.11
146 0.11
147 0.13
148 0.12
149 0.12
150 0.11
151 0.12
152 0.15
153 0.16
154 0.17
155 0.18
156 0.21
157 0.19
158 0.2
159 0.2
160 0.17
161 0.17
162 0.16
163 0.14
164 0.14
165 0.13
166 0.13
167 0.12
168 0.11
169 0.09
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.09
176 0.12
177 0.12
178 0.13
179 0.16
180 0.17
181 0.18
182 0.28
183 0.37
184 0.37
185 0.37
186 0.36
187 0.36
188 0.35
189 0.36
190 0.27
191 0.17
192 0.14
193 0.14
194 0.14
195 0.12
196 0.09
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.08
204 0.1
205 0.11
206 0.14
207 0.18
208 0.19
209 0.23
210 0.26
211 0.3
212 0.31
213 0.38
214 0.44
215 0.47
216 0.54
217 0.51
218 0.54
219 0.6
220 0.65
221 0.67
222 0.68
223 0.65
224 0.66
225 0.74
226 0.72
227 0.7
228 0.62
229 0.56
230 0.5
231 0.47
232 0.39
233 0.31
234 0.27
235 0.19
236 0.24
237 0.21
238 0.17
239 0.17
240 0.19
241 0.2
242 0.23
243 0.28
244 0.23
245 0.24
246 0.26
247 0.26
248 0.25
249 0.24
250 0.21
251 0.16
252 0.18
253 0.18
254 0.16
255 0.14
256 0.13
257 0.11
258 0.11
259 0.11
260 0.09
261 0.12
262 0.13
263 0.14
264 0.14
265 0.14
266 0.15
267 0.15
268 0.16
269 0.11
270 0.11
271 0.13
272 0.13
273 0.15
274 0.19
275 0.2
276 0.21
277 0.21
278 0.2
279 0.24
280 0.25
281 0.26
282 0.27
283 0.28
284 0.26
285 0.27
286 0.27
287 0.2
288 0.17
289 0.14
290 0.08
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.04
298 0.04
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.06
303 0.07
304 0.09
305 0.13
306 0.14
307 0.14
308 0.17
309 0.18
310 0.19
311 0.2
312 0.19
313 0.2
314 0.19
315 0.2
316 0.18
317 0.18
318 0.18
319 0.18
320 0.16
321 0.14
322 0.14
323 0.14
324 0.14
325 0.13
326 0.11
327 0.1
328 0.1
329 0.08
330 0.08
331 0.06
332 0.04
333 0.05
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.05
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.05
343 0.05
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.07
348 0.07
349 0.09
350 0.13
351 0.18
352 0.2
353 0.22
354 0.25
355 0.31
356 0.32
357 0.35
358 0.34
359 0.33
360 0.38
361 0.36
362 0.4
363 0.38
364 0.39
365 0.4
366 0.44
367 0.42
368 0.37
369 0.38
370 0.33
371 0.31
372 0.3
373 0.25
374 0.17
375 0.15
376 0.14
377 0.11
378 0.11
379 0.09
380 0.09
381 0.09
382 0.11
383 0.12
384 0.14
385 0.16
386 0.16
387 0.22
388 0.24
389 0.24
390 0.21
391 0.25
392 0.23
393 0.23
394 0.22
395 0.15
396 0.12
397 0.12
398 0.11
399 0.06
400 0.06
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.05
405 0.05
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.05
411 0.06
412 0.05
413 0.06
414 0.05
415 0.06
416 0.07
417 0.08
418 0.09
419 0.07
420 0.08
421 0.11
422 0.12
423 0.17
424 0.19
425 0.19
426 0.18
427 0.18
428 0.17
429 0.16
430 0.15
431 0.1
432 0.09
433 0.09
434 0.08
435 0.09
436 0.12
437 0.12
438 0.13
439 0.17
440 0.19
441 0.21
442 0.31
443 0.34
444 0.34
445 0.38
446 0.37
447 0.34
448 0.31
449 0.29
450 0.19
451 0.16
452 0.14
453 0.08
454 0.08
455 0.07
456 0.07
457 0.08
458 0.08
459 0.08
460 0.09
461 0.1
462 0.13
463 0.13
464 0.14
465 0.14
466 0.17
467 0.23
468 0.29
469 0.35
470 0.36
471 0.36
472 0.4
473 0.41
474 0.4
475 0.35
476 0.33
477 0.3
478 0.31
479 0.28
480 0.25
481 0.25
482 0.23
483 0.21
484 0.19
485 0.15
486 0.11
487 0.11
488 0.11
489 0.09
490 0.09
491 0.09
492 0.07
493 0.07
494 0.07
495 0.07
496 0.06
497 0.06
498 0.06
499 0.05
500 0.06
501 0.06
502 0.06
503 0.07
504 0.08
505 0.09
506 0.1
507 0.11
508 0.11
509 0.12
510 0.11
511 0.12
512 0.12
513 0.12
514 0.15
515 0.14
516 0.14
517 0.13
518 0.13
519 0.14
520 0.15
521 0.15
522 0.11
523 0.11
524 0.13
525 0.15
526 0.17
527 0.2
528 0.25
529 0.31
530 0.33
531 0.34
532 0.34
533 0.37
534 0.41
535 0.43
536 0.42
537 0.39
538 0.38
539 0.37
540 0.34
541 0.33
542 0.28
543 0.21
544 0.19
545 0.16
546 0.15
547 0.15
548 0.15
549 0.14
550 0.15
551 0.15
552 0.15
553 0.15
554 0.14
555 0.17
556 0.18
557 0.18
558 0.17
559 0.16
560 0.15
561 0.15
562 0.21
563 0.2
564 0.21
565 0.22
566 0.26
567 0.29
568 0.34
569 0.36
570 0.33
571 0.35
572 0.34
573 0.32
574 0.28
575 0.28
576 0.26
577 0.25
578 0.25
579 0.25
580 0.27
581 0.26
582 0.25
583 0.23
584 0.24
585 0.24
586 0.3
587 0.32
588 0.38
589 0.44
590 0.5
591 0.58
592 0.62
593 0.68
594 0.66
595 0.64
596 0.58
597 0.55
598 0.55
599 0.57
600 0.56
601 0.54
602 0.52
603 0.52
604 0.57
605 0.57
606 0.59
607 0.56
608 0.56
609 0.58
610 0.64
611 0.7
612 0.69
613 0.69
614 0.63
615 0.64
616 0.59
617 0.51
618 0.48
619 0.41
620 0.34
621 0.4
622 0.38
623 0.34
624 0.38
625 0.43
626 0.48
627 0.56
628 0.64
629 0.64
630 0.73
631 0.77
632 0.8
633 0.85
634 0.84
635 0.86
636 0.88
637 0.88
638 0.86
639 0.81
640 0.74
641 0.7
642 0.66
643 0.63
644 0.62
645 0.63
646 0.59