Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P40079

Protein Details
Accession P40079    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
294-321FTRLNITNKAEKRKQKQRERNARMNVIGHydrophilic
337-357STSRRGAKKTRSAWDRAQRRLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
305-310KRKQKQ
340-349RRGAKKTRSA
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007146  Sas10/Utp3/C1D  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030532  C:small nuclear ribonucleoprotein complex  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0005732  C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0030490  P:maturation of SSU-rRNA  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG sce:YER127W  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04000  Sas10_Utp3  
Amino Acid Sequences MSELNALLKDINGSLTATSESLERLSGIYSNSATDEIPESNQLHEHLFYDAKKPAEKVSLLSLKNGSMLGYINSLLMLIGNRLDDECKDPSAMDARERSIQHRVVLERGVKPLEKKLAYQLDKLTRAYVKMEKEYKDAEKRALEKSTLVNHSGNDDSEDDESSEDEIAYRPNTSGIINTNKKSSAYRVEETAKQENGEENDDNETGVYKPPKITAVLPPQQTHFEDRFDAREHKDRSNKSRMQAMEEYIRESSDQPDWSASIGADIVNHGRGGIKSLRDTEKERRVTSFEEDNFTRLNITNKAEKRKQKQRERNARMNVIGGEDFGIFSSKRKLEDSTSRRGAKKTRSAWDRAQRRL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.11
3 0.11
4 0.1
5 0.1
6 0.1
7 0.1
8 0.1
9 0.1
10 0.09
11 0.09
12 0.1
13 0.11
14 0.11
15 0.13
16 0.13
17 0.13
18 0.14
19 0.15
20 0.14
21 0.13
22 0.15
23 0.13
24 0.14
25 0.18
26 0.18
27 0.18
28 0.2
29 0.2
30 0.19
31 0.18
32 0.18
33 0.16
34 0.19
35 0.19
36 0.22
37 0.25
38 0.26
39 0.28
40 0.28
41 0.29
42 0.32
43 0.31
44 0.28
45 0.33
46 0.38
47 0.36
48 0.38
49 0.35
50 0.3
51 0.3
52 0.28
53 0.19
54 0.12
55 0.12
56 0.1
57 0.1
58 0.1
59 0.09
60 0.08
61 0.08
62 0.07
63 0.06
64 0.06
65 0.05
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.07
70 0.08
71 0.09
72 0.12
73 0.14
74 0.14
75 0.14
76 0.14
77 0.16
78 0.21
79 0.22
80 0.22
81 0.22
82 0.24
83 0.29
84 0.3
85 0.32
86 0.32
87 0.33
88 0.31
89 0.34
90 0.33
91 0.29
92 0.33
93 0.34
94 0.29
95 0.29
96 0.29
97 0.26
98 0.27
99 0.29
100 0.32
101 0.29
102 0.28
103 0.33
104 0.4
105 0.41
106 0.42
107 0.43
108 0.43
109 0.44
110 0.44
111 0.39
112 0.3
113 0.29
114 0.3
115 0.28
116 0.25
117 0.29
118 0.34
119 0.32
120 0.34
121 0.37
122 0.4
123 0.42
124 0.4
125 0.38
126 0.37
127 0.38
128 0.4
129 0.38
130 0.32
131 0.26
132 0.28
133 0.3
134 0.27
135 0.27
136 0.24
137 0.22
138 0.24
139 0.22
140 0.19
141 0.14
142 0.13
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.09
147 0.08
148 0.09
149 0.07
150 0.07
151 0.06
152 0.05
153 0.05
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.07
160 0.07
161 0.08
162 0.11
163 0.19
164 0.22
165 0.23
166 0.24
167 0.24
168 0.24
169 0.24
170 0.24
171 0.24
172 0.26
173 0.26
174 0.28
175 0.31
176 0.34
177 0.37
178 0.38
179 0.3
180 0.25
181 0.25
182 0.23
183 0.22
184 0.21
185 0.17
186 0.14
187 0.15
188 0.15
189 0.14
190 0.12
191 0.11
192 0.08
193 0.11
194 0.12
195 0.11
196 0.11
197 0.13
198 0.14
199 0.15
200 0.17
201 0.21
202 0.29
203 0.34
204 0.36
205 0.36
206 0.36
207 0.37
208 0.37
209 0.34
210 0.26
211 0.23
212 0.22
213 0.23
214 0.24
215 0.24
216 0.27
217 0.26
218 0.33
219 0.36
220 0.41
221 0.48
222 0.52
223 0.57
224 0.63
225 0.64
226 0.57
227 0.61
228 0.54
229 0.53
230 0.48
231 0.43
232 0.39
233 0.35
234 0.35
235 0.28
236 0.27
237 0.21
238 0.19
239 0.18
240 0.16
241 0.16
242 0.15
243 0.15
244 0.15
245 0.15
246 0.15
247 0.12
248 0.09
249 0.08
250 0.07
251 0.06
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.08
258 0.08
259 0.13
260 0.16
261 0.17
262 0.19
263 0.25
264 0.3
265 0.32
266 0.38
267 0.44
268 0.5
269 0.53
270 0.53
271 0.5
272 0.49
273 0.49
274 0.48
275 0.47
276 0.4
277 0.39
278 0.38
279 0.37
280 0.34
281 0.3
282 0.27
283 0.2
284 0.23
285 0.22
286 0.25
287 0.32
288 0.38
289 0.48
290 0.55
291 0.63
292 0.69
293 0.75
294 0.82
295 0.84
296 0.88
297 0.9
298 0.93
299 0.92
300 0.92
301 0.9
302 0.86
303 0.76
304 0.69
305 0.58
306 0.5
307 0.4
308 0.3
309 0.22
310 0.16
311 0.14
312 0.11
313 0.12
314 0.09
315 0.11
316 0.19
317 0.2
318 0.23
319 0.25
320 0.29
321 0.35
322 0.46
323 0.5
324 0.52
325 0.59
326 0.64
327 0.65
328 0.68
329 0.69
330 0.68
331 0.72
332 0.7
333 0.72
334 0.72
335 0.75
336 0.79
337 0.81