Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P16658

Protein Details
Accession P16658    Localization Confidence Low Confidence Score 8.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MSKGRVNQKRYKYPLPIHPVDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 10, cyto_mito 8.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011856  tRNA_endonuc-like_dom_sf  
IPR036167  tRNA_intron_Endo_cat-like_sf  
IPR006677  tRNA_intron_Endonuc_cat-like  
IPR006676  tRNA_splic  
IPR016589  tRNA_splic_SEN2  
Gene Ontology GO:0012505  C:endomembrane system  
GO:0005741  C:mitochondrial outer membrane  
GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0000214  C:tRNA-intron endonuclease complex  
GO:0016829  F:lyase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000213  F:tRNA-intron endonuclease activity  
GO:0098787  P:mRNA cleavage involved in mRNA processing  
GO:0000379  P:tRNA-type intron splice site recognition and cleavage  
KEGG sce:YLR105C  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01974  tRNA_int_endo  
CDD cd22363  tRNA-intron_lyase_C  
Amino Acid Sequences MSKGRVNQKRYKYPLPIHPVDDLPELILHNPLSWLYWAYRYYKSTNALNDKVHVDFIGDTTLHITVQDDKQMLYLWNNGFFGTGQFSRSEPTWKARTEARLGLNDTPLHNRGGTKSNTETEMTLEKVTQQRRLQRLEFKKERAKLERELLELRKKGGHIDEENILLEKQRESLRKFKLKQTEDVGIVAQQQDISESNLRDEDNNLLDENGDLLPLESLELMPVEAMFLTFALPVLDISPACLAGKLFQFDAKYKDIHSFVRSYVIYHHYRSHGWCVRSGIKFGCDYLLYKRGPPFQHAEFCVMGLDHDVSKDYTWYSSIARVVGGAKKTFVLCYVERLISEQEAIALWKSNNFTKLFNSFQVGEVLYKRWVPGRNRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.82
3 0.77
4 0.69
5 0.65
6 0.57
7 0.5
8 0.44
9 0.34
10 0.25
11 0.22
12 0.19
13 0.16
14 0.17
15 0.14
16 0.12
17 0.12
18 0.12
19 0.12
20 0.12
21 0.13
22 0.13
23 0.18
24 0.2
25 0.24
26 0.29
27 0.32
28 0.34
29 0.38
30 0.41
31 0.41
32 0.48
33 0.52
34 0.51
35 0.49
36 0.49
37 0.45
38 0.42
39 0.37
40 0.27
41 0.2
42 0.16
43 0.15
44 0.14
45 0.11
46 0.1
47 0.11
48 0.12
49 0.1
50 0.1
51 0.1
52 0.12
53 0.14
54 0.19
55 0.17
56 0.17
57 0.18
58 0.2
59 0.2
60 0.17
61 0.22
62 0.19
63 0.21
64 0.21
65 0.2
66 0.19
67 0.18
68 0.17
69 0.15
70 0.14
71 0.13
72 0.14
73 0.14
74 0.16
75 0.17
76 0.21
77 0.19
78 0.26
79 0.3
80 0.3
81 0.33
82 0.36
83 0.4
84 0.4
85 0.43
86 0.4
87 0.39
88 0.41
89 0.4
90 0.38
91 0.35
92 0.31
93 0.29
94 0.27
95 0.23
96 0.21
97 0.2
98 0.2
99 0.25
100 0.25
101 0.25
102 0.27
103 0.28
104 0.29
105 0.29
106 0.26
107 0.22
108 0.22
109 0.19
110 0.16
111 0.14
112 0.16
113 0.21
114 0.23
115 0.29
116 0.31
117 0.38
118 0.44
119 0.5
120 0.51
121 0.55
122 0.62
123 0.65
124 0.67
125 0.66
126 0.68
127 0.68
128 0.7
129 0.67
130 0.63
131 0.57
132 0.57
133 0.53
134 0.48
135 0.48
136 0.45
137 0.45
138 0.41
139 0.37
140 0.32
141 0.29
142 0.28
143 0.25
144 0.26
145 0.2
146 0.22
147 0.21
148 0.2
149 0.2
150 0.19
151 0.16
152 0.11
153 0.1
154 0.08
155 0.1
156 0.14
157 0.19
158 0.22
159 0.3
160 0.38
161 0.47
162 0.5
163 0.54
164 0.59
165 0.56
166 0.58
167 0.53
168 0.49
169 0.4
170 0.37
171 0.31
172 0.21
173 0.19
174 0.15
175 0.1
176 0.06
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.08
181 0.1
182 0.1
183 0.1
184 0.11
185 0.12
186 0.11
187 0.12
188 0.12
189 0.1
190 0.11
191 0.1
192 0.09
193 0.09
194 0.08
195 0.09
196 0.06
197 0.05
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.07
229 0.06
230 0.08
231 0.1
232 0.1
233 0.1
234 0.12
235 0.14
236 0.16
237 0.2
238 0.19
239 0.18
240 0.18
241 0.22
242 0.23
243 0.24
244 0.25
245 0.23
246 0.21
247 0.26
248 0.25
249 0.21
250 0.23
251 0.26
252 0.27
253 0.27
254 0.31
255 0.27
256 0.3
257 0.32
258 0.38
259 0.38
260 0.36
261 0.37
262 0.38
263 0.43
264 0.42
265 0.42
266 0.34
267 0.31
268 0.3
269 0.27
270 0.24
271 0.18
272 0.18
273 0.2
274 0.26
275 0.24
276 0.27
277 0.31
278 0.36
279 0.37
280 0.39
281 0.4
282 0.38
283 0.44
284 0.42
285 0.42
286 0.35
287 0.33
288 0.29
289 0.23
290 0.18
291 0.13
292 0.12
293 0.08
294 0.09
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.11
299 0.11
300 0.1
301 0.11
302 0.13
303 0.13
304 0.16
305 0.17
306 0.16
307 0.16
308 0.16
309 0.18
310 0.21
311 0.24
312 0.21
313 0.2
314 0.22
315 0.22
316 0.22
317 0.21
318 0.21
319 0.18
320 0.23
321 0.27
322 0.26
323 0.26
324 0.28
325 0.27
326 0.23
327 0.23
328 0.17
329 0.13
330 0.12
331 0.13
332 0.12
333 0.13
334 0.12
335 0.15
336 0.19
337 0.23
338 0.27
339 0.28
340 0.29
341 0.32
342 0.38
343 0.38
344 0.38
345 0.38
346 0.34
347 0.33
348 0.34
349 0.3
350 0.27
351 0.24
352 0.24
353 0.22
354 0.22
355 0.22
356 0.26
357 0.32